АвторТема: N1c1(L708+;Y9022+)  (Прочитано 40786 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн mouglleyАвтор темы

  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 7779
  • Страна: hr
  • Рейтинг +434/-7
  • Я знаю, что познаю всё.
    • Записки Маугли
  • Y-ДНК: N1c1-L1025
  • мтДНК: J1c3
N1c1(L708+;Y9022+)
« : 03 Апрель 2012, 12:24:21 »
Создана группа N1c1(L708+;L1026-) (test for L1026 must be made) для тех, у кого, предположительно, может оказаться L1026-:
http://www.semargl.me/ru/dna/ydna/haplotypes/table/367/
Это уважаемые:
anode (N59644) уже проверенный, Dars (96047), Dimitri (176781), Golod (151523), а также Edyge, 152820, 184206, 199032, 199035, 201875, 224955, 137067, 70472, N29994, 171594, 26SXQ

Оффлайн Dimitri

  • Сообщений: 329
  • Страна: ru
  • Рейтинг +52/-0
  • Y-ДНК: N-Y9022>BY32567 [RU-KO] ЖМ: R1a-M458>YP418 [RU-BEL] МЖМ: C-M48 [RU-ZAB]
  • мтДНК: HV9 [RU-SAR]
Re: N1c1(L708+;L1026-)
« Ответ #1 : 30 Октябрь 2012, 16:38:11 »
Приветствую уважаемых участников форума "Молекулярная генеалогия".
Прошу прощения за долгое отсутствие, вызванное рядом обстоятельств.
Вижу, что вопрос филогении N1c1 существенно продвинулся за последнее время благодаря открытию множества новых SNP.
(Я недавно заказал себе Y111 и тесты на L708 и L1026, хотя с последними двумя все ясно.)

К сожалению, нам (членам группы L708+;L1026-) пока не повезло - мы представляем собой разрозненные малочисленные субклады N1c1a1* (L708+), разошедшиеся с остальными ветками много тысяч лет назад.

Некоторую надежду внушает тот факт, что семеро из нас образуют сравнительно недавнюю ветвь возрастом 2200 лет по оценке уважаемого Юргана, с его же легкой руки получившую название Ананьинской. Я попытался вручную построить дерево этой ветки (считая реальные мутации между гаплотипами и реконструируя гаплотипы предков между самыми похожими современными гаплотипами), получилось очень близко к ветке последней версии общего N1-дерева, которое строит уважаемый mouglley с помощью TNT:
* (2100 YBP)
. * (2000 YBP)
. . * (900 YBP)
. . . N59644 (Gavrilov, Russia, Udmurtia)
. . . * (800 YBP)
. . . . 199032 (Kurbatsky, Russia)
. . . . 176781 (Ushakov, Russia, Komi?)
. . * (600 YBP)
. . . 151523 (Golodyaev, Russia)
. . . 199035 (Parshin, Russia)
. * (1300 YBP)
. . 184206 (Golitsin, Russia)
. . 152820 (Pleshivy, Russia?)
Звездочками обозначены предполагаемые предковые гаплотипы, в скобках указан их возраст (на основе константы 0,12 мутаций на 67-маркерный гаплотип на 25-летнее поколение). Мутации считал вручную с учетом палиндромов (их изменение рассматривал за одну мутацию). Возможно, из-за этого возраст несколько занижен.

Еще ряд гаплотипов нашей группы (119747, N56160, M6651, 225440), видимо, образуют еще одну ветвь с похожим возрастом. Обе ветви разошлись друг с другом около 3300 лет назад.

Другие гаплотипы L708+;L1026- находятся на значительном расстоянии от этих двух ветвей.

Теперь самый интересный вопрос: как можно получить SNP для этих двух предполагаемых субкладов? Или с такой малой численностью это безнадежно?

Оффлайн Eugene

  • Санктпетербурхъ
  • Сообщений: 6572
  • Страна: ru
  • Рейтинг +945/-40
    • N1c1 Y-DNA Project
  • Y-ДНК: N-BY32524
  • мтДНК: U-C1341T
Re: N1c1(L708+;L1026-)
« Ответ #2 : 30 Октябрь 2012, 16:44:33 »
Теперь самый интересный вопрос: как можно получить SNP для этих двух предполагаемых субкладов? Или с такой малой численностью это безнадежно?
Пока таким способом является WTY.
Шансы есть. Nimissin 119747 из L708+,L1026- (якутская подветвь)
уже в процессе WTY.

