Какая мито? Из того что я нарыл в своем SNP VCF от данте
73g 5999c 12825c
150t 6047g 13617c
152c 7028t 14182c
263g 7768g 14766t
750g 7836c 14950t
1438g 8860g 14956c
2623g 9453g 15326g
2706g 9477a 16189c
2757g 10283g 16270t
3197c 11467g 16464g
4216c 11719a 16465t
4560a 12308g 16496a
4769g 12372a 16519c
5656g 12616c 16527t
Это залито в виде файла на
https://dna.jameslick.com/mthap/ (только все буквы заглавные)
что-то неправильно ввожу, 73G не принимает от меня. А так - U5b1e1 у вас:
Запустите сами, там цвет очень удобен и важен.
WARNING: Can't understand this line: 73G
rCRSdiff format was uploaded. Based on the markers found, assuming the following regions were completely sequenced: HVR1 (16001~16569) HVR2 (1~574) CR (575~16000).
Found 16610 markers at 16610 positions covering 100.0% of mtDNA.
Markers found (shown as differences to rCRS):
HVR2: 150T 152C 263G
CR: 750G 1438G 2623G 2706G 2757G 3197C 4216C 4560A 4769G 5656G 5999C 6047G 7028T 7768G 7836C 8860G 9453G 9477A 10283G 11467G 11719A 12308G 12372A 12616C 12825C 13617C 14182C 14766T 14950T 14956C 15326G
HVR1: 16189C 16270T 16464G 16465T 16496A (16519C) 16527T
Best mtDNA Haplogroup Matches:
1)
U5b1e1Defining Markers for haplogroup U5b1e1:
HVR2: 73G 150T 152C 263G
CR: 750G 1438G 2706G 2757G 3197C 4769G 5656G 7028T 7768G 8860G 9477A 10283G 11467G 11719A 12308G 12372A 12616C 13617C 14182C 14766T 15326G
HVR1: 16189C 16270T 16465T
Marker path from rCRS to haplogroup U5b1e1 (plus extra markers):
H2a2a1(rCRS) ⇨ 263G ⇨ H2a2a ⇨ 8860G 15326G ⇨ H2a2 ⇨ 750G ⇨ H2a ⇨ 4769G ⇨ H2 ⇨ 1438G ⇨ H ⇨ 2706G 7028T ⇨ HV ⇨ 14766T ⇨ R0 ⇨ 73G 11719A ⇨ R ⇨ 11467G 12308G 12372A ⇨ U ⇨ 16192T 16270T ⇨ U5 ⇨ 3197C 9477A 13617C ⇨ U5a'b ⇨ 150T 7768G 14182C ⇨ U5b ⇨ 5656G ⇨ U5b1 ⇨ 16189C ⇨ U5b1(T16189C) ⇨ 16192C ⇨ U5b1(T16189C T16192C) ⇨ 152C 16465T ⇨ U5b1e ⇨ 2757G 10283G 12616C ⇨ U5b1e1 ⇨ 2623G 4216C 4560A 5999C 6047G 7836C 9453G 12825C 14950T 14956C 16464G 16496A (16519C) 16527T
Imperfect Match. Your results contained differences with this haplogroup:
Matches(28): 150T 152C 263G 750G 1438G 2706G 2757G 3197C 4769G 5656G 7028T 7768G 8860G 9477A 10283G 11467G 11719A 12308G 12372A 12616C 13617C 14182C 14766T 15326G 16189C 16192C 16270T 16465T
Mismatches(1): 73A
Extras(13): 2623G 4216C 4560A 5999C 6047G 7836C 9453G 12825C 14950T 14956C 16464G 16496A (16519C) 16527T