Анализ родства по данным Х-хромосомы

[митохондрия]

У нас в семье кроссинговер по Х не случился. Х - хромосома от деда через мать, т.е. меня,  перешла к внуку ( моему сыну) без изменений. И как рассчитывать людям родство при таком "безобразии", если подобное происходит в разных семьях время от времени?

[Farharaji]

Посему Вы можете верить хоть в марсиан, но Х хромосома, доставшаяся Вам от мамы содержит в себе смесь Х хромосомы дедушки и обеих Х хромосом бабушки (так как мама от своей мамы тоже получила смесь). Соответственно, когда мы смотрим на вот тот веер, иллюстрирующий наследование Х хромосомы, он отображает не потенциальных, а реальных доноров ДНК вашего Х. По крайней мере на несколько поколений вглубь. Дальше, естественно, чей-то материал выпал из наследования. Но можете считать это фактом - Ваша Х хромосома содержит в себе комбинацию Х обоих родителей Вашей мамы, а следовательно - обеих её бабушек и матернального дедушки (т.е., двух Ваших прабабушек и одного прадедушки). Можно пойти ещё чуть вглубь, и расшифровать, что Х Ваших прабабушек - это комбинация Х их родителей, а Х Вашего прадедушки - это Х его мамы (который, как я уже упоминал, есть комбинацией Х ее родителей).
Надеюсь, это тоже понятно.

Теперь смотрите - у вас - двоих мужчин - Х совпал аж на 26 сМ из 181. На самом деле это очень большой кусок. Как я уже показал выше, у родного деда с его внуком может быть 12 сМ. А теперь представим, что у этого деда две дочери (для удобства возьмём от разных жён) и от каждой - по внуку. И каждый совпал с ним на 12 сМ, а между собой - и того меньше (так как бабушки у них разные). А у вас 26 сМ. Другое дело, что у этих внуков должно быть аутосомное совпадение уровня от 150 сМ. А вот на поколение дальше - уже вполне может не быть аутосомного совпадения вообще.

Я бы порекомендовал Вам отобрать ближайшие уровни родства с потенциальным нулевым совпадением по аутосомам. Это 3,5 и 4юродные. И по ним пробежаться. Глядишь, что-то и выявится.

ПС зря Вы не верите в связи казахов с поляками, русскими и украинцами в ХІХ веке. Об этом можно почитать в дневниках Тараса Шевченко. Там, правда, закамуфлировано, но...

Я верю не в марсиан, а в здравый смысл. А он подсказывает что по казахской линии гораздо менее разумно искать, чем по татарской. А так да, в теории все может быть. И я в курсе о связях казахов с поляками, русскими и украинцами. Но понятно что это куда меньший вариант, причем намного. Может 26СМ в Х хромосоме это и большой кусок, это не аутосомы да и тут другие цифры и 26 тут вполне серьезный показатель. Может быть, но исключать что Х хромосома часть пути а может и половину от этого человека ко мне не выветривалась, то есть передавалась без помех нельзя. Х хромосома может быть гораздо более цепкой чем аутосомы. И поколениями не выветриваться по настоящему.
 Тот человек мне ответил, он русский(по крайней мере считает себя таким) с корнями из Тверской обл., город Бежецк.  Ну там северовосток Тверской обл. по карте. Еще часть корней из Пскова. Ну эпик, в том плане что за что тут ухватиться? У меня по X должны быть татары (или как вы настаиваете если по отцу матери, то казахи) Единственное что северные русские могли быть связаны с угрофиннским миром конечно, как и татары. А моя мито вполне может быть угрофинской. Разве что вот этот вариант, но думаю что оч. далекий. Не 4-5 поколений, а дальше конечно. Тем более нет аутосомного родства, только не надо говорить о том что аутосом может и не быть уже на 4 поколениях. Давайте смотреть средние уровни и иметь ввиду что для меня русские это как для вас какойнить англичанин даже хуже, другая раса практически

[Balymba]

sergm. а каково Ваше мнение по совпадению моей мамьі с другой женщиной (родство может идти только через ее неизвестного отца) 42 сМ по Х. Может єто бьіть дочь двоюродного брата мамьі ?

По аутосомам есть совпадение? От него надо сначала отталкиваться.

В теперешней интерпретации ФТДНА 122 см с наибольшим фрагментом 33 сМ. До изменений бьіло (если не ошибаюсь) 168 сМ.

Ну так это уровень двоюродной тёти/племянницы, троюродной сестры, с натяжкой 2.5юродной сестры. Ну и до 4.5юродного родства.
То есть, если коротко - то да, может.
Судя по вопросу, там НДБО?

Со слов совпаденки она плод одиночной связи ее матери с мужчиной в командировке. Поскольку дело бьіло в Канаде 1980 год, то список родственников мамьі мужского пола и подходящего возраста очень ограничен : двоюродньій брат и возможно существовавшие троюродньіе братья (найти по єтой ветке семьи брата бабушки моей мамьі ничего не удается). Аутосомньіе совпадение у канадийки есть со всеми из клана моих родственников.

