АвторТема: Q-L330 Siberian  (Прочитано 32066 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн ШадАвтор темы

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6333
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1292/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Re: Q-L330 Siberian
« Ответ #90 : 01 Декабрь 2013, 15:42:41 »
На текущий момент известно об уже 12 заказах теста BigY представителями гаплогруппы Q.
В числе первых заказчиков этого теста - наш форумчанин АндрейВ.
Он стал как минимум вторым Q-L330 заказавшим тест.
Таким образом, есть отличный шанс уже в ближайшее время изучить структуру субклада Q-L330.
Еще сравнить Q-L330 и Q-M3. Уточнить время расхождения ветвей.

Так как я уже поработал со снипами, выскажу общий скепсис насчет того, что TMRCA таким способом можно посчитать точнее.
Не все снипы качественно прочтутся при секвенировании. Некоторые вообще не прочтуться, некоторые будут сомнительными, по некоторым вообще не будет понятна их филогенетическая позиция.
Таким образом, ТОЧНОГО количества снип-мутаций между двумя гаплотипами я пока не вижу. Приблизительное... пожалуй, да.

Оффлайн Yurgan

  • Кто везёт, тому везёт
  • ...
  • Сообщений: 8270
  • Страна: gt
  • Рейтинг +832/-7
  • Потомок кузнеца Ильмаринена
    • Сибирский родословец
Re: Q-L330 Siberian
« Ответ #91 : 01 Декабрь 2013, 15:43:45 »
На текущий момент известно об уже 12 заказах теста BigY представителями гаплогруппы Q.
В числе первых заказчиков этого теста - наш форумчанин АндрейВ.
Он стал как минимум вторым Q-L330 заказавшим тест.
Таким образом, есть отличный шанс уже в ближайшее время изучить структуру субклада Q-L330.
Еще сравнить Q-L330 и Q-M3. Уточнить время расхождения ветвей.

Так как я уже поработал со снипами, выскажу общий скепсис насчет того, что TMRCA таким способом можно посчитать точнее.
Не все снипы качественно прочтутся при секвенировании. Некоторые вообще не прочтуться, некоторые будут сомнительными, по некоторым вообще не будет понятна их филогенетическая позиция.
Таким образом, ТОЧНОГО количества снип-мутаций между двумя гаплотипами я пока не вижу. Приблизительное... пожалуй, да.
Хотя бы приблизительное.

Оффлайн Nimissin

  • Сообщений: 2375
  • Рейтинг +750/-0
  • Y-ДНК: N-M178 L839+ P298+ M2019+ M2118+ M1991+ M1988+
  • мтДНК: C4b12a
Re: Q-L330 Siberian
« Ответ #92 : 01 Декабрь 2013, 15:55:24 »
Точность зависит от статистики отсчетов, т.е. количества секвенированных образцов. Она же (статистика) поможет верифицировать истинность обнаруженных снипов.

Оффлайн ШадАвтор темы

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6333
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1292/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Re: Q-L330 Siberian
« Ответ #93 : 20 Февраль 2014, 16:56:51 »
Новые данные из проекта SiberiaTransbaikalia
Новые данные.

Ханты
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    
282278   Milimov       Russian Federation   - Q1a3   13   23   13   10   16-16   12   12   13   13   14   31                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           
282280   Karaulov       Unknown Origin   -   Q1a3 -  13   23   13   10   16-16   12   12   13   13   14   31   

Селькупы
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
282277   Itkulov       Unknown Origin   Q1a3   13   23   13   10   15-16   12   12   13   13   14   31                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           

Q1a3 доминируют.  ;D

http://www.semargl.me/ru/dna/ydna/nearest-neighbors/62079/
Ханты близки друг к другу и селькупу на 12 маркерах.

Оффлайн Yurgan

  • Кто везёт, тому везёт
  • ...
  • Сообщений: 8270
  • Страна: gt
  • Рейтинг +832/-7
  • Потомок кузнеца Ильмаринена
    • Сибирский родословец
Re: Q-L330 Siberian
« Ответ #94 : 20 Февраль 2014, 17:36:56 »
Новые данные из проекта SiberiaTransbaikalia
Новые данные.

