GEDmatch.Com - инструменты для популяционного анализа

[Andrey_CH]

Доброго времени суток, уважаемые форумчане. Помогите пожалуйста разобраться с результатами теста.
Генотек выдал результат как  "74% народы Волго-Уральского региона + 20%  Русские и 6% Центральная Азия"  а калькуляторMDLP World-22  показывает:

Admix Results (sorted):

#   Population   Percent
1   North-East-European   41.02
2   West-Asian   14.23
3   Samoedic   12.51
4   Atlantic_Mediterranean_Neolithic   8.91
5   North-European-Mesolithic   6.71
6   North-Siberean   4.67
7   East-Siberean   4.34
8   Paleo-Siberian   2.04
9   Mesoamerican   1.80

Least-squares method.

Using 1 population approximation:
1 Tatar_derived @ 7.615104
2 Chuvash_derived @ 10.680416
3 Tartar_Mishar_derived @ 13.150662
4 Tatar_Kryashen_derived @ 14.238965
5 Komi_derived @ 15.037478
6 Tatar_Lithuania_derived @ 17.702568
7 Mari_derived @ 19.131876
8 Udmurd_derived @ 19.480169
9 Aleut_derived @ 21.800404
10 Mansi_derived @ 22.040323
11 Bashkir_derived @ 23.734610
12 Mordovian_derived @ 25.322279
13 Latvian_V_derived @ 25.446491
14 Mordovian_V_derived @ 25.479959
15 German_derived @ 26.502108
16 Russian_North_derived @ 27.413143
17 Bosnian_derived @ 27.530972
18 Hungarian_derived @ 28.076477
19 Croatian_V_derived @ 28.242302
20 Croatian_derived @ 28.546915

Using 2 populations approximation:
1 50% Tatar_derived +50% Tatar_derived @ 7.615104

Using 3 populations approximation:
1 50% Chuvash_derived +25% Komi_derived +25% Nogai_derived @ 4.517205

Using 4 populations approximation:
++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++
1 Inkeri_derived + Lithuanian_derived + Selkup_derived + Tabassaran_derived @ 3.794411
2 Finnish_derived + Lithuanian_derived + Selkup_derived + Tabassaran_derived @ 3.852593
3 Lithuanian_derived + NorthOssetian_derived + Selkup_derived + Vepsa_derived @ 3.898304
4 Lithuanian_derived + Ossetian_derived + Selkup_derived + Vepsa_derived @ 3.900860
5 Inkeri_derived + Latvian_derived + Selkup_derived + Tabassaran_derived @ 3.916490
6 Inkeri_derived + Lak_derived + Lithuanian_derived + Selkup_derived @ 3.929282
7 Estonian_derived + Kabardinian_derived + Mari_derived + Mari_derived @ 3.972237
8 Inkeri_derived + Lezgin_derived + Lithuanian_derived + Selkup_derived @ 3.998422
9 Finnish_derived + Lak_derived + Lithuanian_derived + Selkup_derived @ 4.011279
10 Kabardinian_derived + Lithuanian_derived + Selkup_derived + Vepsa_derived @ 4.015525
11 Avar_derived + Finnish_derived + Lithuanian_derived + Selkup_derived @ 4.034503
12 Belarusian_derived + Inkeri_derived + Selkup_derived + Tabassaran_derived @ 4.048456
13 Chuvash_derived + Nogai_derived + Russian_North_derived + Udmurd_derived @ 4.056321
14 Karelian_derived + Lithuanian_derived + Selkup_derived + Tabassaran_derived @ 4.056540
15 Finnish_derived + Lezgin_derived + Lithuanian_derived + Selkup_derived @ 4.075364
16 Lithuanian_V_derived + Selkup_derived + Tabassaran_derived + Vepsa_derived @ 4.076100
17 Finnish_derived + Latvian_derived + Selkup_derived + Tabassaran_derived @ 4.076707
18 Belarusian_derived + Karelian_derived + Selkup_derived + Tabassaran_derived @ 4.077308
19 Balkarian_derived + Chuvash_derived + Mari_derived + Russian_North_derived @ 4.079638
20 Avar_derived + Inkeri_derived + Lithuanian_derived + Selkup_derived @ 4.084445
----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
Не могу понять откуда такое минимальное приближение к татарам. По отцовской линии дед считал себя марийцем, возможно ошибочно. Или так притянул дед по матери, с туркменским происхождением? И большинство калькуляторов тоже показывают либо татар, либо чувашей. В некоторых попадаются коми, что вполне может быть - по матери бабушка из Коми-Пермяцкого округа. И совершенно не понимаю откуда такой процент сибирского компонента..

[gecube_ru]

а на самом деле у вас что? Я бы порекомендовал не пожмотиться и купить отчет у FamilioDNA, как наиболее точный.

[Andrey_CH]

Базовый отчет Familio DNA показал то же самое - основная предковая группа это татары, плюс дополнительная - саамы. Уж откуда они взяли саамов, ума не приложу.

