Q-L330 Siberian

[Yurgan]

Идентифицирована ветвь Q-YP1102 под Q-L330, параллельная Q-L332.
Она определяется снипами
YP1102  8550111
YP1103  15880973
YP1104  21489957

общими для образцов YF01841.152850 (Ru), HGDP01227 (Mongolia), 250597 (Kz).

Новая ветвь Q-YP1102 появилась на дереве
http://yfull.com/tree/Q-L330/

Очень интересно.

[Шад]

Ссылка не имеет прямого отношения к Q-L330, но очень уж интересен рассказ про юкагиров...
На самом деле читается как приключенческий роман про индейцев...Тем более и гаплогруппа совпадает.
http://wyradhe.livejournal.com/374472.html

[Шад]

Ещё один Q-L330: kit # 321159 в проекте Russia-Slavic DNA Project

321159 L330+

[Шад]

Идентифицирована ветвь Q-YP1102 под Q-L330, параллельная Q-L332.
Она определяется снипами
YP1102  8550111
YP1103  15880973
YP1104  21489957

общими для образцов YF01841.152850 (Ru), HGDP01227 (Mongolia), 250597 (Kz).

Новая ветвь Q-YP1102 появилась на дереве
http://yfull.com/tree/Q-L330/

Очень интересно.

Ещё более интересно, что к этому же субкладу принадлежат кеты.

[Yurgan]

Идентифицирована ветвь Q-YP1102 под Q-L330, параллельная Q-L332.
Она определяется снипами
YP1102  8550111
YP1103  15880973
YP1104  21489957

общими для образцов YF01841.152850 (Ru), HGDP01227 (Mongolia), 250597 (Kz).

Новая ветвь Q-YP1102 появилась на дереве
http://yfull.com/tree/Q-L330/

Очень интересно.

Ещё более интересно, что к этому же субкладу принадлежат кеты.

А у эльзасца получается другая ветвь?

[Шад]

Идентифицирована ветвь Q-YP1102 под Q-L330, параллельная Q-L332.
Она определяется снипами
YP1102  8550111
YP1103  15880973
YP1104  21489957

общими для образцов YF01841.152850 (Ru), HGDP01227 (Mongolia), 250597 (Kz).

Новая ветвь Q-YP1102 появилась на дереве
http://yfull.com/tree/Q-L330/

Очень интересно.

Ещё более интересно, что к этому же субкладу принадлежат кеты.

А у эльзасца получается другая ветвь?

Даю Вся вот эта компания: Erbland, Eggleston, Watson, Lusk - это параллельная ветвь Q-L332, L329. К ней же принадлежит Yessenbaev, но он L329-
Получается вот так:
Q-L330
..... Q-L332
.......... Q-L329
..... Q-YP1102

[Шад]

Идентифицирована ветвь Q-YP1102 под Q-L330, параллельная Q-L332.
Она определяется снипами
YP1102  8550111
YP1103  15880973
YP1104  21489957

общими для образцов YF01841.152850 (Ru), HGDP01227 (Mongolia), 250597 (Kz).

Новая ветвь Q-YP1102 появилась на дереве
http://yfull.com/tree/Q-L330/

Очень интересно.

Ещё более интересно, что к этому же субкладу принадлежат кеты.

Проверил сегодня снипы кетов из Karmin et al. 2015 и приватных снипов из группы Q в YFull.
Интересные открытия:
Три приватных снипа из YF02890 должны явно находится на уровне Q-YP1102 (http://yfull.com/tree/Q-YP1102/), так как они общие для этого образца и образцов Ket1, Ket2, Selkup3.
Речь идет о:

Код: [Выделить]

BZ162/B287 6786630 T A
BZ165/Z35933 7706350 C G
BZ989           4951578 A G

Z35955 (18577855CG) находится еще выше, так как охватывает как указанные четыре образца, так и Uzbk3, относящегося к субкладу Q-YP1695.
К сожалению, по остальным образцам полного сиквенса, относящимся к Q-L330 таких выводов сделать нельзя, так как все эти четыре снипа не прочитаны. Но на заметку взять можно.

Также загадочную "картинку" выдает совпадение еще трех (причем высококачественных снипов) найденных у Ket1, Selkup 3 (но не у Ket2) с YF01841.
Речь идет о:

Код: [Выделить]

BZ94/Z35964 7614630 T G
BZ99/Z35965 9127075 G T
BZ110/Z35971 16743775 T G
Ведь все два из трех кето-селькупских образцов образовали цепочку снипов YP1691-YP1694 и соответствующий субклад Q-YP1691. При этом YF01841 принадлежит к параллельному субкладу Q-Y11241.
Y11241 (19048174TG) это единственный снип, "цементирующий" этот субклад.
http://yfull.com/tree/Q-YP1102/
В образцах  Ket1, Ket2, Selkup3 он, вероятно, в немутированном варианте (так как у меня есть только список снипов, отличных от референса по этим образцам).
Если я прав в своих выводах, то YF01841 нужно "перепрописать" к кетско-селькупскому субкладу Q-YP1691. 

