Геном неандертальца сделали общедоступным

[Шад]

И что бы это значило?
http://www.semargl.me/ru/dna/ydna/nearest/50959/0/
Nea

то что неандерталец микс из R1a и R1b    днк археологов

Хватали кости грязными руками. Печально:(
Если меня пригласят на раскопки - учту.

[Centurion]

И что бы это значило?
http://www.semargl.me/ru/dna/ydna/nearest/50959/0/
Nea

то что неандерталец микс из R1a и R1b    днк археологов

Хватали кости грязными руками. Печально:(
Если меня пригласят на раскопки - учту.

если серьезно, то странный сиквенс

[mouglley]

Кстати, никто не обратил внимания:

Все эти неточности, указывающие на загрязнения сапиенсом останков неандертальцев, сводят на нет все статейки о наличии процентов неандертальской ДНК у современного человека.

[Yurgan]

Кстати, никто не обратил внимания:

Все эти неточности, указывающие на загрязнения сапиенсом останков неандертальцев, сводят на нет все статейки о наличии процентов неандертальской ДНК у современного человека.

Особенно когда утверждают, что у европейцев неандертальской ДНК больше.

[Шад]

Вот так рушатся красивые теории.
Как отмечено у одного нашего коллеги по форуму: На одном факте теорию не построишь, а вот разрушить уже построенную ему ничего не стоит.

[Semargl]

Особенно когда утверждают, что у европейцев неандертальской ДНК больше.

Или перефразировав: можно утверждать, что археологов европейцев больше.

[Людмила]

Шад

Всё таки контаминация, ошибка прочтения или что-то другое?

Получается - либо контаминация, либо (как предполагал И.Рожанский, и Т.Кран не исключает) там вообще нет У ДНК. А те фрагменты, которые идентифицируются как Y, имеют гомологию в аутосомах и Х.

[Semargl]

Вот так рушатся красивые теории.
Как отмечено у одного нашего коллеги по форуму: На одном факте теорию не построишь, а вот разрушить уже построенную ему ничего не стоит.

Насколько я понимаю, эти сведения еще ничего не опровергают, т.к. Y делали, скорее всего, по остаточному принципу.
Те нестыковки, которые есть, могут быть по причине скудности данных, и как следствие невозможности правильного выравнивания.
Можно сравнить у неандертальца "вес" файла с Y по отношению к файлам с данными остальным хромосом.
1 хромосома - 13 Gb - 247199719np
Y - 330 Mb - 57741652np
При равном качестве Y должен "весить" ~1/4 от 1 хромоcомы, а мы видим соотношение 1/40
Это конечно сильно упрощенно, но дает понимание о порядках разницы в качестве прочтения разных хромосом.

[kirroid]

Наткнулся сегодня утром на очень интересную  Афтор использовал BAM опубликованного генома неандертальца, чтобы посмотреть мутации на его Y хромосоме. Результат, к его удивлению, прекрасно лег на дерево ISOGG и показал, что неандерталец был носителем гаплогруппы R.

Cтатья тут - http://www.reddit.com/r/genetics/comments/2gt9d2/denisova_cave_neanderthal_was_ydna_haplogroup_r/

[Semargl]

Наткнулся сегодня утром на очень интересную  Афтор использовал BAM опубликованного генома неандертальца, чтобы посмотреть мутации на его Y хромосоме. Результат, к его удивлению, прекрасно лег на дерево ISOGG и показал, что неандерталец был носителем гаплогруппы R.

Cтатья тут - http://www.reddit.com/r/genetics/comments/2gt9d2/denisova_cave_neanderthal_was_ydna_haplogroup_r/

R1a Z280+. Мы писали об этом около года назад. Похоже на контаминацию.

[пенелопа]

Темы-клоны объединены.

[Averoes]

Почему так остро стоит проблема загрязнения ископаемых останков современным материалом? Разве ДНК извлекают не изнутри кости?

[пенелопа]

Извлекают. Зубы и кости - очень пористый материал.
Видели кость под микроскопом? Решето...

Картинка из инета наугад:

[Migifbug]

Как Вы смотрите на то, чтобы загрузить неандертальца в Yfull и сделать ему бесплатную интерпретацию?

[Andymeon]

какой интерес к баму проснулся ))

При попытке скачать :

В данный момент просмотр и скачивание этого файла недоступны.

За последнее время этот файл просматривали или скачивали слишком часто. Повторите попытку позже. Если файл очень большой или открыт для доступа широкому кругу пользователей, возможен отказ в доступе к нему в течение ближайших суток. Если через 24 часа ситуация не изменится, обратитесь к администратору домена.