Мурочное древо. Вопросы дилетанта

[Farroukh]

Итак, после долгих долбомучений, древо в мурке таки построено. Теперь возникает следующая цепь вопросов, связанных с расшифровкой древа.



1) Возрасты узлов древа даны в годах. Может ли мурка выдавать возрасты в поколениях и если да, то как это сделать?
2) Возрасты узлов древа даны в годах с допуском с точностью чуть ли до нескольких месяцев, типа 919.24±164.15. Если возраст одного поколения берётся равным 25-ти годам, то ожидаем ответ, крастный числу 25, например, 900±175 лет. В чём здесь дело?
3) Возрасты узлов древа идут по убыванию, начиная с корня. То есть возраст коренного узла - наибольший, возраст самого верхнего узла - наименьший. Но на данном рисунке возраст самого нижнего узла 924.43+-176.58 года, а последующего 959.74±170.45

Я так понимаю, что при определённом значении их допусков они пересекаются, но нельзя ли этот вопрос как-то уладить, выдавая значения в поколениях?
4) Возле каждого узла есть цифры типа:

458 19:20
572 12:11
385b 19:20
[mpp=1.0000]

Если я правильно понимаю, то сиё значит, что характерными значениями маркёров данной ветви являются DYS458=20 (было 19), DYS572=11 (было 12), DYS385b=20 (было 19). Так?
[mpp=1.0000] - а это что?

[I2a1a]

Фульвио, сын мой.
mp -это частота партиции.

[Farroukh]

Ааа, тады, ясно, это про разбиение древа. Поциенту про это можно и не знать.

Вот насчёт остального бы просветиться...

[Овод]

1) Надо спросить Валерия. Но разницы не вижу.
 
2) Занижение доверительного интервала - одна из печальных особенностей ро-статистики (поскольку в ней нет учёта корреляции индивидуальных линий, уменьшающих видимую дисперсию оценки).
 
3) Оценка длины интервала базируется на наиболее вероятном его значении. Однако это не исключает менее вероятных. При небольшой статистике "Shit happens". Нужно делать поправки - дискуссия об этом свойстве статистики интервалов уже была на форуме.
 
4) 572 12:11 означает что в маркере 582 в данном узле произошла мутация из 12-ти повторов в 11.

[Valery]

Фаррух, Овод с Вадимом облегчили мне работу, отвечаю только на неотвеченное

1) Умножь не на 175 а на число поколений в 1 Ро.

6) (Про MPP) Каким скриптом запускал Муру? Если дерево только одно (не было штейнеровской опции FASTUNION) то в графических параметрах MPPART можно не указывать и тогда не будет в этом случае лишних MPP. Если деревьев много (была штейнеровская опция FASTUNION) то MPPART в графисеких параметрах лучше указывать чтобы увидеть долю топологий поддерживаемых каждым ребром. Я указал тебе скриптец из дистра, там все это есть.

[I2a1a]

Для неофитов эзотерического Ордена Мурки выражения типа
 
 

Умножь не на 175 а на число поколений в 1 Ро.

 или
 
 

не было штейнеровской опции FASTUNION

 звучат столь же убедительно и понятно, как эти убедительные высказывания из "Гримуара заклинания духа места"-малоизвестного герметического сочинения обнаруженного в коллекции манускриптов Парижской библиотеки Арсенала:
 
 
 
 
 

[Valery]

+1

князь того места

 

[Valery]

Фаррух, поправка: умножь не на

175

а на

175/(длина мужского эээ... поколения)

[Valery]

Здесь необходимы важные пояснения. У каждого мужчины своя длина поколения и даже собственное мнение какая длина оптимальна (субоптимальна,.. нужное подставить). Более того, многие считают этот вопрос приватным и не желают обсуждать его публично. В случае если возникнет ошибка программы, автору вместе с логом необходимо выслать скрипт запуска, в котором указана оная длина поколения. Автор обязуется свято хранить приватность этой информации и не делиться ею с другими своими пациентами.

[I2a1a]

Здесь необходимы важные пояснения. У каждого мужчины своя длина поколения и даже собственное мнение какая длина оптимальна (субоптимальна,.. нужное подставить). Более того, многие считают этот вопрос приватным и не желают обсуждать его публично. В случае если возникнет ошибка программы, автору вместе с логом необходимо выслать скрипт запуска, в котором указана оная длина поколения.

У меня длина по самое коление.

[I2a1a]

+1

Ну да. Вот Вы пишите в мануале: "Я написал робустный скрипт для построения филогенетического дерева N1c, с помощью которого произвел эксплицитный вызов функции штейнеровского солвера".

А можно и так: " Я написал магический скрипт для построения филогенетического дерева N1c, с помощью которого произвел эксплицитный вызов духа князя того места - Кубары".

 

[Valery]

Кубара - это покровитель N1. У E1 наверное это другой дух.

[I2a1a]

Кубара - это покровитель N1. У E1 наверное это другой дух.

Или,  используя любимый  каламбур молгеновского fellow member Славера можно сказать - наверное, это другой йух (E1->Африка->Юг->йуг->йух.

[Valery]

каламбур, каламбур, игра слов (С)

[I2a1a]

Живя в теплом климате, нет потребности оптимизировать свой генетический код.