АвторТема: дДНК (гаплогруппа Q)  (Прочитано 30306 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн Yurgan

  • Кто везёт, тому везёт
  • ...
  • Сообщений: 8239
  • Страна: gt
  • Рейтинг +819/-7
  • Потомок кузнеца Ильмаринена
    • Сибирский родословец
Re: дДНК (гаплогруппа Q)
« Ответ #30 : 18 Январь 2013, 10:02:12 »
Но на северо-востоке Q не указаны.
Это N

Стр. 29, табл. 3.2
У этого гаплотипа GATA H4=9
Все совпадения по базе Семаргла - из Q.
Какие аргументы, что это N? Может неправильно определили? Там только STR-маркеры были сделаны.
Есть у меня один алтаец N1c - GATA H4=9
9 в системе Y-filer  и достаточно много С3с с девяткой

Оффлайн ШадАвтор темы

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6316
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1275/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Re: дДНК (гаплогруппа Q)
« Ответ #31 : 18 Январь 2013, 10:35:00 »
Но на северо-востоке Q не указаны.
Это N

Стр. 29, табл. 3.2
У этого гаплотипа GATA H4=9
Все совпадения по базе Семаргла - из Q.
Какие аргументы, что это N? Может неправильно определили? Там только STR-маркеры были сделаны.
Есть у меня один алтаец N1c - GATA H4=9
9 в системе Y-filer  и достаточно много С3с с девяткой

Так в базе Семаргла должна быть 8 для перехода с Y-Filer? Тогда нужно смотреть гаплотипы с десяткой в этом маркёре.

Оффлайн Yurgan

  • Кто везёт, тому везёт
  • ...
  • Сообщений: 8239
  • Страна: gt
  • Рейтинг +819/-7
  • Потомок кузнеца Ильмаринена
    • Сибирский родословец
Re: дДНК (гаплогруппа Q)
« Ответ #32 : 18 Январь 2013, 11:04:11 »
Но на северо-востоке Q не указаны.
Это N

Стр. 29, табл. 3.2
У этого гаплотипа GATA H4=9
Все совпадения по базе Семаргла - из Q.
Какие аргументы, что это N? Может неправильно определили? Там только STR-маркеры были сделаны.
Есть у меня один алтаец N1c - GATA H4=9
9 в системе Y-filer  и достаточно много С3с с девяткой

Так в базе Семаргла должна быть 8 для перехода с Y-Filer? Тогда нужно смотреть гаплотипы с десяткой в этом маркёре.
С 8-кой надо смотреть
В базе Семаргла есть два N1c с H4 = 8 - карелы

Оффлайн ШадАвтор темы

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6316
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1275/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Re: дДНК (гаплогруппа Q)
« Ответ #33 : 18 Январь 2013, 14:21:12 »
С 8-кой надо смотреть

Эпик фейл:(
Теперь буду анализировать "десятки".

Оффлайн ШадАвтор темы

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6316
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1275/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Re: дДНК (гаплогруппа Q)
« Ответ #34 : 18 Январь 2013, 22:56:18 »
С 8-кой надо смотреть

Эпик фейл:(
Теперь буду анализировать "десятки".

Анализировать особо нечего. Только два гаплотипа H4=10 -> 9. Это S2 и S4. S4 короче на два маркёра, но в остальном они совпадают на 100%. В итоге я внес в базу под именем S4 "синтетический" гаплотип.
http://www.semargl.me/ru/dna/ydna/kit/50343/
Окружение вот:
http://www.semargl.me/ru/dna/ydna/nearest-neighbors/50343/
Достаточно любопытно. Если отбросить тех, кто притянут по гомоплазии (т.е. явно не Q1b), то ближайшие явно относятся к корню Q1b.
« Последнее редактирование: 18 Январь 2013, 23:19:37 от Шад »

