АвторТема: ДНК-генеалогический софт  (Прочитано 11029 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Онлайн FarroukhАвтор темы

  • Maternal Y-DNA: R1b-L584
  • ...
  • Сообщений: 12950
  • Страна: az
  • Рейтинг +2963/-15
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37518
  • мтДНК: F2f
ДНК-генеалогический софт
« : 17 Август 2009, 18:45:57 »
Мужики, прошу понять меня неправильно. Может, лучше написать прогу, в которую загоняешь гаплотипы, а на выходе получаешь деревья с возрастами общих предков? причём так, чтобы расчёт можно было вести разными методами?

Вручную же можно просто сдохнуть на всём этом. Я тут корячусь с выборкой из каких-то 228 гаплотипов, и уже хочется взять и послать их подальше вместе с гаплогруппой.

Какова ситуация с молген-софтом?
« Последнее редактирование: 17 Август 2009, 21:39:00 от Centurion »

Оффлайн Lifanov

  • Сообщений: 212
  • Рейтинг +60/-0
  • Парадигма-то другая...
    • База YDNA
  • Y-ДНК: R1a1
  • мтДНК: L2a
Re: ДНК-генеалогический софт
« Ответ #1 : 17 Август 2009, 18:47:31 »
Да, у Вадима прямо материал для статьи. Я бы на его месте все это отредактировал с картинками и статья готова.

У этой статьи уже борода выросла. Тогда уж и Каржавина с ММП подключайте...

http://www.rodstvo.ru/forum/index.php?showtopic=1119

Там, правда, статья уже вышла (Вестник Т1 №4).

Оффлайн Centurion

  • 100% Earth (Solar System) genofond
  • Администратор
  • *****
  • Сообщений: 9708
  • Страна: ru
  • Рейтинг +569/-2
Re: ДНК-генеалогический софт
« Ответ #2 : 17 Август 2009, 19:03:03 »
Цитировать
Какова ситуация с молген-софтом?
30 тыс евро и будет супер прога.

Оффлайн Lifanov

  • Сообщений: 212
  • Рейтинг +60/-0
  • Парадигма-то другая...
    • База YDNA
  • Y-ДНК: R1a1
  • мтДНК: L2a
Re: ДНК-генеалогический софт
« Ответ #3 : 17 Август 2009, 19:05:45 »
Цитировать
Какова ситуация с молген-софтом?
30 тыс евро и будет супер прога.

Гы !  ;D

А почему не полтинник?  8)

Онлайн FarroukhАвтор темы

  • Maternal Y-DNA: R1b-L584
  • ...
  • Сообщений: 12950
  • Страна: az
  • Рейтинг +2963/-15
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37518
  • мтДНК: F2f
Re: ДНК-генеалогический софт
« Ответ #4 : 17 Август 2009, 20:12:57 »
Да ну? Там же всего лишь набор рутинной математики. Иль нет?

Оффлайн Centurion

  • 100% Earth (Solar System) genofond
  • Администратор
  • *****
  • Сообщений: 9708
  • Страна: ru
  • Рейтинг +569/-2
Re: ДНК-генеалогический софт
« Ответ #5 : 17 Август 2009, 20:15:06 »
Да ну? Там же всего лишь набор рутинной математики. Иль нет?
Ну если бы было так просто таких универсальных программ было десятки.
Помнишь у Вадима прогу?  :D мечта поэта

Оффлайн Аббат Бузони

  • ...
  • Сообщений: 19389
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1576/-58
  • Y-ДНК: I1a2a1a3a1a1a-YP1084+
  • мтДНК: H16
Re: ДНК-генеалогический софт
« Ответ #6 : 17 Август 2009, 20:21:45 »
Да ну? Там же всего лишь набор рутинной математики. Иль нет?
Ну если бы было так просто таких универсальных программ было десятки.
Помнишь у Вадима прогу?  :D мечта поэта

И я эту мечту видел, все что хочешь, сказка.

Оффлайн Valery

  • Сообщений: 5678
  • Страна: 00
  • Рейтинг +537/-6
  • Ultimate Matriarchy
Re: ДНК-генеалогический софт
« Ответ #7 : 17 Август 2009, 21:16:42 »
Да ну? Там же всего лишь набор рутинной математики.


не уважаете Вы нас программистов :)

Онлайн FarroukhАвтор темы

  • Maternal Y-DNA: R1b-L584
  • ...
  • Сообщений: 12950
  • Страна: az
  • Рейтинг +2963/-15
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37518
  • мтДНК: F2f
Re: ДНК-генеалогический софт
« Ответ #8 : 17 Август 2009, 21:23:10 »
Валерий, что вы, нет! Но я смотрю, что речь идёт о работе с массивами, которые надо обрабатывать по алгоритму.

А что, Вадим уже сваял такую прогу? Можно загонять гаплотипы, а на выходе получать деревья с возрастами ветвей?

