ДНК-генеалогический софт

[Farroukh]

Мужики, прошу понять меня неправильно. Может, лучше написать прогу, в которую загоняешь гаплотипы, а на выходе получаешь деревья с возрастами общих предков? причём так, чтобы расчёт можно было вести разными методами?

Вручную же можно просто сдохнуть на всём этом. Я тут корячусь с выборкой из каких-то 228 гаплотипов, и уже хочется взять и послать их подальше вместе с гаплогруппой.

Какова ситуация с молген-софтом?

[Lifanov]

Да, у Вадима прямо материал для статьи. Я бы на его месте все это отредактировал с картинками и статья готова.

У этой статьи уже борода выросла. Тогда уж и Каржавина с ММП подключайте...

http://www.rodstvo.ru/forum/index.php?showtopic=1119

Там, правда, статья уже вышла (Вестник Т1 №4).

[Centurion]

Какова ситуация с молген-софтом?

30 тыс евро и будет супер прога.

[Lifanov]

Какова ситуация с молген-софтом?

30 тыс евро и будет супер прога.

Гы ! 

А почему не полтинник? 

[Farroukh]

Да ну? Там же всего лишь набор рутинной математики. Иль нет?

[Centurion]

Да ну? Там же всего лишь набор рутинной математики. Иль нет?

Ну если бы было так просто таких универсальных программ было десятки.
Помнишь у Вадима прогу?  мечта поэта

[Аббат Бузони]

Да ну? Там же всего лишь набор рутинной математики. Иль нет?

Ну если бы было так просто таких универсальных программ было десятки.
Помнишь у Вадима прогу?  мечта поэта

И я эту мечту видел, все что хочешь, сказка.

[Valery]

Да ну? Там же всего лишь набор рутинной математики.

не уважаете Вы нас программистов

[Farroukh]

Валерий, что вы, нет! Но я смотрю, что речь идёт о работе с массивами, которые надо обрабатывать по алгоритму.

А что, Вадим уже сваял такую прогу? Можно загонять гаплотипы, а на выходе получать деревья с возрастами ветвей?

[Centurion]

А что, Вадим уже сваял такую прогу? Можно загонять гаплотипы, а на выходе получать деревья с возрастами ветвей?

Прога может делать многое, НО половину через изменение параметров в коде и последующей перекомпиляцией, хотя имеет GUI. В принципе, если довести ее до ума, то ее можно запросто продавать в коробочке баксов за 35-50, минимум. Купил бы даже за 50

Если сделать интерфейс на нескольких языках (анг, нем фр итал рус), думаю спокойно можно продать 300-500 копий.

[Valery]

А что, Вадим уже сваял такую прогу? Можно загонять гаплотипы, а на выходе получать деревья с возрастами ветвей?

Прога может делать многое, НО половину через изменение параметров в коде и последующей перекомпиляцией, хотя имеет GUI. В принципе, если довести ее до ума, то ее можно запросто продавать в коробочке баксов за 35-50, минимум. Купил бы даже за 50

Если сделать интерфейс на нескольких языках (анг, нем фр итал рус), думаю спокойно можно продать 300-500 копий.

Ром, как помнишь мы обсуждали много вариантов и в принципе идея сделать коробочный продукт (включив туда программу Вадима) не такая уж и безумная. Забудь про коммерчекую стоимость - она включает отладку тестирование сопутствующие лицензии и многое другое. Вопрос в том что не каждый программист захочет бесплатно вложить столько труда ради енд-юзера. Наконец, есть моменты специфичные для отрасли. Лично я бы не стал заниматься продуктом который нельзя портировать на позикс, ведь только под виндоуз он будет недоступен профессиональной биоинформатической аудитории. Большая часть этой аудитории на маке и линуксе. А кроссплатформенный эндюзерский продукт - это аццкий труд.

[Valery]

Валерий, что вы, нет! Но я смотрю, что речь идёт о работе с массивами, которые надо обрабатывать по алгоритму.

Это больше камень в мой огород чем в Вадимов (я комбинаторщик). Фаррух, честно это несерьезно с Вашей стороны. "Я видел как играют на скрипке, это очень просто!" (С)

[Centurion]

Валер, я с тобой не согласен. Я имел ввиду софт не для профессиональных генетиков, а для увлекающихся ДНК-генеалогией. Поэтому софт несколько другой. И все что я сказал об этом выше вполне реально. Хватит только под винды.

[Valery]

Валер, я с тобой не согласен. Я имел ввиду софт не для профессиональных генетиков, а для увлекающихся ДНК-генеалогией. Поэтому софт несколько другой. И все что я сказал об этом выше вполне реально. Хватит только под винды.

Биолог в этом плане не всегда выступает профессиональным потребителем. Посмотри на современные портируемые пакеты типа

http://www.geneious.com/
"Research software for biologists, not computer scientists"

- и ты может подкорректируешь свое мнение

По этому образцу сделать реально. Если Вадим согласится писать для mysql - тем более. Что касается ориентации только на любителей - тоже не согласен, так как серьезный программист всегда хочет чтобы со временем его продукт стал популярен у всех частей  потенциальной аудитории.

Еще одна ну оооочень важная деталь: Вадим и программист и исследователь. А большой пакет зачастую является только фронтендом для отдельных программ. В таких оболочках тоже реализованы определенные идеи и находки как упростить доступ к разнородным данным, но это совсем другая сфера деятельности.

[wertner]

Нет у нас какой-то генеральной линии, что ли. Опять все забуксовало. Может пора собраться и чайку попить? Авось вдохновение придет