Z92 и его снипы

[Lesla]

В YFull новенький: YF12027 (R-YP575*)
Наверное 627697 Keybol.
Будет пока в паре с YF09326 (62051 Rhodes).

[Lesla]

На матчах Big Y (не своих) наблюдаю некого Yukevich R-YP1699 (уровень YP1696). Никто не знает, кто это?

[evgivanov]

На матчах Big Y (не своих) наблюдаю некого Yukevich R-YP1699 (уровень YP1696). Никто не знает, кто это?

гугл нашел - https://www.docfindy.com/t/dr-gerald-p-yukevich-internal-medicine-in-vineyard-haven-ma/488538.

Судя по контактному емаил, тест отправляла его дочь

[Lesla]

Друзья, а чей новый образец в YFull - YF12105 [RU-TVE]? Под YP682.
evgivanov?

[Lesla]

Из статьи "The genetic prehistory of the Baltic Sea region" - https://www.nature.com/articles/s41467-018-02825-9
(ископаемая ДНК из Прибалтики от мезолита до раннего железа)
Есть представитель Z92 c нынешней территории Литвы:
Turlojiske 3 - 1010-800 calBCE - R1a-Z280-Z92-YP617

[evgivanov]

Друзья, а чей новый образец в YFull - YF12105 [RU-TVE]? Под YP682.
evgivanov?

да

Пока особой пользы от анализа vcf не вижу

Known SNPs
No call:   27052 (23.46%)

[Centurion]

Друзья, а чей новый образец в YFull - YF12105 [RU-TVE]? Под YP682.
evgivanov?

это предварительное позиционирование, так как там ест дробление ветки

[Centurion]

Known SNPs
No call:   27052 (23.46%)

это проблемы биг у

вот например стат для бама весом 1.13 гб (очень крупный для Бига)

No call:   18015 (15.62%)

а вот вам стат по YSeq

No call:   20 (0.02%)

есть разница?

зы я предполагаю, что ваш биг средний по кач или ниже среднего, об этом говорят косвенные признаки
поэтому с бамом будет тоже не все радужно

вот стат по моему баму 0.89 Gb

No call:   23462 (20.34%)
vs VCF
No call:   28804 (24.97%)

[evgivanov]

это проблемы биг у

зы я предполагаю, что ваш биг средний по кач или ниже среднего, об этом говорят косвенные признаки
поэтому с бамом будет тоже не все радужно

Спасибо за пояснение. Получается, что нет повода для оптимизма от ожидания бам :-(
Я проверил несовпадающие снипы с моими 2-мя ближайшими матч на ftdna и получилось , что процентов 70 из этих несовпадений просто-напросто No call у меня.

[Lesla]

Учитывая что YP617 сформировался всего 3400 лет назад, получается это либо наш предок, либо довольно близкий ему родственник.
Литовцы мы, что-ль?

Какие литовцы "3400 лет назад"?

[Serckesh]

Из статьи "The genetic prehistory of the Baltic Sea region" - https://www.nature.com/articles/s41467-018-02825-9
(ископаемая ДНК из Прибалтики от мезолита до раннего железа)
Есть представитель Z92 c нынешней территории Литвы:
Turlojiske 3 - 1010-800 calBCE - R1a-Z280-Z92-YP617

Извините, за небольшой оффтоп, но раз здесь появилась ссылка на статью, спрошу.

В статье:

Spiginas 2   Lithuania   Late Neolithic   2130–1750   R1a1a1b1a2b-CTS1211

По YFULL возраст CTS1211 4600 лет назад. Время жизни Spiginas 2 около 4000 лет назад. Если этот снип возник не там, значит где-то близко? Это ведь Культура боевых топоров - прабалтославяногерманцы.

Следующий в таблице CTS1211:
Kivutkalns 25   Latvia   Bronze Age   800–545   R1a1a1b1a2b-CTS1211
Это уже культура штрихованной керамики - прабалтославяне.
Поправьте, если неправ.

А есть где-то карта с дДНК R1a?

[пенелопа]

Обсуждение этих образцов здесь: http://forum.molgen.org/index.php/topic,9740.0.html
и здесь: http://forum.molgen.org/index.php/topic,70.1650.html

[пенелопа]

А есть где-то карта с дДНК R1a?

Один из форумчан делал карту по всем дДНК. http://forum.molgen.org/index.php/topic,8204.msg299089.html#msg299089

[Serckesh]

А есть где-то карта с дДНК R1a?

Один из форумчан делал карту по всем дДНК. http://forum.molgen.org/index.php/topic,8204.msg299089.html#msg299089

Спасибо!

[Lesla]

654880 Azarov по результатам Big Y: YP6504+
http://forum.molgen.org/index.php/topic,1280.msg409892.html#msg409892

Раннее предположение о YP569* оказалось ошибочным из-за не способности ФТДНА нормально проверить снип Y11268. Как в снип-паке (на результаты которого ранее опирались), так, как оказалось, и в Big Y!