АвторТема: Новички мито-гаплогруппы H  (Прочитано 133911 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн Gregor

  • Сообщений: 63
  • Страна: am
  • Рейтинг +22/-0
  • мтДНК: H4a1a1a
Re: Новички мито-гаплогруппы H
« Ответ #495 : 25 Октябрь 2014, 15:33:09 »
Мне команда Y-Full, по результатам BigY определила митогруппу: H13a1a1c...
Что посоветуете, стоит ли делать mtFull  Sequence или достаточно этих результатов?
Единственное только негде совпаденцев посмотреть... :(

Извините, а как по сиквенсу Y определить мито  гаплогруппу?

Оффлайн Andymeon

  • Сообщений: 1179
  • Страна: ru
  • Рейтинг +119/-5
  • Y-ДНК: R1a [CTS 3402+ Y2910+ YP310+]
  • мтДНК: H3i
Re: Новички мито-гаплогруппы H
« Ответ #496 : 25 Октябрь 2014, 17:37:10 »
Цитировать
Извините, а как по сиквенсу Y определить мито  гаплогруппу?
ни как  :)  но продукт Биг игрек, позволяет, так же как продукты от Fullgenomes .
Туда много чего попадает, в том числе и мито днк.

Оффлайн Gregor

  • Сообщений: 63
  • Страна: am
  • Рейтинг +22/-0
  • мтДНК: H4a1a1a
Re: Новички мито-гаплогруппы H
« Ответ #497 : 25 Октябрь 2014, 18:30:02 »
Цитировать
Извините, а как по сиквенсу Y определить мито  гаплогруппу?
ни как  :)  но продукт Биг игрек, позволяет, так же как продукты от Fullgenomes .
Туда много чего попадает, в том числе и мито днк.

Если я правильно понял - BigY RAW data файлы содержат и риды для мтДНК? Прямо как в том анекдоте - Почему в собачьей колбасе у вас щепки? А мы вместе с будкой мололи!))

Оффлайн пенелопа

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6485
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2714/-13
  • мтДНК: H1b
Re: Новички мито-гаплогруппы H
« Ответ #498 : 25 Октябрь 2014, 19:42:58 »
Если я правильно понял - BigY RAW data файлы содержат и риды для мтДНК? Прямо как в том анекдоте - Почему в собачьей колбасе у вас щепки? А мы вместе с будкой мололи!))
Именно ;D

Оффлайн Andrew

  • Сообщений: 151
  • Страна: ru
  • Рейтинг +3/-0
  • Y-ДНК: N1a2b (P43)
  • мтДНК: H1c4
Re: Новички мито-гаплогруппы H
« Ответ #499 : 26 Ноябрь 2014, 15:38:04 »
Друзья, у меня H1с4 по Ftdna, 23andMe определили как H1c.
Дерево phylotree.org/tree показывает следующую картину, ниже.
. Стоит ли апгредить и что, чтобы понять H1c4a или H1c4b. Спасибо.
H1c4    G13759A        JQ705516      
                                                        
            H1c4a    A7299G  C15315T                            JX297157   JQ324836   
                                                        
            H1c4b    C16355T                                JQ704378   JQ703499   
                                                        
                                H1c4b1    C6074T                            JQ701984   GU122996   

Оффлайн Елена Александровна

  • Сообщений: 2838
  • Страна: by
  • Рейтинг +800/-2
  • U5a1d2a1 Гедматч - M125805
  • Y-ДНК: R1a1a: отец 248308, сын 260304, дед по маме 249367
  • мтДНК: U5a1d2a1 - я; МЖМЖ U5
Re: Новички мито-гаплогруппы H
« Ответ #500 : 30 Ноябрь 2014, 21:24:26 »
У родственника H1h  - определили по Big Y

Оффлайн Vital

  • Сообщений: 189
  • Страна: ru
  • Рейтинг +66/-0
  • FTDNA: 294252
  • Y-ДНК: R1a-M458>L1029>YP417>YP418>YP728>YP5079
  • мтДНК: V1a1c
Re: Новички мито-гаплогруппы H
« Ответ #501 : 01 Декабрь 2014, 17:38:24 »
Всем привет.