Оффлайн Centurion

  • 100% Earth (Solar System) genofond
  • Администратор
  • *****
  • Сообщений: 9708
  • Страна: ru
  • Рейтинг +569/-2
Re: ДНК-генеалогический софт
« Ответ #9 : 17 Август 2009, 21:27:13 »
Цитировать
А что, Вадим уже сваял такую прогу? Можно загонять гаплотипы, а на выходе получать деревья с возрастами ветвей?
Прога может делать многое, НО половину через изменение параметров в коде и последующей перекомпиляцией, хотя имеет GUI. В принципе, если довести ее до ума, то ее можно запросто продавать в коробочке баксов за 35-50, минимум. Купил бы даже за 50 :)

Если сделать интерфейс на нескольких языках (анг, нем фр итал рус), думаю спокойно можно продать 300-500 копий.

Оффлайн Valery

  • Сообщений: 5678
  • Страна: 00
  • Рейтинг +537/-6
  • Ultimate Matriarchy
Re: ДНК-генеалогический софт
« Ответ #10 : 17 Август 2009, 21:45:00 »
Цитировать
А что, Вадим уже сваял такую прогу? Можно загонять гаплотипы, а на выходе получать деревья с возрастами ветвей?
Прога может делать многое, НО половину через изменение параметров в коде и последующей перекомпиляцией, хотя имеет GUI. В принципе, если довести ее до ума, то ее можно запросто продавать в коробочке баксов за 35-50, минимум. Купил бы даже за 50 :)

Если сделать интерфейс на нескольких языках (анг, нем фр итал рус), думаю спокойно можно продать 300-500 копий.


Ром, как помнишь мы обсуждали много вариантов и в принципе идея сделать коробочный продукт (включив туда программу Вадима) не такая уж и безумная. Забудь про коммерчекую стоимость - она включает отладку тестирование сопутствующие лицензии и многое другое. Вопрос в том что не каждый программист захочет бесплатно вложить столько труда ради енд-юзера. Наконец, есть моменты специфичные для отрасли. Лично я бы не стал заниматься продуктом который нельзя портировать на позикс, ведь только под виндоуз он будет недоступен профессиональной биоинформатической аудитории. Большая часть этой аудитории на маке и линуксе. А кроссплатформенный эндюзерский продукт - это аццкий труд.

Оффлайн Valery

  • Сообщений: 5678
  • Страна: 00
  • Рейтинг +537/-6
  • Ultimate Matriarchy
Re: ДНК-генеалогический софт
« Ответ #11 : 17 Август 2009, 21:49:00 »
Валерий, что вы, нет! Но я смотрю, что речь идёт о работе с массивами, которые надо обрабатывать по алгоритму.

Это больше камень в мой огород чем в Вадимов (я комбинаторщик). Фаррух, честно это несерьезно с Вашей стороны. "Я видел как играют на скрипке, это очень просто!" (С)

Оффлайн Centurion

  • 100% Earth (Solar System) genofond
  • Администратор
  • *****
  • Сообщений: 9708
  • Страна: ru
  • Рейтинг +569/-2
Re: ДНК-генеалогический софт
« Ответ #12 : 17 Август 2009, 21:54:18 »
Валер, я с тобой не согласен. Я имел ввиду софт не для профессиональных генетиков, а для увлекающихся ДНК-генеалогией. Поэтому софт несколько другой. И все что я сказал об этом выше вполне реально. Хватит только под винды.

Оффлайн Valery

  • Сообщений: 5678
  • Страна: 00
  • Рейтинг +537/-6
  • Ultimate Matriarchy
Re: ДНК-генеалогический софт
« Ответ #13 : 17 Август 2009, 22:05:19 »
Валер, я с тобой не согласен. Я имел ввиду софт не для профессиональных генетиков, а для увлекающихся ДНК-генеалогией. Поэтому софт несколько другой. И все что я сказал об этом выше вполне реально. Хватит только под винды.


Биолог в этом плане не всегда выступает профессиональным потребителем. Посмотри на современные портируемые пакеты типа

http://www.geneious.com/
"Research software for biologists, not computer scientists"

- и ты может подкорректируешь свое мнение

По этому образцу сделать реально. Если Вадим согласится писать для mysql - тем более. Что касается ориентации только на любителей - тоже не согласен, так как серьезный программист всегда хочет чтобы со временем его продукт стал популярен у всех частей  потенциальной аудитории.

Еще одна ну оооочень важная деталь: Вадим и программист и исследователь. А большой пакет зачастую является только фронтендом для отдельных программ. В таких оболочках тоже реализованы определенные идеи и находки как упростить доступ к разнородным данным, но это совсем другая сфера деятельности.


Оффлайн wertner

  • ...
  • Сообщений: 1383
  • Страна: ru
  • Рейтинг +321/-0
    • YFull
  • Y-ДНК: E-V13->E-S2972->E-Z16661
  • мтДНК: U4a (xU4a3)
Re: ДНК-генеалогический софт
« Ответ #14 : 18 Август 2009, 02:07:02 »
Нет у нас какой-то генеральной линии, что ли. Опять все забуксовало. Может пора собраться и чайку попить? :) Авось вдохновение придет :)

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100