Анализ родства по данным Х-хромосомы

[Mich Glitch]

Итак.
Моё предположение оказалось верным: баг!
Гедматч вообще программа (сервис, в смысле) сыроватая. Особенно при кроссплатформенных заморочках.
Извиняюсь, что не обратил внимание на Ваши посты ранее. Возможно сэкономил бы Ваше время.     

[ladybel]

Итак.
Моё предположение оказалось верным: баг!
Гедматч вообще программа (сервис, в смысле) сыроватая. Особенно при кроссплатформенных заморочках.
Извиняюсь, что не обратил внимание на Ваши посты ранее. Возможно сэкономил бы Ваше время.     

я нашла в ФТДНА 4 Х-матча. Вообще, Гедматч показывает мне матчи, которых нет в ФТДНА, но все же, есть определенные люди, тестировавшиеся в 23 и анцестри, которых Гедматч выдает как абсолютно идентичные матчи, или с небольшой погрешностю. Неужели все это ерунда и тогда непонятно, зачем нам вообше Гедматч тогда нужен. Думаю что в ФТДНА очень сильные фильтры, по кол-ву снипов итд, а мои Х-матчи почти все недобирают на аутосомах до 7 сМ. Кстати я на ФТДНА даже не вижу самый большой цельный кусок разшареный, а только тотал ((
Думала еще может удалить и заново загрузить мои файлы?

[Mich Glitch]

А каковы наибольшие размеры УПСов у Вас в ФФ?

Не хотел озвучивать эту версию, дабы не обвинили меня в мужском шовинизме, но есть у меня определённые подозрения, что это Вы, а не ГедМатч делаете что-то не так.     

Поэтому повторю вопрос. Каковы размеры наибольшего блока (Longest Block) у Ваших первых в списке ФФ родичей?

[ladybel]

А каковы наибольшие размеры УПСов у Вас в ФФ?

Не хотел озвучивать эту версию, дабы не обвинили меня в мужском шовинизме, но есть у меня определённые подозрения, что это Вы, а не ГедМатч делаете что-то не так.     

Поэтому повторю вопрос. Каковы размеры наибольшего блока (Longest Block) у Ваших первых в списке ФФ родичей?

Уважаемый Mich Glitch, вообще-то в ФФ отображение матчей уже не раз менялось, потому не увидев сразу Лонгест Блок и не стала искать,
Вот все матчи на ФФ-
Full Name   Shared cM   Longest Block
Andrey Nikolaevich Tolmachev   72,29   23,14
Kathleen Germaine Gregory   28,22   13,29
Andrey  Bykanov   41,92   12,83
Raymond P Paicewicz   42,20   12,36
Vasily   Filippskiy   38,90   12,11
Merlin James Hopp   32,53   11,30
Alex   Sapelin A.   28,82   11,20
Pat  Vichas   35,73   10,29
Melker  Olsson   25,67   10,23
William Garvin Hall   28,93   9,99
Donald  Tachick   21,41   9,91
Ira Bernard Brown   26,93   9,87
Joyce Eve Neubeck   34,43   9,67
Nikolay  Khmelevskoy   33,90   9,21
Michael F. Jones   23,86   9,16
Robert Charles Preuss   30,63   9,05
Gheorghe  Taut   28,01   9,00
Alex  Pulisic   37,02   9,00
Millicent Miller Benbow   30,75   8,80
M  Holkko   30,24   8,79
Sergey Grigoryevich Sizov   26,99   8,75
Todd  Truitt   24,51   8,67
Dmitri  Yashchuk   37,94   8,49
James Muny Corbett   27,53   8,45
Henry  Wysmulek   29,12   8,41
John  Poglodzinski   27,40   8,35
Andrea G Ramirez   33,74   8,30
Tamara  Volkova   31,11   8,27
Janet  Mashensic   32,55   8,09
Nichlas Ted Strandberg   27,66   8,09
N.  P.   34,87   8,08
Kathy  Hornberger   42,02   7,98
Ruth  Hornberger   29,12   7,98
Arkadiy  Skripkin   37,48   7,87
ALFRED VINCENT KOUTNIK   32,21   7,86
Harri  Haikka   24,74   7,86
E  Williamson   22,11   7,83
Sam  Burgess   25,34   7,79
Dimitri A. Vorobiov   27,27   7,73
Wendel  Schaefer   20,75   7,70
Мои Х-матчи-

