АвторТема: Дерево гаплогруппы R1a - 111-ти маркёрная версия  (Прочитано 24788 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн SemarglАвтор темы

  • "El sueño de la razón produce monstruos" ©
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 6009
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4220/-5
  • www.semargl.me
    • www.semargl.me
  • Y-ДНК: R1a [CTS3402+]
  • мтДНК: U4a2g
Попробовал свести воедино всю доступную на данный момент информацию по структуре ветвей R1a.

Дерево из 111-ти маркерных гаплотипов менее (чем из 67-ми) подвержено ошибкам, связанным с гомоплазией.
Есть только один недостаток - слишком мало "длинных" гаплотипов.
Отсюда вытекает, как следствие, проблема с правильным подсчетом возрастов ветвей и с позиционированием некоторых веток. Например "северные вятичи", "киргизы", "индийская L657" имеют только по одному 111-ти маркерному гаплотипу от каждой ветви. Поэтому программа может произвольно укоренить эти одиночные гаплотипы, на то место, которое в данный момент ближе им по филогении. Отсюда же и проблема с редкими гаплотипами, подбными Z93*, Z283* и др. Не найдя близких им гаплотипов, TNT ищет ближайшее место для укоренения.
С накоплением статистики, эти проблемы будут понемногу преодолены. Возможно будет изменяться положение ветвей относительно друг друга, но состав (в основном) должен оставаться без изменений.
Например ветви под снипом Z280 крепко связаны в один узел, и сказать, какая ветвь "отпочковалась" ранее, а какая позднее, без снипов почти невозможно.

Каждый из форумчан, имеющий "длинный" гаплотип, сможет увидеть себя на этой версии дерева.
Цветами выделены ветви по классификации нашего форума.

Со временем буду обновлять легенду.

Серые цвета - десятники, темнее - L664+
Голубой цвет - Z93, вложенный прямоугольник цвета морской волны - L342. Ярко салатовый - Z93*, бледный салатовый - ашкеназы, темно-голубой - башкиры.
Большой кластер, обведенный табачным цветом - Z283.
Большой фиолетовый - Z284
Зеленый - M458
Кластер "цвета" дыня - Z280
Две ветви слева, разных оттенков желтого - Малопольские, которая ярче - силезская, бледнее - моравская.
Красный - "сарматы".
Фиолетовый - Z92, в нем отдельно отмечены венеды.

<Отредактировал легенду>

Версия дерева от 29.09.2013. (файл большой)
« Последнее редактирование: 20 Июнь 2021, 17:55:14 от Lesla »

Оффлайн SemarglАвтор темы

  • "El sueño de la razón produce monstruos" ©
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 6009
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4220/-5
  • www.semargl.me
    • www.semargl.me
  • Y-ДНК: R1a [CTS3402+]
  • мтДНК: U4a2g
На этом древе получается, что ветвь "Вятичй" расходится с ветвью "Венедов" из одного узла?
Цитировать
Например ветви под снипом Z280 крепко связаны в один узел, и сказать, какая ветвь "отпочковалась" ранее, а какая позднее, без снипов почти невозможно.
Следует помнить, что время расхождения ветвей под Z280, приблизительно одинаковое.

Оффлайн SemarglАвтор темы

  • "El sueño de la razón produce monstruos" ©
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 6009
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4220/-5
  • www.semargl.me
    • www.semargl.me
  • Y-ДНК: R1a [CTS3402+]
  • мтДНК: U4a2g
Небольшое пояснение.
Как Вы видите, Carpenter, Heath, Waishes (Z280), Clawson выделены красным цветом - пример блуждающих гаплотипов, которые программа не может укоренить по причине малой статистики.

Оффлайн SemarglАвтор темы

  • "El sueño de la razón produce monstruos" ©
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 6009
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4220/-5
  • www.semargl.me
    • www.semargl.me
  • Y-ДНК: R1a [CTS3402+]
  • мтДНК: U4a2g
Готова обновленная версия дерева.
Ссылка на полное изображение - в первом сообщении темы.

Прим.: западные и восточные "вятичи", обозначены на схеме по классификации проекта "R1a & subclades". Разнообразные "M".
"Северные вятичи", L365, Киргизы и некоторые другие ветви представлены всего одним "длинным" гаплотипом, или не представлены вообще, поэтому местоположение на дереве нестабильное.
Красным цветом выделены гаплотипы, в расположении которых на дереве, программа не уверена.

