АвторТема: Определение SNP мутации в Geno 2.0  (Прочитано 11824 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн Semargl

  • "El sueño de la razón produce monstruos" ©
  • Сообщений: 5494
  • Страна: hr
  • Рейтинг +2965/-5
  • www.semargl.me
    • www.semargl.me
  • Y-ДНК: R1a [CTS3402+]
  • мтДНК: U4a2g
Re: Определение SNP мутации в Geno 2.0
« Ответ #60 : 26 Август 2013, 09:06:05 »
Цитировать
После долгих писем наконец-то ответили, что в FTDNA обещали посмотреть, что ни так...
Отправил им как пример таблицу сравнения "Geno 2.0 Raw Data" с их интерпретаций со 103-мя ошибками интерпретации

Странно , чего это специалисты форумные молчат  ::)
Ни одного комментария ситуации  :)
Выше, эта ситуация была прокомментирована неоднократно. Смысла повторяться не вижу.

Оффлайн Semargl

  • "El sueño de la razón produce monstruos" ©
  • Сообщений: 5494
  • Страна: hr
  • Рейтинг +2965/-5
  • www.semargl.me
    • www.semargl.me
  • Y-ДНК: R1a [CTS3402+]
  • мтДНК: U4a2g
Re: Определение SNP мутации в Geno 2.0
« Ответ #61 : 26 Август 2013, 09:12:54 »
Господа, здесь научно-популярный форум.
Просьба воздерживаться от религиозных тем, для этого есть другие площадки, на любой, самый притязательный вкус.

Оффлайн Ставр

  • Сообщений: 121
  • Страна: ru
  • Рейтинг +22/-0
  • Y-ДНК: R1a-Volga-Carpathian
  • мтДНК: H1
Re: Определение SNP мутации в Geno 2.0
« Ответ #62 : 26 Август 2013, 10:05:23 »
Господа, здесь научно-популярный форум.
Просьба воздерживаться от религиозных тем, для этого есть другие площадки, на любой, самый притязательный вкус.

Выражение "религиозная бурда" невольно мобилизует чувства верующих. Чтобы не происходил всплеск религиозных дискуссий не надо их такими неосторожными словами разжигать. Даже придерживаясь атеистических взглядов, можно выразиться менее эмоционально и более корректно.

Оффлайн Farroukh

  • Maternal Y-DNA: R1b-L584
  • ...
  • Сообщений: 12850
  • Страна: az
  • Рейтинг +2897/-15
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37518
  • мтДНК: F2f
Re: Определение SNP мутации в Geno 2.0
« Ответ #63 : 26 Август 2013, 18:46:44 »
Цитировать
Выражение "религиозная бурда" невольно мобилизует чувства верующих. Чтобы не происходил всплеск религиозных дискуссий не надо их такими неосторожными словами разжигать. Даже придерживаясь атеистических взглядов, можно выразиться менее эмоционально и более корректно.
Согласен, приношу свои извинения всем, кто счёл себя оскорблённым.

Оффлайн MigifbugАвтор темы

  • Сообщений: 395
  • Страна: kz
  • Рейтинг +49/-0
  • Y-ДНК: С-F1756, F3830+
  • мтДНК: H7d
Re: Определение SNP мутации в Geno 2.0
« Ответ #64 : 30 Август 2013, 05:12:08 »
Выложил сюда таблицу: https://www.dropbox.com/s/ezo5t577bquoc3b/RawDataSNPs.xlsx
В таблице красным цветом отмечены 103 ошибки интерпретации Geno 2.0 Raw Data трансфера в FTDNA + бордовые на голубом фоне 102 не ясные ошибки (не считали делеции за мутации)...
Считаю, что FTDNA просто обязаны удалить данные трансфера Geno 2.0 из своей базы пока не согласуют методику интерпретации результатов и только после этого начать делать трансфер...
После долгих писем в FTDNA наконец-то исправили ошибки интерпретации Сосновскому: http://www.familytreedna.com/public/Chaplogroup/default.aspx?section=ysnp

Оффлайн MigifbugАвтор темы

  • Сообщений: 395
  • Страна: kz
  • Рейтинг +49/-0
  • Y-ДНК: С-F1756, F3830+
  • мтДНК: H7d
Re: Определение SNP мутации в Geno 2.0
« Ответ #65 : 04 Сентябрь 2013, 09:33:54 »
Выложил сюда таблицу: https://www.dropbox.com/s/ezo5t577bquoc3b/RawDataSNPs.xlsx
В таблице красным цветом отмечены 103 ошибки интерпретации Geno 2.0 Raw Data трансфера в FTDNA + бордовые на голубом фоне 102 не ясные ошибки (не считали делеции за мутации)...
Считаю, что FTDNA просто обязаны удалить данные трансфера Geno 2.0 из своей базы пока не согласуют методику интерпретации результатов и только после этого начать делать трансфер...
После долгих писем в FTDNA наконец-то исправили ошибки интерпретации Сосновскому: http://www.familytreedna.com/public/Chaplogroup/default.aspx?section=ysnp
Обещали исправить ошибки интерпретации трансфера и у нескольких других людей гаплогруппы C...

