АвторТема: Мурочное древо. Вопросы дилетанта  (Прочитано 11405 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн FarroukhАвтор темы

  • Maternal Y-DNA: R1b-L584
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 13000
  • Страна: az
  • Рейтинг +2990/-15
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37518
  • мтДНК: F2f
Мурочное древо. Вопросы дилетанта
« : 19 Сентябрь 2011, 09:15:15 »
Итак, после долгих долбомучений, древо в мурке таки построено. Теперь возникает следующая цепь вопросов, связанных с расшифровкой древа.



1) Возрасты узлов древа даны в годах. Может ли мурка выдавать возрасты в поколениях и если да, то как это сделать?
2) Возрасты узлов древа даны в годах с допуском с точностью чуть ли до нескольких месяцев, типа 919.24±164.15. Если возраст одного поколения берётся равным 25-ти годам, то ожидаем ответ, крастный числу 25, например, 900±175 лет. В чём здесь дело?
3) Возрасты узлов древа идут по убыванию, начиная с корня. То есть возраст коренного узла - наибольший, возраст самого верхнего узла - наименьший. Но на данном рисунке возраст самого нижнего узла 924.43+-176.58 года, а последующего 959.74±170.45

Я так понимаю, что при определённом значении их допусков они пересекаются, но нельзя ли этот вопрос как-то уладить, выдавая значения в поколениях?
4) Возле каждого узла есть цифры типа:

458 19:20
572 12:11
385b 19:20
[mpp=1.0000]

Если я правильно понимаю, то сиё значит, что характерными значениями маркёров данной ветви являются DYS458=20 (было 19), DYS572=11 (было 12), DYS385b=20 (было 19). Так?
[mpp=1.0000] - а это что?

Оффлайн I2a1a

  • ...
  • Сообщений: 10574
  • Страна: ee
  • Рейтинг +757/-8
Re: Мурочное древо. Вопросы дилетанта
« Ответ #1 : 19 Сентябрь 2011, 10:08:06 »
Фульвио, сын мой.
mp -это частота партиции.

Оффлайн FarroukhАвтор темы

  • Maternal Y-DNA: R1b-L584
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 13000
  • Страна: az
  • Рейтинг +2990/-15
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37518
  • мтДНК: F2f
Re: Мурочное древо. Вопросы дилетанта
« Ответ #2 : 19 Сентябрь 2011, 11:54:14 »
Ааа, тады, ясно, это про разбиение древа. Поциенту про это можно и не знать.

Вот насчёт остального бы просветиться...

Оффлайн Овод

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 2088
  • Рейтинг +390/-3
  • Omnia mea mecum porto
  • Y-ДНК: R1a-M198
  • мтДНК: U4a
Re: Мурочное древо. Вопросы дилетанта
« Ответ #3 : 19 Сентябрь 2011, 11:55:06 »
1) Надо спросить Валерия. Но разницы не вижу.
 
2) Занижение доверительного интервала - одна из печальных особенностей ро-статистики (поскольку в ней нет учёта корреляции индивидуальных линий, уменьшающих видимую дисперсию оценки).
 
3) Оценка длины интервала базируется на наиболее вероятном его значении. Однако это не исключает менее вероятных. При небольшой статистике "Shit happens". Нужно делать поправки - дискуссия об этом свойстве статистики интервалов уже была на форуме.
 
4) 572 12:11 означает что в маркере 582 в данном узле произошла мутация из 12-ти повторов в 11.

Оффлайн Valery

  • Сообщений: 5678
  • Страна: 00
  • Рейтинг +537/-6
  • Ultimate Matriarchy
Re: Мурочное древо. Вопросы дилетанта
« Ответ #4 : 19 Сентябрь 2011, 12:09:26 »
Фаррух, Овод с Вадимом облегчили мне работу, отвечаю только на неотвеченное :)

1) Умножь не на 175 а на число поколений в 1 Ро.

6) (Про MPP) Каким скриптом запускал Муру? Если дерево только одно (не было штейнеровской опции FASTUNION) то в графических параметрах MPPART можно не указывать и тогда не будет в этом случае лишних MPP. Если деревьев много (была штейнеровская опция FASTUNION) то MPPART в графисеких параметрах лучше указывать чтобы увидеть долю топологий поддерживаемых каждым ребром. Я указал тебе скриптец из дистра, там все это есть.

Оффлайн I2a1a

  • ...
  • Сообщений: 10574
  • Страна: ee
  • Рейтинг +757/-8
Re: Мурочное древо. Вопросы дилетанта
« Ответ #5 : 19 Сентябрь 2011, 13:11:04 »
Для неофитов эзотерического Ордена Мурки выражения типа
 
 
Цитировать
Умножь не на 175 а на число поколений в 1 Ро.