Ms. Pat Vichas
Janet Mashensic
Miss Tamara Volkova
Kathy Hornberger

А вот Х-матчи не копируются в Excel, а в XML, и самый длинный блок я найти не смогла.
Этих людей мне Гедматч не отображает, как впрочем половину всех ФФ родичей. Хотя вторую половину очень даже хорошо отображает. Это может потому что не все сидят в Гедматче. Но есть люди в Гедматче, тестировавшиеся в ФТДНА которые не отображаются в ФТДНА, у которых по Гедматчу пересечения со мной не меньше чем у тех, что показываются в ФТДНА как родственники.То есть те же 10-12сМ целым куском.  Из этих людей многие имеют по два-три кита в разных компаниях, и во всех китах на Гедматче у меня с ними одинаковые пересечения. Это можно объяснить только разницей в алгоритмах Гедматча и ФТДНА. По Х может быть абсолютно то же самое.  )) Исходя из вашей логики,почти все сотни Гедматчевских матчей ненастоящие? И не только у меня но и у всех здесь присутствующих форумчан?
Вот моей Х-хромосоме вообще не везет, Сначала у МакДональда она не отобразилась хотя я ее действительно посылала, проверила.Теперь непонятные  X-матчи на Гедматче. Вообще у меня было подозрение что произошла какая-то ошибка и вместо моей Х прикрепилось чужое.  Вы собственно даже не захотели зайти на мой Гедматч хотя это вам вышло в максимум пять минут. У меня на ФФ немного матчей как и у любого русского. А на Гедматче у всех несколько сотен - это нормально. В чем здесь может быть какая-то моя ошибка, чисто гипотетически?

[Mich Glitch]

Итак, имеем:

Full Name   Shared cM   Longest Block
Andrey Nikolaevich Tolmachev   72,29   23,14
Kathleen Germaine Gregory   28,22   13,29
Andrey  Bykanov   41,92   12,83
Raymond P Paicewicz   42,20   12,36
Vasily   Filippskiy   38,90   12,11
Merlin James Hopp   32,53   11,30
Alex   Sapelin A.   28,82   11,20
Pat  Vichas   35,73   10,29
Melker  Olsson   25,67   10,23
William Garvin Hall   28,93   9,99
Donald  Tachick   21,41   9,91
Ira Bernard Brown   26,93   9,87
Joyce Eve Neubeck   34,43   9,67
Nikolay  Khmelevskoy   33,90   9,21
Michael F. Jones   23,86   9,16
Robert Charles Preuss   30,63   9,05
Gheorghe  Taut   28,01   9,00
Alex  Pulisic   37,02   9,00
Millicent Miller Benbow   30,75   8,80
M  Holkko   30,24   8,79
Sergey Grigoryevich Sizov   26,99   8,75
Todd  Truitt   24,51   8,67
Dmitri  Yashchuk   37,94   8,49

т.е. в начале списка идёт солидная группа с УПСами от 23.14 сМ до 8.49 см.
Дмитрий Ящук, кстати, мой родственник, с глубоко проработанной генеалогией. Я же его и тестировал. Иными словами, Вы, похоже, имеете отношение к моему предковому селу Черемошное.   

Рассуждаем дальше.

ФФ лист, где-то раз в 13 меньше листа ДНАрелативз у 23эндМИ. Т.е., если в ФФ листе у Вас имеется 10 человек с размерами УПСов 10 сМ и больше, то у 23эндМи может быть ещё 130.
Понятное дело, что имеем вероятностные оценки и самый широкий разброс. Но на круг выходит среднестатистическая постсоветская цифирь где-то в 140 человек.
Допустим, только 5-10% от всех тестированных перенесли свои данные на ГедМатч. Значит там предполагается человек 5-15 с размерами УПСов более 10 сМ.

Про совпадения по Х-хромосоме и про то, что не захожу на Ваш аккаунт.

Во-первых, в Вашем изложении мне послышалась какая-то иррегулярность. Именно поэтому и ответил.
Во-вторых, пословица гласит, лучше один раз увидеть. Смотрите, я пару сообщений тому назад, дал скриншот. Сразу отпала необходимость в куче слов.
Чем куда-то ходить (да, ещё и на неполностью сейчас функционирующий сайт) просто поместите, пожалуйста, два скриншота.
На первом начало листа ГедМатч, отсортированного по размерам УПСов на аутосомах.
Во втором начало листа ГедМатч, отсортированного по размерам УПСов на Х-хромосоме.

Сразу можно будет увидеть, действительно ли Ваша ситуация настолько выбивается из общего ряда, или же всё в пределах нормы.

[ladybel]

т.е. в начале списка идёт солидная группа с УПСами от 23.14 сМ до 8.49 см.
Дмитрий Ящук, кстати, мой родственник, с глубоко проработанной генеалогией. Я же его и тестировал. Иными словами, Вы, похоже, имеете отношение к моему предковому селу Черемошное.   

ФФ лист, где-то раз в 13 меньше листа ДНАрелативз у 23эндМИ. .

Я заметила фамилию Темош в электронном адресе, но не стала сразу спрашивать, оставила так сказать, на закуску 
Вероятно единственное что я не так сделала - что выбрала ФФ а не 23эндМи. 
Тоько что пять раз пыталась сделать скриншоты пока Гедматч еще ко мне благоволил. Успела сделать только 2, отсортированный по генерациям и по наибольшему куску на Х-хромосоме. Остальное попытаюсь как Гедматч нормально заработает.

[Mich Glitch]

Я заметила фамилию Темош в электронном адресе, но не стала сразу спрашивать, оставила так сказать, на закуску 

Не правильно.
Возможно, это единственное основное блюдо.
Вряд ли кто на просторах интернета (русскоговорящего точно) предоставит Вам по родичам генеалогию, выведенную для всех линий.
Т.е. имеется серьёзный шанс с ходу получить по какой-то из собственных фамильных линий проработанное предковое родословие.

