L1280

[Semargl]

У E4464 Labinsky найден новый снип L1280. Неизвестно приватный или будет веточным.
Лабинский, по нашей клас-и относится к "восточным вятичам".
Источник: Л. Майка
http://eng.molgen.org/viewtopic.php?f=77&t=569

[Yurgan]

У E4464 Labinsky найден новый снип L1280. Неизвестно приватный или будет веточным.
Лабинский, по нашей клас-и относится к "восточным вятичам".
Источник: Л. Майка
http://eng.molgen.org/viewtopic.php?f=77&t=569

Очень хорошо.
Это нужная ветвь.
Не знаете, какая у него позиция?

[Lesla]

Смотрю, его нет у:
183681 (L784+)
149865 - "венед"
215487 (L1232+) - Z280*
Это хорошо, что не общий для Z280, дай бог и не приватный будет!
Успеха "галиндам"!

[Yurgan]

Смотрю, его нет у:
183681 (L784+)
149865 - "венед"
215487 (L1232+) - Z280*
Это хорошо, что не общий для Z280, дай бог и не приватный будет!
Успеха "галиндам"!

А как смотрите?  В финче его еще нет.

[Lesla]

А как смотрите?  В финче его еще нет.

Это Майка где-то посмотрел (по ссылке в первом посте).

[Lesla]

Из наших форумчан, вроде, Mikola (N100213) близок - в 10 мутациях на 67.
grimsvotn (221125) - в 11 на 66 маркерах.

[Yurgan]

Смотрю, его нет у:
183681 (L784+)
149865 - "венед"
215487 (L1232+) - Z280*
Это хорошо, что не общий для Z280, дай бог и не приватный будет!
Успеха "галиндам"!

А как смотрите?  В финче его еще нет.

До сих пор в финче ничего нет.

[Semargl]

До сих пор в финче ничего нет.

Есть.
Z1280 | 20049855-20049855 | C->A

Y Chromosome Browser:
http://ymap.ftdna.com/cgi-bin/gb2/gbrowse/hs_chrY/?name=Z1280

[Yurgan]

До сих пор в финче ничего нет.

Есть.
Z1280 | 20049855-20049855 | C->A

Y Chromosome Browser:
http://ymap.ftdna.com/cgi-bin/gb2/gbrowse/hs_chrY/?name=Z1280

Спасибо.
Сейчас будем разбираться

[Semargl]

До сих пор в финче ничего нет.

Есть.
Z1280 | 20049855-20049855 | C->A

Y Chromosome Browser:
http://ymap.ftdna.com/cgi-bin/gb2/gbrowse/hs_chrY/?name=Z1280

Спасибо.
Сейчас будем разбираться

Прошу прощения. Перепутал L1280 с Z1280.

[Yurgan]

До сих пор в финче ничего нет.

Есть.
Z1280 | 20049855-20049855 | C->A

Y Chromosome Browser:
http://ymap.ftdna.com/cgi-bin/gb2/gbrowse/hs_chrY/?name=Z1280

Спасибо.
Сейчас будем разбираться

Прошу прощения. Перепутал L1280 с Z1280.

Понял, но L1280 там есть

L1280 Details
Name:   L1280
Type:   snp
Description:   
Source:   other
Position:   ChrY:16914999..16914999 (+ strand)

Length:   1
ISOGG_haplogroup:   not listed
Mutation:   A to G
YCC_haplogroup:   Approx. hg: R-Z280
allele_anc:   A
allele_der:   G
comments:   Found in a R-Z280 WTY participant
count_derived:   1
count_tested:   1
primer_f:   Z34_F
primer_r:   Z34_R
primary_id:   45334
gbrowse_dbid:   ymap:database
   
>L1280 class=Sequence position=ChrY:16914999..16914999 (+ strand)
a

[Semargl]

Понял, но L1280 там есть

Да. Я тоже нашел:
http://ymap.ftdna.com/cgi-bin/gb2/gbrowse/hs_chrY/?name=ChrY%3A16914999..16914999

Как бы еще узнать позицию снипа по 37-му билду?

[Yurgan]

Понял, но L1280 там есть

Да. Я тоже нашел:
http://ymap.ftdna.com/cgi-bin/gb2/gbrowse/hs_chrY/?name=ChrY%3A16914999..16914999

Как бы еще узнать позицию снипа по 37-му билду?

Один сайт висит, где я это узнаю.
Я вычислил 18405605
Но похоже, в 1000 геномов его нет.

[Semargl]

Я вычислил 18405605
Но похоже, в 1000 геномов его нет.

Пробежался по всем семплам R1a, если вычисленная Вами позиция снипа правильна, то в 1000геномах этого снипа нет.

[Yurgan]

Я вычислил 18405605
Но похоже, в 1000 геномов его нет.

Пробежался по всем семплам R1a, если вычисленная Вами позиция снипа правильна, то в 1000геномах этого снипа нет.

Буду ждать, когда сайт заработает.