Публикации на тему E1b1b1a

[Centurion]

Географическое отнесение некоторых ветвей филогенетического древа E1b1b1a2-V13 // Russian Journal of Genetic Genealogy (Русская версия), Vol 1, No 1 (2009), стр. 14-19

Vadim Urasin

Abstract

Было проанализировано филогенетическое дерево E1b1b1a2-V13, построенное из 67-маркерных гаплотипов (N=342). Для построения использовался метод оценки вероятности дерева через вычисление вероятности ребер дерева и вероятностного распределения времени жизни каждого узла дерева. Время появления снипа оценено как период от XXIX в. до н.э. до VII в. до н. э., время жизни общего предка всего дерева оценено примерно XV в. до н. э. Выделена древняя германская ветвь (приблизительно III в. до н. э., N=20) и более молодые белорусско-русская (XI в, N=5), британская (VII в., N=7) и германо-швейцарская ветви (X в., N=7). Некоторые кластеры проекта M35 были обобщены: E1b1b1a2*-D до британской ветви (VIII в, N=10), E1b1b1a2*-F до британской ветви (XI в, N=18).

http://rjgg.molgen.org/index.php/RJGGRE/article/view/11/7

[wertner]

Замечания:
1. Необходимо добавить в статью 67-маркерный гаплотип предка E1b1b1a2-V13 в явном виде.
2. Для найденных ветвей необходимо выписать характеризующие их мутации, хоть они и видны на рисунках ветвей.
3. Ну и убрать пафосность некоторых предложений. Чтой-то я погорячился

Думаю, изменения в русскую версию вносить не буду. Они будут в английской версии.

Centurion, спасибо за оформление. Mich Glitch, Grigoriev, спасибо за всю остальную работу.

[АнТюр]

Из статьи я не понял, как считалось время жизни общего предка. По какм скоростям мутаций?
Спасибо.

[wertner]

Из статьи я не понял, как считалось время жизни общего предка. По какм скоростям мутаций?
Спасибо.

Откалиброванные только по МакДональдам (дереву из 67-маркерных гаплотипов, построенному тем же способом).
0,173 мутаций на 67 маркеров в 25 лет
или
в среднем 0,0026 мутаций на маркер в 25 лет.
Думаю, скорость выше 0,002 во многом из-за учета RecLOH, которые учитываются как одна мутация.

[Naeel]

Протестированный мной из отцовской деревни
вернее, их даже 2 таких
23andme правильно буквы-цифры определило ?
V13, a2*

E1b1b1a2* defining mutations
variant   call   anc   der
N/A             
E1b1b1a2 defining mutations
variant   call   anc   der
i4000247 (V13)    A    G       A
i4000252 (V36)    C    T       C

[Farroukh]

E1b1b1a2 - устаревшее наименование субклада V13. Теперь - E1b1b1a1b