АвторТема: Population Differentiation of Southern Indian Male Lineages Correlates...  (Прочитано 1447 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн пенелопаАвтор темы

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6476
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2706/-13
  • мтДНК: H1b
Population Differentiation of Southern Indian Male Lineages Correlates with Agricultural Expansions Predating the Caste System

http://www.plosone.org/article/info:doi/10.1371/journal.pone.0050269

GaneshPrasad ArunKumar1,13#, David F. Soria-Hernanz2,3#, Valampuri John Kavitha1,4#, Varatharajan Santhakumari Arun1, Adhikarla Syama1, Kumaran Samy Ashokan5, Kavandanpatti Thangaraj Gandhirajan6, Koothapuli Vijayakumar5, Muthuswamy Narayanan7, Mariakuttikan Jayalakshmi1, Janet S. Ziegle8, Ajay K. Royyuru9, Laxmi Parida9, R. Spencer Wells2, Colin Renfrew10, Theodore G. Schurr11, Chris Tyler Smith12, Daniel E. Platt9, Ramasamy Pitchappan1,13*, The Genographic Consortium¶

Abstract

Previous studies that pooled Indian populations from a wide variety of geographical locations, have obtained contradictory conclusions about the processes of the establishment of the Varna caste system and its genetic impact on the origins and demographic histories of Indian populations. To further investigate these questions we took advantage that both Y chromosome and caste designation are paternally inherited, and genotyped 1,680 Y chromosomes representing 12 tribal and 19 non-tribal (caste) endogamous populations from the predominantly Dravidian-speaking Tamil Nadu state in the southernmost part of India. Tribes and castes were both characterized by an overwhelming proportion of putatively Indian autochthonous Y-chromosomal haplogroups (H-M69, F-M89, R1a1-M17, L1-M27, R2-M124, and C5-M356; 81% combined) with a shared genetic heritage dating back to the late Pleistocene (10–30 Kya), suggesting that more recent Holocene migrations from western Eurasia contributed <20% of the male lineages. We found strong evidence for genetic structure, associated primarily with the current mode of subsistence. Coalescence analysis suggested that the social stratification was established 4–6 Kya and there was little admixture during the last 3 Kya, implying a minimal genetic impact of the Varna (caste) system from the historically-documented Brahmin migrations into the area. In contrast, the overall Y-chromosomal patterns, the time depth of population diversifications and the period of differentiation were best explained by the emergence of agricultural technology in South Asia. These results highlight the utility of detailed local genetic studies within India, without prior assumptions about the importance of Varna rank status for population grouping, to obtain new insights into the relative influences of past demographic events for the population structure of the whole of modern India.

Оффлайн Шад

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6332
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1328/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Re: Population Differentiation of Southern Indian Male Lineages Correlates...
« Ответ #1 : 29 Ноябрь 2012, 17:01:17 »
http://www.plosone.org/article/fetchSingleRepresentation.action?uri=info:doi/10.1371/journal.pone.0050269.s005
есть ссылка на таблицу с STR и снипами:
List of Y chromosome SNPS and haplotype data for the 1680 individuals from 31 tribal and non-tribal populations presented in this study.

По интересующей меня теме:
Q (M242)
Brahmins
Brahancharanam 19,05%
Vadama 6,35%

Warriors
Mukkuvar 11,76%

Вот сводная таблица распределения гаплогрупп по популяциям:
http://www.plosone.org/article/info:doi/10.1371/journal.pone.0050269?imageURI=info:doi/10.1371/journal.pone.0050269.t002

Оффлайн Centurion

  • 100% Earth (Solar System) genofond
  • Администратор
  • *****
  • Сообщений: 9548
  • Страна: ru
  • Рейтинг +571/-2
Re: Population Differentiation of Southern Indian Male Lineages Correlates...
« Ответ #2 : 30 Ноябрь 2012, 00:49:48 »
Опять Генографик убрал dys385, ну если не хотят его применять в Нетфорке ну зачем удалять из приложения? бред.

как всегда, хорошие выборки, но набор снипов ужасен  :)

Оффлайн Шад

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6332
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1328/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Re: Population Differentiation of Southern Indian Male Lineages Correlates...
« Ответ #3 : 30 Ноябрь 2012, 09:03:02 »
Ошибочка вышла с моими Q.
То ли верстальщики не так заверстали, то ли мне зрение окончательно изменило (напишите ваши мнения после изучения таблицы).
Короче  - столбец Q-M242 расположен левее. Проверено по количеству Q в таблице с STR/SNP: 26:1680=1,55%. Именно этот столбец характеризует Q.
В верхней строчке он почему-то упирается в надпись P-M45. Так и рождются мифы.

Итак, никаких брахманов.
Новая  (надеюсь правдивая) информация такова.
Q-M242 это надары. Перевод названия этой касты тоже более чем сромный "те, кто правит на земле".
В статье они поименованы фермерами. Но несмотря на то, что последние века большая часть надаров занимался культивированием пальмы, исторически это каста администраторов, счетоводов и предпринимателей. Это если верить Википедии, в которой, скрорее всего, надары писали сами про себя:)

В любом случае процент Q у них от 3,81 до 9,18 на двух достаточно больших выборках (59 и 98 человек).

Первый надар оказался очень близок к Аскару на 17 маркерах:
http://www.semargl.me/ru/dna/ydna/nearest-neighbors/50145/
Причем обращаю внимание GATA H4=10 минус 1 =9 (характерный признак Q1b).

Интересно, что из 26 Q указанных в таблице этот признак имеют все надары и 3 представителя ещё одной народности или касты - Pulayar.


Оффлайн Шад

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6332
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1328/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Re: Population Differentiation of Southern Indian Male Lineages Correlates...
« Ответ #4 : 01 Декабрь 2012, 09:46:18 »
Выяснилось, что это не единственная ошибка в верстке и журнал это уже признал.
Вот что выяснилось в группе проекта Q на ФБ
Цитировать
Guys, look at samples 997 and 998. Since when does 15/16 matching happen between Q and R1a? Something is wrong with the data file.
I have written a comment about the problem on the PLoS site. I see that someone else has posted there about a related problem in table 2..
They say they have fond the problem(s) and are working on corrections. Please be sure people do not use the raw data for analysis until corrections are posted.

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.