АвторТема: R1a и 1KG/PGP проекты  (Прочитано 28309 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн Semargl

  • "El sueño de la razón produce monstruos" ©
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 6043
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4281/-5
  • www.semargl.me
    • www.semargl.me
  • Y-ДНК: R1a [CTS3402+]
  • мтДНК: U4a2g
Re: R1a и 1KG/PGP проекты
« Ответ #60 : 21 Май 2013, 13:04:32 »
Очередное обновление схем снипов для Z93.
Благодаря Centurion'u мы наскребли еще несколько снипов.

Схема для Z2124:
1) Добавлен снип Y941 - эквивалент Y47, который уже доступен для заказа.
2) Добавлены снипы Y940, Y942, Y943 - эквиваленты Y615 и др

Схема для L657:
1) Добавлен снип Y944 под Y25, Y30.
2) Добавлен снип Y945, под Y7 и братский для Y29, собравший все ветви Y7+(xY29).
3) Регион происхождения семплов обозначен цветом.

Оффлайн asan-kaygy

  • ...
  • Сообщений: 9639
  • Страна: kz
  • Рейтинг +945/-5
  • Y-ДНК: R1a1a1b2a1a-L657+,Y9+,Y944+
Re: R1a и 1KG/PGP проекты
« Ответ #61 : 21 Май 2013, 18:03:10 »
Интерсно, когда это все станет доступно для заказа.

Оффлайн CenturionАвтор темы

  • 100% Earth (Solar System) genofond
  • Администратор
  • *****
  • Сообщений: 9543
  • Страна: ru
  • Рейтинг +571/-2
Re: R1a и 1KG/PGP проекты
« Ответ #62 : 21 Май 2013, 18:20:35 »
Интерсно, когда это все станет доступно для заказа.
все - никогда... только для фулл-сиквенса  :)

Оффлайн Semargl

  • "El sueño de la razón produce monstruos" ©
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 6043
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4281/-5
  • www.semargl.me
    • www.semargl.me
  • Y-ДНК: R1a [CTS3402+]
  • мтДНК: U4a2g
Re: R1a и 1KG/PGP проекты
« Ответ #63 : 02 Август 2013, 10:42:02 »
Новости от YFull
Небольшое обновление дерева с семплами 1кг.
Автоматически обновлено дерево, в соответствии с последней версией ISOGG, и добавлением некоторых субкладов, расположение которых не вызывает сомнения.
К сожалению ISOGG слишком медленно обновляет свое дерево)

R1a

Оффлайн Andymeon

  • Сообщений: 1179
  • Страна: ru
  • Рейтинг +119/-5
  • Y-ДНК: R1a [CTS 3402+ Y2910+ YP310+]
  • мтДНК: H3i
Re: R1a и 1KG/PGP проекты
« Ответ #64 : 02 Август 2013, 12:28:52 »
Цитировать
обновление дерева с семплами 1кг.
В отпуск пора....не мог понять как это : один килограмм семплов  ;D

Оффлайн CenturionАвтор темы

  • 100% Earth (Solar System) genofond
  • Администратор
  • *****
  • Сообщений: 9543
  • Страна: ru
  • Рейтинг +571/-2
Re: R1a и 1KG/PGP проекты
« Ответ #65 : 02 Август 2013, 12:30:15 »
Цитировать
обновление дерева с семплами 1кг.
В отпуск пора....не мог понять как это : один килограмм семплов  ;D

все правильно

1KG = 1000G

Оффлайн napobo3

  • Сообщений: 1259
  • Страна: il
  • Рейтинг +348/-2
  • Y-ДНК: J-FGC5231
  • мтДНК: N1b2
Re: R1a и 1KG/PGP проекты
« Ответ #66 : 02 Август 2013, 18:31:37 »
Имеется в виду: семплы из проекта 1000 геномов.
(их там под три тыщи :)

Оффлайн Semargl

  • "El sueño de la razón produce monstruos" ©
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 6043
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4281/-5
  • www.semargl.me
    • www.semargl.me
  • Y-ДНК: R1a [CTS3402+]
  • мтДНК: U4a2g
Re: R1a и 1KG/PGP проекты
« Ответ #67 : 12 Август 2013, 12:50:42 »
Появился новый образец с полным сиквенсом Y хромосомы.
Z280+ CTS1211+ CTS3402+ Y32+ Y33- Y34+ Y35+ Y36-
таким образом уточняется иерархия снипов лежащих под CTS3402.
Y33 и Y36 расположены ниже CTS3402 и скорее всего маркируют одну или несколько ветвей.

