АвторТема: С-M407  (Прочитано 32430 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн Saken

  • Сообщений: 417
  • Страна: kz
  • Рейтинг +241/-0
  • YFull: YF79031
  • Y-ДНК: C3d [C-Z33001], R1a [R-Y62055], C3x*
  • мтДНК: D4g1* & F1b
Re: С-M407
« Ответ #390 : 25 Сентябрь 2021, 12:05:39 »
Анализ нового образца HLB-182 завершен. Добавил его в нашу группу M407.
По приватным combBED снп расклад такой, 2 наилучшего качества, 1 неоднозначный (2 рида всего) и 8 с одним прочтением. Реальных combBED всего 2-3шт.

Надеюсь, что причина такого малого количества combBED снипов объясняется появлением образца монгола с wgs, который делит общие снипы с HLB-182. Или это такой результат секвенирования. Если причина первая, то ждем появления нового субклада ниже стрима F9733.

Оффлайн Lesla

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 9369
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2669/-9
  • FTDNA: 154400 (Big Y - 283049)
  • Y-ДНК: R1a-YP682 (VK06+)
Re: С-M407
« Ответ #391 : 25 Сентябрь 2021, 13:10:52 »
Анализ нового образца HLB-182 завершен. Добавил его в нашу группу M407.
По приватным combBED снп расклад такой, 2 наилучшего качества, 1 неоднозначный (2 рида всего) и 8 с одним прочтением. Реальных combBED всего 2-3шт.

Надеюсь, что причина такого малого количества combBED снипов объясняется появлением образца монгола с wgs, который делит общие снипы с HLB-182. Или это такой результат секвенирования. Если причина первая, то ждем появления нового субклада ниже стрима F9733.
Супер! Спасибо!

Оффлайн Saken

  • Сообщений: 417
  • Страна: kz
  • Рейтинг +241/-0
  • YFull: YF79031
  • Y-ДНК: C3d [C-Z33001], R1a [R-Y62055], C3x*
  • мтДНК: D4g1* & F1b
Re: С-M407
« Ответ #392 : 25 Сентябрь 2021, 17:09:56 »
На сайте 23mofang нашел статью про Даян-хана.

Ключевые моменты:
* Возраст C-F8536 они оценили в 600 лет, а C-F10378 в 1230 лет.
* Обнаружено 4 веток под F8536.
* 90% F8536 представлены монголами. Наверное здесь имелось ввиду китайские монголы,- Внутренняя Монголия в основном.
* Самая распространенная фамилия у F8536 Борджигины. Около четверти всех выборки. С китаезированными версиями этой фамилий все 60%.

https://www.23mofang.com/ancestry/family/5ed9b29b9d543f00067b1eeb


Переводчик с китайского на английский:

According to the statistics of the 23 Rubik's Cube Zuyuan database, it is found that there is a family with the surname Boerzhijin in Inner Mongolia. C-F8536 accounted for 28.57% of male users surnamed Peerzhijin in Inner Mongolia, which is about 22 times the normal level of 1.31% in Inner Mongolia, and after statistical testing, this family is very significant. Based on this, we speculate that there may be a large number of Boerzhijin family in the downstream of C-F8536, and the main members of this family are located in Inner Mongolia.

Research design and results
We screened 4 Boer Zhijin families from Inner Mongolia that belonged to the downstream of C-F8536 type and several non-Boer Zhijin families from other regions for a joint detailed study.


It was found that the four Pirzhijin families from Inner Mongolia belonged to the lower reaches of F8536. F8536 was divided into at least four branches about 600 years ago and showed multi-forked differentiation, which may correspond to a Mongolia that had a rapid development during the Yuan and Ming Dynasties. The clan is the only Jin family.