У меня тоже из BigY команда YFull вытянула мито.

Подскажите крупные базы по мито, куда можно добавиться ??

Оффлайн Evg33

  • Сообщений: 404
  • Страна: ru
  • Рейтинг +27/-0
  • FTDNA: 312482
    • RusNavi
  • Y-ДНК: R-KMS132+ (Z93+,Z94-,KMS149+)
  • мтДНК: H11a1
Re: Новички мито-гаплогруппы H
« Ответ #502 : 01 Декабрь 2014, 18:54:28 »
Vital: для mt есть FTDNA, www.mitosearch.org, GenBank.

Оффлайн Vital

  • Сообщений: 189
  • Страна: ru
  • Рейтинг +66/-0
  • FTDNA: 294252
  • Y-ДНК: R1a-M458>L1029>YP417>YP418>YP728>YP5079
  • мтДНК: V1a1c
Re: Новички мито-гаплогруппы H
« Ответ #503 : 01 Декабрь 2014, 20:29:16 »
Vital: для mt есть FTDNA, www.mitosearch.org, GenBank.
Спасибо! вот еще видел сайт PhyloTree.org
А он как?

Оффлайн TAM

  • Сообщений: 130
  • Страна: ru
  • Рейтинг +25/-0
  • Y-ДНК: I2a
  • мтДНК: H17a
Re: Новички мито-гаплогруппы H
« Ответ #504 : 13 Декабрь 2014, 20:58:30 »
FTDNA (полный тест) определило Haplogroup - H17a.
Что-то кажется редкое, хотя в 19 в. это обычные среднерусские крестьяне :)
Есть одно совпадение с расстоянием 0 в Европе, это может обнадеживать?
И еще, на mitosearch.org всё время выдается 500 - Internal server error, это временный глюк?

Оффлайн пенелопа

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6485
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2714/-13
  • мтДНК: H1b
Re: Новички мито-гаплогруппы H
« Ответ #505 : 13 Декабрь 2014, 22:18:40 »
Что-то кажется редкое...
http://www.phylotree.org/tree/subtree_R0.htm
Цитировать
И еще, на mitosearch.org всё время выдается 500 - Internal server error, это временный глюк?
Не в первый раз пользователи жалуются, потом перестают :) Временный, наверное...

Оффлайн TAM

  • Сообщений: 130
  • Страна: ru
  • Рейтинг +25/-0
  • Y-ДНК: I2a
  • мтДНК: H17a
Re: Новички мито-гаплогруппы H
« Ответ #506 : 17 Декабрь 2014, 21:27:45 »
Прошу прощения, а по приведенному выше древу (mtDNA subtree R0) или по каким-то другим источникам можно ли узнать какую-то более "практическую" информацию об H17? Например, насколько она древняя, для каких этнических групп или территорий чаще всего засвидетельствована?

Оффлайн пенелопа

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6485
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2714/-13
  • мтДНК: H1b
Re: Новички мито-гаплогруппы H
« Ответ #507 : 17 Декабрь 2014, 21:54:28 »
для каких этнических групп или территорий чаще всего засвидетельствована?
Пройдите по ссылке в предыдущем сообщении, там ссылки под цифрами и буквами на Генбанк, написано, откуда тесты.

Оффлайн nilogov

  • Сообщений: 1379
  • Страна: ru
  • Рейтинг +95/-6
  • философ антиязыка
  • Y-ДНК: R-BY55151
  • мтДНК: T2b-T152C!
Re: Новички мито-гаплогруппы H
« Ответ #508 : 07 Январь 2015, 18:46:11 »
Полгода не могу понять, почему у моей родственницы в аккаунте не выставлена митогаплогруппа. Данные такие:

 
HVR1
A16129G
T16187C
C16189T
T16223C
G16230A
T16278C
C16311T
C16519T
 
HVR2
G73A
C146T
C152T
C195T
A247G
G263A
522.1A
522.2C
 
CODING REGION
G750A
A769G
A825t
A1018G
G1438A
G2706A
A2758G
C2885T
T3594C
G4104A
T4312C
G4769A
T7028C
G7146A
T7256C
A7521G
T8468C
T8655C
G8701A
G8860A
C9540T
G10398A
T10664C
A10688G
C10810T
C10873T
C10915T
A11719G
A11914G
T12705C
G13105A
G13276A
T13506C
T13650C
T14766C
G15326A
 