 или
 
 
Цитировать
не было штейнеровской опции FASTUNION

 звучат столь же убедительно и понятно, как эти убедительные высказывания из "Гримуара заклинания духа места"-малоизвестного герметического сочинения обнаруженного в коллекции манускриптов Парижской библиотеки Арсенала:
 
 
 
 
 

Оффлайн Valery

  • Сообщений: 5678
  • Страна: 00
  • Рейтинг +537/-6
  • Ultimate Matriarchy
Re: Мурочное древо. Вопросы дилетанта
« Ответ #6 : 19 Сентябрь 2011, 13:28:49 »
+1
Цитировать
князь того места
  ;D

Оффлайн Valery

  • Сообщений: 5678
  • Страна: 00
  • Рейтинг +537/-6
  • Ultimate Matriarchy
Re: Мурочное древо. Вопросы дилетанта
« Ответ #7 : 19 Сентябрь 2011, 13:30:56 »
Фаррух, поправка: умножь не на

175

а на

175/(длина мужского эээ... поколения)

Оффлайн Valery

  • Сообщений: 5678
  • Страна: 00
  • Рейтинг +537/-6
  • Ultimate Matriarchy
Re: Мурочное древо. Вопросы дилетанта
« Ответ #8 : 19 Сентябрь 2011, 13:39:18 »
Здесь необходимы важные пояснения. У каждого мужчины своя длина поколения и даже собственное мнение какая длина оптимальна (субоптимальна,.. нужное подставить). Более того, многие считают этот вопрос приватным и не желают обсуждать его публично. В случае если возникнет ошибка программы, автору вместе с логом необходимо выслать скрипт запуска, в котором указана оная длина поколения. Автор обязуется свято хранить приватность этой информации и не делиться ею с другими своими пациентами.

Оффлайн I2a1a

  • ...
  • Сообщений: 10574
  • Страна: ee
  • Рейтинг +757/-8
Re: Мурочное древо. Вопросы дилетанта
« Ответ #9 : 19 Сентябрь 2011, 13:43:30 »
Здесь необходимы важные пояснения. У каждого мужчины своя длина поколения и даже собственное мнение какая длина оптимальна (субоптимальна,.. нужное подставить). Более того, многие считают этот вопрос приватным и не желают обсуждать его публично. В случае если возникнет ошибка программы, автору вместе с логом необходимо выслать скрипт запуска, в котором указана оная длина поколения.

У меня длина по самое коление. ;D

Оффлайн I2a1a

  • ...
  • Сообщений: 10574
  • Страна: ee
  • Рейтинг +757/-8
Re: Мурочное древо. Вопросы дилетанта
« Ответ #10 : 19 Сентябрь 2011, 13:49:23 »
+1

Ну да. Вот Вы пишите в мануале: "Я написал робустный скрипт для построения филогенетического дерева N1c, с помощью которого произвел эксплицитный вызов функции штейнеровского солвера".

А можно и так: " Я написал магический скрипт для построения филогенетического дерева N1c, с помощью которого произвел эксплицитный вызов духа князя того места - Кубары".

 :)

Оффлайн Valery

  • Сообщений: 5678
  • Страна: 00
  • Рейтинг +537/-6
  • Ultimate Matriarchy
Re: Мурочное древо. Вопросы дилетанта
« Ответ #11 : 19 Сентябрь 2011, 13:54:16 »
Кубара - это покровитель N1. У E1 наверное это другой дух.

Оффлайн I2a1a

  • ...
  • Сообщений: 10574
  • Страна: ee
  • Рейтинг +757/-8
Re: Мурочное древо. Вопросы дилетанта
« Ответ #12 : 19 Сентябрь 2011, 14:04:59 »
Кубара - это покровитель N1. У E1 наверное это другой дух.

Или,  используя любимый  каламбур молгеновского fellow member Славера можно сказать - наверное, это другой йух (E1->Африка->Юг->йуг->йух.

Оффлайн Valery

  • Сообщений: 5678
  • Страна: 00
  • Рейтинг +537/-6
  • Ultimate Matriarchy
Re: Мурочное древо. Вопросы дилетанта
« Ответ #13 : 19 Сентябрь 2011, 14:11:25 »
каламбур, каламбур, игра слов (С)

Оффлайн I2a1a

  • ...
  • Сообщений: 10574
  • Страна: ee
  • Рейтинг +757/-8
Re: Мурочное древо. Вопросы дилетанта
« Ответ #14 : 19 Сентябрь 2011, 14:27:33 »
Живя в теплом климате, нет потребности оптимизировать свой генетический код.

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100