АвторТема: GEDmatch.Com - инструменты для популяционного анализа  (Прочитано 95341 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн Klochko

  • Сообщений: 40
  • Страна: ru
  • Рейтинг +8/-0
  • Y-ДНК: J2b
  • мтДНК: HV01a
Вопрос: если запустить Oracle на GEDMatch, то в результате все НЕ финно-угорские популяции (и НЕ северные русские) выданные калькулятором могут иметь отношение ТОЛЬКО к моей отцовско-дедовской линии??? 
Совсем не факт. Протестируйте отца или деда по отцу- это единственный надёжный способ.


Это, к сожалению, уже не возможно

Оффлайн Srkz

  • Сообщений: 6192
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2867/-2
  • Y-ДНК: N-L1025 Y60725
  • мтДНК: U4a1e-pre T16093C T16311T
Вопрос: если запустить Oracle на GEDMatch, то в результате все НЕ финно-угорские популяции (и НЕ северные русские) выданные калькулятором могут иметь отношение ТОЛЬКО к моей отцовско-дедовской линии??? 
Надо принимать во внимание только комбинации, где одной стороной выступают коми - допустим, 77% Komi + 23% Ukrainian-Center, 73% Komi + 27% Belarusian, в таком духе. Если с одно стороны неправильная популяция, то и с другой ожидается неправильная.
Цитировать
Второй вопрос: какой калькулятор запустить и что указать в строке: «Population substring to search»?
Попробуйте Eurogenes EUtest, JTest, K36. В MDLP обычно игнорируется "эффект калькулятора" (ЕМНИП за исключением K23b, его тоже можно попробовать).
« Последнее редактирование: 01 Февраль 2018, 12:39:27 от Srkz »

Оффлайн Klochko

  • Сообщений: 40
  • Страна: ru
  • Рейтинг +8/-0
  • Y-ДНК: J2b
  • мтДНК: HV01a
А что указать в строке population ?

Оффлайн Srkz

  • Сообщений: 6192
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2867/-2
  • Y-ДНК: N-L1025 Y60725
  • мтДНК: U4a1e-pre T16093C T16311T
А что указать в строке population ?
Это не нужно

Оффлайн Klochko

  • Сообщений: 40
  • Страна: ru
  • Рейтинг +8/-0
  • Y-ДНК: J2b
  • мтДНК: HV01a
Цитировать
Надо принимать во внимание только комбинации, где одной стороной выступают коми - допустим, 77% Komi + 23% Ukrainian-Center, 73% Komi + 27% Belarusian, в таком духе. Если с одно стороны неправильная популяция, то и с другой ожидается неправильная.

Спасибо. Eurogenes EUtest V2 K15 - коми вообще не выдает. Jtest дает:

#       Primary Population (source)   Secondary Population (source)   Distance
1       76.5%   Komi   +   23.5%   Northwest_Russian   @   4.27
2       61.4%   Komi   +   38.6%   North_Russian   @   4.28
3       54.6%   Komi   +   45.4%   Erzya   @   4.28
4       79.5%   Komi   +   20.5%   LIT   @   4.4
5       89.9%   Erzya   +   10.1%   Selkup   @   4.43
6       78.4%   Komi   +   21.6%   Belorussian   @   4.75
7       94.3%   Erzya   +   5.7%   Nganassan   @   4.82
8       76.5%   Komi   +   23.5%   Ukrainian-Russian   @   4.85
9       93%   Erzya   +   7%   Chukchi   @   4.85
10       93.3%   Erzya   +   6.7%   Koryak   @   4.87
11       62.7%   Komi   +   37.3%   East_Russian   @   4.91
12       77.3%   Komi   +   22.7%   West_Russian   @   5.07
13       80.3%   Komi   +   19.7%   UA   @   5.18
14       80.6%   Komi   +   19.4%   EE   @   5.26
15       87.7%   North_Russian   +   12.3%   Selkup   @   5.38
16       81.8%   Komi   +   18.2%   PL   @   5.42
17       79.2%   Udmurt   +   20.8%   LIT   @   5.45
18       60%   Udmurt   +   40%   North_Russian   @   5.53
19       76.9%   Udmurt   +   23.1%   Northwest_Russian   @   5.59
20       91.2%   North_Russian   +   8.8%   Chukchi   @   5.62

