АвторТема: Тест аутосомных STR маркеров  (Прочитано 9955 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн Tanasquel

  • Сообщений: 971
  • Страна: ru
  • Рейтинг +135/-0
  • Всем всего светлого и ясного
  • Y-ДНК: G2a-CTS 342
  • мтДНК: U5a1
Re: Тест аутосомных STR маркеров
« Ответ #15 : 14 Март 2023, 14:20:45 »
Подскажите пожалуйста, какие аутосомные str для наших целей наиболее приемлемы?Если есть возможность списком

Онлайн Farroukh

  • Maternal Y-DNA: R1b-FTD83033
  • ...
  • Сообщений: 18341
  • Страна: az
  • Рейтинг +6780/-17
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37518
  • мтДНК: F2f1
Re: Тест аутосомных STR маркеров
« Ответ #16 : 16 Март 2023, 08:44:54 »
Только если необходимо доказать отцовство.

Оффлайн Georg

  • Сообщений: 949
  • Страна: ru
  • Рейтинг +308/-6
  • Племянник vk511(Y),vk160(аДНК)
  • Y-ДНК: I1a1b1a1e2 (Y353312)
  • мтДНК: Я U5b2a1b, дети T1a1ct и H5b*
Re: Тест аутосомных STR маркеров
« Ответ #17 : 09 Май 2025, 14:28:21 »
Кстати, а чем можно из полного генома вытащить 25 аутосомных str маркеров?
локусы, которые делают военным и . для "Постановки на учет в информационный массив сервиса "Ксенон-2" подлежат информационные карты со следующими полиморфными генетическими локусами ДНК: Amelogenin, D3S1358, D1S1656, D2S441, D10S1248, D13S317, D16S539, D18S51, D2S1338, CSF1PO, TH01, vWA, D21S11, D7S820, D5S818, TPOX, D8S1179, D12S391, D19S433, D22S1045, DYS391, FGA."

Из аутосомного генотековского же точно не извлечь
« Последнее редактирование: 09 Май 2025, 14:43:56 от Georg »

Онлайн Farroukh

  • Maternal Y-DNA: R1b-FTD83033
  • ...
  • Сообщений: 18341
  • Страна: az
  • Рейтинг +6780/-17
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37518
  • мтДНК: F2f1
Re: Тест аутосомных STR маркеров
« Ответ #18 : 09 Май 2025, 17:50:12 »
Цитировать
Кстати, а чем можно из полного генома вытащить 25 аутосомных str маркеров?
Георг, должен отметить, что существующие коммерческие ПГ-продукты на самом деле не являются полногеномными в подлинном смысле слова. Те же Y-STR формата Y111 полностью не покрываются, то же относится и к аутосомным сегментам.

То есть для полного ксеноновского профиля каких-то локусов может не быть.

Оффлайн Georg

  • Сообщений: 949
  • Страна: ru
  • Рейтинг +308/-6
  • Племянник vk511(Y),vk160(аДНК)
  • Y-ДНК: I1a1b1a1e2 (Y353312)
  • мтДНК: Я U5b2a1b, дети T1a1ct и H5b*
Re: Тест аутосомных STR маркеров
« Ответ #19 : 09 Май 2025, 17:55:32 »
Цитировать
Кстати, а чем можно из полного генома вытащить 25 аутосомных str маркеров?
Георг, должен отметить, что существующие коммерческие ПГ-продукты на самом деле не являются полногеномными в подлинном смысле слова. Те же Y-STR формата Y111 полностью не покрываются, то же относится и к аутосомным сегментам.

То есть для полного ксеноновского профиля каких-то локусов может не быть.
Понятно, спасибо.
А про такие конверторы/анализаторы не слышали?
По-моему тоже годная тема, особенно холодного поиска, без знания каких-то родственников.

Оффлайн Semargl

  • "El sueño de la razón produce monstruos" ©
  • Сообщений: 6318
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4665/-5
  • www.semargl.me
    • www.semargl.me
  • Y-ДНК: R1a [CTS3402+]
  • мтДНК: U4a2g
Re: Тест аутосомных STR маркеров
« Ответ #20 : 09 Май 2025, 18:31:33 »
Цитировать
Кстати, а чем можно из полного генома вытащить 25 аутосомных str маркеров?
Георг, должен отметить, что существующие коммерческие ПГ-продукты на самом деле не являются полногеномными в подлинном смысле слова. Те же Y-STR формата Y111 полностью не покрываются, то же относится и к аутосомным сегментам.