[gecube_ru]

Пригласите @Srkz в тред

[Srkz]

Ну откуда в калькуляторах лезут казанские татары, в целом понятно - они тоже примерно на четверть носители "марийского" компонента, плюс степь и Южная Сибирь, плюс Восточная Европа. Это довольно похоже на описанное происхождение, где есть марийцы, туркмены (степь), что-то северное/приуральское (русские? коми?) и какая-то неописанная часть (наверное, тоже восточноевропейская). Но вообще, отчёт Фамилио всё-таки должен отличать людей с марийской примесью от настоящих татар. Однако, видимо, в данном случае смесь оказалась для него слишком сложной

[dmitkac]

Здравствуйте. У меня конкретный и очень простой вопрос   Какой калькулятор (или калькуляторы) больше подходит восточно-европейцам с миксом западных (видимо Польша) и восточных (в основном Украина) славян и, возможно, балтов?

[andronn]

Здравствуйте. У меня конкретный и очень простой вопрос   Какой калькулятор (или калькуляторы) больше подходит восточно-европейцам с миксом западных (видимо Польша) и восточных (в основном Украина) славян и, возможно, балтов?

  MDLP World-22, MDLP World, Eurogenes K13, Eurogenes EUtest V2 K15. Эти самые ходовые, более менее для восточноевропейца.

[dmitkac]

Здравствуйте. У меня конкретный и очень простой вопрос   Какой калькулятор (или калькуляторы) больше подходит восточно-европейцам с миксом западных (видимо Польша) и восточных (в основном Украина) славян и, возможно, балтов?

  MDLP World-22, MDLP World, Eurogenes K13, Eurogenes EUtest V2 K15. Эти самые ходовые, более менее для восточноевропейца.

Спасибо!
Кстати, заметил, что в некоторых калькуляторах указано, что данные для Оракулов используются от 2012 года. Это нормально? 10 лет все-таки прошло...
EUtest Oracle population reference data revised 06 Nov 2012.

[Penny]

Добрый день. Подскажите при сравнении с древними образцами с ограничением 5 См, там реально древних родственников показывает? Показал мне денисовца . Не думала, что он у меня есть, но этого стоило ожидать из-за сибирских генов. Еще много с Британских островов - из Англии и Ирландии, причем много средневековых. Можно ли делать вывод о давнем предке с Британских островов?
Насчет денисовца я поторопилась. Просто написано денисовская пещера, не подписано, что за образец. Там вроде куча всяких была.

[gecube_ru]

генов. Еще много с Британских островов - из Англии и Ирландии, причем много средневековых. Можно ли делать вывод о давнем предке с Британских островов?

Преждевременные и необоснованные выводы

[Penny]

генов. Еще много с Британских островов - из Англии и Ирландии, причем много средневековых. Можно ли делать вывод о давнем предке с Британских островов?

Преждевременные и необоснованные выводы

Согласна, что преждевременные. Но мне кажется показывает родство все же, а из-за того, что там и римские англичане и англосаксонцы в большом количестве, и древние британцы, уже вывод можно делать о какой-то привзке к островам.
Нужно срочно добывать документы на деда по маме. Мне кажется вся связь с Западной Европой может быть только через него.

Выдает родство также с татарским захоронением совсем свежим - 290 лет. Поволжские степи. Почитаю потом.

[Навля]

Доброго всем!
Подскажите... есть 40 аутосомных результатов, все друг другу родня с показателями от 100 сМ и совпадениями по Х
..... есть какая либо программа, если даже не в Гедматч, которая могла бы составить древо (типа генеалогического) и расставить по местам родства 40 тестов, в идеале с расчетом времени жизни общего предка?

по Y есть, когда же по аутосомам изобретут ((((

[Penny]

Добрый день. Подскажите при сравнении с древними образцами с ограничением 5 См, там реально древних родственников показывает? Показал мне денисовца . Не думала, что он у меня есть, но этого стоило ожидать из-за сибирских генов. Еще много с Британских островов - из Англии и Ирландии, причем много средневековых. Можно ли делать вывод о давнем предке с Британских островов?
Насчет денисовца я поторопилась. Просто написано денисовская пещера, не подписано, что за образец. Там вроде куча всяких была.

Там я перепутала. При 5 См только два выявляются. И все более-менее стандартно, как у других, при меньших. Неандертальцы некоторые даже при 0.5 не родственны . И Iceman не родсвеннен никак. Почему так, чем он так примечателен.

[gecube_ru]

..... есть какая либо программа, если даже не в Гедматч, которая могла бы составить древо (типа генеалогического) и расставить по местам родства 40 тестов, в идеале с расчетом времени жизни общего предка?

нет такой, но было бы круто

[Farroukh]

с расчетом времени жизни общего предка?

Могу предложить эмпирическую формулу, справедливую для схождений свыше 50 сМ , т. е. уровень пра(3)дедов и ближе.