Степанов В.А.

[Centurion]

Степанов В.А.
доктор биологических наук



ГУ НИИ медицинской генетики ТНЦ СО РАМН - ЛАБОРАТОРИЯ ЭВОЛЮЦИОННОЙ ГЕНЕТИКИ

Основное направление работы лаборатории - этногеномика и анализ разнообразия генома в популяциях человека.
Исследования лаборатории посвящены изучению закономерностей эволюционного развития этносов, проживающих на территории Северной Евразии с помощью точных молекулярно-генетических тестов, а также исследованию эволюционных основ распространения мультифакториальных заболеваний
Свои научные исследования в 2000 году лаборатория начала с изучения молекулярной этногенетики населения Сибири и Средней Азии. Дальнейшая работа продолжается в русле исследования неравновесия по сцеплению в различных участках человеческого генома, связанных с мультифакториальными болезнями.
За короткий период существования лаборатории были выявлены закономерности эволюции мужских линий (гаплотипов Y-хромосомы) у населения Евразии, впервые проведен детальный филогеографический анализ распределения мужских линий в популяциях Старого Света.
Лаборатория, наряду с другими подразделениями института, постоянно участвует в экспедиционных поездках по Сибири и Дальнему Востоку с целью накопления образцов крови коренных этносов и пополнения банка ДНК института.
Методический арсенал лаборатории включает широкий спектр современных генетических технологий, включая секвенирование, мультилокусное генотипирование микросателлитов с помощью капиллярного гель-электрофореза, ПЦР-ПДРФ анализ, аллель-специфическую амплификацию, олигонуклеотид-лигазный анализ. Исследование структуры и эволюции генофондов проводятся с помощью различных систем генетических маркеров: мобильных генетических элементов Alu, аутосомных микросателлитов, компаундных гаплотипов Y-хромосомы.
В лаборатории постоянно проходят практику и проводят дипломные и диссертационные исследования студенты и аспиранты Томского государственного университета и Сибирского медицинского института.
Лаборатория поддерживает тесные контакты и участвует в совместных исследованиях с различными научными учреждениями: Университет Западной Австралии и госпиталь принцессы Маргарет (Перт, Австралия), Центр генома человека, Универсимтет Хельсинки (Финляндия), Институт общей генетики %

[Grigoriev]

Genetic variability of 15 autosomal STR loci in Russian populations

Vadim A. Stepanov, Alexander V. Melnikov, Andrey Yu. Lash-Zavada, Vladimir N. Kharkov, Svetlana A. Borinskaya, Tatiana V. Tyazhelova, Olga V. Zhukova, Yuri V. Schneider, Irina N. Shil’nikova, Valery P. Puzyrev, Anna A. Rybakova and Nikolai K. Yankovsky

AbstractAllele frequencies for 15 STRs (CSF1PO,  D3S1358, D5S818, D7S820, D8S1179, D13S317, D16S539, D18S51, D21S11, FGA,  Penta D, Penta E, THO1, TPOX, and vWA) in the PowerPlex 16 System  (Promega Corporation) were assessed in 386 individuals from five Russian  urban populations. No significant between-population differences in  frequencies and molecular variance of 15 microsatellites were revealed.  For all 15 loci, the combined matching probability is 3.19 ? 10^?18 and the power of exclusion is 99.99989%.

http://www.sciencedirect.com/science?_ob=ArticleURL&_udi=B6W7W-50HN7M2-4&_user=2949221&_coverDate=09%2F30%2F2010&_rdoc=1&_fmt=high&_orig=search&_origin=search&_sort=d&_docanchor=&view=c&_acct=C000059317&_version=1&_urlVersion=0&_userid=2949221&md5=3c263516972a3c85eaacb79462910600&searchtype=a