АвторТема: Гаплогруппа Q: новые снипы  (Прочитано 34454 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн ШадАвтор темы

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6333
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1292/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Re: Гаплогруппа Q: новые снипы
« Ответ #75 : 02 Апрель 2013, 13:05:05 »
Значит для 117351 придется заказывать обычный F1748 тест.

F1748 для заказа недоступен. И пока даже не собираются его запускать. Или молчат.
Пока сообщество не попросит, маловероятно что FTDNA самостоятельно запустят эти снипы.
Владимир, попробуйте написать письмо Т. Крану, с обоснованием того, почему эти снипы желательно сделать доступными для заказа.
Или можно написать совместное письмо с Б Шарк (вроде она ведет Q-проект?)

Нет, его ведёт Ребекка Канада.
А так я писал даже Беннетту. Похоже у них там такое твориться с обработкой заказов, что им не до таких мелочей. Q1b это даже не R1a. Двадцать пятый приоритет:(
Тем более, что Ребекка продолжает считать этот снип сомнительным. Похоже, что он не определился в гораздо большем количестве образцов. Или темнят. Все данные по снипам проекта закрыты. Черпаю из открытых проектов.

Оффлайн ШадАвтор темы

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6333
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1292/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Re: Гаплогруппа Q: новые снипы
« Ответ #76 : 05 Апрель 2013, 22:15:43 »
В проекте PGP обнаружен один Q1b1a. Причем из Марокко. В проекте Q yDNA есть несколько северо-африканских Q1b. Все они принадлежат берберским евреям.
Участник помечен как PGP130.
Вот набор его снипов:
Цитировать
Q1b1a ['L1002', 'L1004', 'L1009', 'L1013', 'L1053', 'L985', 'L989', 'L990', 'V161', 'V168', 'V171', 'V174', 'V203', 'V203', 'V238', 'V241', 'V250', 'L1005', 'L986', 'P108', 'V221', 'L413', 'L418', 'L438', 'L440', 'L604', 'L957', 'L962', 'L969', 'L970', 'L971', 'L977', 'M299', 'M42', 'M94', 'P97', 'Page65.1', 'PK1', 'V187', 'V202', 'V235', 'V29', 'V31', 'V59', 'V64', 'M168', 'M294', 'P9.1', 'P143', 'L132.1', 'M213', 'M235', 'M89', 'P133', 'P134', 'P135', 'P136', 'P138', 'P139', 'P14', 'P140', 'P141', 'P142', 'P145', 'P146', 'P148', 'P149', 'P151', 'P157', 'P158', 'P159', 'P160', 'P161', 'P163', 'P166', 'P187', 'P316', 'L15', 'L16', 'M9', 'P128', 'P131', 'P132', 'P19_1', 'M526', '92R7_1', '92R7_2', 'L268', 'L405', 'L471', 'L536', 'L721', 'L741', 'L768', 'L779', 'L781', 'M45', 'M74', 'P226', 'P228', 'P230', 'P235', 'P237', 'P239', 'P240', 'P243', 'P244', 'P27.1_1', 'P27.1_2', 'P281', 'P282', 'P283', 'P284', 'P295', 'P69', 'Page83', 'V231', 'M242', 'L232', 'L273', 'L274', 'P36.2', 'L275', 'L314', 'L214', 'L215', 'M378', 'L245']+ ['P305', 'V148', 'V149', 'V154', 'V164', 'V166', 'V172', 'V173', 'V177', 'V190', 'V196', 'V223', 'V225', 'V229', 'V233', 'V239', 'L1000', 'L1001', 'L1006', 'L1008', 'L1010', 'L1012', 'L1016', 'L1018', 'L896', 'L982', 'L984', 'L991', 'L993', 'L995', 'L998', 'L999', 'M31', 'P82', 'V14', 'V25', 'V4', 'P114', 'L419', 'M181', 'M247', 'P90', 'M182', 'M236', 'M288', 'M145', 'M203', 'P144', 'P153', 'P165', 'P167', 'P183', 'P112', 'M150', 'Page18', 'M112', 'M192', 'M130', 'M216', 'P184', 'P255', 'P260', 'Page85', 'P104', 'P91', 'M427', 'M428', 'L279', 'L281', 'L284', 'L285', 'L286', 'M282', 'P96', 'M481', 'L116', 'L154', 'L204', 'L269', 'L402', 'L520', 'L521', 'L522', 'L523', 'L605', 'L769', 'L770', 'L836', 'L837', 'M201', 'P257', 'Page94', 'U12', 'U21', 'U23', 'U3', 'U33', 'U7', 'M370', 'M69', 'M429', 'P123', 'P124', 'P125', 'P126', 'P127', 'P129', 'P130', 'S22', 'L41', 'M170', 'M258', 'P19_2', 'P19_3', 'P19_4', 'P19_5', 'P212', 'P38', 'U179', 'L134', 'M304', 'P209', 'S6', 'L298', 'L811', 'L855', 'L863', 'L878', 'L879', 'M11', 'M185', 'M20', 'M61', 'L206', 'L445', 'L452', 'L455', 'L810', 'M184', 'M272', 'Page129', 'M214', 'P188', 'P192', 'P193', 'P194', 'P195', 'P256', 'Page93', 'M230', 'P202', 'P204', 'P261', 'P263', 'P299', 'P307', 'P79', 'P304', 'P308', 'P60', 'M207', 'P224', 'P227', 'P229', 'P232', 'P280', 'P285', 'M479', 'M173', 'M306', 'P225', 'P231', 'P233', 'P234', 'P236', 'P238', 'P242', 'P245', 'P286', 'P294', 'L472', 'L474', 'MEH2', 'M120', 'M265', 'L528', 'L56', 'L57', 'M346', 'M143', 'M25', 'L272.1']-
См.: https://docs.google.com/spreadsheet/ccc?authkey=CIOag_UD&key=0Agq_ez43qXCjdFlxemtlUnZ1Qk01cVhMRVBFcm5WX3c&authkey=CIOag_UD#gid=16

