DNA tribes - этно-популяционный анализ

[Mich Glitch]

Наконец-то получил результаты тестов по аутосомным маркерам для своей сестры.
Тестовый набор сестра просто бросила в почтовый ящик в Москве, предварительно наклеив необходимое количество марок.

Итак. Как могут разниться родные брат и сестра при тестировании по маркерам неполовых хромосом?
Напомню свои данные:

То есть, мой генетический портрет соответствует средне-польскому портрету в 159734.07 раз больше, чем у некого усредненого мирового обитателя. Данная цифирь, выше чем данные у 99% поляков.

Теперь по сестре:

Генетический портрет получился гораздо менее ярко выраженным. Наиболее ярко выраженная компонента - угро-финская. В этом нет ничего удивительного, если учесть, что наша с сестрой материнская гаплогруппа Н6а1 присуща 11% мордвы (этим собирательным термином я объединяю и мокшу и эрзя). А коренное население рязанщины большей частью угро-финское (о чем, например, ясно свидетельствуют сохранившиеся топонимы рек и озер Мещеры).
Как уже отметил, генетический портрет сестры гораздо менее ярковыраженный чем мой. Вероятность того, что она имеет угро-финское происхождение всего в каких-то 200.17 раз выше среднемирового. И это против моих почти 160 тысяч в пользу польского происхождения!
Поэтому цифра ее выше для всего 54% угро-финских популяций проти 99% польской популяции у меня.
Иными словами, для 46% угро-финнов имеют более ярковыраженные генетические черты. И только 1% поляков, является более поляком чем я.

Так карты легли. Таким вот образом получили генов от своих пращуров.

То есть, если у меня аутосомные идут от какой-то небольшой группы предков со стороны отца, то у сестры они скорее всего равномерно надерганы со всех фамильных линий со стороны матери.

Так вот вкратце. Если тема заинтересует дам более подробное изложение.

[Mich Glitch]

1. "по аутосомным маркерам для своей сестры" - сестра родная, двоюродная? Интересна степень вашего родства при сравнении генеаогическом и днк-г.
- Сестра родная.

2. "результаты тестов по аутосомным маркерам" о каких именно тестах идет речь? Например, по Y и по mt - все более или менее понятно, а в аутосомах какие?
- Тест по 21 маркеру. На сегодняшний день - это максимально возможное разрешение, предоставляемое коммерческой компанией широкой публике.
Вот мои данные:

А это значения сестры:


3. "Данная цифирь, выше чем данные у 99% поляков." - т.е. вы "бОльший поляк", чем сами поляки? А что или кто является эталоном по аутосомам для поляков? "Предковый" набор аутосом?
Как происходит обработка данных?
Сначала идет сбор материала по коренным популяциям. На сегодня для сравнения используются 896 популяций со всего мира. Для каждой из них, на основании наиболее часто встречающихся значений, выводится некий типичный генетический портрет.
С ним то и сравнивались мои данные и данные моей сестры.
Понятно, что внутри конкретной выборки кто-то соответствует усредненным данным больше, а кто-то меньше. Так вот мое соответствие польскому портрету - выше чем у 99% поляков из проведенного исследования. Причем сама эта выборка была по нынешним меркам огромна - 1500 человек.

О чем это говорит?

Мой набор генов, унаследованный от предков, сложился таким образом, что указал большей частью на одну какую-то ветвь. А вот у сестры произошло равномерное распределение (то есть по чуть-чуть от многих предков).

[Mich Glitch]

Вот моя первая сотня популяций:
 
