Из конкретно этих VCF v2 от FTDNA я думаю можно вытянуть более 90% информации по снипам по сравнению с BAM'ом. А вот с STR в VCF все гораздо хуже.
Тогда можно только призвать всех уже протестированных на Big Y, не дожидаясь ВАМа, загрузить в YFull свои файлы VCF. А ВАМ уже попозже, когда появится возможность.
не совсем понятно, что может вытащить Yfull из VCF чего уже не показывает FTDNA. Одним из плюсов Yfull было возможность вытащить до 500 STR, но для этого нужен BAM
кстати, большинство к СТР относятся как к второстепенному... в ближайшее время будут СТР-ветви добавляться на дерево плюс позднее расчитаны скорости по СТР-маркерам и в СТР-матчах вероятно будут показываться время до общего предка
максимальная информация которую можно вытащить, удобная работа с базой снипов (аннотирование, рейтингование и тд), группы, кроссреференсность (hg19, hg38 и тд), большой обновляемый сет научных образцов, единый аккаунт для нескольких образцов, возможность анализа образцов от одной и той же персоны сделанный в разных лабораториях, публичное обновляемое дерево, сложна система фильтрации качества для новых снипов плюс ручная верификация "приватных снипов", "чистая" санируемая база известных снипов (более 114 тыс) - нет "мусорных" снипов, БАМ-браузер и тд. и еще куча запланированных инноваций
~95% инф по известным снипам в vcf
~50% стр (пока простые маркеры, но возможно позже добавить и сложно-составные, соотв процент увеличится)
для vcf конечно есть ограничения по полноте
Тема: Z92 и его снипы (Прочитано 354971 раз)