Там же есть и легендарный Saqqaq, помеченный как:
1) Palaeo-Eskimo (about 4000 years old)
2) categorized as Q1a* in original publication: http://www.nature.com/nature/journal/v463/n7282/full/nature08835.html ; see also http://www.ancientgenome.dk/ and http://www.binf.ku.dk/saqqaq/

Оффлайн ШадАвтор темы

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6333
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1292/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Re: Гаплогруппа Q: новые снипы
« Ответ #77 : 06 Апрель 2013, 19:08:12 »
Касательно PGP130.
Все его "новые" снипы оказались относящимися к гаплогруппам более высокого уровня: A1, A1b, BT, CT, CF, F, IKJ, P...
Из нюансов можно отметить только L990+ (относится ISOGG к А0, а не А1). Но тут скорее всего какая-то L990.X которая позднее возникла где-то ниже А1. А вот где непонятно. Также непонятна и практическая ценность такой информации на текущий момент, так как в Geno 2.0 этих снипов нет (они были открыты позже)...
Посмотрим что даст полный сиквенс Y-хромосомы трех представителей Q1b.
Также у PGP130 зафиксировал снипы P19.X и P27.X характерные для других гаплогрупп. Но опять же пока не ясно когда возникла эта мутация и что она определяет.

Оффлайн Centurion

  • 100% Earth (Solar System) genofond
  • Администратор
  • *****
  • Сообщений: 9589
  • Страна: ru
  • Рейтинг +571/-2
Re: Гаплогруппа Q: новые снипы
« Ответ #78 : 06 Апрель 2013, 19:16:51 »
Касательно PGP130.
Все его "новые" снипы оказались относящимися к гаплогруппам более высокого уровня: A1, A1b, BT, CT, CF, F, IKJ, P...
Из нюансов можно отметить только L990+ (относится ISOGG к А0, а не А1). Но тут скорее всего какая-то L990.X которая позднее возникла где-то ниже А1. А вот где непонятно. Также непонятна и практическая ценность такой информации на текущий момент, так как в Geno 2.0 этих снипов нет (они были открыты позже)...
Посмотрим что даст полный сиквенс Y-хромосомы трех представителей Q1b.
Также у PGP130 зафиксировал снипы P19.X и P27.X характерные для других гаплогрупп. Но опять же пока не ясно когда возникла эта мутация и что она определяет.
никто не искал у него никаких новых снипов. весь список это известные снипы из дерева иссог от корня до терминального  ;D

Оффлайн ШадАвтор темы

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6333
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1292/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Re: Гаплогруппа Q: новые снипы
« Ответ #79 : 07 Апрель 2013, 12:25:19 »
Список снипов PGP130 имеется благодаря уважаемому Юргану.

Оффлайн ШадАвтор темы

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6333
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1292/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Re: Гаплогруппа Q: новые снипы
« Ответ #80 : 23 Май 2013, 22:20:06 »
ISOGG наконец-то сделал официальный апдейт дерева снипов. Все изменения коснулись Q1a
http://www.isogg.org/tree/ISOGG_HapgrpQ.html
Теперь благодаря ISOGG нас ждет грандиозная путаница. Субклад Q1a3 вообще исчез и переименован в Q1a2:) Всем придется переучиваться.