Ханты
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    
282278   Milimov       Russian Federation   - Q1a3   13   23   13   10   16-16   12   12   13   13   14   31                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           
282280   Karaulov       Unknown Origin   -   Q1a3 -  13   23   13   10   16-16   12   12   13   13   14   31   

Селькупы
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
282277   Itkulov       Unknown Origin   Q1a3   13   23   13   10   15-16   12   12   13   13   14   31                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           

Q1a3 доминируют.  ;D

http://www.semargl.me/ru/dna/ydna/nearest-neighbors/62079/
Ханты близки друг к другу и селькупу на 12 маркерах.

Ломаю голову, к кому ближе Иткулов. Фамилия тюркская, родом из кетских селькупов. Ближе тувинцы, но кто знает, могут быть близки и кеты.
Надо бы им хотя бы 25.
Тогда можно будет уверенно сказать, что это L330 и какая ветвь из двух основных.


Оффлайн ШадАвтор темы

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6333
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1292/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Re: Q-L330 Siberian
« Ответ #95 : 29 Март 2014, 15:24:43 »
Похоже, что ещё один Q-L330
http://www.semargl.me/ru/dna/ydna/nearest-neighbors/61864/
Турецкого происхождения.
В Османской империи в своё время мог оказаться кто угодно. И не всегда по своей воли. Хотя, здесь вероятно и первоначально огузское происхождение, из первых тюркских покорителей Передней Азии. 

Оффлайн Yurgan

  • Кто везёт, тому везёт
  • ...
  • Сообщений: 8270
  • Страна: gt
  • Рейтинг +832/-7
  • Потомок кузнеца Ильмаринена
    • Сибирский родословец
Re: Q-L330 Siberian
« Ответ #96 : 29 Март 2014, 17:15:28 »
Похоже, что ещё один Q-L330
http://www.semargl.me/ru/dna/ydna/nearest-neighbors/61864/
Турецкого происхождения.
В Османской империи в своё время мог оказаться кто угодно. И не всегда по своей воли. Хотя, здесь вероятно и первоначально огузское происхождение, из первых тюркских покорителей Передней Азии.
Спасибо, интересно.

Оффлайн ШадАвтор темы

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6333
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1292/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Re: Q-L330 Siberian
« Ответ #97 : 20 Июнь 2014, 22:46:02 »
Ещё один Q-L330: kit # 321159 в проекте Russia-Slavic DNA Project

Оффлайн ШадАвтор темы

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6333
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1292/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Re: Q-L330 Siberian
« Ответ #98 : 27 Июнь 2014, 22:43:18 »
Интересная версия распространения Q-L330 от Игоря Львовича:
Цитировать
озадачивает факт, что не слишком многочисленная (всего несколько процентов от имеющейся выборки) ветвь монголов (точнее, ойратов) субклада L330 отметилась в Центральной России настолько, чтобы принести своего общего предка с собой, а основные их линии из гаплогруппы С никак себя не проявили. На мой взгляд, имеющиеся на сегодняшний день данные по носителям L330 в России (Псковская, Ивановская - 229580, Тверская? области), Литве и Украине (244508) говорят о каком-то намного более раннем событии.

Как вариант, субклад L330 мог быть минороной линией при миграции носителей N1c1 из Сибири к берегам Балтики. В ту эпоху (4300 лет назад и раннее) ареалы Q-L330 и C могли и не перекрываться, как это имееет место сейчас.

Цитировать
Похоже на то, что уже 3000±500 лет назад ее предок жил на Русской Равнине или находился на пути туда. По датировкам и географии это совпадает с миграциями носителей гаплогруппы N1c, так что версия, предложенная в предыдущем сообщении, похоже, становится ведущей.

В принципе, достаточно убедительно.


