Доместикация КРС

[Farroukh]

Считается, что корову впервые приручили 8-10 тыс. лет назад в Передней Азии. Тем не менее, Вики, говорит, что проведённые в 1994 г. генетические исследования показали, что современные коровы не принадлежат, как долгое время считалось, одной родовой линии. Возможно, полная расшифровка генома коровы, законченная в 2009 году, дополнит наши знания в этом вопросе.

Я так понимаю, что эти исследования как раз показали единоразовый факт доместикации?

[Nevada]

Считается, что корову впервые приручили 8-10 тыс. лет назад в Передней Азии. Тем не менее, Вики, говорит, что проведённые в 1994 г. генетические исследования показали, что современные коровы не принадлежат, как долгое время считалось, одной родовой линии. Возможно, полная расшифровка генома коровы, законченная в 2009 году, дополнит наши знания в этом вопросе.

Я так понимаю, что эти исследования как раз показали единоразовый факт доместикации?

Нет, два. Еще один, емнип, в Индии. Только не найду быстро источники.

[Nevada]

 Вот здесь поподробней. В Индии вообще другой подвид, разница между зебу и переднеазиатским быком даже больше, чем между тарпаном и лошадью Пржевальского.

[Nimissin]

Whole-genome sequencing of three native cattle breeds originating from the northernmost cattle farming regions.

Melak Weldenegodguad, Ruslan Popov, Kisun Pokharel, Innokentyi Ammosov, Ming Yao, Zoya Ivanova, Juha Kantanen.

https://www.biorxiv.org/content/early/2018/08/16/390369
Abstract

Northern Fennoscandia and the Sakha Republic in the Russian Federation represent the northernmost regions on Earth where cattle farming has been traditionally practiced. In this study, we performed whole-genome resequencing to genetically characterize three rare native breeds namely, Eastern Finncattle, Western Finncattle and Yakutian cattle, adapted to these northern Eurasian regions. We examined the demographic history, genetic diversity and unfolded loci under natural or artificial selection. On average, we achieved 13.01-fold genome coverage after mapping the sequencing reads on the bovine reference genome (UMD 3.1) and detected a total of 17.45 million single nucleotide polymorphisms (SNPs) and 1.95 million insertions-deletions (indels). We observed that the ancestral species (Bos primigenius) of Eurasian taurine cattle experienced two notable prehistorical declines in effective population size associated with dramatic climate changes. The modern Yakutian cattle exhibited a higher level of within-population variation in terms of number of SNPs and nucleotide diversity than the contemporary European taurine breeds. This result is in contrast to the results of marker-based cattle breed diversity studies, indicating assortment bias in previous analyses. Our results suggest that the effective population size of the ancestral Asiatic taurine cattle may have been higher than that of the European cattle. Alternatively, our findings could indicate the hybrid origins of the Yakutian cattle ancestries and possibly the lack of intensive artificial selection. We identified a number of genomic regions under selection that may have contributed to the adaptation to the northern and subarctic environments, including genes involved in disease resistance, sensory perception, cold adaptation and growth. By characterizing the native breeds, we were able to obtain new information on cattle genomes and on the value of the adapted breeds for the conservation of cattle genetic resources.

Расхождение ветвей Североевропейской породы и якутской породы КРС авторы оценивают в 8800 лет назад.
("In addition, our model suggested that the divergence of North European native cattle and East Siberian turano-mongolicus type of cattle occurred 8,822 years ago (CI, 8,775-8,869 years ago)").

[hgv]

Интересный доклад, рекомендую, если еще не видели.

Д.М. Ларкин.
Структура популяций и следы селекции в геномах пород КРС, разводимых в России.https://www.youtube.com/watch?v=j2jMLp7rXec

https://www.youtube.com/watch?v=j2jMLp7rXec

[kardes]

До недавнего времени считалось, что, согласно археологическим свидетельствам, скотоводство появилось в Центральной Азии примерно 5000 лет назад.Но оказалось, что овец в Ферганской долине разводили уже 8000 лет назад, пишут Уильям Тейлор из Университета Колорадо-Боулдер и его коллеги в апрельском выпуске журнала Nature Human Behavior: «Эти результаты заставляют переоценить сроки и маршруты самого раннего распространения на восток земледелия и скотоводства, а также роль домашних животных и растений в развитии сложной социальной организации на этом перекрестке дорог».Авторы утверждают, что Ферганская долина могла послужить «ключевым узлом» для распространения домашних животных и растений с Ближнего Востока в Восточную Азию. Они секвенировали ДНК в найденных зубах, подтвердив, что у животных был общий предок с современными популяциями овец в Северной Африке, Европе и Восточной Азии, исключив таким образом возможность того, что они были одомашнены в Центральной Азии.