Оффлайн Dimitri

  • Сообщений: 329
  • Страна: ru
  • Рейтинг +52/-0
  • Y-ДНК: N-Y9022>BY32567 [RU-KO] ЖМ: R1a-M458>YP418 [RU-BEL] МЖМ: C-M48 [RU-ZAB]
  • мтДНК: HV9 [RU-SAR]
Re: N1c1(L708+;L1026-)
« Ответ #3 : 30 Октябрь 2012, 16:53:28 »
Спасибо за ответ!

Как я понимаю, с помощью WTY можно найти приватные SNP. Но на общее дерево ISOGG они не попадут до тех пор, пока их не обнаружат еще у нескольких человек, так? Cтанут ли эти приватные SNP доступны для заказа другим "ананьинцам"?
И какое минимальное число человек должно положительно на них провериться, чтобы SNP был помещен на дерево ISOGG?

Оффлайн Eugene

  • Санктпетербурхъ
  • Сообщений: 6572
  • Страна: ru
  • Рейтинг +945/-40
    • N1c1 Y-DNA Project
  • Y-ДНК: N-BY32524
  • мтДНК: U-C1341T
Re: N1c1(L708+;L1026-)
« Ответ #4 : 30 Октябрь 2012, 16:58:30 »
Спасибо за ответ!

Как я понимаю, с помощью WTY можно найти приватные SNP. Но на общее дерево ISOGG они не попадут до тех пор, пока их не обнаружат еще у нескольких человек, так? Cтанут ли эти приватные SNP доступны для заказа другим "ананьинцам"?
И какое минимальное число человек должно положительно на них провериться, чтобы SNP был помещен на дерево ISOGG?
Да верно, понимаете.
Вот критерии для помещения на древо ISOGG
http://isogg.org/tree/ISOGG_SNP_Requirements.html

Оффлайн mouglleyАвтор темы

  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 7779
  • Страна: hr
  • Рейтинг +434/-7
  • Я знаю, что познаю всё.
    • Записки Маугли
  • Y-ДНК: N1c1-L1025
  • мтДНК: J1c3
Re: N1c1(L708+;L1026-)
« Ответ #5 : 30 Октябрь 2012, 17:21:10 »
Теперь самый интересный вопрос: как можно получить SNP для этих двух предполагаемых субкладов? Или с такой малой численностью это безнадежно?
Здравствуйте, Дмитрий. Давно Вас не было.
Начался в набор проект http://forum.molgen.org/index.php/topic,4536
Там будут тестироваться также снипы из 1k genomes project.
А там, вроде бы, у N есть интересные снипы.

Оффлайн Lesla

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 9171
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2401/-9
  • FTDNA: 154400 (Big Y - 283049)
  • Y-ДНК: R1a-YP682 (VK06+)
Re: N1c1(L708+;L1026-)
« Ответ #6 : 06 Декабрь 2012, 17:14:42 »
Nimissin 119747 из L708+,L1026- (якутская подветвь)
уже в процессе WTY.
В Финче уже появились результаты!
119747 - L1355, L1356
Поздравляю Nimissin!

Оффлайн Centurion

  • 100% Earth (Solar System) genofond
  • Администратор
  • *****
  • Сообщений: 9708
  • Страна: ru
  • Рейтинг +569/-2
Re: N1c1(L708+;L1026-)
« Ответ #7 : 06 Декабрь 2012, 17:32:01 »
Nimissin 119747 из L708+,L1026- (якутская подветвь)
уже в процессе WTY.
В Финче уже появились результаты!
119747 - L1355, L1356
Поздравляю Nimissin!
не густо

в реале должно быть 50-70 снипов  :)

Оффлайн Eugene

  • Санктпетербурхъ
  • Сообщений: 6572
  • Страна: ru
  • Рейтинг +945/-40
    • N1c1 Y-DNA Project
  • Y-ДНК: N-BY32524
  • мтДНК: U-C1341T
Re: N1c1(L708+;L1026-)
« Ответ #8 : 06 Декабрь 2012, 17:34:33 »
Nimissin 119747 из L708+,L1026- (якутская подветвь)
уже в процессе WTY.
В Финче уже появились результаты!
119747 - L1355, L1356
Поздравляю Nimissin!
не густо

в реале должно быть 50-70 снипов  :)
Ну так если читать что WTY - это 1% от полного сиквенса (грубо). То реально около 100 должно быть. :)