Также образец Uzbk3 из Karmin et al. 2015 позволил уточниться еще одному субкладу под Q-L330 - а именно Q-YP1695.
Вот эти снипы являются общими для Uzbk3 и YF02841
http://yfull.com/tree/Q-L332/

Код: [Выделить]

BZ422 3340850 T C Best qual
BZ425 16519587 C T Best qual
BZ433 15739867 T C Acceptable qual
BZ438 16843267 A T Acceptable qual
BZ988 18188735 C T Ambiguous qual
Таким образом, есть все основания пополнить этот субклад еще пятью снипами.

[Semargl]

Также загадочную "картинку" выдает совпадение еще трех (причем высококачественных снипов) найденных у Ket1, Selkup 3 (но не у Ket2) с YF01841.
Речь идет о:

Код: [Выделить]

BZ94/Z35964 7614630 T G
BZ99/Z35965 9127075 G T
BZ110/Z35971 16743775 T G
Ведь все три кето-селькупских образца образовали цепочку снипов YP1691-YP1694 и соответствующий субклад Q-YP1691. При этом YF01841 принадлежит к параллельному субкладу Q-Y11241.
Y11241 (19048174TG) это единственный снип, "цементирующий" этот субклад.
http://yfull.com/tree/Q-YP1102/
В образцах  Ket1, Ket2, Selkup3 он, вероятно, в немутированном варианте (так как у меня есть только список снипов, отличных от референса по этим образцам).
Если я прав в своих выводах, то YF01841 нужно "перепрописать" к кетско-селькупскому субкладу Q-YP1691. 

"Загадочная" картинка легко объясняется, если учитывать неполный охват Y в работе Кармин. То что нет не только БАМов, но и простых VCF/TSV/BED значительно осложняет работу с филогенией. Признав снип Y11241 неохваченным в указанной работе, нам остается только удалить субклад Q-Y11241. Снип Y11241 переносится на уровень Q-YP1102. Между уровнями Q-YP1102 и Q-YP1691 добавляется новый подуровень Q-BZ99 (BZ94, BZ99, BZ110). Семпл YF01841 таким образом будет Q-BZ99*

[Шад]

Вот и обновление (YFull 4.02)
Q-BZ99 (Z35965/BZ99 * Z35964/BZ94 * Z35971/BZ110)
http://yfull.com/tree/Q-BZ99/

[Виталий77]

Разветвилось дерево ниже снипа Q-L329:

[Шад]

Но при этом Q-L329 так и остался территориально локализованным в Западной Европе.

[Михаил Ночевной]

Какие последние данные по Q L330+ ?
Мне интересно в каких этносах произошел и как распространялся этот субклад, и кем были в расовой принадлежности носители этого субклада?
В Еупедии такая информация: "the main subclade of the Mongols, also found among the Kazakhs and Uzbeks, as well as in Ukraine, Turkey and Greece (probably Mongolian and Turkic) "

[Yurgan]

Какие последние данные по Q L330+ ?
Мне интересно в каких этносах произошел и как распространялся этот субклад, и кем были в расовой принадлежности носители этого субклада?
В Еупедии такая информация: "the main subclade of the Mongols, also found among the Kazakhs and Uzbeks, as well as in Ukraine, Turkey and Greece (probably Mongolian and Turkic) "

Наибольшая частота у кетов. 100%. Дальше селькупы, тувинцы, ханты. У остальных частота незначительная. Этот субклад легко выявляется. Большинство Q-L330 имеет DYS437 = 13.

[Шад]

Какие последние данные по Q L330+ ?
Мне интересно в каких этносах произошел и как распространялся этот субклад, и кем были в расовой принадлежности носители этого субклада?
В Еупедии такая информация: "the main subclade of the Mongols, also found among the Kazakhs and Uzbeks, as well as in Ukraine, Turkey and Greece (probably Mongolian and Turkic) "

@Михаил

Давайте рассмотрим вот эту ссылку: https://www.yfull.com/tree/Q-L330/

Здесь мы видим структуру субклада, восстановленную по данным полного сиквенса игрек-хромосомы.
Субклад Q-L330 образовался примерно 16300 лет назад. И ближе к концу 7 тысячелетия распался на два субклада: Q-YP1102 (азиатский) и Q-YP771 (евразийской). Название достаточно условные, так как условно европейские и условно азиатские ветви присутствуют в обоих субкладах. Что указывает на то, что их распад по географическому признаку происходил не раз и в более позднее время.
Рассмотрим ветвь Q-YP771:
Q-YP771* (западноевропеец)
Q-YP1695 - казах, найман. К этому же субкладу принадлежит узбек Uzbk3 из коллекции Эстонского биоцентра (Karmin et al, 2015)
Q-L329 (западноевропейцы)

