АвторТема: DNA tribes - этно-популяционный анализ  (Прочитано 59556 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн Srkz

  • Сообщений: 6835
  • Страна: ru
  • Рейтинг +3620/-3
  • Y-ДНК: N-L1025 Y64023
  • мтДНК: U4a1e-pre T16093C T16311T
Re: DNA tribes - этно-популяционный анализ
« Ответ #180 : 03 Июль 2013, 13:02:19 »
1 Pskov, Russia (0.97) 3,335,300.88
2 Pinsk, Belarus (0.98) 1,374,005.65
3 Poland (0.94) 1,257,512.31
4 Finland (0.97) 933,063.70
5 Lodz, Poland (0.93) 884,767.25
6 Western Poland (0.93) 738,603.14
7 Croatia (0.92) 733,426.98
8 Pomorze Zachodnie, Northwest Poland (0.91) 718,144.61
9 Poland (0.92) 709,742.17
10 Belarus (0.94) 637,449.88
Разве вы из Пскова? Хорошо, вероятно качество предиктов действительно еще выросло за последние три года. Это будет полезно для человека, все предки которого из одной и той же местности. Мои предки приезжали в Сибирь из разных мест, хотя теперь ясно, что больше всего с Севера и Волги. СТР-тест выдаст некое случайное среднее, взяв с каждой хромосомы по маленькому кусочку. Возможно, позже я его закажу, но пока жалко денег и времени.

Оффлайн Srkz

  • Сообщений: 6835
  • Страна: ru
  • Рейтинг +3620/-3
  • Y-ДНК: N-L1025 Y64023
  • мтДНК: U4a1e-pre T16093C T16311T
Re: DNA tribes - этно-популяционный анализ
« Ответ #181 : 03 Июль 2013, 13:03:31 »
Алеуты не эскимосы. Хотя и в одной эскимосско-алеутской языковой семье. Так можно и немцев славянами назвать. ;)
Ок, выразился некорректно. Хотя немцы недалеки от славян по аутосомам  :)

Оффлайн Jonik

  • Сообщений: 405
  • Страна: us
  • Рейтинг +25/-0
  • Y-ДНК: N1c1 (L591+)
  • мтДНК: I1a1a
Re: DNA tribes - этно-популяционный анализ
« Ответ #182 : 01 Октябрь 2013, 19:47:06 »
Если Вам нужен более-менее нормальный этно-анализ (непонятно для чего, но нужен; типа, каприз такой), то логичнее всего заказать 27 СТР маркеров у ДНАтрайбз. Больше тысячи опубликованных научных работ (читай, популяций). Методика отлажена на миллионах (МИЛ-ЛИ-О-НАХ) сэмплов. Потому как всё изначально создавалось с простой целью - по ДНК образцу восстановить этно профиль преступника. (В США создавалось, а не в странах третьего мира.)

По поводу снип интерпретаций устаю повторять. Сравнительная база по белорусам - почти нулевая. Поэтому и будут вас показывать кем ни попадя.

Приведу излюбленный пример.
Допустим в каком-то языке есть слова только для следующих цветов: чёрный, белый, жёлтый, зелёный. Ставится задача носителю этого языка описать красный, или синий цвет. Вот он и мудрит. На зелёный и черный вроде похоже (в разной степени), а на белый и жёлтый не очень.
Если нет белоруской референтной группы, то будете себе скакать между разными народами.

Теперь ещё азы. Про положение на этно-плотах.
Представьте себе расположенные в объёме предметы.
Представили?
Так вот, всегда можно выбрать такую проекцию (то есть точку и направление зрения), что два любых произвольных предмета окажутся по соседству.
Вот и мудрят на двухмерных картах, пытаясь расположить этносы, согласно их географическим ареалам проживания.

И в чём смысл, юноши?

Вы и так знаете, что являетесь белорусами. Любой смышлённый школяр вам также скажет, что скорее всего взаимопроникающие интерференции связаны с соседними народами.