Rank  Sample Name (TribeScore)  MLI Score
1 Poland (0.99)  159,734.07
2 Pinsk, Belarus (0.99)  128,447.89
3 Andalusia, Spain (0.96)  117,083.85
4 Lodz, Poland (0.98)  106,641.81
5 Pomorze Zachodnie, Northwest Poland (0.98) 97,461.80
6 Dundee, Scotland (0.95)  95,582.72
7 Western Poland (0.98)  94,038.41
8 Lodz, Poland (0.98)  89,814.90
9 Estonia (0.98)  78,843.92
10 Northern Ireland (0.97)  77,399.58
11 Belarus (0.99)  75,180.95
12 Poland (0.98)  72,093.32
13 Central Poland (0.98)  66,178.36
14 Caucasian (0.97)  62,218.18
15 Southeast Poland (0.98)  59,769.76
16 Glasgow, Scotland (0.95)  59,697.00
17 Belarus (0.98)  58,963.14
18 Presov, Eastern Slovakia (0.97)  58,759.63
19 Germany (0.97)  58,709.80
20 Upper Silesia, Poland (0.97)  54,388.45
21 Finland (0.98)  54,361.15
22 Podlasie, Northeast Poland (0.96) 51,798.00
23 Pomerania-Kujawy, Northern Poland (0.97) 51,208.01
24 Czech Republic (0.96)  50,377.19
25 Caucasian (U.S.A.) (0.97)  47,861.93
26 European-Aboriginal (mixed) (New South Wales, Australia) (0.99) 44,376.94
27 Bucharest, Romania (0.97)  42,791.47
28 Ireland (0.95)  41,703.19
29 Dundee, Scotland (0.95)  41,417.25
30 North and Central Poland (0.95)  40,257.91
31 Belarus (0.95)  39,036.35
32 Basque (Basque Country, Spain) (0.93) 38,497.81
33 Svetlogorsk, Belarus (0.99)  37,696.44
34 North Poland (0.98)  36,767.80
35 Balearic Islands, Spain (0.96)  35,994.84
36 Murcia, Spain (0.94)  35,699.24
37 Slovenia (0.94)  35,651.86
38 Caucasian (South Australia) (0.97) 35,068.56
39 Banat and Transylvania, Western Romania (0.98) 34,678.04
40 Extremadura, Spain (0.93)  33,220.72
41 Valencia, Spain (0.95)  32,754.43
42 Caucasian (Western Australia) (0.97) 32,053.41
43 Hungary (0.97)  31,443.88
44 Caucasian (Western Australia) (0.97) 31,371.51
45 Estonia (0.98)  31,270.03
46 Caucasian (Tasmania, Australia) (0.96) 30,060.07
47 Caucasian (Canada) (0.96)  30,024.29
48 Caucasian (0.96)  29,831.33
49 Caucasian (Northern Territory, Australia) (0.98) 29,524.53
50 Denmark (0.9)  27,354.56
51 Hamburg, Germany (0.96)  27,334.60
52 Kharkiv, Ukraine (0.99)  27,283.69
53 European-Aboriginal (mixed) (Riverine Region, Australia) (0.99) 27,281.75
54 Germany (0.92)  27,021.23
55 Germany (0.93)  27,021.23
56 Caucasian (Virginia, U.S.A.) (0.95) 26,904.79
57 South Poland (0.94)  26,859.17
58 Caucasian (Florida, U.S.A.) (0.97) 26,702.13
59 Southern Russia (Stavropol, Orel and Saratov regions) (0.98) 26,585.44
60 Finland (0.97)  26,332.98
61 Austria (0.94)  26,319.38
62 Northeast Poland (0.95)  25,086.62
63 Northern Portugal (0.93)  25,041.89
64 Vienna, Austria (0.94)  24,450.34
65 European-Aboriginal (mixed) (Southeast Australia) (0.99) 24,443.37
66 Austria (0.93)  23,744.34
67 Caucasian (Indiana, U.S.A.) (0.96) 23,133.56
68 Non-Hasidic Jewish (New York City, U.S.) (0.97) 23,131.91
69 Krupki, Belarus (0.98)  22,603.49
70 Bosnia (0.94)  22,571.44
71 Russia (0.95)  21,937.08
72 Caucasian (Queensland, Australia) (0.96) 20,946.71
73 Ivanovo, Belarus (0.96)  20,063.02
74 Serbia (0.94)  19,985.35
75 Toulouse, France (0.91)  19,954.66
76 Caucasian (New York, U.S.A.) (0.96) 19,893.08
77 Germany (0.93)  19,861.55
78 Caucasian (California, U.S.A.) (0.95) 18,863.48
79 Caucasian (Capital Territory, Australia) (0.94) 18,665.36
80 United Kingdom (0.94)  18,218.57
81 Caucasian (Victoria, Australia) (0.96) 17,447.84
82 Moscow, Russia (0.96)  16,899.79
83 Sweden (0.94)  16,649.03
84 Tuscany, Italy (0.9)  16,312.15
85 Bavaria, Germany (0.93)  16,165.91
86 Norway (0.93)  16,144.16
87 Caucasian (Northern Territory, Australia) (0.94) 15,948.57
88 Portugal (0.88)  15,569.56
89 Caucasian (U.S.A.) (0.94)  15,170.43
90 Molodecheno, Belarus (0.96)  15,168.91
91 United Kingdom (0.93)  14,945.69
92 Szekler (Romania) (0.96)  14,861.93
93 Budapest, Hungary (0.92)  14,752.85
94 Belgrade, Serbia (0.96)  14,722.50
95 Spain (0.93)  14,233.71
96 Cantabria, Spain (0.92)  14,189.00
97 Finland (0.95)  14,105.47
98 France (0.93)  14,065.82
99 Northern Portugal (0.92)  14,051.12
100 Serbia and Montenegro (0.94)  13,686.52