Distribution ratio and surname composition
We designed C-F8536 and other downstream sites into the chip for large-scale population screening. The C-F8536 type accounts for nearly 90% of the Mongolian population, which is a typical Mongolian type. It is speculated that the C-F8536 type accounts for about 0.018% of the Chinese male population, and there are about 130,000 male descendants. More than 80% of the population of this type is distributed in Inner Mongolia, accounting for about 1.31% of the population of Inner Mongolia. It is also distributed in Xinjiang (0.25%), Liaoning (0.03%), Beijing (0.03%) and other places. In Inner Mongolia, with the Xilin Gol League (4.74%) as the center, the population in the neighboring Tongliao City (2.02%), Chifeng City (1.78%), Xing’an League (1.35%), Hulunbuir City (1.23%) and other places have a relatively large population. The high proportion is also distributed in the west of Bayannaoer City (0.51%), Hohhot City (0.45%), Ordos City (0.37%), and Baotou City (0.36%). In Xilin Gol, Xiwuzhumuqin Banner and Sunitezuoqi (11.11%) accounted for more than 10% of the population, and Xiwuzhumuqin Banner accounted for 25.71%. It also accounts for a relatively high proportion of the population in East Ujimqin Banner (8.7%). Under this type, Bo'erzhijin (Chinese characters are Mongolian transliteration, also written as "Borzhijin", "Boerzhijin", etc.) occupies an absolute advantage, accounting for about 26.83% of the population of this type, and the rest of Bao ( 12.2%), Bao (7.32%), Bao (7.32%), Bai (2.44%), Pakistan (2.44%), Qi (2.44%) and other surnames are also mostly derived from the surnames changed from Beierzhijin to Chinese, a total of about 60 % Of the population is still surnamed Beierzhijin or related Han surnames. In addition, there are surnames such as Wu, Tu, Beligu Nudeng, Keli, Maimat, Si, Sau, Balaqirude, Wu, Chahan, and Hahanud.

Note
Beierzhijin originated from Mongolian transliteration and is the surname of the Genghis Khan family. It is also known as "Qiyan·Birzhijinshi", which is also translated as Borjijit, Borjijiin, Borjijin, and Boerjijin. Erjid, Pirjigan, Pirjijin, Boluote, Baoluo, Buerchijin, Borji, etc., later changed the surname Bao, Bao, Qi, Bao, etc., and some people still use this surname. The proportion of the Mongolian population in the lower reaches of C-F8536 and the Boerzhijin and related surnames all indicate that C-F8536 is closely related to the Genghis Khan Golden Family. Based on the origin of the surname and the time of haplogroup differentiation, it is speculated that C-F8536 may be related to Boerzhijin. Jin Batumengke (that is, Dayan Khan) corresponds. The age of Dayan Khan (1472-1517) is very close to the time of differentiation of F8536. Dayan Khan has eleven sons, which is also consistent with the at least four-point distribution of C-F8536 and the population size of its descendants. F8536 is more likely to correspond to the Dayan Khan family, and the actual situation still needs ancient DNA verification.

Due to the limited samples tested, the pedigree relationship of the descendants of the Boer Zhijin family under C-F8536 and the precise age of the ancestor of C-F8536 still need to be further confirmed. Therefore, more users are required to participate in the "in-depth paternal detection" to improve the family pedigree. Tree. We will continue to pay attention to the differentiation, distribution, surname, family history and other information of this branch, and update it in due course.

Оффлайн Saken

  • Сообщений: 417
  • Страна: kz
  • Рейтинг +241/-0
  • YFull: YF79031
  • Y-ДНК: C3d [C-Z33001], R1a [R-Y62055], C3x*
  • мтДНК: D4g1* & F1b
Re: С-M407
« Ответ #393 : 29 Сентябрь 2021, 06:11:32 »
Вчера обработка анализа монгола, YF90692, завершилась. Изначально стоял статус блокировки (красный кирпич) с датой 27 декабря 2021. Cегодня проверил еще раз, уже стоит зеленая галочка ;) Видимо сделал оплату :) Гуд.

В ветке F9733 появились 3 доп. снипа, из которых 2шт. combBED.
« Последнее редактирование: 29 Сентябрь 2021, 06:24:19 от Saken »

Оффлайн varang

  • Сообщений: 5416
  • Страна: fi
  • Рейтинг +1815/-8
    • Проект "R1a-Y417 & Subclades" (M458>L1029>YP417)
  • Y-ДНК: R1a-L1029-A14777
  • мтДНК: H2a1
Re: С-M407
« Ответ #394 : 29 Сентябрь 2021, 07:16:10 »
И он ответил мне, что он халх, Хиат, Борджигон.

