АвторТема: Сравнение геномов на 23andMe  (Прочитано 2869 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн dnaexploraАвтор темы

  • Сообщений: 124
  • Рейтинг +5/-0
  • ySearch: KWRRB, maternal yDNA J2a4b*
  • Y-ДНК: G2a3b1a1* (U1+ L13- P303+)
  • мтДНК: H1e
Сравнение геномов на 23andMe
« : 25 Декабрь 2009, 23:27:52 »
Несколько вопросов:
1. Правильно ли я понимаю что число которое там показывается (процент) -- это совпадения в 1% генома который у всех индивидумальный (т.е. игнорируются 99% генома которые у всех одинаковые) ?
2. Какой процент похожести должен быть у сына и отца или двух братьев? Какие реально диапазоны выпадают у различных протестированных?
3. Какое максимальное число там может быть теоретически?
4. Может ли быть высокий процент похожести (90%, например) у двух неродственников?
5. Существует ли порог выше которого люди гарантированно родственники в каком-то поколении (соотв. порог относительный)?

Оффлайн Mich Glitch

  • Genus regis
  • Сообщений: 37027
  • Страна: ca
  • Рейтинг +3757/-48
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5a
Re: Сравнение геномов на 23andMe
« Ответ #1 : 26 Декабрь 2009, 20:03:41 »
Несколько вопросов:
1. Правильно ли я понимаю что число которое там показывается (процент) -- это совпадения в 1% генома который у всех индивидумальный (т.е. игнорируются 99% генома которые у всех одинаковые) ?

Пропустил Ваши вопросы, так как они были не в секции 23эндМи.
По поводу общего совпадения.
Конечно было бы хорошо сравнивать наиболее вариабельную часть генома. Т.е. тот пресловутый 1%. На деле же речь идёт о сравнении по панели снипов в 577 тысяч. Многие из них выбраны достаточно случайно, чисто по техническим причинам. Как результат, процент сравнения никогда не опускается ниже 60%. Даже, если бы значения снипов были строго бинарными, то и тогда бы в идеальном случае статистически минимальная разница должна находиться на уровне 50%.

2. Какой процент похожести должен быть у сына и отца или двух братьев? Какие реально диапазоны выпадают у различных протестированных?
Лучше один раз увидеть. В своих настройках аккаунта выставьте крестик напротив показа семейства Менделей. Наряду с УПСами:



посмотрите и процент совпадения. Цифра находится в районе 85% для пары родитель-ребёнок.
Самоё высокое совпадение в среднем случае бывает у бар брат-брат и сестра-сестра. Особенно у пар близнецовых.

3. Какое максимальное число там может быть теоретически?
Не совсем корректный вопрос. Поэтому и отвечу расплычато: мне неизвестны случаи 90% совпадения.

5. Существует ли порог выше которого люди гарантированно родственники в каком-то поколении (соотв. порог относительный)?
Если брать дальнее родство, то для европейцев с высокой степени вероятности можно оценить по % совпадение двоюродное родство и ближе.
Но вообще родство смотрят по  УПСам, а % совпадения, наряду с этно-плотом характеризует Ваше этно окружение.

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.