Как работает чип?

[wbull]

Кто нибудь знает как работают чипы (microarray chip), позволяющие одновременно тестировать большое количество снипов.
Я просмотрел документацию с сайта одного из производителей (Illumina, его чип  Illumina OmniExpress используется для FF FTDNA) и, если  я правильно понял, чип представляет собой металлическую пластинку со множеством дырочек (матрица). Каждой дырочке соответствует определенная аллея и в зависимости от комбинации белков в ней она окрашивается либо в зеленый или красный цвет. Далее матрица просматривается оптической аппаратурой и расшифровывается компьютером. Каждая матрица используется для 2- 12 образцов, в зависимости от ее типа (количества сканируемых снипов).
Возникли следущие вопросы:
1) Как осуществляется привязка определенной аллеи к определенной дырочке?
2) Как происходит окрашивание?
3) Как один и тот же чип может использоваться для нескольких образцов без загрязнения продуктами ЦПР, что, насколько я знаю, является наиболее распространенной причиной ошибки при анализе ДНК?
4) Заявленное время сканирования от 3 до 18 мин. Почему тогда тестирование на FF занимает в среднем 6 недель?
Может на форуме есть микробиологи знающие эту методику...     

[Centurion]

Хотите свой чип сконструировать? 

[пенелопа]

К биоинформатикам http://bioinformatics.ru/Misc/genseq-roadmap.html

[wbull]

Хотите свой чип сконструировать? 

Нет.
Просто природное любопытство.

[wbull]

К биоинформатикам http://bioinformatics.ru/Misc/genseq-roadmap.html

Спасибо. Очень интересный материал. С удовольствием посмотрел презентацию Зубова, но вопросы остались. И даже добавились.
Например, правильно ли я понял, что Illumina OmniExpress  флуоресциентный, а не полупроводниковый чип?

[Andymeon]

http://sensation.com.ua/story/view/3918/   

Чистящие средства нового поколения способны удалять с ткани не только грязь, но и генетические следы жертвы или самого преступника, передает Reuters. Важные улики, которые прежде могли десятилетиями сохраняться на одежде, теперь могут быть стерты в считаные минуты благодаря воздействию кислорода, входящего в состав современной продукции бытовой химии.