Q-YP1102
Q-Y1102* (не полностью типирован из-за низкого качества секвенирования) - HGDP01227 (Mongolia)
Q-BZ99 (кеты, селькупы и один из участников нашего форума, вполне себе русского, точнее - западнорусского происхождения)
Q-Y12448 - казахи из рода кулан-кипчак и канглы.

Не типированные образцы (принадлежность к субкладам будет уточнена в перспективе):
L330+
246832 и еще два аналогичных образца в совпадениях: евреи-романиоты из Янины (L330+). Очевиден эффект-основателя, восходят к общему предку.
189818 Kulmanakov L330+, L334+ обский карагас
239004   Kulmenev L330+ второй обский карагас (ни одного совпадения даже на 12 маркерах)
229580   Sirotkin   Kondratiy Zhuravlev,b.c.1575,Yurievsky Uezd   L330+ (ни одного совпадения даже на 12 маркерах, в ФТДНА)
244508   Boyko  (Западная Украина) L330+    (ни одного совпадения даже на 12 маркерах)
373460     Илья Шемчук 1838-1928 Украина, Винницкая область, Барский р-н, с.Ялтушков https://www.familytreedna.com/public/UkrainianDNA?iframe=yresults
321159   Kuzmin   Kuzmin, Yekaterinburg, Russia  L330+    (ни одного совпадения даже на 12 маркерах)
314848   Berberov   Berberov, Turkey → Karachay L330+ (ни одного совпадения даже на 12 маркерах)

170259   Juozapas Šumskis, b.c.1735, Lithuania   Lithuania (см. проект https://www.familytreedna.com/public/LituaniaPropria/default.aspx?section=yresults)

L332+
16161 Zoltán Sisa    Péter Sisa, 1570, Gyarmat (ma Balassagyarmat) - см. Ясский-ДНК проект. Один совпаденец с той же фамилией и один грек (?).
328213 Tikhon Slyadnev (тут вообще явный анекдот - три совпаденца с Q-M3 на 12 маркерах, других нет ни на 12 маркерах, ни дальше-  хотя у него сделано 67 маркеров)
285905 Valsame, предок -    Georgios Valsamides, b. ca. 1825, d. ca. 1915   Turkey (ни одного совпадения на 12 маркерах)

Еще по северным популяциям

Ханты
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
282278   Milimov       Russian Federation   - Q1a3   13   23   13   10   16-16   12   12   13   13   14   31                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           
282280   Karaulov       Unknown Origin   -   Q1a3 -  13   23   13   10   16-16   12   12   13   13   14   31   
Селькупы
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 
282277   Itkulov       Unknown Origin   Q1a3   13   23   13   10   15-16   12   12   13   13   14   31   

https://www.familytreedna.com/public/SiberiaTransbaikalia/default.aspx?section=yresults
Если кому-то интересно, то в теме выше приведены около десятка СТР-данных из научных выборок по этим популяциям. По снипам, к сожалению, глухо. Сами они финансировать не могут, а спонсоров пока нет.

Итого: субклад достаточно обширно распределен на территории Евразии. Прародину можно поместить в районе Алтая (хотя это достаточно примерно и спекулятивно, учитывая интенсивность миграционных процессов).
Относительно распределения субклада можно прочесть другие мнения еще здесь: http://forum.molgen.org/index.php/topic,6127.msg242479.html#msg242479

Постарался дать максимально полный обзор информации на текущий день. Если что упустил - прошу уважаемых Yurgan  и asan-kaygy дополнить.

[Михаил Ночевной]

Какие последние данные по Q L330+ ?
Мне интересно в каких этносах произошел и как распространялся этот субклад, и кем были в расовой принадлежности носители этого субклада?
В Еупедии такая информация: "the main subclade of the Mongols, also found among the Kazakhs and Uzbeks, as well as in Ukraine, Turkey and Greece (probably Mongolian and Turkic) "

Наибольшая частота у кетов. 100%. Дальше селькупы, тувинцы, ханты. У остальных частота незначительная. Этот субклад легко выявляется. Большинство Q-L330 имеет DYS437 = 13.

спасибо Владимир!
т.е. все коренные сибирские народы имеют и были первончальными носителями Q1a L330+ ?
в википедии прочел что селькупы, кеты, карагасы - представители т.н. западносибирской расы.