Определение базовых гаплотипов

[Farroukh]

Я переставил столбцы в том порядке, что в той таблице, галочки поснимал. Опять киргуду выдаёт. Кстати, там можно как-нибудь одной командой снимать все миллион галочек и потом просто поставить свои 11?

[Овод]

Не пытался никогда. По-моему низзя.
 
Экспериментируйте дальше. Если долго мучиться, что-нибудь получится. (с) Все через это прошли.

[Farroukh]

Может, есть другие утилиты, где не надо так изгаляться?

[Аббат Бузони]

Как это знакомо.

[Farroukh]

Интересно, а для чего они меняют порядок отображения маркеров?

[Овод]

Интересно, а для чего они меняют порядок отображения маркеров?

Чтобы было удобно импортировать данные из FTDNA или Y-search.

[Mich Glitch]

Может, есть другие утилиты, где не надо так изгаляться?

Есть и другие. Например, вот эта неплохая бета-версия (ссылка).
Но поизгаляться всё равно придётся.

[Farroukh]

Не пытался никогда. По-моему низзя.

Овод, там те же маркеры, только в другом порядке. Если я выстрою их в том же порядке, что и в утилите - от этого что-то искажается?

[Овод]

Не пытался никогда. По-моему низзя.

Овод, там те же маркеры, только в другом порядке. Если я выстрою их в том же порядке, что и в утилите - от этого что-то искажается?

Вы можете вообще начхать на порядок маркеров.Если без весов (а утилита их не знает) - результат не изменится.
 
Только обозначения маркеров вовсех программах, куда пойдут данные из утилиты (если Вы её для этого пользуете) названия (только) маркеров будут искажены.
 
И ещё - учтите, что утилита считает  ВБОП по методу "неопределённых аллелей",  который годится только для весьма молодых гаплотипов.
 
Последнее - ставьте вероятность 50%, если хотите иметь нормальное, среднее значение возраста, а не с запасом на соответствующий квантиль.

[Mich Glitch]

Вы можете вообще начхать на порядок маркеров.Если без весов (а утилита их не знает) - результат не изменится.

1) Если не без весов, а при постоянной скорости мутаций по всем маркерам.
2) Если выскакивают сообщения об ошибках, то генетические дистанции просчитываются неверно. (Проверено!!!) Стало быть и масштабирование ветвей (а иногда и общая топология) будут другими.

Короче говоря это то, о чём я поторопился сказать раньше:

Раньше советовали при постоянной скорости вообще не обращать внимание на сообщения об ошибках. Это неправильно. Генетические дистанции просчитываются неверно.

Выходит, что не раньше, а и сейчас.

Кстати, пожилой лев, как немного льстиво обозвали АК в одном из сегодняшних постов, не раз похвалялся (до того как начал фантазировать о какой-то утилите, специально для него написанной студентами), что не обращает внимание на выскакивающие сообщения об ошибках. Понятное дело, что сопоставить две разных матрицы, полученных с сообщениями об ошибке и без, ему в голову не пришло.

Я тоже всё это на веру принимал без проверки, пока дотошный Alexander мне глаза не раскрыл.

[Овод]

Я бы не стал доверять результатам ЛЮБОЙ программы, выдающей предупреждение об ошибке.
 
Ну, если, конечно, это не моя программа и я точно уверен, что ошибка не повлияет на результат вычислений. Или в руководстве к программе содержится чёткое описание природы ошибки и её последствий.

[Mich Glitch]

Я бы не стал доверять результатам ЛЮБОЙ программы, выдающей предупреждение об ошибке.

Я сейчас не говорю о доверии.
Мысль моя проще.
Если сообщений об ошибках нет - получается одна матрица.
Если сообщения об ошибках есть - получается другая матрица.
Речь идёт не о какой-то отвлечённой программе, а именно о той утилите, что использует Фаррух и подавляющее большинство присутствующих на форуме.

Что до сообщения об ошибке, то оно очень корректно информирует о превышении заданного интервала значений для конкретного маркера. Можно предположить, что если эти значения выходят за рамки, то программа их просто не обрабатывает. Тем самым меняя матрицу.


Ну, а по сути. Считаю, что маркеры расставить в одном из трёх предлагаемых форматов, а потом галочки поубирать - задача не такая уж и сложная.

[mouglley]

Всё зависит от того, сставишь галу "Скорость FTDNA, или нет.
Если ставишь, то для всех маркеров скорость 0,0024 и ошибки нее будет, ежели нет, то ошибка обеспечена.

[Valery]

до того как начал фантазировать о какой-то утилите, специально для него написанной студентами

речь о 70х?

[Овод]

Всё зависит от того, сставишь галу "Скорость FTDNA, или нет.
Если ставишь, то для всех маркеров скорость 0,0024 и ошибки нее будет, ежели нет, то ошибка обеспечена.

Существенная поправка, Маугли. Поддерживаю.