Оффлайн Evg33

  • Сообщений: 404
  • Страна: ru
  • Рейтинг +27/-0
  • FTDNA: 312482
    • RusNavi
  • Y-ДНК: R-KMS132+ (Z93+,Z94-,KMS149+)
  • мтДНК: H11a1
Re: Определение SNP мутации в Geno 2.0
« Ответ #66 : 15 Январь 2014, 09:15:08 »
Так появился какой софт или сайты, где можно на автомате проанализировать свои Geno2 RAW DATA  ?

Оффлайн Yurgan

  • Кто везёт, тому везёт
  • ...
  • Сообщений: 8730
  • Страна: gt
  • Рейтинг +742/-7
  • Потомок кузнеца Ильмаринена
    • Сибирский родословец
Re: Определение SNP мутации в Geno 2.0
« Ответ #67 : 15 Январь 2014, 10:05:23 »
Так появился какой софт или сайты, где можно на автомате проанализировать свои Geno2 RAW DATA  ?
А Вы уже получили свои данные?

Оффлайн I2a1a

  • ...
  • Сообщений: 10574
  • Страна: ee
  • Рейтинг +757/-8
Re: Определение SNP мутации в Geno 2.0
« Ответ #68 : 15 Январь 2014, 10:13:53 »
Так появился какой софт или сайты, где можно на автомате проанализировать свои Geno2 RAW DATA  ?

Такого софта много.

Оффлайн Evg33

  • Сообщений: 404
  • Страна: ru
  • Рейтинг +27/-0
  • FTDNA: 312482
    • RusNavi
  • Y-ДНК: R-KMS132+ (Z93+,Z94-,KMS149+)
  • мтДНК: H11a1
Re: Определение SNP мутации в Geno 2.0
« Ответ #69 : 15 Январь 2014, 10:20:18 »
А Вы уже получили свои данные?
Да. Сегодня утром появились.

Оффлайн Andymeon

  • Сообщений: 1153
  • Страна: ru
  • Рейтинг +113/-4
  • Y-ДНК: R1a [CTS 3402+ Y2910+ YP310+]
  • мтДНК: H3i
Re: Определение SNP мутации в Geno 2.0
« Ответ #70 : 15 Январь 2014, 10:43:43 »
Цитировать
Да. Сегодня утром появились.
Там кроме терминального снипа особо анализировать нечего  :)

Оффлайн Людмила

  • Сообщений: 1034
  • Рейтинг +148/-1
Re: Определение SNP мутации в Geno 2.0
« Ответ #71 : 15 Январь 2014, 20:33:33 »
Andymeon
Цитировать
Там кроме терминального снипа особо анализировать нечего  :)
На самом деле не так. Мы в своей ветви J2a L24-25 ждем каждый новый результат GENO2.0. Кроме терминальных снипов определены снипы разных субкладов. Благодаря этому тесту стала понятна структура нашей ветви. Гаплотипы, которые не известно куда было относить, нашли свое место, какие-то субклады объединились вышестоящими общими снипами, которые никто и предсказать не мог. Абсолютно новое видение ветви L24-25 после GENO2.0
Даю ссылку, не сочтите за нескромность, мой вклад минимальный - рисунок, весь анализ ведет наш неутомимый администратор проекта J2a L24-25 - Al Aburto.
http://forum.molgen.org/index.php/topic,2609.45.html

Оффлайн Andymeon

  • Сообщений: 1153
  • Страна: ru
  • Рейтинг +113/-4
  • Y-ДНК: R1a [CTS 3402+ Y2910+ YP310+]
  • мтДНК: H3i
Re: Определение SNP мутации в Geno 2.0
« Ответ #72 : 15 Январь 2014, 23:42:59 »
Людмила, я начал тестирование с гено и мне он по прежнему нравится  :)
Все его плюсы мне известны и за вашими успехами я тоже слежу  :)
Я имел ввиду, что во-первых, биг игрек появился и хотя мы еще не знаем чего он себя представляет, я уверен что он внесет куда больший вклад чем гено (потом наверно и гено 3 появится)
Во-вторых мое поверхностное мнение - уже наверно все более менее крупные ветки обзавелись всеми возможными снипами из гено и нужно как то расширять возможности в виде полных секвенсов или  биг игреков  :)
Извините за невнятный слог, пишу почти на ходу..

Оффлайн Людмила

  • Сообщений: 1034
  • Рейтинг +148/-1
Re: Определение SNP мутации в Geno 2.0
« Ответ #73 : 16 Январь 2014, 07:45:11 »
Andymeon Понятно. С тем, что от биг У ожидаем большего - не спорю. Но GENO2.0 отрабатывает себя. Буквально за прошедшую ночь в нашей группе еще 1 рез-т - похоже, разделились снипы подгруппы самого Абурто (N14560). L264 наверно теперь 1ый из известных снипов, определяющих ветвь, за ним L229. Протестировался 304753, оказался только L264+. Эти 2 кита отличаются 39 из111 маркеров.

Оффлайн Людмила

  • Сообщений: 1034
  • Рейтинг +148/-1
Re: Определение SNP мутации в Geno 2.0
« Ответ #74 : 16 Январь 2014, 22:09:54 »
Цитировать
L264 наверно теперь 1ый из известных снипов
...
внесла правку в разделе Коррекция дерева J2a.

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100