Оффлайн ШадАвтор темы

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6333
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1292/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Re: Гаплогруппа Q: новые снипы
« Ответ #81 : 30 Май 2013, 23:49:07 »
Цитировать
CTS10168+, CTS10362+, CTS109+, CTS11358+, CTS11575+, CTS11726+, CTS125+, CTS12632+, CTS1996+, CTS3135+, CTS3331+, CTS3358+, CTS3431+, CTS3536+, CTS3654+, CTS3662+, CTS3868+, CTS3996+, CTS4364+, CTS4368+, CTS4437+, CTS4443+, CTS4717+, CTS4740+, CTS5318+, CTS5457+, CTS5532+, CTS5884+, CTS6135+, CTS6383+, CTS6800+, CTS6907+, CTS7922+, CTS7933+, CTS8243+, CTS8980+, CTS9828+, F1046+, F108+, F1082+, F1126+, F115+, F1169+, F1205+, F1209+, F1213+, F1237+, F1293+, F1302+, F1320+, F1329+, F1337+, F1349+, F1528+, F1537+, F1594+, F1704+, F1714+, F1728+, F1734+, F1748+, F1753+, F1767+, F1780+, F180+, F1829+, F1836+, F1839+, F1858+, F1875+, F1974+, F2023+, F2048+, F2075+, F212+, F2142+, F2145+, F2155+, F2230+, F2250+, F2302+, F2313+, F2343+, F2402+, F2440+, F2587+, F2603+, F2628+, F2657+, F2688+, F2710+, F2777+, F2837+, F2851+, F2877+, F2894+, F29+, F2934+, F2985+, F2993+, F3067+, F3084+, F3111+, F3121+, F313+, F3136+, F3193+, F3207+, F332+, F3335+, F3389+, F344+, F3556+, F359+, F3621+, F3680+, F3692+, F4+, F4052+, F506+, F556+, F640+, F647+, F671+, F719+, F803+, F815+, F826+, F83+, L132+, L15+, L16+, L214+, L215+, L232+, L245+, L275+, L314+, L350+, L468+, L470+, L471+, L498+, L566+, L612+, L721+, L768+, L779+, L781+, L808+, L82+, M139+, M168+, M235+, M294+, M378+, M42+, M45+, M526+, M89+, M94+, P128+, P131+, P132+, P135+, P136+, P138+, P14+, P141+, P145+, P146+, P148+, P151+, P158+, P159+, P160+, P166+, P187+, P207+, P226+, P228+, P230+, P235+, P237+, P240+, P243+, P244+, P281+, P282+, P283+, P284+, P295+, P36+, PAGES00083+, PF1016+, PF1029+, PF1031+, PF1040+, PF1046+, PF1061+, PF1092+, PF1097+, PF110+, PF1203+, PF1269+, PF1276+, PF15+, PF192+, PF210+, PF212+, PF223+, PF234+, PF258+, PF2591+, PF2593+, PF2599+, PF2600+, PF2608+, PF2611+, PF2615+, PF2624+, PF263+, PF2631+, PF2643+, PF272+, PF2745+, PF2747+, PF2748+, PF2749+, PF2770+, PF278+, PF292+, PF316+, PF325+, PF342+, PF500+, PF5465+, PF5468+, PF5471+, PF5851+, PF5853+, PF5854+, PF5865+, PF5869+, PF5871+, PF5882+, PF5886+, PF5887+, PF5888+, PF5956+, PF5957+, PF5964+, PF5965+, PF5982+, PF601+, PF667+, PF719+, PF720+, PF725+, PF779+, PF796+, PF803+, PF815+, PF821+, PF840+, PF844+, PF892+, PF937+, PF951+, PF954+, PF970+, V186+, V189+, V205+, V52+, V9+, YSC0000176+, YSC0000186+, YSC0000205+, YSC0000227+, YSC0000251+, YSC0000270+, YSC0000279+

N114044   John Mendall B CA 1640 D 1720   Q1b1a   Q-L245
http://www.familytreedna.com/public/southworth-southard/default.aspx?section=ysnp
« Последнее редактирование: 30 Май 2013, 23:59:31 от Шад »

Оффлайн Semargl

  • "El sueño de la razón produce monstruos" ©
  • Сообщений: 5718
  • Страна: cn
  • Рейтинг +3652/-5
  • www.semargl.me
    • www.semargl.me
  • Y-ДНК: R1a [CTS3402+]
  • мтДНК: U4a2g
Re: Гаплогруппа Q: новые снипы
« Ответ #82 : 12 Июль 2013, 12:16:07 »
В рамках исследовательского проекта YFull обнаружены новые снипы для Q1b:
121 снип уровня Q1b.
132 снипа уровня Q1b*(xQ1b1). Все эти снипы маркируют самостоятельную ветвь, назовем ее условно Q1b2.
3 с неточной локализацией - уровень Q1b или Q1b2.

