АвторТема: Компьютер для ДНК-Генеалога  (Прочитано 13174 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн Lifanov

  • Сообщений: 192
  • Рейтинг +60/-0
  • Парадигма-то другая...
    • База YDNA
  • Y-ДНК: R1a1
  • мтДНК: L2a
Re: Компьютер для ДНК-Генеалога
« Ответ #30 : 09 Октябрь 2009, 09:29:21 »
Импортирует:
- РДФ, старый и новый
- ИЧ

Импортируются РДФ, где чары закодированы символами АСКИ от 0х30 (ноль) до 0х5А (Z). Если на входе мусор - в данных может также оказаться мусор.
Перед экспортом обязательна "бинаризация". Не сделаешь вручную - программа сделает принудительно.

Если на входе бинаризации 0/1, то он так и откопируется.
Если на входе С/Т, то он преобразовывается во внутреннее хранение 0/1, причем Т=1.
Если на входе ACTG, то появляются два бита AG_TC и AC_TG, причем вес первого в 5 раз больше базового. Соответственно, А=00, G=01, C=10, T=11.
Если на входе десятичное число до 48 (0х30) - то из набора чисел вычисляются минимум и максимум, делается набор бит в количестве Max-Min...

При экспорте в НЕКС 0/1 будет преобразован в С/Т, причем Т=1.
При экспорте веса, количества, наименования маркеров пока не поддерживаются.

Мужики, пока у меня попадаются обрывки свободного времени, хочу довести ФилоКонв до какого-то разумного состояния и выложить.

Поэтому:
1. Багрепорты есть?!?!?!
2. Что-то еще надо оперативно добавить?

Оффлайн wertner

  • ...
  • Сообщений: 1332
  • Страна: ru
  • Рейтинг +321/-0
    • YFull
  • Y-ДНК: E-V13->E-S2972->E-Z16661
  • мтДНК: U4a (xU4a3)
Re: Компьютер для ДНК-Генеалога
« Ответ #31 : 10 Октябрь 2009, 04:04:25 »
Кажется, Вадим Веренич не отказался бы от конвертации гаплотипов разной длины, коли уж TNT их поддерживает. Уточню у него.

Оффлайн I2a1a

  • ...
  • Сообщений: 10364
  • Страна: ee
  • Рейтинг +761/-8
Re: Компьютер для ДНК-Генеалога
« Ответ #32 : 10 Октябрь 2009, 08:52:14 »
Кажется, Вадим Веренич не отказался бы от конвертации гаплотипов разной длины, коли уж TNT их поддерживает. Уточню у него.

Да,Вадим Веренич не отказался бы. :)

Оффлайн Lifanov

  • Сообщений: 192
  • Рейтинг +60/-0
  • Парадигма-то другая...
    • База YDNA
  • Y-ДНК: R1a1
  • мтДНК: L2a
Re: Компьютер для ДНК-Генеалога
« Ответ #33 : 12 Октябрь 2009, 09:38:18 »
Кажется, Вадим Веренич не отказался бы от конвертации гаплотипов разной длины, коли уж TNT их поддерживает. Уточню у него.

Да,Вадим Веренич не отказался бы. :)

А "хвосты" чем добивать? "?" ?

Оффлайн mouglley

  • ...
  • Сообщений: 7105
  • Страна: hr
  • Рейтинг +434/-7
  • Я знаю, что познаю всё.
    • Записки Маугли
  • Y-ДНК: N1c1-L1025
  • мтДНК: J1c3
Re: Компьютер для ДНК-Генеалога
« Ответ #34 : 12 Октябрь 2009, 10:59:43 »
Ими, вопросами.

Оффлайн Lifanov

  • Сообщений: 192
  • Рейтинг +60/-0
  • Парадигма-то другая...
    • База YDNA
  • Y-ДНК: R1a1
  • мтДНК: L2a
Re: Компьютер для ДНК-Генеалога
« Ответ #35 : 12 Октябрь 2009, 11:01:59 »
Ими, вопросами.

Понял. Имеется ввиду преобразование rdf, ych -> nex?
Или вы о сливе нескольких файлов в один?

А то вроде ни рдф, ни ич не позволяют хранить гаплотипы разной длины...

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.