Подскажите, пжл, что значат цифры в конце каждой строки.
« Последнее редактирование: 08 Февраль 2018, 12:01:30 от пенелопа »

Оффлайн Srkz

  • Сообщений: 6192
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2867/-2
  • Y-ДНК: N-L1025 Y60725
  • мтДНК: U4a1e-pre T16093C T16311T
По этому калькулятору дед по отцу примерно беларус:
Цитировать
1       76.5%   Komi   +   23.5%   Northwest_Russian   @   4.27
4       79.5%   Komi   +   20.5%   LIT   @   4.4
6       78.4%   Komi   +   21.6%   Belorussian   @   4.75
8       76.5%   Komi   +   23.5%   Ukrainian-Russian   @   4.85
12       77.3%   Komi   +   22.7%   West_Russian   @   5.07
13       80.3%   Komi   +   19.7%   UA   @   5.18
14       80.6%   Komi   +   19.4%   EE   @   5.26

Оффлайн Stanislav S

  • Сообщений: 596
  • Страна: ru
  • Рейтинг +130/-4
  • Y-ДНК: R1a1a1b1a2b3
  • мтДНК: H3
По этому калькулятору дед по отцу примерно беларус:
Цитировать
1       76.5%   Komi   +   23.5%   Northwest_Russian   @   4.27
4       79.5%   Komi   +   20.5%   LIT   @   4.4
6       78.4%   Komi   +   21.6%   Belorussian   @   4.75
8       76.5%   Komi   +   23.5%   Ukrainian-Russian   @   4.85
12       77.3%   Komi   +   22.7%   West_Russian   @   5.07
13       80.3%   Komi   +   19.7%   UA   @   5.18
14       80.6%   Komi   +   19.4%   EE   @   5.26

Скорее из псковской, смоленской или тверской популяции.

Оффлайн Yaroslav

  • Я всего лишь уличный повеса, Улыбающийся встречным лицам
  • Сообщений: 15455
  • Страна: ru
  • Рейтинг +3359/-11
  • 76% East Europe + 17% Finland
  • Y-ДНК: J1a2b1a-ZS3114 > ZS3084 > Y39893 > ZS3067, ЖМ: I2a1a2b1a1a1a1-Z16971 > Y159653, МЖМ: G2a2b1a1a1a2b2a-FT40739
  • мтДНК: K1b1a1-T199C, МЖ: H13a1a1d
Подскажите, пожалуйста, что это за популяции в EUtest:

Ukrainian-Russian

EE

East_Russian

Где вообще можно глянуть, из каких регионов брали образцы для популяций этого калькулятора?

Оффлайн UA6ATG

  • Сообщений: 175
  • Страна: ru
  • Рейтинг +23/-1
  • Y-ДНК: J-M172
Кстати, я вот писал  про мобильное приложение http://forum.molgen.org/index.php/topic,6092.msg403160.html#msg403160
Очень удобно, кстати.  Получаешь PUSH уведомление о совпадениях и смотришь.  Если видишь, что пользователь по идее говорит по русски, пишешь письмо и спрашиваешь .  Куда удобнее, чем смотреть совпадения в FTDNA или на сайте того же Gedmath .

Оффлайн осколок империи

  • Сообщений: 594
  • Страна: aq
  • Рейтинг +103/-0
С помощью базы данных GED Match полиции США опять удалось поймать убийцу-насильника после 30-ти лет бузуспешного поиска:
https://www.gazeta.ru/science/2018/05/21_a_11758933.shtml

Оффлайн Feroce

  • Сообщений: 1486
  • Страна: ru
  • Рейтинг +420/-0
  • Потомок помещичьих крестьян Бессоновых(Безсоновых)
    • Бессоновы/Безсоновы
  • Y-ДНК: R1a-Z92 (YP569>>Y11268>>>>Y86309/FT74365)
  • мтДНК: мтДНК в ожидании
У gedmath нашлось мобильное приложение:

GEDmatch, Kirill Kudin
https://itunes.apple.com/ru/app/gedmatch/id1215112695?mt=8




А вопрос такой: как интерпретировать "total cM " и largest cM  в программе?
Полгода не заходил в приложение и сегодня обнаружил, что оно давно уже не обновляет совпадения и пропало из iTunes.
Может кто знаком с разработчиком приложения?