всего 256 снипов.
все снипы Q1b*(xQ1b1) обнаружены в трех образцах:
Bengali in Bangladesh,
Punjabi in Lahore,Pakistan,
Indian Telugu in the UK

Все снипы внесены в серию Y и в ближайшее время будут опубликованы.
« Последнее редактирование: 15 Июль 2013, 12:50:12 от Semargl »

Оффлайн ШадАвтор темы

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6333
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1292/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Re: Гаплогруппа Q: новые снипы
« Ответ #83 : 12 Июль 2013, 12:54:40 »
В рамках исследовательского проекта YFull обнаружены новые снипы для Q1b:
121 снип уровня Q1b.
132 снипа уровня Q1b*(xQ1b1). Все эти снипы маркируют самостаятельную ветвь, назовем ее условно Q1b2.
3 с неточной локализацией - уровень Q1b или Q1b2.

всего 256 снипов.
все снипы Q1b*(xQ1b1) обнаружены в трех образцах:
Bengali in Bangladesh,
Punjabi in Lahore,Pakistan,
Indian Telugu in the UK

Все снипы внесены в серию Y и в ближайшее время будут опубликованы.

Они из проекта 1K Genomes?

Оффлайн Centurion

  • 100% Earth (Solar System) genofond
  • Администратор
  • *****
  • Сообщений: 9589
  • Страна: ru
  • Рейтинг +571/-2
Re: Гаплогруппа Q: новые снипы
« Ответ #84 : 12 Июль 2013, 13:01:01 »
Они из проекта 1K Genomes?
да

Оффлайн Semargl

  • "El sueño de la razón produce monstruos" ©
  • Сообщений: 5718
  • Страна: cn
  • Рейтинг +3652/-5
  • www.semargl.me
    • www.semargl.me
  • Y-ДНК: R1a [CTS3402+]
  • мтДНК: U4a2g

Оффлайн ШадАвтор темы

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6333
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1292/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Re: Гаплогруппа Q: новые снипы
« Ответ #86 : 12 Июль 2013, 23:46:00 »
Тех. данные по новым снипам.

А не подтверждается гипотеза о L68.1, как снипе-определителе новой ветви Q1b2?
Сначала Ребекка опубликовала информацию о нем в драфте, но потом как-то без энтузиазма сообщила, что написанному верить не обязательно.

Также интересно, что L314 присутствует не у всех L275.
Судя по всему имеется ветвь L275+ L314- представленная бенгальцем HG03914   (BEB).
Запасаемся попкорном и с нетерпением ждем продолжения!

Кстати, на Full Genomes уже сделали заказы 6 Q1b:
2 Q-L245 (еврейский кластер)
1 Q-L245 (армянский кластер)
1 Q-L245 (Европа)
2 Q-M378 L245- (Европа, Казахстан)
« Последнее редактирование: 13 Июль 2013, 00:00:21 от Шад »

Оффлайн Semargl

  • "El sueño de la razón produce monstruos" ©
  • Сообщений: 5718
  • Страна: cn
  • Рейтинг +3652/-5
  • www.semargl.me
    • www.semargl.me
  • Y-ДНК: R1a [CTS3402+]
  • мтДНК: U4a2g
Re: Гаплогруппа Q: новые снипы
« Ответ #87 : 15 Июль 2013, 12:46:26 »
Судя по всему имеется ветвь L275+ L314- представленная бенгальцем HG03914   (BEB).
У HG03914 снип L314 не определен, т.к. этот участок не имеет покрытия.

Оффлайн Migifbug

  • Сообщений: 390
  • Страна: kz
  • Рейтинг +49/-0
  • Y-ДНК: С-F1756, F3830+
  • мтДНК: H7d
Re: Гаплогруппа Q: новые снипы
« Ответ #88 : 18 Август 2013, 10:45:38 »
Тех. данные по новым снипам.

А не подтверждается гипотеза о L68.1, как снипе-определителе новой ветви Q1b2?
Сначала Ребекка опубликовала информацию о нем в драфте, но потом как-то без энтузиазма сообщила, что написанному верить не обязательно.

Также интересно, что L314 присутствует не у всех L275.
Судя по всему имеется ветвь L275+ L314- представленная бенгальцем HG03914   (BEB).
Запасаемся попкорном и с нетерпением ждем продолжения!

Кстати, на Full Genomes уже сделали заказы 6 Q1b:
2 Q-L245 (еврейский кластер)
1 Q-L245 (армянский кластер)
1 Q-L245 (Европа)
2 Q-M378 L245- (Европа, Казахстан)
Здравствуйте! Есть ли новости по Full Genomes? Есть ли результаты? Хотелось бы познакомиться с качеством новой услуги...

Оффлайн ШадАвтор темы

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6333
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1292/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Re: Гаплогруппа Q: новые снипы
« Ответ #89 : 18 Август 2013, 15:01:45 »
Здравствуйте! Есть ли новости по Full Genomes? Есть ли результаты? Хотелось бы познакомиться с качеством новой услуги...

Пока нет. Ждем. Ориентируют на середину сентября.

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.