Что Вы собираетесь в конце-концов выяснить? И какого ответа ждёте?

Я, например, могу чётко доложить, на что надеюсь и что получаю при проведении каждого вида теста. Включая и этно-анализ по снипам. У вас, похоже, трудно вербализуемая каша.

Ya delal po 15 markeram, dumal dozakazat' pozzhe na bol'shee kolichestvi markerov, no v to vremya iz Latvii voobche ne bylo u nih v baze dannih ni odnoho analiza ne govorya uzhe o Latgalii.

Оффлайн Mich GlitchАвтор темы

  • Genus regis
  • Сообщений: 37027
  • Страна: ca
  • Рейтинг +3757/-48
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5a
Re: DNA tribes - этно-популяционный анализ
« Ответ #183 : 01 Октябрь 2013, 20:04:29 »
Вы на сайте всегда можете просмотреть обновляемый лист протестированных популяций.
Если нужного этноса нет, или если есть только малочисленная выборка, то тест делать вообще смысла особого нет.

Оффлайн Jonik

  • Сообщений: 405
  • Страна: us
  • Рейтинг +25/-0
  • Y-ДНК: N1c1 (L591+)
  • мтДНК: I1a1a
Re: DNA tribes - этно-популяционный анализ
« Ответ #184 : 10 Октябрь 2013, 22:39:52 »
Вы на сайте всегда можете просмотреть обновляемый лист протестированных популяций.
Если нужного этноса нет, или если есть только малочисленная выборка, то тест делать вообще смысла особого нет.

Я вижу проблему в етом списке, не в том, что например Латвии нет, а в том, что в нем не указано по скольким маркерам представлена каждая выборка и заказывая все более "точный" (так думаете) тест по количеству маркеров вы тем самым уменьшаете список, так как наиболее полно он как я понимаю представлен типичным скажем так ФБР маркерами числом около 15. Делаешь 27 и из длинного списка для вашего анализа исчезнут достаточно много старых выборок (в 15 маркеров) - стран/популяций/диаспор/тд. И скажут вам что вы не из подмосковья, а из под сантопауло и вашим предкам было характерно не распевать после летнего заката солнца Подмосковные Вечера, а танцевать полуголым на празднечном карнавале под оглушительные звуки труб и барабанов. Правильно?
« Последнее редактирование: 10 Октябрь 2013, 23:36:22 от Jonik »

Оффлайн Mich GlitchАвтор темы

  • Genus regis
  • Сообщений: 37027
  • Страна: ca
  • Рейтинг +3757/-48
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5a
Re: DNA tribes - этно-популяционный анализ
« Ответ #185 : 11 Октябрь 2013, 07:48:27 »
Нет, совершенно не правильно.

Выборки, естественно, никуда не исчезают.
Вы делаете 27 маркеров.
Скажем, 90% базы используют 15 маркерный набор. По ним и идёт сравнение.
Допустим, только 10% используют 27 маркеров. Они тоже учитываются.

То есть, Вы переплачиваете подобно тому, как имея 111 игрек-СТР маркеров, ведёте основное сравнение по 67 маркерам.

Можно подождать. Никто не спорит. А можно вообще, вместо разбрасывания денег на генеалогию, заняться чем-то более приземлённым и полезным.

Оффлайн Jonik

  • Сообщений: 405
  • Страна: us
  • Рейтинг +25/-0
  • Y-ДНК: N1c1 (L591+)
  • мтДНК: I1a1a
Re: DNA tribes - этно-популяционный анализ
« Ответ #186 : 11 Октябрь 2013, 18:25:37 »
Нет, совершенно не правильно.

Выборки, естественно, никуда не исчезают.
Вы делаете 27 маркеров.
Скажем, 90% базы используют 15 маркерный набор. По ним и идёт сравнение.
Допустим, только 10% используют 27 маркеров. Они тоже учитываются.