Оффлайн Semargl

  • "El sueño de la razón produce monstruos" ©
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 6043
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4281/-5
  • www.semargl.me
    • www.semargl.me
  • Y-ДНК: R1a [CTS3402+]
  • мтДНК: U4a2g
Re: R1a и 1KG/PGP проекты
« Ответ #68 : 12 Август 2013, 13:57:45 »
Обновил схему для Z280 с учетом новых изменений.

Оффлайн VVizard741

  • 600 years on the river Northern Dvina
  • Сообщений: 1022
  • Страна: ru
  • Рейтинг +253/-0
  • Vilegodskaya Permtsa - SolVychegodsk
    • Православные приходы и монастыри Севера
  • Y-ДНК: R1a-YP951-FGC39315 6. Vorontsov clan
  • мтДНК: H3*, мж: T1a*; ммж: U5b2a1a2
Re: R1a и 1KG/PGP проекты
« Ответ #69 : 12 Август 2013, 17:25:18 »
Y33 и Y36 расположены ниже CTS3402 и скорее всего маркируют одну или несколько ветвей.
Отлично ! Остается ждать, когда будут доступны для заказа :(.

Оффлайн Lesla

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 9656
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2962/-10
  • FTDNA: 154400 (Big Y - 283049)
  • Y-ДНК: R1a-YP682 (VK06+)
Re: R1a и 1KG/PGP проекты
« Ответ #70 : 14 Август 2013, 08:11:29 »
Спасибо за интересные новости!

Оффлайн Nimissin

  • Сообщений: 2403
  • Рейтинг +759/-0
  • Y-ДНК: N-M178 L839+ P298+ M2019+ M2118+ M1991+ M1988+
  • мтДНК: C4b12a
Re: R1a и 1KG/PGP проекты
« Ответ #71 : 14 Август 2013, 13:06:14 »
А где можно посмотреть координаты снипов серии Y? Меня интересуют Y29, Y945 и более поздние мутации.

Оффлайн Semargl

  • "El sueño de la razón produce monstruos" ©
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 6043
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4281/-5
  • www.semargl.me
    • www.semargl.me
  • Y-ДНК: R1a [CTS3402+]
  • мтДНК: U4a2g
Re: R1a и 1KG/PGP проекты
« Ответ #72 : 14 Август 2013, 13:10:11 »
А где можно посмотреть координаты снипов серии Y? Меня интересуют Y29, Y945 и более поздние мутации.
Практически все снипы серии Y внесены в официальную таблицу снипов, найденных в семплах проекта "1000 геномов".

Оффлайн Nimissin

  • Сообщений: 2403
  • Рейтинг +759/-0
  • Y-ДНК: N-M178 L839+ P298+ M2019+ M2118+ M1991+ M1988+
  • мтДНК: C4b12a
Re: R1a и 1KG/PGP проекты
« Ответ #73 : 14 Август 2013, 13:14:31 »
Спасибо, уважаемый Semargl!

Оффлайн Semargl

  • "El sueño de la razón produce monstruos" ©
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 6043
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4281/-5
  • www.semargl.me
    • www.semargl.me
  • Y-ДНК: R1a [CTS3402+]
  • мтДНК: U4a2g
Re: R1a и 1KG/PGP проекты
« Ответ #74 : 29 Август 2013, 10:25:19 »
Обновление схемы снипов для Z280.
CTS8816 и еще 9 новых снипов, найденных у троих сардинцев и в образце HG00366 из проекта "1000 геномов", судя по всему, маркируют волго-карпатскую ветвь.

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.