Оффлайн ШадАвтор темы

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6316
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1275/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Re: дДНК (гаплогруппа Q)
« Ответ #35 : 08 Декабрь 2013, 10:43:51 »
Цитировать
Y chromosomes of ancient Hunnu people and its implication on the phylogeny of East Asian linguistic families.
LL. Kang et al.
The Hunnu (Xiongnu) people, also called Huns in Europe, were the largest ethnic group to the north of Han Chinese until the 5th century. The ethno-linguistic affiliation of the Hunnu is controversial among Yeniseian, Altaic, Uralic, and Indo-European. Ancient DNA analyses on the remains of the Hunnu people had shown some clues to this problem. Y chromosome haplogroups of Hunnu remains included Q-M242, N-Tat, C-M130, and R1a1. Recently, we analyzed three samples of Hunnu from Barköl, Xinjiang, China, and determined Q-M3 haplogroup. Therefore, most Y chromosomes of the Hunnu samples examined by multiple studies are belonging to the Q haplogroup. Q-M3 is mostly found in Yeniseian and American Indian peoples, suggesting that Hunnu should be in the Yeniseian family. The Y chromosome diversity is well associated with linguistic families in East Asia. According to the similarity in the Y chromosome profiles, there are four pairs of congenetic families, i.e., Austronesian and Tai-Kadai, Mon-Khmer and Hmong-Mien, Sino-Tibetan and Uralic, Yeniseian and Palaesiberian. Between 4,000-2,000 years before present, Tai-Kadai, Hmong-Mien, Sino-Tibetan, and Yeniseian languages transformed into toned analytic languages, becoming quite different from the rest four. Since Hunnu was in the Yeniseian family, all these four toned families were distributed in the inland of China during the transformations. There must be some social or biological factors induced the transformations at that time, which is worth doing more linguistic and genetic researches.

Это было опубликовано в тезисах ASHG 2013 в сентябре. Гунны M3 это сенсация типа "подводная лодка в степях Украины".
Но теперь вроде формируется абсолютно иное понимание этого сюжета. На мой взгляд, очевидно более логичное и менее сенсационное.
Вот что та же группа авторов сообщает в более развернутом докладе:
Цитировать
The Hunnu (Xiongnu) people, also called Huns in Europe, were the largest ethnic group to the north of Han Chinese until the 5th century.

Recently we analyzed three samples of Hunnu from Barköl, Xinjiang, China and determined QM3 haplogroup. Therefore most Y chromosomes of the
Hunnu samples examined by multiple studies are belonging to the Q haplogroup. Thirteen ancient DNA samples of Hunnu from Barköl
site have been typed for Y chromosome SNPs and STRs. All these samples fell into Y chromosome haplogroup Q. One of the samples showed the STR
data as follows:
DYS19            12       
DYS389I         13       
        391         10       
        393         13       
        437         14       
        439         13       
        456         16       
        458         17       
        635         22
        385a      14         

We inferred this sample to be Q M3, however, the SNP typing of this sample was not read demonstrably. Haplogroups of the other samples included Q*, Q1a,
and Q1b, indicating high genetic diversity and long history of the Hunnu people. Previous studies of the Hunnu samples from Pengyang and Egyin Gol sites
also found high frequencies of haplogroup Q. Only samples from the northern border of the Hunnu Kingdom were haplogroup C, N, or R. This diversity
pattern indicated that chromosome haplogroup might be predominant in Hunnu people.
On the map, Q was marked for the following sites:
Egyin Gol:  N1c, C3, Q
Barkol:        Q, Q
Pengyang:  Q
These sites were in the Hunnu territory.
http://comonca.org.cn/lh/doc/A104.pdf

А вот кто близок упомянутому носителю дНК:
http://www.semargl.me/ru/dna/ydna/nearest-neighbors/59562/
Сразу скажу, что это турки и хазареец (все из академических выборок). И вездесущие ашкеназы.

Свою версию о том, что это не хунну я уже излагал выше.