Но по матчам сравнить не с кем. Несколько раз писал FTDNA. Реакция нулевая. Что делать? Прогонял эти данные по программе, и результат такой:

mthap version 0.19a (2013-04-08); haplogroup data version PhyloTree Build 16 (2014-02-19)
raw data source 324996-FASTA.fasta (16KB)

FASTA format was uploaded. Based on the markers found, assuming the following regions were completely sequenced: HVR2 (1~574) CR (575~16000).

Found 16000 markers at 16000 positions covering 96.6% of mtDNA.

Markers found (shown as differences to rCRS):

HVR2:
CR:
HVR1:

Best mtDNA Haplogroup Matches:

1) H2a2a1

Defining Markers for haplogroup H2a2a1:
HVR2:
CR:
HVR1:

Marker path from rCRS to haplogroup H2a2a1:
H2a2a1(rCRS)

Perfect Match! Your results are an exact match to this haplogroup.

2) H2a2a1g

Defining Markers for haplogroup H2a2a1g:
HVR2:
CR:
HVR1: 16189C

Marker path from rCRS to haplogroup H2a2a1g:
H2a2a1(rCRS) ⇨ 16189C ⇨ H2a2a1g

Imperfect Match. Your results contained differences with this haplogroup:
Untested(1): 16189

2) H2a2a1d

Defining Markers for haplogroup H2a2a1d:
HVR2:
CR:
HVR1: 16172C

Marker path from rCRS to haplogroup H2a2a1d:
H2a2a1(rCRS) ⇨ 16172C ⇨ H2a2a1d

Imperfect Match. Your results contained differences with this haplogroup:
Untested(1): 16172

3) H2a2a1e

Defining Markers for haplogroup H2a2a1e:
HVR2:
CR: 8182T
HVR1:

Marker path from rCRS to haplogroup H2a2a1e:
H2a2a1(rCRS) ⇨ 8182T ⇨ H2a2a1e

Imperfect Match. Your results contained differences with this haplogroup:
Mismatches(1): 8182C

3) H2a2a

Defining Markers for haplogroup H2a2a:
HVR2: 263G
CR:
HVR1:

Marker path from rCRS to haplogroup H2a2a:
H2a2a1(rCRS) ⇨ 263G ⇨ H2a2a

Imperfect Match. Your results contained differences with this haplogroup:
Mismatches(1): 263A

3) H2a2a1f

Defining Markers for haplogroup H2a2a1f:
HVR2: 93G
CR:
HVR1:

Marker path from rCRS to haplogroup H2a2a1f:
H2a2a1(rCRS) ⇨ 93G ⇨ H2a2a1f

Imperfect Match. Your results contained differences with this haplogroup:
Mismatches(1): 93A

3) H2a2a1a

Defining Markers for haplogroup H2a2a1a:
HVR2:
CR: 15314A
HVR1:

Marker path from rCRS to haplogroup H2a2a1a:
H2a2a1(rCRS) ⇨ 15314A ⇨ H2a2a1a

Imperfect Match. Your results contained differences with this haplogroup:
Mismatches(1): 15314G

3) H2a2a1b

Defining Markers for haplogroup H2a2a1b:
HVR2:
CR: 9299G
HVR1:

Marker path from rCRS to haplogroup H2a2a1b:
H2a2a1(rCRS) ⇨ 9299G ⇨ H2a2a1b

Imperfect Match. Your results contained differences with this haplogroup:
Mismatches(1): 9299A

Оффлайн пенелопа

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6485
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2714/-13
  • мтДНК: H1b
Re: Новички мито-гаплогруппы H
« Ответ #509 : 07 Январь 2015, 19:50:03 »
Родственник по мужской линии получил результат МитоДНК - H20a. Есть что-то по этой гаплогруппе? Самостоятельно ничего толкового найти не смог.
Древо: http://www.phylotree.org/tree/subtree_R0.htm
Там есть ссылки на Генбанк.

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.