А это первая сотня моей сестры:

Rank  Sample Name (TribeScore)  MLI Score
1 Chaco, Argentina (0.71)  218.40
2 Finland (0.54)  200.17
3 San Alejo, El Salvador (0.65)  194.80
4 Hispanic (Arizona, U.S.A.) (0.58) 178.62
5 Costa Rica (0.59)  155.72
6 Finland (0.48)  124.32
7 Santa Fe, Argentina (0.59)  122.63
8 Mendoza, Argentina (0.57)  119.36
9 Santa Catarina, Brazil (0.49)  117.32
10 Hispanic (0.5)  112.83
11 Caucasian (Indiana, U.S.A.) (0.45) 111.41
12 Buenos Aires, Argentina (0.51)  109.24
13 Buenos Aires, Argentina (0.51)  107.04
14 Costa Rica (0.52)  107.00
15 Dundee, Scotland (0.32)  106.31
16 Hispanic (Michigan, U.S.A.) (0.52) 101.47
17 Misiones, Argentina (0.49)  101.30
18 Hispanic (Connecticut, U.S.A.) (0.5) 100.33
19 Costa Rica (0.55)  94.31
20 Caucasian (0.43)  87.36
21 Chubut, Argentina (0.54)  79.93
22 Finland (0.45)  79.38
23 Norway (0.36)  70.98
24 Maracaibo, Venezuela (0.46)  69.88
25 Rio Grande do Sul, Brazil (0.38)  68.78
26 Puerto Rican (Springfield, Massachusetts, U.S.A.) (0.37) 67.11
27 Hispanic (Minnesota, U.S.A.) (0.52) 65.91
28 Santander, Colombia (0.52)  64.89
29 Amazon Region, Brazil (0.58)  64.07
30 Amazon Region, Brazil (0.58)  63.71
31 Brazil (0.48)  63.13
32 Rio Negro, Argentina (0.48)  62.57
33 Caucasian (New York, U.S.A.) (0.42) 62.14
34 Hispanic (California, U.S.A.) (0.52) 61.50
35 Poland (0.36)  61.13
36 Hispanic (0.39)  54.89
37 Caucasian (Victoria, Australia) (0.39) 54.10
38 Dundee, Scotland (0.29)  53.45
39 Sao Paulo, Brazil (0.3)  53.06
40 Hispanic (0.48)  52.35
41 Caucasian (Tasmania, Australia) (0.35) 50.45
42 Sweden (0.33)  50.16
43 Caracas, Venezuela (0.33)  49.59
44 Hispanic (0.51)  46.71
45 Portugal (0.32)  46.35
46 Neuquen, Argentina (0.45)  46.05
47 Northern Ireland (0.23)  45.43
48 Chihuahua, Mexico (0.43)  44.90
49 Poland (0.32)  44.78
50 Minas Gerais, Brazil (0.28)  43.40
51 United Kingdom (0.33)  43.19
52 Pomerania-Kujawy, Northern Poland (0.28) 41.23
53 Brazilian (Southeastern, Southern and Central Brazil) (0.33) 39.79
54 Hispanic (0.57)  39.31
55 Costa Rica (0.42)  38.50
56 Santa Catarina, Brazil (0.3)  37.54
57 Caucasian (Canada) (0.3)  37.26
58 Strathclyde, Scotland (0.2)  37.20
59 Serbia (0.3)  37.07
60 French Canadian (Quebec, Canada) (0.32) 36.97
61 Sweden (0.3)  36.75
62 Mexico (0.47)  35.68
63 Colombia (0.53)  35.41
64 Caucasian (Australia) (0.3)  34.25
65 Paraguay (0.37)  33.50
66 Podlasie, Northeast Poland (0.22) 32.87
67 Hispanic (U.S.A.) (0.42)  32.50
68 Brazil (0.29)  32.37
69 Southwest Andean Region, Colombia (0.39) 31.35
70 Caucasian (Canada) (0.29)  31.08
71 Caucasian (Northern Territory, Australia) (0.29) 30.71
72 Mestizo (Cesar and Guajira, Colombia) (0.26) 30.63
73 Caucasian (0.3)  30.48
74 Caucasian (Western Australia) (0.29) 30.23
75 Caucasian (Western Australia) (0.29) 30.13
76 Glasgow, Scotland (0.21)  29.96
77 Ireland (0.23)  28.85
78 Maracaibo, Venezuela (0.4)  28.59
79 Estonia (0.36)  28.13
80 Netherlands  (0.25)  27.89
81 Serbian (Vojvodina, Serbia and Montenegro) (0.33) 26.61
82 Bahia, Brazil (0.3)  26.42
83 European-Aboriginal (mixed) (Southeast Australia) (0.34) 25.78
84 Caucasian (Northern Territory, Australia) (0.28) 25.28
85 Boyaca, Colombia (0.39)  25.19
86 Hispanic (0.45)  24.57
87 Caucasian (0.22)  24.20
88 Colombia (0.37)  23.55
89 Pinsk, Belarus (0.38)  23.43
90 Austria (0.21)  23.36
91 Upper Silesia, Poland (0.23)  23.25
92 Caucasian (Queensland, Australia) (0.26) 23.25
93 Caucasian (U.S.A.) (0.25)  23.09
94 United Kingdom (0.26)  23.02
95 Northern Italy (0.23)  22.81
96 Portugal (0.18)  22.75
97 Caldas, Colombia (0.33)  22.18
98 Central Andean Region, Colombia (0.38) 22.16
99 Belgium (0.2)  21.90
100 Andalusia, Spain (0.16)  21.77