Оффлайн ШадАвтор темы

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6316
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1275/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z

Оффлайн asan-kaygy

  • ...
  • Сообщений: 9278
  • Страна: kz
  • Рейтинг +905/-5
  • Y-ДНК: R1a1a1b2a1a-L657+,Y9+,Y944+
Re: дДНК (гаплогруппа Q)
« Ответ #37 : 18 Декабрь 2013, 09:21:17 »
Цитировать
Y chromosomes of ancient Hunnu people and its implication on the phylogeny of East Asian linguistic families.
LL. Kang et al.
The Hunnu (Xiongnu) people, also called Huns in Europe, were the largest ethnic group to the north of Han Chinese until the 5th century. The ethno-linguistic affiliation of the Hunnu is controversial among Yeniseian, Altaic, Uralic, and Indo-European. Ancient DNA analyses on the remains of the Hunnu people had shown some clues to this problem. Y chromosome haplogroups of Hunnu remains included Q-M242, N-Tat, C-M130, and R1a1. Recently, we analyzed three samples of Hunnu from Barköl, Xinjiang, China, and determined Q-M3 haplogroup. Therefore, most Y chromosomes of the Hunnu samples examined by multiple studies are belonging to the Q haplogroup. Q-M3 is mostly found in Yeniseian and American Indian peoples, suggesting that Hunnu should be in the Yeniseian family. The Y chromosome diversity is well associated with linguistic families in East Asia. According to the similarity in the Y chromosome profiles, there are four pairs of congenetic families, i.e., Austronesian and Tai-Kadai, Mon-Khmer and Hmong-Mien, Sino-Tibetan and Uralic, Yeniseian and Palaesiberian. Between 4,000-2,000 years before present, Tai-Kadai, Hmong-Mien, Sino-Tibetan, and Yeniseian languages transformed into toned analytic languages, becoming quite different from the rest four. Since Hunnu was in the Yeniseian family, all these four toned families were distributed in the inland of China during the transformations. There must be some social or biological factors induced the transformations at that time, which is worth doing more linguistic and genetic researches.

Это было опубликовано в тезисах ASHG 2013 в сентябре. Гунны M3 это сенсация типа "подводная лодка в степях Украины".
Но теперь вроде формируется абсолютно иное понимание этого сюжета. На мой взгляд, очевидно более логичное и менее сенсационное.
Вот что та же группа авторов сообщает в более развернутом докладе:
Цитировать
The Hunnu (Xiongnu) people, also called Huns in Europe, were the largest ethnic group to the north of Han Chinese until the 5th century.

Recently we analyzed three samples of Hunnu from Barköl, Xinjiang, China and determined QM3 haplogroup. Therefore most Y chromosomes of the
Hunnu samples examined by multiple studies are belonging to the Q haplogroup. Thirteen ancient DNA samples of Hunnu from Barköl
site have been typed for Y chromosome SNPs and STRs. All these samples fell into Y chromosome haplogroup Q. One of the samples showed the STR
data as follows:
DYS19            12       
DYS389I         13       
        391         10       
        393         13       
        437         14       
        439         13       
        456         16       
        458         17       
        635         22
        385a      14         

We inferred this sample to be Q M3, however, the SNP typing of this sample was not read demonstrably. Haplogroups of the other samples included Q*, Q1a,
and Q1b, indicating high genetic diversity and long history of the Hunnu people. Previous studies of the Hunnu samples from Pengyang and Egyin Gol sites
also found high frequencies of haplogroup Q. Only samples from the northern border of the Hunnu Kingdom were haplogroup C, N, or R. This diversity
pattern indicated that chromosome haplogroup might be predominant in Hunnu people.
On the map, Q was marked for the following sites:
Egyin Gol:  N1c, C3, Q
Barkol:        Q, Q
Pengyang:  Q
These sites were in the Hunnu territory.
http://comonca.org.cn/lh/doc/A104.pdf

А вот кто близок упомянутому носителю дНК:
http://www.semargl.me/ru/dna/ydna/nearest-neighbors/59562/
Сразу скажу, что это турки и хазареец (все из академических выборок). И вездесущие ашкеназы.