« Последнее редактирование: 12 Июль 2012, 08:41:09 от Semargl »

Оффлайн Mich Glitch

  • Genus regis
  • Сообщений: 36936
  • Страна: ca
  • Рейтинг +3773/-48
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5a
Очень наглядно (у меня правда почему то не четко все :( )
Используйте ссылку с первого сообщения данной темы.
:)

Оффлайн SemarglАвтор темы

  • "El sueño de la razón produce monstruos" ©
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 6009
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4220/-5
  • www.semargl.me
    • www.semargl.me
  • Y-ДНК: R1a [CTS3402+]
  • мтДНК: U4a2g
По сообщению пана Лаппы, за период скидок, в проекте "R1a & subclades", было заказано 55 апгрейдов до 111-ти маркеров.
Не считая всего остального. :)

Оффлайн Mich Glitch

  • Genus regis
  • Сообщений: 36936
  • Страна: ca
  • Рейтинг +3773/-48
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5a
По сообщению пана Лаппы, за период скидок, в проекте "R1a & subclades", было заказано 55 апгрейдов до 111-ти маркеров.
Не считая всего остального. :)
Ура!
Скоро 111 маркерное дерево придётся на ветки распилить.  :o

Оффлайн SemarglАвтор темы

  • "El sueño de la razón produce monstruos" ©
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 6009
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4220/-5
  • www.semargl.me
    • www.semargl.me
  • Y-ДНК: R1a [CTS3402+]
  • мтДНК: U4a2g
Скоро 111 маркерное дерево придётся на ветки распилить.  :o
Если дело пойдет в таком темпе - через год придется пилить :)

Оффлайн Людмила

  • Сообщений: 1007
  • Рейтинг +151/-1
До скидок заказывали апгрейд до 111. Дождались. FT 196067. Когда будет обновление Вашего Древа, увижу.

Оффлайн SemarglАвтор темы

  • "El sueño de la razón produce monstruos" ©
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 6009
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4220/-5
  • www.semargl.me
    • www.semargl.me
  • Y-ДНК: R1a [CTS3402+]
  • мтДНК: U4a2g
До скидок заказывали апгрейд до 111. Дождались. FT 196067. Когда будет обновление Вашего Древа, увижу.
Отлично. Думаю дерево подрастет.)
Обновление планирую в сентябре.

Оффлайн muso

  • Сообщений: 55
  • Рейтинг +4/-0
  • Y-ДНК: R-Y2914
  • мтДНК: H1c9a
До скидок заказывали апгрейд до 111. Дождались. FT 196067. Когда будет обновление Вашего Древа, увижу.
Отлично. Думаю дерево подрастет.)
Обновление планирую в сентябре.
Жду обновления!

Оффлайн SemarglАвтор темы

  • "El sueño de la razón produce monstruos" ©
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 6009
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4220/-5
  • www.semargl.me
    • www.semargl.me
  • Y-ДНК: R1a [CTS3402+]
  • мтДНК: U4a2g
Re: Дерево гаплогруппы R1a - 111-ти маркёрная версия
« Ответ #11 : 05 Октябрь 2012, 11:43:42 »
Обновление планирую в сентябре.
Я не забыл про свое обещание, в конце сентября выложить новую версию дерева.
Дерево готово, но есть 29 интересных гаплотипов, у которых сделано по 101 маркеру, а FTDNA тянет резину, никак не закончит тесты.
Будет жаль оставить эти гаплотипы за бортом, и не включить их в дерево.

Гаплотипы, результаты которых я хочу подождать:
Z93* - 1
L342.2 - 2
L657 - 1
Z283* - 1
L1029 -5
"сарматы" - 2
Z280 ungr -2
L365 - 2
"силезец" - 1
L1280 - 4
"нёвры" - 2
L448 - 2
Z287 - 2
Z284* - 1
L664 - 1

Для справки, в июльской версии дерева было 339 гаплотипа, сейчас уже 418.
Если дождемся тех, которые на подходе, то будет 447 гаплотипов!!!
За три месяца прирост на треть)

Оффлайн Аббат Бузони

  • ...
  • Сообщений: 19888
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1818/-60
  • Y-ДНК: I1-SHTR7+
  • мтДНК: H16-a1-T152C!
Re: Дерево гаплогруппы R1a - 111-ти маркёрная версия
« Ответ #12 : 05 Октябрь 2012, 12:32:56 »
Скоро Сергачев мой тоже должен подоспеть, но последнюю панель не могут сделать.

Оффлайн Nycticorax

  • Сообщений: 1548
  • Рейтинг +285/-35
  • Y - R1a1, mtDNA - D5a3
Re: Дерево гаплогруппы R1a - 111-ти маркёрная версия
« Ответ #13 : 05 Октябрь 2012, 13:16:56 »
Аналогично. У них какие-то накладки. У меня последняя панель два раза числилась как fail.
Даже присылали письмо с извинениями, писали, что у них что-то при пересылке из лаборатории в лабораторию не сложилось.

Оффлайн mladshij

  • Сообщений: 801
  • Страна: ru
  • Рейтинг +119/-0
  • Darth Vader
  • Y-ДНК: R1a-Z92 -> YP569 -> Y85137
  • мтДНК: H1
Re: Дерево гаплогруппы R1a - 111-ти маркёрная версия
« Ответ #14 : 05 Октябрь 2012, 14:25:40 »
Кстати, а с какой именно панелью и в каком батче проблема?
У меня никак не могут сделать панель 94-102 из 472 батча. Тоже уже два раза переносили. В понедельник очередной срок истекает. Посмотрим, сделают ли.

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.