Оффлайн Saken

  • Сообщений: 417
  • Страна: kz
  • Рейтинг +241/-0
  • YFull: YF79031
  • Y-ДНК: C3d [C-Z33001], R1a [R-Y62055], C3x*
  • мтДНК: D4g1* & F1b
Re: С-M407
« Ответ #395 : 29 Сентябрь 2021, 07:43:53 »
И он ответил мне, что он халх, Хиат, Борджигон.

Отлично!) Его не приглашали вступить в нашу группу M407?

Оффлайн varang

  • Сообщений: 5416
  • Страна: fi
  • Рейтинг +1815/-8
    • Проект "R1a-Y417 & Subclades" (M458>L1029>YP417)
  • Y-ДНК: R1a-L1029-A14777
  • мтДНК: H2a1
Re: С-M407
« Ответ #396 : 29 Сентябрь 2021, 08:07:57 »
И он ответил мне, что он халх, Хиат, Борджигон.

Отлично!) Его не приглашали вступить в нашу группу M407?

Нет еще, дружище. Ты лучше точное название группы знаешь, Сакен, и ты лидер в ней, может быть, вышлешь ему приглашение?
Если что, напиши, я ему тогда вышлю, без проблем.

Оффлайн Рудольф

  • Сообщений: 661
  • Рейтинг +147/-0
Re: С-M407
« Ответ #397 : 29 Сентябрь 2021, 08:16:18 »
И он ответил мне, что он халх, Хиат, Борджигон.
Хиат --это Кият , элитное племя в годы правления  Чингизидов  и генетически с ними связанное .Из этого племени был  беклярбек Мамай и Мансуры -Глинские
Борджигин -это род Чингизидов

Оффлайн varang

  • Сообщений: 5416
  • Страна: fi
  • Рейтинг +1815/-8
    • Проект "R1a-Y417 & Subclades" (M458>L1029>YP417)
  • Y-ДНК: R1a-L1029-A14777
  • мтДНК: H2a1
Re: С-M407
« Ответ #398 : 29 Сентябрь 2021, 08:59:54 »
И он ответил мне, что он халх, Хиат, Борджигон.
Хиат --это Кият , элитное племя в годы правления  Чингизидов  и генетически с ними связанное .Из этого племени был  беклярбек Мамай и Мансуры -Глинские
Борджигин -это род Чингизидов

Да, именно. Вот пусть специалисты и присматриваются фокусированно к нашим Даянханидам под F9733.

(Для нас же эта очень близкая братская ветвь. Общий предок жил, возможно, даже и раньше, чем Рюрик у Рюриковичей. С точки зрения генетической геналогии - не скрою, приятно).

Оффлайн Saken

  • Сообщений: 417
  • Страна: kz
  • Рейтинг +241/-0
  • YFull: YF79031
  • Y-ДНК: C3d [C-Z33001], R1a [R-Y62055], C3x*
  • мтДНК: D4g1* & F1b
Re: С-M407
« Ответ #399 : 29 Сентябрь 2021, 09:11:08 »
Отлично!) Его не приглашали вступить в нашу группу M407?
Нет еще, дружище. Ты лучше точное название группы знаешь, Сакен, и ты лидер в ней, может быть, вышлешь ему приглашение?
Если что, напиши, я ему тогда вышлю, без проблем.

Ок. Уже отправил по внутренней системе YFull приглашалку на нашу группу ;) Надеюсь, что он примет ее.
« Последнее редактирование: 29 Сентябрь 2021, 14:16:02 от Saken »

Оффлайн Saken

  • Сообщений: 417
  • Страна: kz
  • Рейтинг +241/-0
  • YFull: YF79031
  • Y-ДНК: C3d [C-Z33001], R1a [R-Y62055], C3x*
  • мтДНК: D4g1* & F1b
Re: С-M407
« Ответ #400 : 29 Сентябрь 2021, 16:10:35 »
Не учел длину покрытия, 4 снипы * 8467165/6766401= 1.251 * 4 = 5 скорректированных снипов. И в итоге 5 * 144.41 + 60 = 782 ybp или 800ybp округленно. Это начала XIII века, и он ровесник с Z33001.