Оффлайн Yurgan

  • Кто везёт, тому везёт
  • ...
  • Сообщений: 8737
  • Страна: gt
  • Рейтинг +748/-7
  • Потомок кузнеца Ильмаринена
    • Сибирский родословец
Re: N1c1(L708+;L1026-)
« Ответ #9 : 06 Декабрь 2012, 19:04:38 »
Nimissin 119747 из L708+,L1026- (якутская подветвь)
уже в процессе WTY.
В Финче уже появились результаты!
119747 - L1355, L1356
Поздравляю Nimissin!
Наконец-то.
Сейчас проверим, встречаются ли у других.

Оффлайн Eugene

  • Санктпетербурхъ
  • Сообщений: 6572
  • Страна: ru
  • Рейтинг +945/-40
    • N1c1 Y-DNA Project
  • Y-ДНК: N-BY32524
  • мтДНК: U-C1341T
Re: N1c1(L708+;L1026-)
« Ответ #10 : 06 Декабрь 2012, 19:16:17 »
Сейчас проверим, встречаются ли у других.
Принципиально важный момент.  :)
У Томаса они пока на карте сразу после M178 и параллельно L392. Хотя у него просто драфт для предварительной оценки.

Оффлайн Yurgan

  • Кто везёт, тому везёт
  • ...
  • Сообщений: 8737
  • Страна: gt
  • Рейтинг +748/-7
  • Потомок кузнеца Ильмаринена
    • Сибирский родословец
Re: N1c1(L708+;L1026-)
« Ответ #11 : 06 Декабрь 2012, 19:36:13 »
Nimissin 119747 из L708+,L1026- (якутская подветвь)
уже в процессе WTY.
В Финче уже появились результаты!
119747 - L1355, L1356
Поздравляю Nimissin!
Наконец-то.
Сейчас проверим, встречаются ли у других.
Проверил, ни у кого из N из 1000 genomes и из personal genomes эти снипы не выявлены.

Так что надо срочно их запускать.

Эти снипы могут выделить большую ветвь.


Оффлайн Eugene

  • Санктпетербурхъ
  • Сообщений: 6572
  • Страна: ru
  • Рейтинг +945/-40
    • N1c1 Y-DNA Project
  • Y-ДНК: N-BY32524
  • мтДНК: U-C1341T
Re: N1c1(L708+;L1026-)
« Ответ #12 : 06 Декабрь 2012, 19:40:58 »
Nimissin 119747 из L708+,L1026- (якутская подветвь)
уже в процессе WTY.
В Финче уже появились результаты!
119747 - L1355, L1356
Поздравляю Nimissin!
Наконец-то.
Сейчас проверим, встречаются ли у других.
Проверил, ни у кого из N из 1000 genomes и из personal genomes эти снипы не выявлены.

Так что надо срочно их запускать.

Эти снипы могут выделить большую ветвь.
Для начала можно Anode проверить.

Оффлайн Yurgan

  • Кто везёт, тому везёт
  • ...
  • Сообщений: 8737
  • Страна: gt
  • Рейтинг +748/-7
  • Потомок кузнеца Ильмаринена
    • Сибирский родословец
Re: N1c1(L708+;L1026-)
« Ответ #13 : 06 Декабрь 2012, 19:45:26 »
Nimissin 119747 из L708+,L1026- (якутская подветвь)
уже в процессе WTY.
В Финче уже появились результаты!
119747 - L1355, L1356
Поздравляю Nimissin!
Наконец-то.
Сейчас проверим, встречаются ли у других.
Проверил, ни у кого из N из 1000 genomes и из personal genomes эти снипы не выявлены.

Так что надо срочно их запускать.

Эти снипы могут выделить большую ветвь.
Для начала можно Anode проверить.
Есть кандидаты и более близкие к уважаемому Нимиссину.

Оффлайн Centurion

  • 100% Earth (Solar System) genofond
  • Администратор
  • *****
  • Сообщений: 9708
  • Страна: ru
  • Рейтинг +569/-2
Re: N1c1(L708+;L1026-)
« Ответ #14 : 06 Декабрь 2012, 19:49:25 »
Проверил, ни у кого из N из 1000 genomes и из personal genomes эти снипы не выявлены.
...
Так что надо срочно их запускать.
...
Эти снипы могут выделить большую ветвь.

а где логика? если не у кого не встр?  :)

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100