Оффлайн Станислава Терещенко

  • Сообщений: 6
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1/-0
Добрый день! У меня вопрос по поводу дистанций в Oracle и Оr4.  Насколько важно смотреть на дистанцию в различных калькуляторах? Например, в 3 калькуляторах мне выдаются довольно близкие и одинаковые названия и популяции, но самая ближайшие дистанции 5, 5,6,8,8,10 и тд тп.
То есть цифра изначально большая.
А на других калькуляторах самое близкое значение уже меньше, например 3 или 4, а в последнем калькуляторе  и самые дальние значение  ближе, чем в других калькуляторах первые.

Eurogenes EUtest
1 Southwest_Russian @ 6.464371
2 Estonian_Polish @ 7.435607
3 Ukrainian_Belgorod @ 7.441883
4 Kargopol_Russian @ 7.855106
5 Belorussian @ 7.979885
6 Erzya @ 8.210104
7 Russian_Smolensk @ 8.374781
8 Lithuanian @ 9.905124
9 Polish @ 11.475938
10 Ukrainian @ 12.687358

MDLP K23b
1 Russian-Upper-Volga_ @ 5.601648
2 Erzya_ @ 5.651031
3 Russian_Vologda_ @ 6.051419
4 Russian-North_ @ 6.228769
5 Russian_Meshtchyora_ @ 6.267435
6 Mordovian_ @ 6.591326
7 Russian_North_ @ 6.641616
8 Russian-West_ @ 7.419563
9 Finn_East_ @ 7.867873
10 Finnish_FIN_ @ 7.937615

Вот последние 2 калькулятора, тут все значения ближе, чем в парвых, значит ориентироваться на них? Первые калькуляторы мне не подходят?

MDLP World
1 Mordovian_V @ 3.954214
2 Ukrainian_V @ 5.097991
3 Ukrainian-Center @ 6.196055
4 Ukrainian-West @ 6.319921
5 Ukrainian-East @ 6.636633
6 Russian_cossack @ 6.644701
7 Russian_South @ 6.844413
8 Ukrainian @ 7.144650
9 Russian_V @ 7.579736

MDLP K16 Modern
1 Cossack_Kuban @ 3.795999
2 Russian_CentralRussia @ 4.228504
3 Russian_Tver @ 4.481949
4 Belarusian_Kobryn_Brest @ 4.498834
5 Russian_Kostroma @ 4.684186
6 Belarusian_East_EastBelarus @ 4.693571
7 Russian_CentralRussia @ 4.814293
8 Russian_SouthRussia @ 4.862890
9 Pole_Poland @ 5.004658
10 Russian_cossack_Kuban @ 5.062016
11 Ukrainians_east_EastUkraine @ 5.279266
12 Ukrainians_north_NorthUkraine @ 5.397770
13 Belarusian_Belarus @ 5.458704
14 Finn_WestFinland @ 5.798429
15 Ukrainian_Ukraine @ 5.808726
16 Erzya_Moksha_Mordovia @ 5.907428
17 Pole_Wroclaw @ 5.947031
18 Pole_WestPoland @ 6.199608
19 Belarusian_West_WestBelarus @ 6.215925
20 Ingrians_Ingermanland @ 6.484031

С этим вопрос. Дистанции важно учитывать независимо от калькулятора, например все дистанции во всех калькуляторах в пределах значения 5 к вам близки? Или в каждом калькуляторе важны не значения дистанции, а порядковый номер, ну допустим 1 десять популяций к вам близки?
Заранее большое спасибо за ответ!

Оффлайн Srkz

  • Сообщений: 6192
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2867/-2
  • Y-ДНК: N-L1025 Y60725
  • мтДНК: U4a1e-pre T16093C T16311T
Дистанции важно учитывать независимо от калькулятора, например все дистанции во всех калькуляторах в пределах значения 5 к вам близки? Или в каждом калькуляторе важны не значения дистанции, а порядковый номер, ну допустим 1 десять популяций к вам близки?
Заранее большое спасибо за ответ!
Скорее второе. Вы ещё попробуйте сделать К36 и закинуть в тему с оракулами

Оффлайн Эллен

  • Сообщений: 30
  • Страна: ru
  • Рейтинг +0/-0
Добрый вечер!
Залила результаты аутосомного теста на Майхеритаж на Гедматч, кит DB5785495. Мама - северная русская, отец - узбек (таджик?), а по легенде - даже с арабскими корнями из селения Сайрам (в Казахстане, но не казахского, два часа от Ташкента). Так как по тем краям совпаденцев почти нет, сконцентрировалась на Оракулах. Из просмотренных все показывают далекие расстояния. И вдруг - Гедросия К-3, просто настолько идеально, что подозрительно. Вот так:

Least-squares method.

