Как-то у меня доверия к этим TMRCA вот прямо сильно поубавилось после всех этих многочисленных пересчетов в YFull. Вот у 817 TMRCA выросло до 2800 ybp, больше чем на 1000 лет. Как такое может быть? Ну и для расчетов принимается около 144 года на один снип, Но у меня остается вопрос: если отцу например 16 лет, то вероятность передачи сыну мутации просто очень маленькая из-за возраста. А если отцу 60 лет, то вариант передачи мутации в несколько раз больше. Как мы можем привести возраст поколений к среднему, например 31.5 года? Плюс скорость мутации зависит от ультрафиолета, радиации. По идее у северян скорость намного меньше, южан намного больше, но везде все под одну гребенку. Причем основанную, как я понимаю, на столетних линиях европейских аристократов, живших в самых "тепличных условиях" для своего времени. Наверное, надо как то учитывать временные интервалы (об этом где-то упоминал Ярослав), но не TMRCA, который у меня лично за полгода три раза поменялся (1000 лет, 650 лет и 800 лет) . Так мысли вслух дилетанта, но сомнений много.
Согласен, почва для сомнений есть, и хорошо, что такие темы поднимаются. Насчёт факторов мутаций - не буду спорить, Вы как медик всё же гораздо ближе к этому. Но тут речь скорее о статистике и больших числах. В любом случае, нам ведь нужны какие-то рабочие гипотезы. В нашей группе, по данным опроса примерно 40 человек, получается, что у мужчин сыновья появлялись в возрасте от 18 до 55 лет, а среднее значение сейчас - 31,6 года. Вероятно, оно откорректируется с появлением новых ответов, но вряд ли сильнее, чем на полгода. У молодых мутаций мало, у старых много, но среднее при большой выборке - работает. На мой взгляд, эти цифры не должны были сильно меняться, как минимум, со времени начала неолита, как раньше - трудно сказать. Насколько тепличными условия были для аристократов, по крайней мере, до 18 века - можно спорить.... но в любом случае, у них были лучше шансы оставить потомство, а значит, можно допускать, что их цифры - релевантны.
По моему опыту расчётов, большие колебания расчётных данных имели место либо когда речь шла о слишком маленькой выборке, либо о существенных изменениях в методике. С тех пор, как я стал применять средневзвешенные значения, где большую значимость получают лучше представленные ветви, колебания сильно уменьшились. Насчёт YFull - тут всё противоречиво, они вроде заявляют, что используют средневзвешенные, но в описании методики этого нет. Что за недавние глюки были - отдельный вопрос. В общем, ребят надо поддерживать, спонсорские деньги при наличии на YFull направлять - но и свои расчёты делать))))