[Mich Glitch]

Вероятно единственное что я не так сделала - что выбрала ФФ а не 23эндМи. 

И тут не согласен.
23эндМи, несмотря на всю свою огромную базу, находится сейчас на этапе, если не загнивания, то стагнации.

Вы,, кстати, триангуляцию по Ящуку сделали? Будет второй из протестированных мною образцов (если, конечно, будет), уже можно произвести локализацию нужной предковой линии.

Если же везение будет столь велико, что появится пара и больше моих сэмплов - линию Вам назову со всей определённостью.

*** Но об этом лучше в соответствующей ветке.

[Mich Glitch]

Тоько что пять раз пыталась сделать скриншоты пока Гедматч еще ко мне благоволил. Успела сделать только 2, отсортированный по генерациям и по наибольшему куску на Х-хромосоме. Остальное попытаюсь как Гедматч нормально заработает.

Да, ГедМатч он такой.
Кроме того, у меня личный опыт общения с держателями-разработчиками сайта, который закончился абсолютно ничем.
Бурно пытались сделать фазирование (сборный гаплотип для недостающего родителя). Исписали кучу писем. Перепробовали варианты. Так и не заработало.     

Действительно показывает целую кучу Х хромосомных родичей. Что, на мой взгляд, не есть правильно.

Что советую сделать:

1. Посмотрите своих 4 Х-хромосомных родичей в ФФ листе и по размерам УПСа, данного ФТДНА, попытайтесь их найти в ГедМатч. Шансы слабы, что именно нужные ребята свои данные в ГедМатч загрузили, но попытка не пытка.

2. Попытайтесь найти имена из ГедМатч списка в своём ФФ списке.

3. Пункт последний, но самый лёгкий.   Дайте, пожалуйста размеры Х-хромосомных УПСов Ваших четырёх родичей. Посмотрим на порядок величин.

[ladybel]

1. Посмотрите своих 4 Х-хромосомных родичей в ФФ листе и по размерам УПСа, данного ФТДНА, попытайтесь их найти в ГедМатч. Шансы слабы, что именно нужные ребята свои данные в ГедМатч загрузили, но попытка не пытка.

2. Попытайтесь найти имена из ГедМатч списка в своём ФФ списке.

3. Пункт последний, но самый лёгкий.   Дайте, пожалуйста размеры Х-хромосомных УПСов Ваших четырёх родичей. Посмотрим на порядок величин.

1. Пока никого не нашла . Кстати, куда делась функция поиска по определенному участку хромосомы на Гедматче?
2.я нахожу только тех кто без X- матч в ФТДНА. Одна особа у меня в ФТДНА без Х-матча а в Гедматче с Х-матчем- Миллер
3.Х-пересечения на ФФ очень маленькие, 1.5-1.8 сМ, кроме Кэти Хорнбергер, где он около 5 сМ

[Mich Glitch]

3.Х-пересечения на ФФ очень маленькие, 1.5-1.8 сМ, кроме Кэти Хорнбергер, где он около 5 сМ

Склоняюсь всё-таки к тому, что с Вашим сэмплом у ГедМатч имеем какой-то необычный баг.

Возможно Вам действительно лучше:
а) удалить аккаунт на ГедМатч;
б) закачать данные у FTDNA;
в) залить данные на ГедМатч.

[митохондрия]

23эндМи, несмотря на всю свою огромную базу, находится сейчас на этапе, если не загнивания, то стагнации.

 

Надеюсь, что все же не увянут совсем. Я как раз собралась у них тестироваться, на днях образцы отправляю...

[kbg]

Я уверена, что не увянут. Правда, у меня такое впечатление, что туда в последнее время хлынули усыновленные дети в поисках родни - а это, конечно, не так чтоб облегчает поиск общих предков.

[Елена Александровна]

Я уверена, что не увянут. Правда, у меня такое впечатление, что туда в последнее время хлынули усыновленные дети в поисках родни - а это, конечно, не так чтоб облегчает поиск общих предков.

Да.
У меня тоже есть с усыновленными предками и в 23andMe и в FTDNA! 
Зато они более активно сами идут на контакт.
А это уже большой плюс!

[Елена Александровна]

Продублирую свой вопрос в этой теме из темы по Гедматчу, т.к. он касается именно Х-хромосомы.

Проанализировала по ком моя кузена из 23andMe ( я там тоже в прошлом году делала тест) по отцу или маме.

Получается по отцу... Но интересная картина.
С мамой вроде бы 0  до 3 сМ.

А вот у отца Х с ней нет.
Зато у меня есть! И общих сМ на 0,5 больше... И 7,9сМ - иксов, которых не показывают ни у отца ни у мамы.

Это различия тестов FTDNA и 23andMe?
Но у меня с родителями и общие и иксы показаны.

Народ! Мне пока никто так и не ответил! Как это произошло??