То есть, Вы переплачиваете подобно тому, как имея 111 игрек-СТР маркеров, ведёте основное сравнение по 67 маркерам.

Можно подождать. Никто не спорит. А можно вообще, вместо разбрасывания денег на генеалогию, заняться чем-то более приземлённым и полезным.

No eti moguchestvennye 10% (27 markerov) protiv 90% (15 markerov) mogut dat' bol'shee shodstvo s imeyuchejsya 27 markernoj svezhej bazoj dannih i znachitel'no izmenit' geografiyu otveta ili net? Nekotorye zhalovalis', chto oni stali "brazil'cami".
P.S.: Po vashemu Avataru ya ponyal chto "zanimat'sya prizemlennym i poleznym" vi etim reklamiruete, a sami drugim to ved' zanimaetes navernyaka...
« Последнее редактирование: 11 Октябрь 2013, 22:46:47 от Jonik »

Оффлайн FenriR

  • Сообщений: 2005
  • Страна: 00
  • Рейтинг +527/-2
  • Y-ДНК: N1c1-L1025
  • мтДНК: K1a
Re: DNA tribes - этно-популяционный анализ
« Ответ #187 : 05 Июнь 2014, 15:41:53 »
У DNA tribes вышло большое обновление: были добавлены новые популяции и улучшены алгоритмы обработки данных.

Мои результаты
было, стало:

1 Smolensk Russia
2 Lithuania
3 Russia General
4 Belarus
5 Vologda Northern Russia
6 Estonia
7 Mordvin
8 Ukraine Northeast
9 Oryol Russia
10 Poland
11 Kursk Russia
12 Voronezh Russia
13 Ukraine General
14 Ukraine Western
15 Moldavia
16 Slovenia
17 Croatia
18 Hungary
20 Germany
21 Tatarstan
22 Finland
23 Serbia and Croatia
24 Sweden
25 Chuvash Russian Federation
26 Netherlands
27 Bulgaria
28 Norway
29 Romania
31 Argyll and Bute Scottish Highlands
...

Admixture Analysis: 5 Continental Cores
Basque 64.0%
Dravidian South India 23.5%
Mesoamerican 8.8%
Aka-Mbuti-Hadza 3.7%
South China 0.0%

Admixture Analysis: 44 Regional Clusters
Balto-Slavic 42.7%
Central European 21.9%
NW Europe 7.2%
Kalash-Balochi 6.5%
Finnish 5.3%
Mari-Chuvash 5.2%
Basque 3.1%
Mesoamerican 2.3%
Pontic West Caucasus 1.8%
West African 1.5%
Tatar-Chuvash 0.8%
Horn of Africa 0.6%
Berber-North African 0.5%
Sephardic-Sicilian 0.3%
Polynesian 0.3%
Red Sea Yemen-Egypt 0.2%

Карта новых кластеров:
« Последнее редактирование: 05 Июнь 2014, 15:54:56 от FenriR »

Оффлайн Srkz

  • Сообщений: 6835
  • Страна: ru
  • Рейтинг +3620/-3
  • Y-ДНК: N-L1025 Y64023
  • мтДНК: U4a1e-pre T16093C T16311T
Re: DNA tribes - этно-популяционный анализ
« Ответ #188 : 05 Июнь 2014, 16:25:11 »
У DNA tribes вышло большое обновление: были добавлены новые популяции и улучшены алгоритмы обработки данных.
Молодцы, работают. Интересно, что у них появился татарский кластер. А также положение на дереве тройки "палеокластеров" - Mari-Chuvash вообще до развилки (Европа и Ближний Восток)/(Индия и Центральная Азия), Finnish, Tatar-Chuvash. Все же странноватое дерево, откровенно говоря.