[kardes]

https://science.sciencemag.org/content/sci/suppl/2019/07/10/365.6449.173.DC1/aav1002_Verdugo_SM.pdf
Ancient cattle genomics:iraq-iran-levant-Anatolia-Balkans-CentralAsia-Georgia

ДНК помогла раскрыть тайны древних вымерших быков
Последний тур умер четыре века назад. Новое исследование помогло лучше разобраться в их истории.
Международная группа исследователей раскрыла подробности о вымершем виде животных. Они проанализировали ДНК тура, первобытного быка, который перестал существовать почти 400 лет назад. Об этом сообщает Phys.org.
Исследователи собрали ДНК костей, возраст которых составляет 50 тыс. лет. Останки охватывают территорию от Сибири до Великобритании. По словам экспертов, у европейских туров нашли три отдельные популяции — западноевропейская, итальянская и балканская. Раньше ученые считали, что этот тип был единым. «Таким образом, разнообразие диких форм было больше» Генетическое разнообразие при похолодании  значительно уменьшилось, когда туров Юго-Западной Азии одомашнили примерно 10 тыс. лет назад.Наиболее выраженное падение генетического разнообразия происходит между периодом, когда туры юго-западной Азии были одомашнены на севере Плодородного полумесяца, чуть более 10 000 лет назад, чтобы дать первый одомашненный  крупный рогатый скот. Примечательно, что только несколько материнских линий (как видно по митохондриальной ДНК) проходят через этот процесс в генофонд крупного рогатого скота.«Однако узкая генетическая база первого крупного рогатого скота была расширена, когда они впервые отправились со своими пастухами на запад, восток и юг. Очевидно, что существовало раннее и повсеместное спаривание с самцами диких туров, оставившее наследие четырех отдельных предков туров доледникового периода, которое сохраняется среди домашнего скота сегодня».

[kardes]

Разнообразные доисторические формы скотоводства в лесах Центральной Европы
Розалинд Э. Джиллис , Питер Богуцкий ,Вероника Брыхова ,Эммануэль Казанова 29 октября 2024 г. Абстракт
В шестом тысячелетии ДО НАШЕЙ ЭРЫ первые земледельцы Центральной Европы быстро распространились по разнообразной мозаике лесных сред. Такие среды могли бы предложить важные источники богатых минералами кормов для животных и укрытия, что вызвало бы вопрос: в какой степени ранние земледельцы использовали леса для выращивания своих стад? Здесь, чтобы решить эту проблему, мы собрали многорегиональные наборы данных, включающие объемные и специфические для соединений стабильные изотопные значения из зооархеологических останков и керамики, и провели анализ перекрестной корреляции в рамках палеоэкологической структуры. Наши результаты показывают разнообразие стратегий выпаса скота, используемых ранними земледельцами, с заметным акцентом на интенсивное использование лесов для выпаса и сезонного кормления в некоторых регионах. Этот эксперимент с кормами для животных на основе леса ранними земледельцами мог бы повысить плодовитость животных и надои молока для потребления человеком, одновременно способствуя расширению доисторических сельскохозяйственных поселений и трансформации лесных экосистем. Наше исследование подчеркивает сложную взаимосвязь, существовавшую между древними земледельцами и лесными ландшафтами, проливая свет на адаптивную динамику, которая формировала людей, животных и окружающую среду в прошлом.

[kardes]

Геномное наследие гибридизации туров у древнего и современного иберийского скота
Торстен Гюнтер , Якоб Чисауски Вальдиосера 17 ноября 2024 г Абстракт
 Крупный рогатый скот был ценным экономическим ресурсом и культурным символом с доисторических времен. С момента первоначальной экспансии домашнего скота в Европу в период неолита, бычий скот (Bos taurus) и его дикий предок, зубр (B. primigenius), имели перекрывающиеся ареалы, что приводило к обширным возможностям для спаривания (независимо от того, планировалось ли это фермерами или нет). Мы провели биоархеологический анализ 24 останков Bos из Иберии, датируемых периодом от мезолита до римского периода. Археогеномный набор данных позволяет нам исследовать степень гибридизации домашних и диких животных с течением времени, предоставляя представление о поведении вида и методах охоты и управления человеком, сопоставляя изменения с культурными и геномными переходами в археологических записях. Наши результаты показывают частую гибридизацию в период неолита и халколита, вероятно, отражающую смесь охоты и выпаса скота или относительно неуправляемых стад, в которых в гибридизации участвовали в основном самцы зубра и самки домашнего скота. Это подтверждается изотопными доказательствами, соответствующими разделению экологической ниши, при этом, возможно, только несколько домашних животных находятся под контролем. Доля предков зубров остается относительно постоянной с примерно 4000 лет назад, вероятно, из-за управления стадом и отбора против гибридов первого поколения, что совпадает с другими культурными переходами. Постоянный уровень диких предков (~20%) продолжается в современных западноевропейских породах, включая испанскую породу лидия, которая разводится из-за своей агрессивности и боевых способностей, но не демонстрирует повышенных уровней предков зубров. Это исследование рассматривает геномный взгляд на влияние действий человека и дикой интрогрессии на становление крупного рогатого скота как одного из важнейших домашних видов сегодня.