GEDmatch.Com - инструменты для популяционного анализа

[UA6ATG]

У gedmath нашлось мобильное приложение:

GEDmatch, Kirill Kudin
https://itunes.apple.com/ru/app/gedmatch/id1215112695?mt=8




А вопрос такой: как интерпретировать "total cM " и largest cM  в программе? 

[FELIX]

У gedmath нашлось мобильное приложение:

GEDmatch, Kirill Kudin
https://itunes.apple.com/ru/app/gedmatch/id1215112695?mt=8




А вопрос такой: как интерпретировать "total cM " и largest cM  в программе?

Общее количество сегментов и размер самого крупного.

[gecube_ru]

У gedmath нашлось мобильное приложение:

GEDmatch, Kirill Kudin
https://itunes.apple.com/ru/app/gedmatch/id1215112695?mt=8




А вопрос такой: как интерпретировать "total cM " и largest cM  в программе?

К сожалению, приложение только под айфоны. В play market аналогичной утилиты нет.

[MaximN88]

Подскажите пожалуйста, чем у Веренича в K16 Modern отличаются Ukrainian (Ukraine) от Ukrainians_west (WestUkraine), Ukrainians_north (NorthUkraine), Ukrainians_east (EastUkraine)?

А то у меня встречаются все эти разновидности, но ближе всего обычные Ukrainian. Была мысль что это нечто среднее от всех остальных. Может кто-то пояснить? Кстати это не только Украинцев касается, но также и Польши и Белоруссии.

MDLP K16 Modern Oracle results:
MDLP K16 2xOracle and OracleX4

Kit T482725

Admix Results (sorted):

#   Population   Percent
1    NorthEastEuropean    31.97
2    Caucasian    23.5
3    Neolithic    22.83
4    Steppe    19.81
5    Arctic    1.21
6    Siberian    0.68

Single Population Sharing:

#   Population (source)   Distance
1    Ukrainian (Ukraine)    2.84
2    Pole (WestPoland)    3.02
3    Pole (Wroclaw)    3.39
4    Pole (EastPoland)    3.43
5    Sorb (Lusatia)    3.84
6    Slovak (Slovakia)    3.89
7    Ukrainians_west (WestUkraine)    3.92
8    Ukrainians_north (NorthUkraine)    3.93
9    Pole (Poland)    4.15
10    Belarusian (Belarus)    4.18
11    Russian (SouthRussia)    4.19
12    Hungarian (Hungary)    4.21
13    Belarusian_West (WestBelarus)    4.25
14    Russian (CentralRussia)    4.36
15    Belarusian (Kobryn_Brest)    4.43
16    Ukrainians_east (EastUkraine)    4.61
17    Belarusian_East (EastBelarus)    4.74
18    Hungarian (Budapest)    4.76
19    Russian_cossack (Kuban)    5
20    Belarusian (Zhytkavichy_Homel)    5.2

[penzel]

Вроде как все логично, так обозначены регионы, откуда производилась выборка образцов.

Еast_Ukraine наверняка Харьков и Слобожанщина
Belarus (Kobryn_Brest) здесь уже точне указано, что из городка Кобрин в Брестской области

Или вопрос в другом?)

[MaximN88]

про east west north понятно. Не понятно что такое просто Ukrainian. Это еще какой то регион Украины (например центр) или это что-то среднее между east-west-north Ukrainian, то есть вся Украина в целом?

[Srkz]

Просто другая научная выборка без детальной информации

[MaximN88]

И какая тогда из этих выборок более полноценная? Если выборка Ukrainian неполноценная, и выборки с приписками north-east-west более точные, то я тогда ближе к Pole (WestPoland)    3.02

[Srkz]

Ну можно заподозрить, что в ней какой-то источник неточностей, раз от остальных отклоняется.

[nataliamednik]

здравствуйте у меня вопрос у меня на gedmatch несколько матчей данные такие
total cm    largest cm
85.5          31
84.9          16.8
77.3          10.6
77.2          17.6
мне интересно насколько параметры являются близкими можно ли найти общих предков с этими матчес

[niksoft1]

здравствуйте у меня вопрос у меня на gedmatch несколько матчей данные такие
total cm    largest cm
85.5          31
84.9          16.8
77.3          10.6
77.2          17.6
мне интересно насколько параметры являются близкими можно ли найти общих предков с этими матчес

1. Если эти данные показаны в списке one-to-many, рекомендую кликнуть на букве А и сравнить индивидуально. Часто результаты более скептические.
Но в целом это высокий уровень совпадения, думаю, не больше 200 лет до общего предка.

[nataliamednik]

это первый матч
Largest segment = 34.0 cM
Total of segments > 7 cM = 52.1 cM
2 matching segments
Estimated number of generations to MRCA = 4.1
2
673853 SNPs used for this comparison.
Largest segment = 16.8 cM
Total of segments > 7 cM = 37.2 cM
3 matching segments
Estimated number of generations to MRCA = 4.3

673663 SNPs used for this comparison.
3
Largest segment = 10.6 cM
Total of segments > 7 cM = 34.0 cM
4 matching segments
Estimated number of generations to MRCA = 4.4

658153 SNPs used for this comparison.

[FELIX]

это первый матч
Largest segment = 34.0 cM
Total of segments > 7 cM = 52.1 cM
2 matching segments
Estimated number of generations to MRCA = 4.1
2
673853 SNPs used for this comparison.
Largest segment = 16.8 cM
Total of segments > 7 cM = 37.2 cM
3 matching segments
Estimated number of generations to MRCA = 4.3

673663 SNPs used for this comparison.
3
Largest segment = 10.6 cM
Total of segments > 7 cM = 34.0 cM
4 matching segments
Estimated number of generations to MRCA = 4.4

658153 SNPs used for this comparison.

Здравствуйте!

посмотрите FAQ по аутосомам: http://forum.molgen.org/index.php/topic,8868.0.html

там есть ряд ценных рекомендаций. особенно про составные сегменты.
по своему опыту добавлю, что шансы найти родство при Ваших исходных ничтожно малы.

[Klochko]

Здравствуйте. У меня вопрос к экспертам.
Из четырех моих дедушек-бабушек трое – коми-зыряне с хорошо проработанной генеалогией до рубежа 16-17 веков. Жесткий изолят. Настолько, что многие персоны генеалогического дерева 17-18 веков одновременно являются моими предками и с материнской стороны, и со стороны бабушки отца. Все, включая боковые ветви, сысольские и удорские коми.
А вот дед по отцу родом из Припяти. Генеалогия проработана до середины 18 века. Гаплогруппа J2b. Украинско- польский кластер на Yfull https://yfull.com/tree/J-Y29718/    Z – 1043, которой относится кластер, редкая для всех мест ветвь J2B с противоречивой дискуссией о ее происхождение. 
Вопрос: если запустить Oracle на GEDMatch, то в результате все НЕ финно-угорские популяции (и НЕ северные русские) выданные калькулятором могут иметь отношение ТОЛЬКО к моей отцовско-дедовской линии??? 
Второй вопрос: какой калькулятор запустить и что указать в строке: «Population substring to search»?

[Eugene]

Вопрос: если запустить Oracle на GEDMatch, то в результате все НЕ финно-угорские популяции (и НЕ северные русские) выданные калькулятором могут иметь отношение ТОЛЬКО к моей отцовско-дедовской линии??? 

Совсем не факт. Протестируйте отца или деда по отцу- это единственный надёжный способ.