Свою версию о том, что это не хунну я уже излагал выше.
спасибо за ссылку.

Оффлайн ШадАвтор темы

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6316
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1275/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Re: дДНК (гаплогруппа Q)
« Ответ #38 : 03 Июль 2014, 17:23:27 »
Strong genetic admixture in the Altai at the Middle Bronze Age revealed by uniparental and ancestry informative markers

Clémence Hollarda, Christine Keysera, Pierre-Henri Giscardb, Turbat Tsagaanc, Noost Bayarkhuuc, Jan Bemmannd, Eric Crubézye, Bertrand Ludese.

Abstract

The Altai Mountains have been a long term boundary zone between the Eurasian Steppe populations and South and East Asian populations. To disentangle some of the historical population movements in this area, 14 ancient human specimens excavated in the westernmost part of the Mongolian Altai were studied. Thirteen of them were dated from the Middle to the End of the Bronze Age and one of them to the Eneolithic period. The environmental conditions encountered in this region led to the good preservation of DNA in the human remains. Therefore, a multi-markers approach was adopted for the genetic analysis of identity, ancestry and phenotype markers. Mitochondrial DNA analyses revealed that the ancient Altaians studied carried both Western (H, U, T) and Eastern (A, C, D) Eurasian lineages. In the same way, the patrilineal gene pool revealed the presence of different haplogroups (Q1a2a1-L54, R1a1a1b2-Z93 and C), probably marking different origins for the male paternal lineages. To go further in the search of the origin of these ancient specimens, phenotypical characters (ie: hair and eye colour) were determined. For this purpose, we adapted the HIrisPlex assay recently described to MALDI-TOF mass spectrometry. In addition, some ancestry informative markers were analyzed with this assay. The results revealed mixed phenotypes among this group confirming the probable admixed ancestry of the studied Altaian population at the Middle Bronze Age. The good results obtained from ancient DNA samples suggest that this approach might be relevant for forensic casework too.

http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1872497314001161
Forensic Science International: Genetics, published online 04 June 2014



Цитировать
по мужской линии генофонд показал наличие различных гаплогрупп (Q1a2a1-L54, R1a1a1b2-Z93 и С)


Преобладают кареглазые (только один R1a голубоглазый) и темноволосые (и опять только R1a - тёмнорусый и шатен).

Обращает на себя внимание три Q-L54 (ТА8, ТА11-14) и один недотипированный Q-M242 (ТU31).

По аутосомам: почти вся алтайская компания имеет преобладание "европейских" снипов. Вот тут впору задуматься - или это европейцы в Азии или те, кого мы считаем эталонными европейцами (и по кому калибровались снипы) - с Алтая:)
« Последнее редактирование: 03 Июль 2014, 17:45:37 от Шад »

Оффлайн ШадАвтор темы

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6316
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1275/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Re: дДНК (гаплогруппа Q)
« Ответ #39 : 03 Июль 2014, 17:54:38 »
Речь идет не о российском, а о монгольском Алтае.



Цитировать
In its East Asian part, the Southern border of the Eurasian Steppe is delimited by the Altai Mountains. This 2000 kilometer long mountain range with many peaks between 3000 and 4000 meters high extend southward in Mongolia and in the Xinjiang province of China. In the present work, we studied two necropolises in the Mongolian Altai Mountains: the site of Tsagaan Asga (on the Chinese border) and the site of Takhilgat Uzuur-5 (on the Siberian border) (Fig. 1A). These sites were dated from the Middle Bronze Age, as were subjects of European origin found in the Siberian side of the Eurasian steppe. The cold environment in this area probably helped the recovery of 14 well preserved skeletons excavated in important Kurgans (Fig. 1B).

TU31 с территории Монголии, на границе с Сибирью - захоронение Takhilgat Uzuur.
Соответственно, все TA - это  Tsagaan Asga (на границе с Китаем).

