1000 Genomes (проект 1000 геномов)

[mouglley]

Скачал, а что дальше делать, какой программой открыть, там по 700 Мб и больше?

Результаты по снипам в этих данных, конечно, есть. И немалые.
По некоторым гаплогруппам результаты, просто, кардинально фиксируют деревья.

Только я сдался обрабатывать такую уйму информации по N на маломощной летней железке.

[napobo3]

Проект 1000 Genomes опубликовал STR-маркеры 576 протестируемых.

http://ftp.1000genomes.ebi.ac.uk/vol1/ftp/technical/working/20140107_chrY_str_haplotypes/YSTRs_PowerPLexY23_1000Y_QA_20130107.txt

Те же результаты, сконвертированные для  http://predictor.ydna.ru/ (маркеры в алфавитном порядке) :
http://napobo3.lk.net/dna/576samples-alphabet-order.txt

[Centurion]

Проект 1000 Genomes опубликовал STR-маркеры 576 протестируемых.

http://ftp.1000genomes.ebi.ac.uk/vol1/ftp/technical/working/20140107_chrY_str_haplotypes/YSTRs_PowerPLexY23_1000Y_QA_20130107.txt

Те же результаты, сконвертированные для  http://predictor.ydna.ru/ (маркеры в алфавитном порядке) :
http://napobo3.lk.net/dna/576samples-alphabet-order.txt

да, по 23 стра

[Yurgan]

Проект 1000 Genomes опубликовал STR-маркеры 576 протестируемых.

http://ftp.1000genomes.ebi.ac.uk/vol1/ftp/technical/working/20140107_chrY_str_haplotypes/YSTRs_PowerPLexY23_1000Y_QA_20130107.txt

Те же результаты, сконвертированные для  http://predictor.ydna.ru/ (маркеры в алфавитном порядке) :
http://napobo3.lk.net/dna/576samples-alphabet-order.txt

Да, очень интересно.

[kirroid]

А кто такие ASW и TSI?

[Srkz]

А кто такие ASW и TSI?

African Ancestry in Southwest US   AWS
Toscani in Italy   TSI

[KHAN]

Проект 1000 Genomes опубликовал STR-маркеры 576 протестируемых.

http://ftp.1000genomes.ebi.ac.uk/vol1/ftp/technical/working/20140107_chrY_str_haplotypes/YSTRs_PowerPLexY23_1000Y_QA_20130107.txt

Те же результаты, сконвертированные для  http://predictor.ydna.ru/ (маркеры в алфавитном порядке) :
http://napobo3.lk.net/dna/576samples-alphabet-order.txt

Отличная новость! Жалко, что маркеров сэмпла HG01617 нет. А из GATA H4 единицу надо вычитать?

[Lesla]

да, по 23 стра

Опубликовали по 23, но у меня возникло ощущение, что у них больше стров сделано. По 70 и больше.

[Аббат Бузони]

У меня возникло ощущение, что их запросто можно в семаргл ввести и снипы и стры

[Centurion]

да, по 23 стра

Опубликовали по 23, но у меня возникло ощущение, что у них больше стров сделано. По 70 и больше.

нет - это мультиплекс poqerplex23