АвторТема: 23andMe чип v.4  (Прочитано 18477 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн ШадАвтор темы

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6334
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1330/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Re: 23andMe чип v.4
« Ответ #45 : 24 Октябрь 2014, 23:56:37 »
Феликс выкладывал в своем блоге конвертер v4 в v3, что позволяло закачать файл в FTDNA.
Цитировать
23andMe v4 SNPs only has half of the atDNA SNPs compared to v3. This tool allows to convert  23andMe v4 chip SNPs to  v3 chip by adding most of the missing SNPs as accurate as possible. This tool is not restricted to only 23andMe v4 files but also for FTDNA and Ancestry files who wish to see their additional SNPs. In order to use FTDNA and Ancestry files, you need to make sure the files are in 23andMe format, which you can convert using  Autosomal DNA Converter.

Но потом убрал.
Кто-нибудь успел скачать? И попробовать?

Оффлайн kirroid

  • Выгляда як ядвинга
  • Сообщений: 1062
  • Страна: by
  • Рейтинг +338/-6
  • Из Вайшнории
  • Y-ДНК: I1-M227
Re: 23andMe чип v.4
« Ответ #46 : 27 Октябрь 2014, 07:39:17 »
Обещают добавить около 10 тысяч снипов (в том числе и уже протестировавшимся на v4):
Цитировать
Analysis of our data has allowed us to improve the interpretation of over 10,000 SNPs for customers on the V4 platform. These SNPs are distributed genome-wide. Raw data downloads for customers on all genotyping platforms will be temporarily disabled for a period of time during the week of July 28, 2014 while the SNPs are incorporated. After the raw data download is re-enabled, V4 customers will see calls for the SNPs that previously did not exist in their raw data. Existing SNP calls will not be affected by this update. Similarly, no features of the site other than raw data should be impacted as these additional SNPs will not be referenced by any health or ancestry features.
У двоюродного дядьки появилось прочтение в интересующей позиции, которого раньше не было, но mtDNA группу при этом не обновили. Все как обещали, так и сделали.

Оффлайн Людмила

  • Сообщений: 1007
  • Рейтинг +151/-1
Re: 23andMe чип v.4
« Ответ #47 : 27 Октябрь 2014, 09:16:26 »
Шад:
Цитировать
Феликс выкладывал в своем блоге конвертер v4 в v3, что позволяло закачать файл в FTDNA.
Если кто узнает что-то по этому поводу, сообщите,пожалуйста. Осталось 2 результата в v4.

Онлайн Srkz

  • Сообщений: 8462
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4813/-3
  • Y-ДНК: N-L1025 Y64023
  • мтДНК: U4a1-a C16134T
Re: 23andMe чип v.4
« Ответ #48 : 27 Октябрь 2014, 09:28:05 »
Отконвертировать-то можно, но ведь придется для более чем половины набора снипов FTDNA вписывать предположительные значения. Особого доверия к результату нет :)
Можно использовать для пропущенных снипов гетерозиготные значения, тогда они точно не порвут сегмент. Все настоящие сегменты останутся, зато удлинятся случайным образом сантиморгана на два каждый.

Оффлайн ШадАвтор темы

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6334
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1330/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Re: 23andMe чип v.4
« Ответ #49 : 27 Октябрь 2014, 09:57:32 »
Отконвертировать-то можно, но ведь придется для более чем половины набора снипов FTDNA вписывать предположительные значения. Особого доверия к результату нет :)
Можно использовать для пропущенных снипов гетерозиготные значения, тогда они точно не порвут сегмент. Все настоящие сегменты останутся, зато удлинятся случайным образом сантиморгана на два каждый.

Ну автор видимо это и имел ввиду, когда писал: by adding most of the missing SNPs as accurate as possible.
Только не понятно - почему он убрал конвертер? В ФТДНА не понравилась идея ("замусорят" базу) или автор сам усомнился в целесообразности этой затеи?

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.