АвторТема: H1c  (Прочитано 5669 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн пенелопа

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 5871
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2127/-12
  • мтДНК: H1b
Re: H1c
« Ответ #15 : 09 Июнь 2013, 05:48:29 »

Оффлайн Санька

  • Сообщений: 159
  • Страна: 00
  • Рейтинг +9/-3
Re: H1c
« Ответ #16 : 09 Июнь 2013, 05:55:45 »
http://mtdna.gentis.ru/hg/ages.htm#

Спасибо, пенелопа!

В табличке указывают возраст гаплогруппы. Мне также интересно узнать частоту носителей H1c по странам или этническим группам. Вот, скажем, H1c - это характерная группа для восточных славян?

Оффлайн пенелопа

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 5871
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2127/-12
  • мтДНК: H1b
Re: H1c
« Ответ #17 : 09 Июнь 2013, 06:22:22 »
Ссылки на статьи по мито-ДНК: http://forum.molgen.org/index.php/board,36.0.html
Ссылка на карту есть выше в теме: http://s47.radikal.ru/i117/1211/04/5b48096b346a.jpg

Оффлайн Санька

  • Сообщений: 159
  • Страна: 00
  • Рейтинг +9/-3
Re: H1c
« Ответ #18 : 09 Июнь 2013, 06:31:48 »
Спасибо вам еще раз!  :)

Оффлайн Elcher

  • Сообщений: 149
  • Страна: ru
  • Рейтинг +23/-0
  • мтДНК: I4a
  • мтДНК: I4a
Re: H1c
« Ответ #19 : 22 Декабрь 2013, 14:42:13 »
Готовы результаты FullSequence моей родной тети. H1c. Корни с территории Липецкой области, село Топки Раненбургского уезда. Данные по женской линии известны со второй половины 19 в., до прапрабабушки.

Оффлайн Elcher

  • Сообщений: 149
  • Страна: ru
  • Рейтинг +23/-0
  • мтДНК: I4a
  • мтДНК: I4a
Re: H1c
« Ответ #20 : 01 Январь 2014, 12:39:31 »
 Сегодня стали известны результаты FGS двоюродного брата отца H1c-T152C! Прабабушка родом с Алтая, ее мать тоже, из старообрядцев.

Оффлайн Ashat

  • Сообщений: 16
  • Рейтинг +5/-0
Re: H1c
« Ответ #21 : 14 Сентябрь 2014, 07:02:02 »
http://mtdna.gentis.ru/hg/ages.htm#

Спасибо, пенелопа!

В табличке указывают возраст гаплогруппы. Мне также интересно узнать частоту носителей H1c по странам или этническим группам. Вот, скажем, H1c - это характерная группа для восточных славян?
получил мт-ДНК результаты  у меня  H1c  и я казах по отцу и матери.

Оффлайн Белгородец

  • Сообщений: 100
  • Страна: ru
  • Рейтинг +39/-0
  • Y-ДНК: I1-Z63-PR683
  • мтДНК: U4a2g
Re: H1c
« Ответ #22 : 08 Январь 2021, 18:54:45 »
Здравствуйте! Я еще в 2014 году заказал своей родной тете ГВР2. У нее тогда было 4 полных кузена, а спустя шесть лет стало 10 кузенов. У тети предки по прямой женской линии из слободы Волоконовки, в которую, предположительно, шло активное переселение в 1760-ые годы из-под Днепропетровска, так как в то время владельцем Волоконовки был екатеринославский гуьернатор Синельников. У одного из этих 10 полных кузенов на ГВр2 предки как раз из Екатеринославской губернии, что было любопытно. В общем, решился заказать полное мито. А я вчера построил-таки филогенетическое древо Н1с.
Очень удивился, когда после получения на полном мито результатов увидел 500 кузенов своей тети!
И единственный полный кузен (0 мутаций) на полном мито - как раз с предками из Екатеринославской губернии!
Даже по результатам на ГВР2 было понятно, что у тети Н1с (у нее есть мутация Т477С возрастом 4300 лет, характерная для Н1с).
Несколько недель после получения результатов на полном мито заняло построение филогенетического древа Н1с.
Для этого я связался с ближайшими кузенами тети и два из них любезно предостаивли мне свои результаты на полном мито и список своих генетических кузенов. После получения этих данных оказалось возможным построить древо, зная расстояния до трех человек. Оказалось, что две добавочные мутации тети A7076G или С16133Т после Н1с есть только у десятка ее кузенов. У остальных сотен кузенов нет этих мутаций.
Кстати, только для 4 человек генетические расстояния до нашей троицы такие, что не позволяют их однозначно поместить на древо. Не очень понятно также, по какой причине мутации 309.1С и 315.1С порой не участвуют в определении генетического расстояния. Иными словами, есть случаи полных кузенов на полном мито (0 мутаций), хотя их результаты этих кузенов отличаются на 309.1С или 315.1С.
Единственная трудность в построении филогенетического древа - понять, какая из мутаций моей тети A7076G или отсутствие С16133Т (обратная мутация) прошла раньше. Я склоняюсь к тому, что все же первой была мутация A7076G в кодовом регионе (носителей этой мутации 6 человек), а уже потом отсутствие мутации С16133Т в ГВР2. У остальных кузенов с отсутствующей С16133Т эта мутация прошла на более ранней ступени. Т.е. больше половины полных кузенов тети на ГВР2 были ложными. Близкие кузены с A7076G стали видны только на полном мито. Кстати, на игрек фулл филогенетическое древо Н1с насчитывает уже 39 ветвей, смотрите https://www.yfull.com/mtree/H1c/

Оффлайн Valery

  • Сообщений: 5624
  • Страна: 00
  • Рейтинг +525/-6
  • Ultimate Matriarchy
Re: H1c
« Ответ #23 : 09 Январь 2021, 02:15:13 »
И единственный полный кузен (0 мутаций) на полном мито - как раз с предками из Екатеринославской губернии!

