Александр,
будет ли какая-нибудь публикация по результатам исследования?
Даже если нет возможности или желания делать серьёзное научное исследование, то можно было бы сделать публикацию в журнале сообщества МолГен - http://forum.molgen.org/index.php/topic,327.0.html
Данные интересные и после публикации они смогут хотя бы войти в научный оборот, так как не все и не всегда следят на за постами на форуме.
Что касается L2... не являюсь в этом вопросе экспертом, но выскажу версию. В Османской империи греки были не только этнической общностью, но и общиной, сформированной по кофессиональному признаку, возглавляемой Константинопольским патриархом. Таким образом, православные греки стали "точкой сборки" для всего православного населения бывшей Восточной Римской империи. Уже через одно-два поколения они полностью интегрировались, что вполне вероятно в условиях достаточно жесткого размежевания именно по религиозному признаку.
А с учетом того, что на момент начала османской экспансии всё многонациональное население Византии было православным... Греками в итоге могли оказаться представители практически всех народов Малой Азии и Причерноморья.
Сходные субклады среди турок будут подтверждения иных процессов - часть турков это отнюдь не потомки османских завоевателей, а потомки ренегатов по тем или иным причинам сменивших религию.
А на тему того, как было всё непросто рекомендую поискать в Гугле информации о брачно-родственных связях византийской и османской аристократии. Среди рядовых жителей империи вряд ли было по-другому.
Империя была многонациональной согласен но греки были греками, армяне армянами, болгары болгарами.
Ромей это конфессиональный термин для болгар, сербов, армян-православных и т.д.То есть с конфесиональной стороны они ромеи ромейской веры (православные) или греческой веры. Для греков это еще и этноним. Которым они себя именовали с нач. 212г.н.э., римлянин (ромей) в замен эллин-язычник. еще до возникновения Вост. Римской империи.
Даже сейчас многие греки диаспоры называют себя ромеями. Кроме нас никто себя так называет, потому как для нас эллин-грек-ромей - это одно и тоже.
По поводу ассимиляционных процесов они конечно были.
Раскажу одну историю, друзья ездили в Турцию в Трабзон, недалеко от города есть быв. православный монастырь Панагия Сумела, они встретили группу людей оказалось что они Лазы, один из ребят знал грузинский язык. Он им говорит вы грузины? они отвечают, что мы не грузины, мы лазы. Им даже такое сравнение не понравилось один даже насторожился и говорит: А вы откуда? Мы с России урумы (ромеи). Они сразу не поняли, когда сказали юнан они сразу поняли что ребята греки. И один из наших гворит такую вещь что лазы это теже греки, прикол в том что не было такой возмущенной реакции! Один даже сказал что мы ближе к грекам, чем к грузинам. Вот такая вот история. Кстати у турецких курдов бытует прозвище лазов "Юнантохуму", что в переводе с турецкого значит "греческое семя".
Где то читал, что самыми близкими генетически народами для греков, являются албанцы, сербы, болгары, македонцы-славяне, в особенности юж. итальянцы, турки.