Интересно будет сравнить эти результаты с YFull, а именно когда завершится анализ с HLB-182.

Если в расчете возраста у HLB-182 также учтут combBED снип F12364, тот что с доп. локализацией, то возраст еще на четверть станет старше. Примерно 1000лет от текущего исчисления.

F12364 вывели из приватных, и расположили его на уровне C-F8465* terminal.

Оффлайн Saken

  • Сообщений: 417
  • Страна: kz
  • Рейтинг +241/-0
  • YFull: YF79031
  • Y-ДНК: C3d [C-Z33001], R1a [R-Y62055], C3x*
  • мтДНК: D4g1* & F1b
Re: С-M407
« Ответ #401 : 30 Сентябрь 2021, 06:52:10 »
В M407 попадают 3 образца, - 2 Сонида и 1 халха монгол.

Меня заинтересовали сониды. Их в общем протестировали 6 чел. , и каждый 3 из M407. Судя по описанию в вики у сонидов есть связь с борджигинами.

В «Сокровенном сказании монголов» говорится, что у предка Чингисхана Хайду было три сына, младшим из которых был Чаочжин Ортегай. От его младшего сына и произошло племя сонид[3]. Так в середине XI в. появился род сунитов. Суниты вплоть до конца XII в. обитали в тайге вместе с лесными народами[1].


Хотел прозондировать файлы самому. Но к сожалению файлы полного генома закрыты для скачивания, но можно запросить доступ, для этого нужно подписать бумагу и отправить скан в BGI. Качество покрытия очень хорошое, в среднем 20-23x WGS, что эквивалентно 10x Y.

Для получения доступа к BAM файлам, в начале сентября заполнил и отправил по email подписанный документ в "Mongolians Genomics Committee". Вчера напоминалку написал, и сегодня утром ответили. Отказали в доступе ссылаясь на ограничение от китайского правительства :-\

Dear Saken,

Sorry to give you the feedback so late. In past several days, we asked guys of the database about your request. Unfortunately, based on current regulation of Chinese government, we still can’t send the data out the mainland of China.

Sorry again I couldn’t help you.

Best wishes,

Xiaosen Guo

Оффлайн Saken

  • Сообщений: 417
  • Страна: kz
  • Рейтинг +241/-0
  • YFull: YF79031
  • Y-ДНК: C3d [C-Z33001], R1a [R-Y62055], C3x*
  • мтДНК: D4g1* & F1b
Re: С-M407
« Ответ #402 : 20 Октябрь 2021, 08:38:17 »
Дерево на YFull обновилось. Возраст формирование C-F10378 оценен в 2700ybp, общего предка в 1100ybp.

Оффлайн varang

  • Сообщений: 5416
  • Страна: fi
  • Рейтинг +1815/-8
    • Проект "R1a-Y417 & Subclades" (M458>L1029>YP417)
  • Y-ДНК: R1a-L1029-A14777
  • мтДНК: H2a1
Re: С-M407
« Ответ #403 : 20 Октябрь 2021, 08:49:22 »
Дерево на YFull обновилось. Возраст формирование C-F10378 оценен в 2700ybp, общего предка в 1100ybp.

Супер. В следующем релизе будет оценка датировки уже и для C-F9733.

Оффлайн Saken

  • Сообщений: 417
  • Страна: kz
  • Рейтинг +241/-0
  • YFull: YF79031
  • Y-ДНК: C3d [C-Z33001], R1a [R-Y62055], C3x*
  • мтДНК: D4g1* & F1b
Re: С-M407
« Ответ #404 : 17 Ноябрь 2021, 06:26:50 »
https://evolbio.ut.ee/chrY/
На сайте Эстонского Био Центра нашел сырые данные Y хромосом наших 9 образцев бурятов с Karmin et al. ;)

Какая процедура загрузки научных образцев на YFull? Все исходники в формате tsv.bz2. Файлы очень увесистые, в районе 10гига.







Вчера James Kane (автор y-dna warehouse) запустил новую версию https://ydna-warehouse.org/tree с деревом как на YFull. И заметил, что у него есть образцы с статьи Кармина, о которых я писал выше, есть те которых нет на YFull.


 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.