АвторТема: 1000 Genomes (проект 1000 геномов)  (Прочитано 8295 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн mouglley

  • ...
  • Сообщений: 7102
  • Страна: hr
  • Рейтинг +434/-7
  • Я знаю, что познаю всё.
    • Записки Маугли
  • Y-ДНК: N1c1-L1025
  • мтДНК: J1c3
Re: 1000 Genomes (проект 1000 геномов)
« Ответ #15 : 31 Июль 2011, 23:36:51 »
Скачал, а что дальше делать, какой программой открыть, там по 700 Мб и больше?
Результаты по снипам в этих данных, конечно, есть. И немалые.
По некоторым гаплогруппам результаты, просто, кардинально фиксируют деревья.

Только я сдался обрабатывать такую уйму информации по N на маломощной летней железке.

Оффлайн napobo3

  • Сообщений: 1257
  • Страна: il
  • Рейтинг +348/-2
  • Y-ДНК: J-FGC5231
  • мтДНК: N1b2
Re: 1000 Genomes (проект 1000 геномов)
« Ответ #16 : 10 Январь 2014, 00:22:09 »
Проект 1000 Genomes опубликовал STR-маркеры 576 протестируемых.

http://ftp.1000genomes.ebi.ac.uk/vol1/ftp/technical/working/20140107_chrY_str_haplotypes/YSTRs_PowerPLexY23_1000Y_QA_20130107.txt

Те же результаты, сконвертированные для  http://predictor.ydna.ru/ (маркеры в алфавитном порядке) :
http://napobo3.lk.net/dna/576samples-alphabet-order.txt


Оффлайн Centurion

  • 100% Earth (Solar System) genofond
  • Администратор
  • *****
  • Сообщений: 9548
  • Страна: ru
  • Рейтинг +571/-2
Re: 1000 Genomes (проект 1000 геномов)
« Ответ #17 : 10 Январь 2014, 00:31:38 »
Проект 1000 Genomes опубликовал STR-маркеры 576 протестируемых.

http://ftp.1000genomes.ebi.ac.uk/vol1/ftp/technical/working/20140107_chrY_str_haplotypes/YSTRs_PowerPLexY23_1000Y_QA_20130107.txt

Те же результаты, сконвертированные для  http://predictor.ydna.ru/ (маркеры в алфавитном порядке) :
http://napobo3.lk.net/dna/576samples-alphabet-order.txt
да, по 23 стра

Оффлайн Yurgan

  • Кто везёт, тому везёт
  • ...
  • Сообщений: 8445
  • Страна: ar
  • Рейтинг +957/-8
  • Потомок кузнеца Ильмаринена
    • Сибирский родословец
Re: 1000 Genomes (проект 1000 геномов)
« Ответ #18 : 10 Январь 2014, 07:20:47 »
Проект 1000 Genomes опубликовал STR-маркеры 576 протестируемых.

http://ftp.1000genomes.ebi.ac.uk/vol1/ftp/technical/working/20140107_chrY_str_haplotypes/YSTRs_PowerPLexY23_1000Y_QA_20130107.txt

Те же результаты, сконвертированные для  http://predictor.ydna.ru/ (маркеры в алфавитном порядке) :
http://napobo3.lk.net/dna/576samples-alphabet-order.txt
Да, очень интересно.

Оффлайн kirroid

  • Выгляда як ядвинга
  • Сообщений: 1062
  • Страна: by
  • Рейтинг +338/-6
  • Из Вайшнории
  • Y-ДНК: I1-M227
Re: 1000 Genomes (проект 1000 геномов)
« Ответ #19 : 10 Январь 2014, 08:25:39 »
А кто такие ASW и TSI?

Оффлайн Srkz

  • Сообщений: 8553
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4898/-3
  • Y-ДНК: N-L1025 Y64023
  • мтДНК: U4a1-a C16134T
Re: 1000 Genomes (проект 1000 геномов)
« Ответ #20 : 10 Январь 2014, 09:30:42 »
А кто такие ASW и TSI?
African Ancestry in Southwest US   AWS
Toscani in Italy   TSI

Оффлайн KHAN

  • Сообщений: 282
  • Страна: es
  • Рейтинг +97/-0
  • Y-ДНК: R-S3373*, J-Y146888*, R-S1327*, R-YP1137*, R-YP4078*, I-Y3118*, I-Y10622*
  • мтДНК: U5b1a1b, N1b1a8a, H7c1, H1c
Re: 1000 Genomes (проект 1000 геномов)
« Ответ #21 : 10 Январь 2014, 11:19:26 »
Проект 1000 Genomes опубликовал STR-маркеры 576 протестируемых.

http://ftp.1000genomes.ebi.ac.uk/vol1/ftp/technical/working/20140107_chrY_str_haplotypes/YSTRs_PowerPLexY23_1000Y_QA_20130107.txt

Те же результаты, сконвертированные для  http://predictor.ydna.ru/ (маркеры в алфавитном порядке) :
http://napobo3.lk.net/dna/576samples-alphabet-order.txt
Отличная новость! Жалко, что маркеров сэмпла HG01617 нет. А из GATA H4 единицу надо вычитать?

Оффлайн Lesla

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 9646
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2940/-9
  • FTDNA: 154400 (Big Y - 283049)
  • Y-ДНК: R1a-YP682 (VK06+)
Re: 1000 Genomes (проект 1000 геномов)
« Ответ #22 : 12 Январь 2014, 02:24:30 »
да, по 23 стра
Опубликовали по 23, но у меня возникло ощущение, что у них больше стров сделано. По 70 и больше.

Оффлайн Аббат Бузони

  • ...
  • Сообщений: 19889
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1820/-60
  • Y-ДНК: I1-SHTR7+
  • мтДНК: H16-a1-T152C!
Re: 1000 Genomes (проект 1000 геномов)
« Ответ #23 : 12 Январь 2014, 03:10:37 »
У меня возникло ощущение, что их запросто можно в семаргл ввести и снипы и стры

Оффлайн Centurion

  • 100% Earth (Solar System) genofond
  • Администратор
  • *****
  • Сообщений: 9548
  • Страна: ru
  • Рейтинг +571/-2
Re: 1000 Genomes (проект 1000 геномов)
« Ответ #24 : 12 Январь 2014, 11:27:48 »
да, по 23 стра
Опубликовали по 23, но у меня возникло ощущение, что у них больше стров сделано. По 70 и больше.
нет - это мультиплекс poqerplex23

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.