Анализ родства по данным Х-хромосомы

[Елена Александровна]

Виват показанным сегментам на Х -хромосоме!
http://forum.molgen.org/index.php/topic,2254.msg228152.html#msg228152

[Людмила]

А у меня сегодня такая вот эпопея разворачивается по Х хромосоме. Написал немец, у матери которого я 2ая по совпадению - 13 сегментов
Largest segment = 8.5 cM
Total of segments > 3 cM = 63.5 cM Actual
У меня, если сравнивать весь геном, ее вообще нет в совпаденцах. Но если сравнивать Х от 2х китов, то  - вышеприведенные результаты.
Смотрю своих родителей. У отца - 0, у мамы -
Largest segment = 4.8 cM
Total of segments > 3 cM = 20.8 cM Actual.
Откуда взялись мои сегменты? Материнские у меня присутствуют, не точь- в точь, но из тех же районов. А 2/3 составных?
У моих детей поменьше, чем у меня, но больше, чем у бабушки.
Однозначно можно сказать, что общие сегменты что-то отражают (у кого-то их нет), но насколько это соответствует действительности?

[ladybel]

Интересно это у всех такое огромное количество Х-матчей как у меня? Да еще целыми кусками до 20 сМ доходят, чего не скажешь об аутосомных матчах ((
И опять же, русских почти нет.

[митохондрия]

Интересно это у всех такое огромное количество Х-матчей как у меня? Да еще целыми кусками до 20 сМ доходят, чего не скажешь об аутосомных матчах ((
И опять же, русских почти нет.

Потому-что русские еще не развились достаточно, чтобы исследовать свои геномы.

[rLin]

ladybel, не у всех. У меня только 5 человек с самым длинным блоком 9.69 сМ. Правда данные импортированы из 23andMe.

[kbg]

Из моих 6 профилей:

у меня - нет никого (в свою табличку я записываю только тех, кто не совпадает с мамой или тетей по отцу)
у мамы - 5, из них три 11-16 сМ, один 9 с копейками и один 8 сМ
у тети - 3, из них только два 9 сМ и больше
у двоюродного брата со стороны мамы нет совпаденцев на Х-хр.
у мужа - один (9 сМ)
у друга - один (пока? его результаты получены только пару месяцев назад)

[ladybel]

когда я сортирую по наибольшему куску на Х, то на 1500-м матче он составляет 8.3 сМ
а когда я делаю то же самое для аутосомных матчей, то самый длинный кусок только начинается с 10, не считая пару матчей

[Don]

Интересно это у всех такое огромное количество Х-матчей как у меня? Да еще целыми кусками до 20 сМ доходят, чего не скажешь об аутосомных матчах ((
И опять же, русских почти нет.

Вот у меня три девицы в Гедматче истинные западноевропейки (проверил их по этнокалькуляторам). Откуда у моей маменьки эта Х-хромосома - не понятно, все русские.  Вот таперича я аглицкай жентильмен.

[Mich Glitch]

когда я сортирую по наибольшему куску на Х, то на 1500-м матче он составляет 8.3 сМ
а когда я делаю то же самое для аутосомных матчей, то самый длинный кусок только начинается с 10, не считая пару матчей

Честно сказать, как-то в пол глаза просматривал тему, но сдаётся мне, что у Вас элементарный баг с представлением данных: типа, вместо икс родичей показываются аутосомные, а вместо аутосомных родичей, те что по иксу.

Ваше огромное количество Х-хромосомных родичей где показывается?
Непосредственно в ДНАрелативз + встроенные хромосомные браузеры (или же ФФ, если Вы делали тест у ФТДНА)?
Или же в ГедМатче?

[ladybel]

когда я сортирую по наибольшему куску на Х, то на 1500-м матче он составляет 8.3 сМ
а когда я делаю то же самое для аутосомных матчей, то самый длинный кусок только начинается с 10, не считая пару матчей

Честно сказать, как-то в пол глаза просматривал тему, но сдаётся мне, что у Вас элементарный баг с представлением данных: типа, вместо икс родичей показываются аутосомные, а вместо аутосомных родичей, те что по иксу.

Ваше огромное количество Х-хромосомных родичей где показывается?
Непосредственно в ДНАрелативз + встроенные хромосомные браузеры (или же ФФ, если Вы делали тест у ФТДНА)?
Или же в ГедМатче?

в ГедМатче
на аутосомных матчах-то как раз впереди русские, человек 5-6. Так что не думаю что что-то перепутано. Да и с ФТДНА совпадает.
Х-матчи странные, посмотрите сами, отсортируйте по Х
Там кого только нету

[Mich Glitch]

в ГедМатче
на аутосомных матчах-то как раз впереди русские, человек 5-6. Так что не думаю что что-то перепутано. Да и с ФТДНА совпадает.
Х-матчи странные, посмотрите сами, отсортируйте по Х
Там кого только нету

Не буду пока ничего сортировать, а задам второй наводящий вопрос:
Вы тестировались в 23эндМи, или в ФФ

[ladybel]

в ГедМатче
на аутосомных матчах-то как раз впереди русские, человек 5-6. Так что не думаю что что-то перепутано. Да и с ФТДНА совпадает.
Х-матчи странные, посмотрите сами, отсортируйте по Х
Там кого только нету

Не буду пока ничего сортировать, а задам второй наводящий вопрос:
Вы тестировались в 23эндМи, или в ФФ

в ФФ

[Mich Glitch]

в ФФ

Прекрасно!
Сколько матчей по игрек хромосоме показывает Ваш ФФ лист?

[ladybel]

Прекрасно!
Сколько матчей по игрек хромосоме показывает Ваш ФФ лист?

по-моему вообще нет ((

[Mich Glitch]

по-моему вообще нет ((

И не удивительно.
У меня более двух десятков протестированных документальных родственников только в ФФ.
А вот матч по игрек хромосоме имею только с мамой: