АвторТема: Филогенетическое древо гаплогруппы I1 (Нетворк)  (Прочитано 13492 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн Аббат БузониАвтор темы

  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 19888
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1818/-60
  • Y-ДНК: I1-SHTR7+
  • мтДНК: H16-a1-T152C!
Эта тема также для новичков. Можно будет спавнить деревья в Мурке и Нетворке на основании одной выборки. ВопросЫ специально буду задавать самые "простые".
« Последнее редактирование: 26 Июнь 2009, 18:48:18 от Аббат Бузони »

Оффлайн Аббат БузониАвтор темы

  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 19888
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1818/-60
  • Y-ДНК: I1-SHTR7+
  • мтДНК: H16-a1-T152C!
Вопрос первый. Где скачать Нетворк?

Оффлайн wertner

  • ...
  • Сообщений: 1332
  • Страна: ru
  • Рейтинг +321/-0
    • YFull
  • Y-ДНК: E-V13->E-S2972->E-Z16661
  • мтДНК: U4a (xU4a3)

Оффлайн Аббат БузониАвтор темы

  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 19888
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1818/-60
  • Y-ДНК: I1-SHTR7+
  • мтДНК: H16-a1-T152C!
Какие требования к ПК для установки и работы Нетворка?

Оффлайн wertner

  • ...
  • Сообщений: 1332
  • Страна: ru
  • Рейтинг +321/-0
    • YFull
  • Y-ДНК: E-V13->E-S2972->E-Z16661
  • мтДНК: U4a (xU4a3)
Windows, каких-либо специальных ограничений не замечено.

Оффлайн Аббат БузониАвтор темы

  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 19888
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1818/-60
  • Y-ДНК: I1-SHTR7+
  • мтДНК: H16-a1-T152C!
Когда-то скачивал версию Нетворк 2008 года, почему не работает?

Оффлайн Centurion

  • 100% Earth (Solar System) genofond
  • Администратор
  • *****
  • Сообщений: 9548
  • Страна: ru
  • Рейтинг +571/-2
Когда-то скачивал версию Нетворк 2008 года, почему не работает?
Она только 1 год работает ))) потом надо новую качать.

Оффлайн Аббат БузониАвтор темы

  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 19888
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1818/-60
  • Y-ДНК: I1-SHTR7+
  • мтДНК: H16-a1-T152C!
Установил. Теперь надо составить выборку. Где брать гаплотипы для выборки? Какой длины гаплотипы предпочтительней и почему?

Оффлайн Centurion

  • 100% Earth (Solar System) genofond
  • Администратор
  • *****
  • Сообщений: 9548
  • Страна: ru
  • Рейтинг +571/-2
Установил. Теперь надо составить выборку. Где брать гаплотипы для выборки? Какой длины гаплотипы предпочтительней и почему?
Ты что не разу не работал в Нетворке?  :)

Оффлайн Аббат БузониАвтор темы

  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 19888
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1818/-60
  • Y-ДНК: I1-SHTR7+
  • мтДНК: H16-a1-T152C!
Нет, не знаю, вообще на Вашем сайте в первый раз. Прочитал форум стало интересно.

Оффлайн wertner

  • ...
  • Сообщений: 1332
  • Страна: ru
  • Рейтинг +321/-0
    • YFull
  • Y-ДНК: E-V13->E-S2972->E-Z16661
  • мтДНК: U4a (xU4a3)
Centurion, он же написал, что будет задавать глупые вопросы.

Аббат Бузони, необходимо подготовить .ych файл с гаплотипами.
Гаплотипы надо брать на сайте YSearch.org или familytreedna.com/projects
первый раз сформировать .ych поможет Y-Utility с галочкой "Generate Fluxus phylogenetic network .ych data" (и с минимумом остальных)
потом рекомендуется заглянуть в файл и добавлять туда гаплотипы самому.

Чем длинее гаплотипы, тем лучше - более достоверные сети получаются. Т.е. лучше брать 67 маркеров. Гаплотипы в одном файле должны быть одинаковой длины.

Оффлайн Аббат БузониАвтор темы

  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 19888
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1818/-60
  • Y-ДНК: I1-SHTR7+
  • мтДНК: H16-a1-T152C!
Порядок маркеров в проектах FTDNA и в базе Ysearch разный, какой выбрать для составления ych-файла?

Оффлайн Centurion

  • 100% Earth (Solar System) genofond
  • Администратор
  • *****
  • Сообщений: 9548
  • Страна: ru
  • Рейтинг +571/-2
Порядок маркеров в проектах FTDNA и в базе Ysearch разный, какой выбрать для составления ych-файла?
Абсолютно любой.

Оффлайн wertner

  • ...
  • Сообщений: 1332
  • Страна: ru
  • Рейтинг +321/-0
    • YFull
  • Y-ДНК: E-V13->E-S2972->E-Z16661
  • мтДНК: U4a (xU4a3)
Порядок маркеров любой. Только надо его всегда помнить при указании гаплотипов и весов.

Оффлайн Аббат БузониАвтор темы

  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 19888
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1818/-60
  • Y-ДНК: I1-SHTR7+
  • мтДНК: H16-a1-T152C!
Какое количество гаплотипов в выборке приемлимо для работы в Нетворке?

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.