АвторТема: Постройте, пожалуйста, древо...  (Прочитано 5072 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн Farroukh

  • Maternal Y-DNA: R1b-L584
  • ...
  • Сообщений: 12855
  • Страна: az
  • Рейтинг +2902/-15
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37518
  • мтДНК: F2f
Re: Постройте, пожалуйста, древо...
« Ответ #15 : 20 Март 2013, 17:59:28 »
N=19, L=37:


N=14, L=67:


Оффлайн Mich Glitch

  • Genus regis
  • Сообщений: 37082
  • Страна: ca
  • Рейтинг +3689/-48
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5a
Re: Постройте, пожалуйста, древо...
« Ответ #16 : 21 Март 2013, 09:37:00 »
N=19, L=37:


N=14, L=67:


Ага,

Теперь знаю, кого теребить, чтобы построить деревца по-простому. По средней частоте мутаций. Как АК говорит (тьфу-тьфу, не к ночи будь помянут  :o ), и с чем я полностью согласен: ВБОПы - ничто, топология - всё.
Не буду сейчас скучно гундеть про то, что частоты и топология - крепко взаимосвязаны.
Также не буду портить настроение банальными очевидностями о том, что имеем неохватную множественность вариантов (топологии).

Задачка у меня стоит дурковатая и чиста агитационная: по разносубкладным (sic!) 111 маркерным гаплотипам из одного ареала построить общее дерево. Упражнение подобно тому, что делал на 17 маркерах для однофамильцев и под ТНТ Alexander.

*** Урок усвоен: плакать надо жалобнее и громче. И тогда добрый Farroukh выделит полчаса своего времени.    ::)

Оффлайн Farroukh

  • Maternal Y-DNA: R1b-L584
  • ...
  • Сообщений: 12855
  • Страна: az
  • Рейтинг +2902/-15
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37518
  • мтДНК: F2f
Re: Постройте, пожалуйста, древо...
« Ответ #17 : 21 Март 2013, 10:15:49 »
Михаил, как я понял, Ринат - человек немолодой и ему и впрямь сложно освоить мурку даже по моему поциент-мануалу.

Оффлайн VVR

  • ...
  • Сообщений: 2668
  • Страна: ua
  • Рейтинг +615/-0
  • Y-ДНК: o.R1a1a1b1a2a1a1a1e~-YP569,YP1260+;м.R1a1a1b1a1a1a2~-L260,YP1337+
  • мтДНК: K1c1h
Re: Постройте, пожалуйста, древо...
« Ответ #18 : 21 Март 2013, 10:22:26 »
имеем неохватную множественность вариантов (топологии).

Для такого количества гт множественность вполне охватная. Хуже то,что несколько вполне оптимальных вариантов.

Урок усвоен: плакать надо жалобнее и громче.
Фаруху нужны подготовленые гаплотипы. Отсылаете. А дальше плакать надо громче и требовательнее: "Шо такое? Уже 2 дня, как отослал гаплотипы, а дерева всё нет! Неужели не хватает совести помочь человеку?!!" :)

Оффлайн Mich Glitch

  • Genus regis
  • Сообщений: 37082
  • Страна: ca
  • Рейтинг +3689/-48
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5a
Re: Постройте, пожалуйста, древо...
« Ответ #19 : 21 Март 2013, 10:26:42 »
Михаил, как я понял, Ринат - человек немолодой и ему и впрямь сложно освоить мурку даже по моему поциент-мануалу.
1. Мануал хороший и понятный.
2. Мурку люблю чисто из эстетических соображений. За неторопливую плавность линий. :) В остальном же она не многим лучше Филипки и, скажем так, уступает ТНТ.
3. Свято верую в высказывание дело мастера боится. В том смысле, что даже знаки табуляции и пробелы поубирать, или правильные имена сэмплам поприсваивать, у человека, уже не раз это делавшего, выйдет много быстрее, чем у новичка. Во время оно, построение под Филипом у меня занимало 12 минут.

Так что буду теребить.  Но не скоро. Пока имею с десяток гаплотипов.

Вот когда их будет хотя бы 20-30...   
Тогда и отниму 10 минут Вашего времени.  ::)

Оффлайн Mich Glitch

  • Genus regis
  • Сообщений: 37082
  • Страна: ca
  • Рейтинг +3689/-48
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5a
Re: Постройте, пожалуйста, древо...
« Ответ #20 : 21 Март 2013, 10:35:10 »
Кстати, по поводу молодой - немолодой.

Я, в свои 52 года, ощущаю себя, если не юношей, то молодым человеком.   ::)

Во-первых, девушки-женщины ещё одаривают улыбками и внимательными взглядами (хотя, как уже предполагал, возможно просто приценивают меня на роль шуга дэдди  :-X )

Во-вторых, жива ещё мама, так что, я по-прежнему остаюсь ребёнком.