[Farharaji]

Ну в 9покрлений я поверю запросто,  а не в 4-5 как ранее вы говорили.  И то что русский ничего не значит,  скорее у него татары или какие угрофинны просто он не знает. Он вообще как я понял не разбирается и не занимается генеалогией,  тестами.. Я тоже генеалогией так то не занимаюсь. И уж никого у меня нет из того что я знаю даже близко с намеком в те края. Если искать,  то стартовать мне надо с Татарстана (да и вообще посетить имено село митопрабабки неплохо бы думаю как-нибудь. Пока думаю это все явно в долгий ящик ляжет . И да,  меня самого в ФТдна нету.

[Farharaji]

 У меня полногеномка, урезанная до уровня all snps combined для гедматча(но все равно это куда больше инфы чем обычные фэмили фандер или 23эндми)
У "совпаденца" (но подчеркну он совпаденец только по иксам, никаких аутосом общих НЕт, так что совпаденец -ГРОМКО сказано) написано в гедматче Migration - F2 - H Что это значит я не знаю, но наверняка какое то научное исследование. И да, прогнал я его рез в калькуляторе. Например MDLP World22
#   Population   Percent
1   North-East-European   59.28
2   Atlantic_Mediterranean_Neolithic   17.51
3   West-Asian   4.69
4   Samoedic   4.27
5   North-European-Mesolithic   2.85
6   Near_East   2.19
7   North-Siberean   1.66
8   East-South-Asian   1.58
9   Indo-Iranian   1.56
10   East-Siberean   1.56

Почти 5% зап. азии, свыше 4% самоедов Нет восточных корней? ага, поверили
Using 1 population approximation:
1 Mordovian_V_derived @ 5.088784
2 Ukrainian_V_derived @ 6.535326
3 Ukrainian-West_derived @ 6.722512
4 Mordovian_derived @ 6.927584
5 Ukrainian-Center_derived @ 7.600473

Using 2 populations approximation:
1 50% Polish_derived +50% Tatar_Kryashen_derived @ 2.510698


Using 3 populations approximation:
1 50% Russian_V_derived +25% Sorb_derived +25% Tatar_derived @ 1.930078


По 2м популяциям калькуль уверяет что смесь поляка и татара-крящена. По 3м, что полурусский четвертьтатарин


Using 4 populations approximation:
+++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++
1 Czech_derived + Russian_derived + Russian_V_derived + Tatar_derived @ 1.653482
2 Russian_V_derived + Sorb_derived + Sorb_derived + Tatar_derived @ 1.654135
3 Chuvash_derived + Czech_derived + Russian_cossack_derived + Russian_cossack_derived @ 1.739614
4 Belarusian_V_derived + Russian_V_derived + Sorb_derived + Tatar_derived @ 1.767630
5 Chuvash_derived + Russian_derived + Slovenian_derived + Sorb_derived @ 1.778646
6 Chuvash_derived + Czech_derived + Russian_cossack_derived + Russian_V_derived @ 1.779145
7 Chuvash_derived + Czech_derived + Russian_Center_derived + Sorb_derived @ 1.787384
8 Chuvash_derived + Sorb_derived + Sorb_derived + Ukrainian_V_derived @ 1.793976

Ну и 4 популяции дают тоже. Полурусский четьверть татарин четверть может быть чтото еще...Ну в общем, всё понятно, есть у него татарское, просто не знает сам.

[Farharaji]

 А щас прогоню 2го совпаденца по Иксу моего -девушка с канадским доменом почты с 12,6cM общих со мной.
И снова MDLP World22
всего 5 популяций из 22 присутствуют(первый раз такое вижу!) Но
#   Population   Percent
1   North-East-European   60.19
2   Atlantic_Mediterranean_Neolithic   21.01
3   West-Asian   8.43
4   North-European-Mesolithic   4.70
5   North-Amerind   1.14
 Западной азии 8.5 процентов


Using 1 population approximation:
1 Ukrainian_V_derived @ 5.430867
2 Ukrainian-Center_derived @ 5.652051
3 Ukrainian-West_derived @ 5.684805
4 Mordovian_V_derived @ 7.101020
5 Slovakian_derived @ 7.515798

Однако..Украина "отаке" ,хм

Using 2 populations approximation:
1 50% German_derived +50% Russian_South_derived @ 3.590785


Using 3 populations approximation:
1 50% German_derived +25% Latvian_derived +25% Latvian_V_derived @ 3.360307
 На 2-3 популяциях вообще все запуталось -немцы и латыши подключились