Using 1 population approximation:
1 Tajik @ 1.716648
2 Sindhi @ 2.601123
3 Pathan @ 3.128019
4 Pashtun_Afghan @ 4.424450
5 GujaratiA @ 4.473433
6 Kurd_SE @ 4.675029
7 Kshatriya @ 4.878806
8 Kalash @ 5.839139
9 Kashmiri_Pandit @ 6.002068
10 Uzbek_Afghan @ 6.189687
Потом так:
Using 2 populations approximation:
1 50% Finnish +50% Hazara_Afghan @ 0.000000
2 50% Hazara_Afghan +50% Mordovian @ 0.000000
3 50% Hazara_Afghan +50% Russian @ 0.000000
4 50% Kalash +50% Kashmiri_Pandit @ 0.000000
5 50% Kalash +50% Uzbek_Afghan @ 0.000000
6 50% Belarusian +50% Bengali @ 0.561672
7 50% Tajik_Pomiri +50% UP_Brahmin @ 0.574230
8 50% Adygei +50% Uzbek @ 0.577412
9 50% Burusho +50% Tajik_Pomiri @ 0.581835
10 50% Bengali +50% Estonian @ 0.710505
и вдруг вот так:
Using 3 populations approximation:
1 50% Abkhasian +25% Altaian +25% Kalash @ 0.000000
Подскажите, не глюк ли эти нули? Можно ли ориентирвоаться на этот оракул? Или стоит все же попробовать что-то другое? (Абхазия откуда в третьем - не понимаю). Арабов нет, значит про арабов легенда. Но, возможно, все же какие-то пришлые в них трансформировались...

Оффлайн Ankor

  • Сообщений: 349
  • Страна: ru
  • Рейтинг +175/-0
Добрый вечер!
Залила результаты аутосомного теста на Майхеритаж на Гедматч, кит DB5785495. Мама - северная русская, отец - узбек (таджик?), а по легенде - даже с арабскими корнями из селения Сайрам (в Казахстане, но не казахского, два часа от Ташкента). Так как по тем краям совпаденцев почти нет, сконцентрировалась на Оракулах. Из просмотренных все показывают далекие расстояния. И вдруг - Гедросия К-3, просто настолько идеально, что подозрительно. Вот так:

Least-squares method.

Using 1 population approximation:
1 Tajik @ 1.716648
2 Sindhi @ 2.601123
3 Pathan @ 3.128019
4 Pashtun_Afghan @ 4.424450
5 GujaratiA @ 4.473433
6 Kurd_SE @ 4.675029
7 Kshatriya @ 4.878806
8 Kalash @ 5.839139
9 Kashmiri_Pandit @ 6.002068
10 Uzbek_Afghan @ 6.189687
Потом так:
Using 2 populations approximation:
1 50% Finnish +50% Hazara_Afghan @ 0.000000
2 50% Hazara_Afghan +50% Mordovian @ 0.000000
3 50% Hazara_Afghan +50% Russian @ 0.000000
4 50% Kalash +50% Kashmiri_Pandit @ 0.000000
5 50% Kalash +50% Uzbek_Afghan @ 0.000000
6 50% Belarusian +50% Bengali @ 0.561672
7 50% Tajik_Pomiri +50% UP_Brahmin @ 0.574230
8 50% Adygei +50% Uzbek @ 0.577412
9 50% Burusho +50% Tajik_Pomiri @ 0.581835
10 50% Bengali +50% Estonian @ 0.710505
и вдруг вот так:
Using 3 populations approximation:
1 50% Abkhasian +25% Altaian +25% Kalash @ 0.000000
Подскажите, не глюк ли эти нули? Можно ли ориентирвоаться на этот оракул? Или стоит все же попробовать что-то другое? (Абхазия откуда в третьем - не понимаю). Арабов нет, значит про арабов легенда. Но, возможно, все же какие-то пришлые в них трансформировались...
Этот вопрос уже поднимался: у это калькулятора всего три компонента, отсюда и нулевые дистанции

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100