АвторТема: Генетические расстояния  (Прочитано 23422 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн FarroukhАвтор темы

  • Maternal Y-DNA: R1b-BY124371
  • ...
  • Сообщений: 17212
  • Страна: az
  • Рейтинг +5974/-17
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37518
  • мтДНК: F2f1
Генетические расстояния
« : 13 Июнь 2009, 23:05:49 »
На сайте ysearch.org есть возможность поиска ближайших родственников на основании данных Y-гаплогруппы. В результате выдаётся таблица, где перечислены фамилии людей с близкими гаплотипами. Крайне правый столбик таблицы (Genetic Distance) указывает на некое генетическое расстояние, измеряемое в неких единицах (это расстояние можно задавать при поиске).
Мне, например, наиболее близки Cro-Early Europeans (CJWJ5). От меня до них два шага.

Вопрос: это расстояние характеризует время жизни общего предка?

Оффлайн wertner

  • ...
  • Сообщений: 1332
  • Страна: ru
  • Рейтинг +321/-0
    • YFull
  • Y-ДНК: E-V13->E-S2972->E-Z16661
  • мтДНК: U4a (xU4a3)
Re: Генетические расстояния
« Ответ #1 : 13 Июнь 2009, 23:20:53 »
Расстояние в 2 мутации на 12 маркерах? Примерно 1500 лет плюс минус лет с тысячу (слишком мало маркеров у него протестировано, 12).

Оффлайн Centurion

  • 100% Earth (Solar System) genofond
  • Администратор
  • *****
  • Сообщений: 9548
  • Страна: ru
  • Рейтинг +571/-2
Re: Генетические расстояния
« Ответ #2 : 13 Июнь 2009, 23:21:44 »
Вопрос: это расстояние характеризует время жизни общего предка?

Нет, это расстояние в мутациях, то есть если у вас с кем то на 12 локусах ген. дист. 2, то это значит, что 10 локусов из 12 имеют одинаковое кол-во повторов, а 2 различаются.

Оффлайн Mich Glitch

  • Genus regis
  • Сообщений: 36936
  • Страна: ca
  • Рейтинг +3773/-48
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5a
Re: Генетические расстояния
« Ответ #3 : 13 Июнь 2009, 23:30:17 »
На ysearch.org есть одно неприятное ограничение. При генетической дистанции более 6 всё считается только в одношаговых мутациях.

Оффлайн Centurion

  • 100% Earth (Solar System) genofond
  • Администратор
  • *****
  • Сообщений: 9548
  • Страна: ru
  • Рейтинг +571/-2
Re: Генетические расстояния
« Ответ #4 : 13 Июнь 2009, 23:31:49 »
На ysearch.org есть одно неприятное ограничение. При генетической дистанции более 6 всё считается только в одношаговых мутациях.
Не замечал этого. Спасибо.

Оффлайн Mich Glitch

  • Genus regis
  • Сообщений: 36936
  • Страна: ca
  • Рейтинг +3773/-48
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5a
Re: Генетические расстояния
« Ответ #5 : 13 Июнь 2009, 23:36:52 »
На ysearch.org есть одно неприятное ограничение. При генетической дистанции более 6 всё считается только в одношаговых мутациях.
Не замечал этого. Спасибо.
Посмотрите.
Вы выставляете генетическую дистанцию 6(максимум). То есть можете иметь дистанцию в 6 шагов на одном маркере.
А потом бац, можно иметь разницу хоть на всех маркерах, но не более 1 шага на маркер.
То есть допустим есть кто-то с генетической дистанцией 3 на одном маркере и 4 на другом (всего 7), а мне будут высвечивать бедолаг с 20-30 одношаговыми разницами.
Стрём.

Оффлайн Mich Glitch

  • Genus regis
  • Сообщений: 36936
  • Страна: ca
  • Рейтинг +3773/-48
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5a
Re: Генетические расстояния
« Ответ #6 : 13 Июнь 2009, 23:38:30 »
Я собственно и поэтому тоже больше 6 генетическую разницу не беру.

Оффлайн wertner

  • ...
  • Сообщений: 1332
  • Страна: ru
  • Рейтинг +321/-0
    • YFull
  • Y-ДНК: E-V13->E-S2972->E-Z16661
  • мтДНК: U4a (xU4a3)
Re: Генетические расстояния
« Ответ #7 : 13 Июнь 2009, 23:46:25 »
Если не лень отключиться от сети (если комп в локальной сети, то от нее, а если комп напрямую в инете, то от инета), то можно смотреть и на расстоянии больше 6:
открываете страничку поиска "Enter Search Parameters"
заполняете все необходимые поля, в т.ч. слова с картинки, ставите макс. дистанцию 6
отключаетесь от сети
нажимаете кнопку Search
(Вам выдается сообщение о невозможности найти страницу)
меняете в адресной строке браузера 6 на 50 (или любое другое число)
поключаетесь к сети
нажимаете Enter в адресной строке
наслаждаетесь тысячей (это максимум) результатов ;)

я обычно задаю расстояние 50 при общих протестированных 64 маркерах (Show users that tested at least 64 f the markers that I did; a maximum genetic distance of 50)

Оффлайн zastrug

  • ...
  • Сообщений: 11307
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2885/-49
  • I2b1c (P78+)=I2a2a1b1a= I2a1b1a2a1a1( I-FT413656)
  • Y-ДНК: I2b1c
  • мтДНК: T2a1a
Re: Генетические расстояния
« Ответ #8 : 14 Июнь 2009, 00:04:08 »
Браво! Очень полезная информация.