Оффлайн ШадАвтор темы

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6333
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1292/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Re: Q-L330 Siberian
« Ответ #99 : 08 Сентябрь 2014, 14:23:13 »
Yurgan

От китайских товарищей Xu et al принимайте еще трех хантов. DYS437=13.
Предполагаю: L330
http://www.semargl.me/en/dna/ydna/nearest-neighbors/65779/

JK4217 Khanty-Mansi, Ymal-Nenets, and northern Tomsk, Russia [Khanty] 13 13 32 23 10 14 13 14,18 11 13 13 19 15 16 22 11
JK4222 Khanty-Mansi, Ymal-Nenets, and northern Tomsk, Russia [Khanty] 13 13 31 23 10 14 13 15,16 11 13 13 19 15 16 22 11
JK4244 Khanty-Mansi, Ymal-Nenets, and northern Tomsk, Russia [Khanty] 13 13 32 23 10 14 13 15,16 11 13 13 19 15 16 22 11

Сюда же для коллекции делаю репост по чувашам:
Интересная информация по чувашам из работы Xu et al, 2014
http://forum.molgen.org/index.php/topic,7251.0.html

Четверо Q1a-MEH2 среди 14 чувашей (в оригинале звучит как southern Ural Mountains region of Russia [Chuvash])
ID Population DYS456 DYS389I DYS390 DYS389II DYS458 DYS19 DYS385a DYS393 DYS391 DYS439 DYS635 DYS392 YGATAH4 DYS437 DYS438 DYS448
JK4068 southern Ural Mountains region of Russia [Chuvash] 17 13 25 30 15 16 11,14 13 10 10 23 11 12 14 11 20
JK4070 southern Ural Mountains region of Russia [Chuvash] 14 13 23 29 18 14 11,13 13 10 11 21 14 12 14 10 20
JK4072 southern Ural Mountains region of Russia [Chuvash] 14 14 23 31 17 14 11,13 14 11 10 21 14 12 14 10 19
JK4074 southern Ural Mountains region of Russia [Chuvash] 13 13 23 29 17 14 12,13 13 10 10 24 14 12 14 10 19
JK4075 southern Ural Mountains region of Russia [Chuvash] 15 13 23 32 16 13 15,18 13 10 13 22 14 11 13 11 19
JK4076 southern Ural Mountains region of Russia [Chuvash] 15 13 23 31 16 13 15,16 13 10 13 22 14 11 13 11 19
JK4079 southern Ural Mountains region of Russia [Chuvash] 15 13 23 32 16 13 15,16 13 10 13 22 14 11 13 11 19
JK4081 southern Ural Mountains region of Russia [Chuvash] 14 14 23 30 18 14 11,14 13 10 10 21 14 12 14 10 20
JK4085 southern Ural Mountains region of Russia [Chuvash] 15 13 24 30 16 13 16,19 13 10 12 22 13 13 14 10 20
JK4089 southern Ural Mountains region of Russia [Chuvash] 16 13 25 30 15 16 10,14 13 11 10 23 11 12 14 11 20
JK4090 southern Ural Mountains region of Russia [Chuvash] 15 13 22 30 15 14 13,17 13 11 13 23 13 11 15 10 20
JK4064 southern Ural Mountains region of Russia [Chuvash] 15 13 23 29 17 13 12,12 13 10 10 24 12 12 14 10 18
JK4066 southern Ural Mountains region of Russia [Chuvash] 15 13 23 30 15 17 12,16 12 10 11 23 11 11 15 9 21
JK4067 southern Ural Mountains region of Russia [Chuvash] 14 14 23 30 17 14 11,13 14 11 10 22 14 13 14 10 19

Кстати, даже при малой выборке 4/14=29% это уже существенно.
По предиктору к чувашским Q1a относятся JK4075, JK4076, JK4079, JK4085.

Самое интересное, что не смотря на мое ожидание увидеть Q-M25 (памятуя о Печникове и Мещерском), указанные гаплотипы более похожи на Q-L330.

