Представляю вниманию общественности мое первое самостоятельное исследование на ниве ДНК-генеалогии. Хорошо бы услышать критические замечания экспертов.
Согласно
Katoh 2004, 5% мужчин доминирующего монгольского этноса халха принадлежат гаплогруппе N1c, которая достаточно распространена в России (14%) и сопредельных с ней странах. Учитывая богатую историю Монгольской империи и Золотой Орды, интересно ответить на два вопроса: когда жил последний общий предок этой группы халха-монголов и есть ли среди Российских и зарубежных представителей N1c его потомки? В качестве начального упражнения в ДНК-генеалогии я попытался ответить на эти вопросы, используя ресурсы Молекулярно-генеалогического фонда Соренсена.
База данных Y-DNA гаплотипов SMGF содержит 845 монгольских образцов, поэтому ее можно считать достаточно содержательным источником для анализа монгольского этноса методами ДНК-генеалогии. Российское представительство скромнее (380), но тоже вполне репрезентативно. Из сопредельных с Монголией или Россией стран в SMGF много китайцев (506), шведов (495), поляков (278), норвежцев (273), киргизов (215), финнов (165), украинцев (47), литовцев (37) – вполне достаточно для того, чтобы отследить следы монгольских военных походов (если они сколь-нибудь значимы).
Пользовательский интерфейс базы SMGF достаточно скромен и позволяет находить не более 150 похожих гаплотипов в пределах 70% соответствия по заданным маркерам. Причем результаты поиска сообщаются в виде бинарной шкалы («угадал-не угадал» для каждого STR-маркера), а географическую фильтрацию результатов можно выполнить только вручную. Информацию о гаплогруппах данная база не содержит. С помощью такого интерфейса извлечь из базы SMGF все 845 монгольских гаплотипов довольно затруднительно, но зато вполне реально расшифровать представительное подмножество, принадлежащее гаплогруппе N1c.
Как извлечь гаплотипы N1c, если в базе данных нет информации о бинарных (SNP) полиморфизмах? Для этого можно воспользоваться модальным гаплотипом N1c и найти в базе SMGF все похожие на него (с учетом ограничений на 70% схожесть и размер выборки – не более 150 похожих гаплотипов). Именно это я и проделал. Модальный гаплотип N1c был вычислен усреднением значений аллелей по всем известным гаплотипам гаплогрупп N1c, N1c1, N1c1a, N1c1b и N1c1c, хранящимся в базе данных ySearch. Найдя несколько монгольских гаплотипов, похожих на N1c, я вычислил модальный уже для этой монгольской подгруппы, после чего нашел все остальные монгольские гаплотипы, предположительно относимые к N1c. Результаты были подвергнуты ДНК-генеалогическому анализу по
методу А. Клесова.
Всего мне удалось извлечь 34 полных (43-маркерных в стандарте лаборатории SMGF) гаплотипа, а также 14 частичных (от 39 до 42 маркеров). Кроме того, из базы SMGF были извлечены все похожие гаплотипы других стран. Для начала я установил предположительный предковый гаплотип для группы 34 монгольских гаплотипов путем вычисления среднего значения по каждому маркеру. Вот этот гаплотип, приведенный в стандарте FTDNA (после 67 стандартных для FTDNA маркеров перечисляются дополнительные маркеры, которые тестируются в SMGF - DYS 461, DYS 462, GATA A10, DYS 635, GAAT1B07, DYS 441, DYS 445, DYS 452, DYS 463):
14 23 14 10 11 13 11 12 10 14 14 30
17 10 10 11 12 26 14 19 28 14.3 14.3 14.3 14.3
11 11 18 20 14 0 0 0 0 0 12 10
0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 13 0 0 15 0 0 0 0 0 0 0
12 12 12 22 11 18 12 31 21
33 из исследуемых гаплотипов симметрично расположены вокруг данного на расстоянии в 1-9 мутаций каждый (полного совпадения с базовым нет ни у одного исследуемого гаплотипа). Наибольшее среднее квадратичное отклонение зафиксировано в маркерах DYS 385b (29.9), DYS 458 (17.5), DYS 447 (15.5), наименьшее (нулевое) для DYS 390, DYS 19/394, DYS 426, DYS 388, DYS 392, DYS 455, DYS 437, DYS 448, DYS 464c/d, DYS 460, YCA IIb, DYS 446, GATA A10, DYS 445, DYS 452, DYS 463 – значения аллелей в данных 17 маркерах одинаковы во всех 33 гаплотипах.
Один исследуемый монгольский гаплотип стоит особняком – на генетическом расстоянии в 20 мутаций от предполагаемого базового гаплотипа. Вряд ли он имеет какое-то отношение к остальным 33, поэтому в дальнейших расчетах не учитывается.
На 33 оставшихся гаплотипа приходятся суммарно 154 мутации. По таблице А. Клесова получаем 54 поколения до общего предка без учета возвратных мутаций или 58 поколений с их учетом. Последнее соответствует примерно 1450 лет до общего предка, который, выходит, жил в середине VI в. – в период образования Тюркского каганата (простиравшегося от Северного Кавказа на западе до Манчжурии на востоке и включавшего в себя территорию современной Монголии). Из какого древнего этноса происходил этот человек – отдельный вопрос, который я перед собой (пока) не ставил.
Тема: Возраст монгольских N1c и их влияние на генофонд России и других стран (Прочитано 54199 раз)