ну и конечно самое главное -метод 4х популяций

Using 4 populations approximation:
++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++
1 Latvian_V_derived + Mordovian_derived + Swedish_derived + Ukrainian-Center_derived @ 3.128087
2 Estonian_derived + German_derived + German_derived + Latvian_V_derived @ 3.129505
3 German-North_derived + Latvian_V_derived + Russian_North_derived + Ukrainian-Center_derived @ 3.146085
4 German_V_derived + Latvian_V_derived + Russian_North_derived + Russian_South_derived @ 3.218959
5 German_V_derived + Latvian_V_derived + Polish_V_derived + Russian_North_derived @ 3.232117
6 Estonian_derived + Latvian_V_derived + Latvian_V_derived + Norwegian_V_derived @ 3.235302
7 Latvian_V_derived + Norwegian_V_derived + Russian_South_derived + Russian_South_derived @ 3.244103
8 Latvian_V_derived + Mordovian_V_derived + Swedish_V_derived + Ukrainian-Center_derived @ 3.271945
9 CEU_derived + Estonian_derived + Latvian_V_derived + Mordovian_V_derived @ 3.279674

Есть вариант с четвертьмордовскостью! Ну и явно что-то из Украины. Конечно есть вариан с русскими, прибалтами и даже германцами...но думаю это не по иксу...скорее по иксу мордовскость(или украинскость) Да, аутосомно тоже ничего нет! Тоже галимый ИКС

[митохондрия]

У нас в семье кроссинговер по Х не случился. Х - хромосома от деда через мать, т.е. меня,  перешла к внуку ( моему сыну) без изменений.

Т.е., у деда с внуком по Х совпадение 181 сМ на FTDNA? Такое, конечно же, возможно, точно так же, как и 0 сМ. Но это скорее экстремальные случаи.

Да, глянула в Гедматч ( у сына анализ в 23andme, а не в FTDNA)
181.1

[ALB]

На скринах сравнение на хромосомном браузере генома женщины с родной сестрой отца (синий сегмент) X Match 72 cM  и двоюродной сестрой , являющейся дочерью родной сестры матери (красный сегмент) X Match
147 cM.
Значит ли это , что есть общие предки по женским линиям ?

[mikhail a.]

Решил проверить возможности механизма совпадений по X-хромосоме и, так сказать, "откалибровать" его для с ебя на практическом примере. Для этого использовал имеющиеся в ФТДНА образцы с дворянским корнями, генеалогия которых по понятным причинам хорошо прослеживается всем линиям. У одного из таких образцов было всего 2 совпадения по Х-хромосоме. Один из совпаденцев оказался также представитель российского дворянства с понятной генеалогией. Величина совпадения - 11 сМ. В результате углубления по предковым линиям по правилам Х-хромосомы у обоих обнаружилась единственная общая прапрабабушка - Екатерина Николаевна Карамзина (1806—1867), дочь историка.
Таким образом, родство мужских образцов в 4 колене дало по Х-хромосоме 11 сМ.

[Evgeny Kolchugin]

Таким образом, родство мужских образцов в 4 колене дало по Х-хромосоме 11 сМ.

Учитывая, что у женщин Х-хромосома подвергается кроссоверингу, размер общего фрагмента должен существенно зависеть от количество женщин между общим женским предком и исследуемыми. Интересно, как обстояло дело у ваших? Возможные варианты для мужских образцов в 4 колене:
ЖЖЖЖМ
ЖЖМЖМ
ЖМЖЖМ

[mikhail a.]

Учитывая, что у женщин Х-хромосома подвергается кроссоверингу, размер общего фрагмента должен существенно зависеть от количество женщин между общим женским предком и исследуемыми. Интересно, как обстояло дело у ваших? Возможные варианты для мужских образцов в 4 колене:
ЖЖЖЖМ
ЖЖМЖМ
ЖМЖЖМ

В данном случае между общим предком и трестируемыми было по одному мужскому переходу в обоих случаях.

[shink]

Расмотрим такой кейс. У женщины протестированной в FTDNA на FF совпадение со своей тетей (сестрой матери) на X -хромосоме 163 См. Со своим сыном она имеет совпадние 181 См (полная хромосома). Правильно я понимаю, что она получила от матери что-то около 160 См, а от бабушки по отцу только порядка 20 См? Правильны ли такие рассуждения?

[Oxon]

  Дядя по матери и племянник (сын сестры) оба получили свою Х хромосому из приблизительно одного источника.  Оба не рекомбинируют.  Однако совпадение всего 30сМ.   

[valera27]

  Дядя по матери и племянник (сын сестры) оба получили свою Х хромосому из приблизительно одного источника.  Оба не рекомбинируют.  Однако совпадение всего 30сМ.

В смысле не рекомбинируют? Не рекомбинируют они при передаче мужчинами своим дочерям (как получили от мамы, так и передали дальше). А у Ваших сестры, мамы и бабушки наверняка было все в порядке с рекомбинацией, и особенно с кроссинговером)))

[Tusya84]

Добрый день.
У меня  есть совпадение по X Match 29 см, это заслуживает внимания или это очень маленькое количество см?
Спасибо.