Оффлайн Mich Glitch

  • Genus regis
  • Сообщений: 36936
  • Страна: ca
  • Рейтинг +3773/-48
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5a
Re: Генетические расстояния
« Ответ #9 : 14 Июнь 2009, 00:04:46 »
Если не лень отключиться от сети (если комп в локальной сети, то от нее, а если комп напрямую в инете, то от инета), то можно смотреть и на расстоянии больше 6:
открываете страничку поиска "Enter Search Parameters"
заполняете все необходимые поля, в т.ч. слова с картинки, ставите макс. дистанцию 6
отключаетесь от сети
нажимаете кнопку Search
(Вам выдается сообщение о невозможности найти страницу)
меняете в адресной строке браузера 6 на 50 (или любое другое число)
поключаетесь к сети
нажимаете Enter в адресной строке
наслаждаетесь тысячей (это максимум) результатов ;)

я обычно задаю расстояние 50 при общих протестированных 64 маркерах (Show users that tested at least 64 f the markers that I did; a maximum genetic distance of 50)
Да, я делал тоже самое не отключаясь от сети. Просто задавал маленькую разницу и пока осуществлялся поиск менял адресную строку.
Кроме того для избежания тайм-оффов увеличивал время выполнения скриптов.

Оффлайн Valery

  • Сообщений: 10107
  • Страна: 00
  • Рейтинг +1381/-7
  • Ultimate Matriarchy
Re: Генетические расстояния
« Ответ #10 : 14 Июнь 2009, 00:10:55 »
Вместо выдергивания разъема Work Offline сойдет? :)

Оффлайн Sergey Lutak

  • Сообщений: 1146
  • Страна: 00
  • Рейтинг +122/-0
  • Carpatho-Rusyn E-FTA26699 - Venetic H1b* or H41b*
  • Y-ДНК: E1b1b1a1b1a10b*~ (FGC11451+, FTA26699+)
  • мтДНК: H1b* (16189C, 16356C, 16519C, 263G, 315.1C) or H41b* (G15617A, G12192A)
Re: Генетические расстояния
« Ответ #11 : 14 Июнь 2009, 12:23:48 »
Если не лень отключиться от сети (если комп в локальной сети, то от нее, а если комп напрямую в инете, то от инета), то можно смотреть и на расстоянии больше 6:
открываете страничку поиска "Enter Search Parameters"
заполняете все необходимые поля, в т.ч. слова с картинки, ставите макс. дистанцию 6
отключаетесь от сети
нажимаете кнопку Search
(Вам выдается сообщение о невозможности найти страницу)
меняете в адресной строке браузера 6 на 50 (или любое другое число)
поключаетесь к сети
нажимаете Enter в адресной строке
наслаждаетесь тысячей (это максимум) результатов ;)

я обычно задаю расстояние 50 при общих протестированных 64 маркерах (Show users that tested at least 64 f the markers that I did; a maximum genetic distance of 50)

Спасибо, Вадим!
Получилось. Отлично! :D

Оффлайн mouglley

  • ...
  • Сообщений: 7105
  • Страна: hr
  • Рейтинг +434/-7
  • Я знаю, что познаю всё.
    • Записки Маугли
  • Y-ДНК: N1c1-L1025
  • мтДНК: J1c3
Re: Генетические расстояния
« Ответ #12 : 14 Июнь 2009, 12:48:37 »
Да: +2 гаплотипа-67.
Спасибо.

Оффлайн FarroukhАвтор темы

  • Maternal Y-DNA: R1b-BY124371
  • ...
  • Сообщений: 17212
  • Страна: az
  • Рейтинг +5974/-17
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37518
  • мтДНК: F2f1
Re: Генетические расстояния
« Ответ #13 : 14 Июнь 2009, 12:52:14 »
Cro-Early Europeans - кто это могут быть? ранние кроманьонцы Европы?

Оффлайн FarroukhАвтор темы

  • Maternal Y-DNA: R1b-BY124371
  • ...
  • Сообщений: 17212
  • Страна: az
  • Рейтинг +5974/-17
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37518
  • мтДНК: F2f1
Re: Генетические расстояния
« Ответ #14 : 20 Июль 2009, 12:28:19 »
Цитировать
Расстояние в 2 мутации на 12 маркерах? Примерно 1500 лет плюс минус лет с тысячу (слишком мало маркеров у него протестировано, 12).
Wertner, задал поиск по 12 маркерам, расстояние =1. Результаты в прицепе. Что можно сказать о степени нашего родства? Примерное время жизни общего предка?

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.