Ниже ссылка на пост Диенека по вышеуказанной статье:
http://dienekes.blogspot.gr/2014/06/ancient-dna-from-bronze-age-altai.html
Там интересен даже не пост, а комментарии ниже.

Оффлайн Yurgan

  • Кто везёт, тому везёт
  • ...
  • Сообщений: 8239
  • Страна: gt
  • Рейтинг +819/-7
  • Потомок кузнеца Ильмаринена
    • Сибирский родословец
Re: дДНК (гаплогруппа Q)
« Ответ #40 : 03 Июль 2014, 21:36:39 »
Гаплотипы еще не появились?

Оффлайн ШадАвтор темы

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6316
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1275/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Re: дДНК (гаплогруппа Q)
« Ответ #41 : 03 Июль 2014, 21:44:56 »
Гаплотипы еще не появились?

Могу выслать доступный мне текст статьи. Гаплотипов там нет. И скорее всего и не будет. Они просто типировали образцы по снипам.

Оффлайн ШадАвтор темы

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6316
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1275/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Re: дДНК (гаплогруппа Q)
« Ответ #42 : 11 Октябрь 2015, 09:01:43 »
I0434   SVP47   Samara_Eneolithic   5200-4000 BCE   Khvalynsk II, Volga River, Samara   Russia   Q1a   

Терминальный снип - F2676.
То есть это уровень Q-MEH2
Что не сильно информативно:(

Источники:
http://www.biorxiv.org/content/early/2015/10/10/016477.full-text.pdf+html
https://docs.google.com/spreadsheets/d/1Vjbp450AwI7R-Y9J1YGSm9FjJWu9s9lx1azjUJbS8hQ/edit#gid=1120645201

Оффлайн Yurgan

  • Кто везёт, тому везёт
  • ...
  • Сообщений: 8239
  • Страна: gt
  • Рейтинг +819/-7
  • Потомок кузнеца Ильмаринена
    • Сибирский родословец
Re: дДНК (гаплогруппа Q)
« Ответ #43 : 11 Октябрь 2015, 09:16:41 »
I0434   SVP47   Samara_Eneolithic   5200-4000 BCE   Khvalynsk II, Volga River, Samara   Russia   Q1a   

Терминальный снип - F2676.
То есть это уровень Q-MEH2
Что не сильно информативно:(

Источники:
http://www.biorxiv.org/content/early/2015/10/10/016477.full-text.pdf+html
https://docs.google.com/spreadsheets/d/1Vjbp450AwI7R-Y9J1YGSm9FjJWu9s9lx1azjUJbS8hQ/edit#gid=1120645201
Это могут быть предки тех Q1a3, что есть на Кавказе и у русских Костромы - DYS437 = 15
« Последнее редактирование: 11 Октябрь 2015, 10:18:09 от Yurgan »

Оффлайн ШадАвтор темы

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6316
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1275/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Re: дДНК (гаплогруппа Q)
« Ответ #44 : 30 Ноябрь 2015, 09:38:34 »
I0434   SVP47   Samara_Eneolithic   5200-4000 BCE   Khvalynsk II, Volga River, Samara   Russia   Q1a   

Терминальный снип - F2676.
То есть это уровень Q-MEH2
Что не сильно информативно:(

Источники:
http://www.biorxiv.org/content/early/2015/10/10/016477.full-text.pdf+html
https://docs.google.com/spreadsheets/d/1Vjbp450AwI7R-Y9J1YGSm9FjJWu9s9lx1azjUJbS8hQ/edit#gid=1120645201

Получил доступ к БАМ и проверил "хвалынца". Параллельно его проверил уважаемый Семаргл.
Выводы совпали:
Q: V2083/F1237/M1077+
Q-L472: L528/F2676+

То есть - увы, в этом сиквенсе больше ничего нет, чтобы позволило идентифицировать этот образец по нижерасположенным субкладам.
Скорее всего - вымершая ветвь. Q1a*.

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.