UPD Вот ближайшее окружение по базе Семаргла, подтверждающее высказанный выше тезис
http://www.semargl.me/ru/dna/ydna/nearest-neighbors/65776/

JK4075, JK4076, JK4079: DYS437=13, -> L330+

Кстати, обратите внимание на нахождение в близком окружении калмыцких гаплотипов: Avademic sample #52 #65 Kalmyk Lutz Roewer et al (2006) Y-chromosomal STR haplotypes in Kalmyk population samples.
И вот этого знакомого Вам монгола: ~UNKNOWN[Mongolia]: 2 gen - Khaltar, b. Erdeneburen, Khovd, Mongolia - Jarantai, b. Erdeneburen, Khovd, Mongolia
Настало время перенести их всех в Q-L330?

Оффлайн Yurgan

  • Кто везёт, тому везёт
  • ...
  • Сообщений: 8270
  • Страна: gt
  • Рейтинг +832/-7
  • Потомок кузнеца Ильмаринена
    • Сибирский родословец
Re: Q-L330 Siberian
« Ответ #100 : 08 Сентябрь 2014, 14:34:55 »
Yurgan

От китайских товарищей Xu et al принимайте еще трех хантов. DYS437=13.
Предполагаю: L330
http://www.semargl.me/en/dna/ydna/nearest-neighbors/65779/

JK4217 Khanty-Mansi, Ymal-Nenets, and northern Tomsk, Russia [Khanty] 13 13 32 23 10 14 13 14,18 11 13 13 19 15 16 22 11
JK4222 Khanty-Mansi, Ymal-Nenets, and northern Tomsk, Russia [Khanty] 13 13 31 23 10 14 13 15,16 11 13 13 19 15 16 22 11
JK4244 Khanty-Mansi, Ymal-Nenets, and northern Tomsk, Russia [Khanty] 13 13 32 23 10 14 13 15,16 11 13 13 19 15 16 22 11

Сюда же для коллекции делаю репост по чувашам:
Интересная информация по чувашам из работы Xu et al, 2014
http://forum.molgen.org/index.php/topic,7251.0.html

Четверо Q1a-MEH2 среди 14 чувашей (в оригинале звучит как southern Ural Mountains region of Russia [Chuvash])
ID Population DYS456 DYS389I DYS390 DYS389II DYS458 DYS19 DYS385a DYS393 DYS391 DYS439 DYS635 DYS392 YGATAH4 DYS437 DYS438 DYS448
JK4068 southern Ural Mountains region of Russia [Chuvash] 17 13 25 30 15 16 11,14 13 10 10 23 11 12 14 11 20
JK4070 southern Ural Mountains region of Russia [Chuvash] 14 13 23 29 18 14 11,13 13 10 11 21 14 12 14 10 20
JK4072 southern Ural Mountains region of Russia [Chuvash] 14 14 23 31 17 14 11,13 14 11 10 21 14 12 14 10 19
JK4074 southern Ural Mountains region of Russia [Chuvash] 13 13 23 29 17 14 12,13 13 10 10 24 14 12 14 10 19
JK4075 southern Ural Mountains region of Russia [Chuvash] 15 13 23 32 16 13 15,18 13 10 13 22 14 11 13 11 19
JK4076 southern Ural Mountains region of Russia [Chuvash] 15 13 23 31 16 13 15,16 13 10 13 22 14 11 13 11 19
JK4079 southern Ural Mountains region of Russia [Chuvash] 15 13 23 32 16 13 15,16 13 10 13 22 14 11 13 11 19
JK4081 southern Ural Mountains region of Russia [Chuvash] 14 14 23 30 18 14 11,14 13 10 10 21 14 12 14 10 20
JK4085 southern Ural Mountains region of Russia [Chuvash] 15 13 24 30 16 13 16,19 13 10 12 22 13 13 14 10 20
JK4089 southern Ural Mountains region of Russia [Chuvash] 16 13 25 30 15 16 10,14 13 11 10 23 11 12 14 11 20
JK4090 southern Ural Mountains region of Russia [Chuvash] 15 13 22 30 15 14 13,17 13 11 13 23 13 11 15 10 20
JK4064 southern Ural Mountains region of Russia [Chuvash] 15 13 23 29 17 13 12,12 13 10 10 24 12 12 14 10 18
JK4066 southern Ural Mountains region of Russia [Chuvash] 15 13 23 30 15 17 12,16 12 10 11 23 11 11 15 9 21
JK4067 southern Ural Mountains region of Russia [Chuvash] 14 14 23 30 17 14 11,13 14 11 10 22 14 13 14 10 19

Кстати, даже при малой выборке 4/14=29% это уже существенно.
По предиктору к чувашским Q1a относятся JK4075, JK4076, JK4079, JK4085.