То есть для полного ксеноновского профиля каких-то локусов может не быть.
Это связано не с шириной покрытия или как говорят "не полного генома", а с разницей в технологиях. 111 STR маркеров в полном геноме, как и в Y700, полностью покрыты, но прочитать их все не возможно из-за длины чтения примененного в тесте. Поэтому FTDNA не рискует определять STR маркеры из теста NGS дабы избежать претензий когда человек перепроверит их) И они делают отдельный тест 111 методом Сэнгера. Плюсуя цену этих 111 к тесту NGS. Отсюда и повышенная цена. Все очень просто.

Онлайн Farroukh

  • Maternal Y-DNA: R1b-FTD83033
  • ...
  • Сообщений: 18341
  • Страна: az
  • Рейтинг +6780/-17
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37518
  • мтДНК: F2f1
Re: Тест аутосомных STR маркеров
« Ответ #21 : 09 Май 2025, 18:46:33 »
Цитировать
Это связано не с шириной покрытия или как говорят "не полного генома", а с разницей в технологиях. 111 STR маркеров в полном геноме, как и в Y700, полностью покрыты, но прочитать их все не возможно из-за длины чтения примененного в тесте.
Плюсую и принимаю к сведению :)

Впрочем, для рядового тестируемого техническая разница между "шириной покрытия" и "длиной чтения" малоуловима, ибо в один клик извлекать софтом из ПГ готовые профили типа CODIS или "Ксенон-2" (пока) невозможно.

Оффлайн Georg

  • Сообщений: 949
  • Страна: ru
  • Рейтинг +308/-6
  • Племянник vk511(Y),vk160(аДНК)
  • Y-ДНК: I1a1b1a1e2 (Y353312)
  • мтДНК: Я U5b2a1b, дети T1a1ct и H5b*
Re: Тест аутосомных STR маркеров
« Ответ #22 : 15 Май 2025, 13:48:44 »
Помимо Ксенона, оказывается делается
Программа Союзного государства «ДНК-идентификация-1 и 2.
Пока не нашел научно-технических подробностей - суорее всего расширенный профиль str ( документы пропали
, но доступны через вебархив
https://web.archive.org/web/20240716163622/https://soyuz.by/projects/ldfklr/programma-razrabotka-innovacionnyh-genogeograficheskih-i-genomnyh-tehnologiy-identifikacii-lichnosti-i-individualnyh-osobennostey-cheloveka-na-osnove-izucheniya-genofondov-regionov-soyuznogo-gosudarstva-dnk-identifikaciya
Но вообще шумиха и уровень комментариев ответственных лиц настораживает - якобы определяется и психоэмоциональное состояние индивида лол, и возраст кек.
Задача Б мероприятие 5
Разработка методики определения статусов генетических локусов и прижизненной модификации участков днк, влияющих на психо-эмоциональный статус человека )))

Оффлайн Древ

  • Сообщений: 960
  • Страна: ru
  • Рейтинг +265/-4
  • Y-ДНК: I-PH1410
  • мтДНК: H5a1a*
Re: Тест аутосомных STR маркеров
« Ответ #23 : 15 Май 2025, 16:53:27 »
Задача Б мероприятие 5
Разработка методики определения статусов генетических локусов и прижизненной модификации участков днк, влияющих на психо-эмоциональный статус человека )))
Нууу... чем чёрт не шутит. А вдруг найдут такие локусы?
Например, насколько я знаю, что если у человека есть психическое заболевание проявленное, то оно с большей вероятностью наследуется, нежели непроявленное. А это как раз связь между психо-эмоциональным состоянием и генетикой человека.
Вообще, так называемая "генетика поведения" - это вполне доказанная штука. Но тут уже хотят шагнуть дальше.

Оффлайн Georg

  • Сообщений: 949
  • Страна: ru
  • Рейтинг +308/-6
  • Племянник vk511(Y),vk160(аДНК)
  • Y-ДНК: I1a1b1a1e2 (Y353312)
  • мтДНК: Я U5b2a1b, дети T1a1ct и H5b*
Re: Тест аутосомных STR маркеров
« Ответ #24 : 07 Июнь 2025, 09:51:01 »
Сделал себе 25 маркеров на всякий случай.
Нет ли у кого доступа в Ксенон сравниться?

Оффлайн Georg

  • Сообщений: 949
  • Страна: ru
  • Рейтинг +308/-6
  • Племянник vk511(Y),vk160(аДНК)
  • Y-ДНК: I1a1b1a1e2 (Y353312)
  • мтДНК: Я U5b2a1b, дети T1a1ct и H5b*
Re: Тест аутосомных STR маркеров
« Ответ #25 : 08 Июнь 2025, 19:29:51 »
Интересно, на украине есть ли днк-идентификация и лаборатории по работе со сложными биоматериалами, хотя бы как в Ростове?
В принципе сообщали еще в 2023 , что "ДНК человека будет храниться в личном деле военного"

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.