0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.
Исходники с гаплотпами - y.ch/y.rdf. Оба файла существуют и содержат те самые 700 с гаком гаплотипов. Запускаю runmjstr.bat, тот рассчитывает всё за считанные микросекунды (хотя гаплотпов тьма, считать должно долго). Да и древо явно не то.Вот мой runmjstr.bat. murka -T "MJ" -S "VB|RSW|EM|THR2" -V "VP|VL|VR" -I 1 -F 20.0 -H "N" -P "1;1.4;2.25;5000;1;1.4;2.25;5000;0;0.75;500;50;33;" -C "0;50;0;" -M "0; 0; 0; 0; RESCHECK|FASTUNION|MORETREES; 1; 0; 0; SEP1|NTT|NT1|NT2|NTD|LEUC|PS|SL|NV|LE|PT|PTE|DA|NTDX|EXTV|EXTVDA|EXTVDAP|ASCPRN|EXPV|CUTRDA|EXTEEDA; 0; LBDA|UBRSPH|KEEPBND|BNDREPEATS3|BNDPERC2|EXTTEST2|EXTTESTP2|PRUNE3|REDREP3|PROCMSG1|NWPERFMON|REDPMLEV2|COMPLTRAVERSAL|KEEPTREE|OOO1|DEFERPW3; " -J 0 -X 0 -Y 0 -U 0 -W 0 -Z 0 -s "BCACHE|DCACHE|THASH" -j "CONSTSPLITS|EQSPLITS|PSHELLING|POSTPROC|CONTRACTNT2|ROOTING|ALLOWTERMROOT|MIDPOINTROOT|MSNCACHE|NWGRCACHE|FASTMJ|WPHEUR|MPSTAT|CONSTREE" -e 0 -x 0 -b 100 -f "NOFU|NS3|STAPPR|FH" -m 0.6 -n 100 -l 10 -t "RDF" -i "data\seq\y.rdf" -r "data\metric\states_str0050ineq_2_4" -d 0.8 -o "SEQTABLE|TAXATABLE|CHARTABLE|CHARCHNGTABLE|NW|NWEXT|STAT|STP|MPCOMPTABLE|MPRFTDMATRIX|MPPARTTABLE|MPTOPOTABLE|CHARSTTABLE|DMATRIX" -c "inn_" -p "nw" -q "stat" -u "nwlinktbl#" -O "seq.rdf" -w "distmx" -D "charsttbl" -z "taxatbl#" -a "chartbl#" -k "charchngtbl#" -Q "wtdistmx" -K "rftdistmx" -R "tcmptbl" -B "parttbl" -L "topotbl" -G "TRDF; 4; ROOTPREFERRED|DIST|CHNAMES|CHCHNG|TXFR|ROOTONLY|TREEONLY|NOPOOL|NOSEQ|MPPART; 4; 3; 0.0; 0.0; ; ; ; ; viz\nw#.txt; ; ; ; "