Отконвертировать-то можно, но ведь придется для более чем половины набора снипов FTDNA вписывать предположительные значения. Особого доверия к результату нет
Можно использовать для пропущенных снипов гетерозиготные значения, тогда они точно не порвут сегмент. Все настоящие сегменты останутся, зато удлинятся случайным образом сантиморгана на два каждый.