[Centurion]

Да, я делал... намбер ван! Года 2 назад.

Мой портрэт. Жертвую...



Надо отметить, что есть потрясающая корреляция с данными по географ. совпадениям Y и митоднк.



vs Mich_Glitch



Кроме собственно Восточно-европейского у меня более ярко выражен Средиземноморский (0.55/36.94) и Эгейский компоненты (0.61/29.23), также Фино-угорский... ну если смотреть дальше в тысячелетия (может в десятки даже), то у меня "по мелочи" больше намешано: Индия, Месопотамия, Алтай... даже Тибет (0.04/0.59)

У Mich_Glitch тоже есть Средиземноморский компонент (0.55/13.55), а Эгейского нет... также дальнейший "микс" у него состоит из меньшего количества компонентов, чем у меня

[Mich Glitch]

Вот пример родных брата и сестры (мои и моей сестры).
Насколько велика может быть разница.
Сестра, похоже, пошла в мать. Ну, а я в отца.

Файл первый:

[Mich Glitch]

Файл второй:

[Mich Glitch]

Файл третий и последний:

[Mich Glitch]

Мои обновлённый этно-профиль (с учётом новых данных по популяциям).
Всё становится на свои места.

[Mich Glitch]

Мои первых 40 популяций:

Rank Sample Name (TribeScore) MLI Score
1 Pskov, Russia (0.99) 2,686,281.95
2 Poland (0.98) 908,984.60
3 Pinsk, Belarus (0.99) 896,831.19
4 Estonia (0.99) 595,546.97
5 Croatia (0.99) 541,487.01
6 Pomorze Zachodnie, Northwest Poland (0.97) 516,596.81
7 Western Poland (0.97) 481,949.22
8 Lodz, Poland (0.99) 478,169.45
9 Lodz, Poland (0.96) 472,630.59
10 Finland (0.98) 438,067.31
11 Poland (0.99) 391,829.81
12 Dundee, Scotland (0.96) 367,478.12
13 Northern Ireland (0.95) 366,144.85
14 Belarus (0.96) 348,109.98
15 Central Poland (0.96) 346,915.92
16 Belarus (0.95) 344,558.79
17 Southeast Poland (0.96) 328,167.44
18 Andalusia, Spain (0.97) 327,569.65
19 Presov, Eastern Slovakia (0.99) 302,047.52
20 Northwest Spain (0.98) 295,648.60
21 Caucasian (U.S.A.) (0.99) 283,812.92
22 Belarus (0.95) 266,207.26
23 Denmark (0.97) 264,232.38
24 Podlasie, Northeast Poland (0.95) 263,005.93
25 Upper Silesia, Poland (0.94) 258,886.87
26 North and Central Poland (0.95) 254,634.12
27 Czech Republic (0.98) 252,098.23
28 Germany (0.99) 251,658.08
29 Caucasian (U.S.A.) (0.98) 234,306.83
30 Glasgow, Scotland (0.96) 227,648.14
31 Sweden (0.94) 220,350.12
32 Belarus (0.96) 217,819.59
33 Estonia (0.99) 211,356.82
34 Pomerania-Kujawy, Northern Poland (0.98) 202,048.38
35 North Poland (0.99) 201,619.86
36 Southern Russia (Stavropol, Orel and Saratov regions) (0.99) 192,043.55
37 Basque (Basque Country, Spain) (0.96) 186,483.78