В-третьих, до пенсии мне ещё целых 15 лет (для моего года рождения, в Канаде регулярная пенсия начинается с 67 лет; как для дядечек, так и для тётечек  :o )


:)

Оффлайн Farroukh

  • Maternal Y-DNA: R1b-L584
  • ...
  • Сообщений: 12855
  • Страна: az
  • Рейтинг +2902/-15
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37518
  • мтДНК: F2f
Re: Постройте, пожалуйста, древо...
« Ответ #21 : 21 Март 2013, 12:05:01 »
Окей, убедили!  ;D
Если человек активен на форуме, то всегда готов помочь, благо что дело нехитрое  ;D

Оффлайн РинатАвтор темы

  • Сообщений: 2166
  • Страна: ru
  • Рейтинг +317/-4
  • I1 M227
Re: Постройте, пожалуйста, древо...
« Ответ #22 : 21 Март 2013, 14:32:28 »
N=19, L=37:


N=14, L=67:


Ага,

Теперь знаю, кого теребить, чтобы построить деревца по-простому. По средней частоте мутаций. Как АК говорит (тьфу-тьфу, не к ночи будь помянут  :o ), и с чем я полностью согласен: ВБОПы - ничто, топология - всё.
Не буду сейчас скучно гундеть про то, что частоты и топология - крепко взаимосвязаны.
Также не буду портить настроение банальными очевидностями о том, что имеем неохватную множественность вариантов (топологии).

Задачка у меня стоит дурковатая и чиста агитационная: по разносубкладным (sic!) 111 маркерным гаплотипам из одного ареала построить общее дерево. Упражнение подобно тому, что делал на 17 маркерах для однофамильцев и под ТНТ Alexander.

*** Урок усвоен: плакать надо жалобнее и громче. И тогда добрый Farroukh выделит полчаса своего времени.    ::)
Я кстати думал, что и вы умеете делать деревце  . Ну уж если вы , не совсем умеете , тогда да :o  Плакать не надо
« Последнее редактирование: 21 Март 2013, 16:16:11 от Ринат »

Оффлайн Farroukh

  • Maternal Y-DNA: R1b-L584
  • ...
  • Сообщений: 12855
  • Страна: az
  • Рейтинг +2902/-15
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37518
  • мтДНК: F2f
Re: Постройте, пожалуйста, древо...
« Ответ #23 : 21 Март 2013, 16:24:56 »
Ринат, обращайтесь если что. Со временем вы и сами научитесь строить деревья

Оффлайн РинатАвтор темы

  • Сообщений: 2166
  • Страна: ru
  • Рейтинг +317/-4
  • I1 M227
Re: Постройте, пожалуйста, древо...
« Ответ #24 : 21 Март 2013, 16:49:22 »
Спасибо вам . Мне строить наверно незачем . Я и так тут задержался . Все что хотел узнал .  Еще пару штрихов и хватит

Оффлайн Аббат Бузони

  • ...
  • Сообщений: 19377
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1575/-58
  • Y-ДНК: I1a2a1a3a1a1a-YP1084+
  • мтДНК: H16
Re: Постройте, пожалуйста, древо...
« Ответ #25 : 21 Март 2013, 17:13:37 »
Спасибо вам . Мне строить наверно незачем . Я и так тут задержался . Все что хотел узнал .  Еще пару штрихов и хватит

"А компот?" (с)

Вот сейчас только самое интересное и начинается.

Оффлайн Шад

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6292
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1229/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Re: Постройте, пожалуйста, древо...
« Ответ #26 : 21 Март 2013, 17:30:24 »
Спасибо вам . Мне строить наверно незачем . Я и так тут задержался . Все что хотел узнал .  Еще пару штрихов и хватит

Это всё равно что уйти с рыбалки через 1 час, поймав одного карася.
Вы думаете, что дальше ничего интересного не будет?

Оффлайн Centurion

  • 100% Earth (Solar System) genofond
  • Администратор
  • *****
  • Сообщений: 9708
  • Страна: ru
  • Рейтинг +569/-2
Re: Постройте, пожалуйста, древо...
« Ответ #27 : 21 Март 2013, 17:31:49 »
обиделся  :'(

Оффлайн Аббат Бузони

  • ...
  • Сообщений: 19377
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1575/-58
  • Y-ДНК: I1a2a1a3a1a1a-YP1084+
  • мтДНК: H16
Re: Постройте, пожалуйста, древо...
« Ответ #28 : 21 Март 2013, 17:57:26 »
обиделся  :'(

Да ладно тебе, тоже начинаешь...

Оффлайн Mich Glitch

  • Genus regis
  • Сообщений: 37082
  • Страна: ca
  • Рейтинг +3689/-48
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5a
Re: Постройте, пожалуйста, древо...
« Ответ #29 : 21 Март 2013, 18:37:09 »
Окей, убедили!  ;D
Если человек активен на форуме, то всегда готов помочь, благо что дело нехитрое  ;D

Вот и договорились.

:)

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100