Самое интересное, что не смотря на мое ожидание увидеть Q-M25 (памятуя о Печникове и Мещерском), указанные гаплотипы более похожи на Q-L330.

UPD Вот ближайшее окружение по базе Семаргла, подтверждающее высказанный выше тезис
http://www.semargl.me/ru/dna/ydna/nearest-neighbors/65776/

JK4075, JK4076, JK4079: DYS437=13, -> L330+

Кстати, обратите внимание на нахождение в близком окружении калмыцких гаплотипов: Avademic sample #52 #65 Kalmyk Lutz Roewer et al (2006) Y-chromosomal STR haplotypes in Kalmyk population samples.
И вот этого знакомого Вам монгола: ~UNKNOWN[Mongolia]: 2 gen - Khaltar, b. Erdeneburen, Khovd, Mongolia - Jarantai, b. Erdeneburen, Khovd, Mongolia
Настало время перенести их всех в Q-L330?
Спасибо.
Жалко ненцев нет

Оффлайн G-Man

  • Сообщений: 608
  • Страна: ru
  • Рейтинг +539/-1
  • Y-ДНК: G-Z6702
Re: Q-L330 Siberian
« Ответ #101 : 20 Сентябрь 2014, 16:04:43 »
314848   Berberov (Turkey → Karachay)    L330+

Оффлайн ШадАвтор темы

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6333
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1292/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Re: Q-L330 Siberian
« Ответ #102 : 18 Октябрь 2014, 15:35:05 »
314848   Berberov (Turkey → Karachay)    L330+

M242+, L330+, L332-, M3-

Вот снипы уровня Q-L330
Цитировать
L330, L334, Y5233, Y5234, Y5235, Y5236, Y5237, Y5238, Y5239, Y5228, Y5229, Y5230, Y5231, Y5232, Y5240, Y5241, Y5242, Y5243, Y5244, Y5245, Y5246, Y5247, Y5248, Y5249, Y5250, Y5251, Y5252, Y5253, Y5254, Y5255, Y5256, Y5257, Y5258, Y5259, Y5260, Y5261, Y5262, Y5263, Y5264, Y5265, Y5266, Y5267, Y5268, Y5269, Y5270, Y5271, Y5272, Y5273, Y5274, Y5275, Y5276, Y5277, Y5278

Будем со временем делать панель в ФТДНА специально для Q-L330. Тогда можно будет сказать что-нибудь точнее.

Оффлайн ШадАвтор темы

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6333
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1292/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Re: Q-L330 Siberian
« Ответ #103 : 23 Ноябрь 2014, 00:52:35 »
Идентифицирована ветвь Q-YP1102 под Q-L330, параллельная Q-L332.
Она определяется снипами
YP1102  8550111
YP1103  15880973
YP1104  21489957

общими для образцов YF01841.152850 (Ru), HGDP01227 (Mongolia), 250597 (Kz).

Оффлайн ШадАвтор темы

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6333
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1292/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Re: Q-L330 Siberian
« Ответ #104 : 03 Декабрь 2014, 15:26:53 »
Идентифицирована ветвь Q-YP1102 под Q-L330, параллельная Q-L332.
Она определяется снипами
YP1102  8550111
YP1103  15880973
YP1104  21489957

общими для образцов YF01841.152850 (Ru), HGDP01227 (Mongolia), 250597 (Kz).

Новая ветвь Q-YP1102 появилась на дереве
http://yfull.com/tree/Q-L330/

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.