38 Finland (0.97) 185,404.37
39 Slovenia (0.96) 185,255.25
40 Ireland (0.96) 182,755.44

[Centurion]

Сколько сейчас стоит апдейт?

[Mich Glitch]

Сколько сейчас стоит апдейт?

25 $.
Количество популяций, кажется, 1023.

[Mich Glitch]

Они, кстати, и методику расчёта немного изменили.

[Аббат Бузони]

Можно сравниться с отдельной популяцией?

[Аббат Бузони]

Adyghe (Southern Russia) (15)
Bashkir (Russian Federation) (100)
Belgorod, Russia (38)
Chuvash (Russian Federation) (96)
Komi (Russian Federation) (103)
Mari (Russian Federation) (44)
Mineralnye Vody, Russia (60)
Mordva-Erzia (Russian Federation) (52)
Mordva-Moksha (Russian Federation) (47)
Moscow, Russia (166)
Moscow, Russia (187)
Oryol, Russia (72)
Pskov, Russia (62)
Russia (24)
Russian (402)
Russian (100)
Saratov, Russia (52)
Tatar-Mishary (Russian Federation) (94)
Udmurt (Russian Federation) (93)
Velikiy Novgorod, Russia (59)

Итого 1866 человек из России, впечатляет.

[Mich Glitch]

Можно сравниться с отдельной популяцией?

Можно заказать полный тест по 21 маркеру (или менее точный по 15).
Или же, если данные аутосомных маркеров уже есть, заказать только анализ, т.е. сравнение со всеми популяциями.
Вот, например, мои выписки по российским и украинским популяциям:

Rank Sample Name (TribeScore) MLI Score
1 Pskov, Russia (0.99) 2,686,281.95
...
41 Kharkiv, Ukraine (0.98) 180,129.48
...
43 Moscow, Russia (0.98) 155,132.42
...
59 Russia (0.96) 124,433.56
...
100 Velikiy Novgorod, Russia (0.97) 70,402.94
...
114 Oryol, Russia (0.98) 60,611.90
...
121 Russian (0.95) 53,760.01
...
162 Saratov, Russia (0.97) 32,156.27
...
170 Belgorod, Russia (0.98) 27,933.62
...
181 Mordva-Erzia (Russian Federation) (0.99) 23,495.60
...
196 Ukrainian (0.94) 18,474.51
...
202 Russia (0.9) 15,137.05
...
228 Tatar-Mishary (Russian Federation) (0.99) 9,912.77
...
246 Moscow, Russia (0. 6,346.55
...
259 Mineralnye Vody, Russia (0.92) 5,316.58
...
287 Kharkov, Ukraine (0. 3,257.44
...
301 Chuvash (Russian Federation) (0.92) 2,209.25
...
309 Mordva-Moksha (Russian Federation) (0.92) 1,963.68
...
331 Komi (Russian Federation) (0.87) 1,490.00
...
397 Mari (Russian Federation) (0.83) 251.29
...
426 Udmurt (Russian Federation) (0.65) 104.20
...
435 Bashkir (Russian Federation) (0.65) 77.10
...
572 Altai (Altai Republic) (0.16) 0.40
...
627 Khakas (Republic of Khakassia) (0.06) 0.10
...
Все остальные популяции по нулям. типа, вот такой записи
...
783 Adyghe (Southern Russia) (0.04) 0.00