о прочих забудьте, 1 мутация на полном сиквенсе - это примерно 3600 лет, то есть 1800 до общего предка в среднем.

ГВР

если пишете по-русски, то ГВС будет более читабельно (ГВР не употребимо, только "сегмент")

Оффлайн Valery

  • Сообщений: 5624
  • Страна: 00
  • Рейтинг +525/-6
  • Ultimate Matriarchy
Re: H1c
« Ответ #24 : 09 Январь 2021, 02:36:29 »
С16133Т

Это исключительно редкая мутация (по моим прикидкам, порядка 0.00006-0.00007). Это столь мало, что не иди речь о FTDNA (у них есть контроль качества), я бы отверг такой результат как артефакт.

Оффлайн Valery

  • Сообщений: 5624
  • Страна: 00
  • Рейтинг +525/-6
  • Ultimate Matriarchy
Re: H1c
« Ответ #25 : 09 Январь 2021, 02:53:22 »
есть случаи полных кузенов на полном мито (0 мутаций), хотя их результаты этих кузенов отличаются на 309.1С или 315.1С

при исключении C-тракта 302-315 все равно полный кузен у тети только один? чем линия тети отличается от ближайших совпаденцев? это 1,2 приватные мутации, и где они? как  понял из описания ситуации, A7076G и С16133Т приватными не являются, это маркеры всей ветви

Не очень понятно также, по какой причине мутации 309.1С и 315.1С порой не участвуют в определении генетического расстояния

Инделы C/G-трактов в мт вляются самыми легковесными во всей молекуле. У большого % людей есть гетероплазмические варианты с другой длиной трактов, а если рассматривать соматику, то наверное у практически всех. Возможна ситуация, что у матери детектится гетероплазмия длин (сэнгером - когда от 20% молекул, ngs - порог даже ниже), а у ребенка фиксируется основной вариант длины не такой, как у матери (то есть у ребенка конечно тоже гетероплазмия, но ниже порога). Для филогенетики такой тип полиморфизма не интересен.

Оффлайн Valery

  • Сообщений: 5624
  • Страна: 00
  • Рейтинг +525/-6
  • Ultimate Matriarchy
Re: H1c
« Ответ #26 : 09 Январь 2021, 03:12:00 »
EMPOP, как база более консервативная, чем моя, дает для 16133T частоту 0.00002. То есть это реально на грани артефакта. Не исключаю, что у Парсона вообще есть сомнения в джермлайн-принадлежности таких мутаций, если вообще не в их реальности. По кр. мере по опыту совместной работы он категорически против чтобы это засчитывалось - и тк считаю его более компетентным, чем сам, то прислушиваюсь.

Оффлайн Белгородец

  • Сообщений: 100
  • Страна: ru
  • Рейтинг +39/-0
  • Y-ДНК: I1-Z63-PR683
  • мтДНК: U4a2g
Re: H1c
« Ответ #27 : 09 Январь 2021, 17:26:42 »
Всего среди носителей Н1с (700 кузенов на расстоянии до 4 мутаций от моей тети на полном мито) есть
два человека с A7076G и отсутствием C16311T (Белгородская и Днепропетровская области) (на мой взгляд ветка Т477С>A7076G>отсутствие С16311Т);
два человека с A7076G и С16311Т и еще одной мутацией после Т477С (Украина и, возможно, Швеция) (на мой взгляд ветка Т477С>A7076G>дополнительная мутация);
два человека с A7076G и С16311Т (Россия и Украина)  (на мой взгляд ветка Т477С>A7076G);
6 человек с отсутствием С16311Т (Польша, Ирландия, Греция, Англия, Испания)  (на мой взгляд ветка Т477С> отсутствие С16311Т).
При построении древа я исходил из того, что географически носители A7076G распределяются на меньшей площади, чем носители отсутствующей С16311Т. Это означает, что мутация A7076G произошла позже, чем мутация отсутствия С16311, причем отсутствие мутации С16311Т независимо случилось еще раз в ветке A7076G.
Правильно ли составлено филогенетическое древо?


Оффлайн Valery

  • Сообщений: 5624
  • Страна: 00
  • Рейтинг +525/-6
  • Ultimate Matriarchy
Re: H1c
« Ответ #28 : 09 Январь 2021, 17:39:34 »
При построении древа я исходил из того, что географически носители A7076G распределяются на меньшей площади, чем носители отсутствующей С16311Т. Это означает, что мутация A7076G произошла позже, чем мутация отсутствия С16311, причем отсутствие мутации С16311Т независимо случилось еще раз в ветке A7076G.
Правильно ли составлено филогенетическое древо?

скажем так - разумно построено. Географию имеет смысл привлекать для частых мутаций, склонных к параллельному или обратному развитию, как 16311, а 7076G скорее единичное событие. Причем это можно показать и без привлечения географии. Но ваша идея абсолютно корректная.

Оффлайн Белгородец

  • Сообщений: 100
  • Страна: ru
  • Рейтинг +39/-0
  • Y-ДНК: I1-Z63-PR683
  • мтДНК: U4a2g
Re: H1c
« Ответ #29 : 09 Январь 2021, 17:47:30 »
Результаты моей тети
Your Results   H1c Haplogroup rCRS Values   
Extra Mutations   315.1C 522.1A 522.2C A7076G
Missing Mutations   C16311T
На странице участников проекта Н и HV на сайте ФТДНА у всех носителей Н1с есть мутации 315.1C, 522.1A, 522.2C, поэтому эти мутации были исключены из рассмотрения при построении филогенетического древа.


 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100