Оффлайн FenriR

  • Сообщений: 2005
  • Страна: 00
  • Рейтинг +527/-2
  • Y-ДНК: N1c1-L1025
  • мтДНК: K1a
Re: DNA tribes - этно-популяционный анализ
« Ответ #189 : 05 Июнь 2014, 16:29:55 »
Молодцы, работают. Интересно, что у них появился татарский кластер. А также положение на дереве тройки "палеокластеров" - Mari-Chuvash вообще до развилки (Европа и Ближний Восток)/(Индия и Центральная Азия), Finnish, Tatar-Chuvash. Все же странноватое дерево, откровенно говоря.
да, положение Mari-Chuvash тоже удивило.
ну и 6.5% Kalash-Balochi, по традиции)

Оффлайн Srkz

  • Сообщений: 6835
  • Страна: ru
  • Рейтинг +3620/-3
  • Y-ДНК: N-L1025 Y64023
  • мтДНК: U4a1e-pre T16093C T16311T
Re: DNA tribes - этно-популяционный анализ
« Ответ #190 : 05 Июнь 2014, 16:42:01 »
да, положение Mari-Chuvash тоже удивило.
Возможно, оно таким и должно быть, вспоминая результаты мальтинца. Скорее вопросы к Tatar-Chuvash. Похоже, выделили что-то "на грани шума". Рано я его назвал "татарским кластером".
Цитировать
ну и 6.5% Kalash-Balochi, по традиции)
Да, что-то все туда тянет )) Видимо, в целом картину рисуют правильно, а отдельные компоненты гуляют.

Оффлайн Asmat headhunter

  • Биохимическая субстанция
  • Сообщений: 12395
  • Страна: id
  • Рейтинг +814/-34
  • И того казака те тунгусы пальмами тут искололи
Re: DNA tribes - этно-популяционный анализ
« Ответ #191 : 05 Июнь 2014, 16:48:42 »
ну и 6.5% Kalash-Balochi, по традиции)

Что это вообще такое может быть в России? Откуда у нас калаши и белуджи? :o

Оффлайн FenriR

  • Сообщений: 2005
  • Страна: 00
  • Рейтинг +527/-2
  • Y-ДНК: N1c1-L1025
  • мтДНК: K1a
Re: DNA tribes - этно-популяционный анализ
« Ответ #192 : 05 Июнь 2014, 17:01:08 »
Возможно, оно таким и должно быть, вспоминая результаты мальтинца. Скорее вопросы к Tatar-Chuvash. Похоже, выделили что-то "на грани шума". Рано я его назвал "татарским кластером".
волго-уральские популяции вообще очень интересны, имхо. жаль их пока мало изучают.

Цитировать
Да, что-то все туда тянет )) Видимо, в целом картину рисуют правильно, а отдельные компоненты гуляют.
у меня и в Harappe они были и вот недавно в myOrigins вылез один процент с центром в Афганистане)
калаши, кстати, одни из ближайших ко мне популяций Южной Азии, согласно DNA tribes:
59 Tajik
60 Pashtun Afghanistan
66 Kalash Pakistan
69 Turkmen
79 Brahmin Uttar Pradesh India
82Pashtun Pakistan
83 Meena India
89 Arain Punjab Pakistan
95 Burusho Pakistan
98 Brahui Pakistan
99 Lambadi India

неужели и правда что-то есть?))
правда у них по несколько процентов Balto-Slavic, а у калашей даже Mari-Chuvash.

Что это вообще такое может быть в России? Откуда у нас калаши и белуджи? :o
имхо, скорее всего, это или близость этого компонента к европейским или степь или "если в компонентах происходит что-то странное, списывай все на влияние Урала"=)

Оффлайн Srkz

  • Сообщений: 6835
  • Страна: ru
  • Рейтинг +3620/-3
  • Y-ДНК: N-L1025 Y64023
  • мтДНК: U4a1e-pre T16093C T16311T
Re: DNA tribes - этно-популяционный анализ
« Ответ #193 : 05 Июнь 2014, 17:10:58 »
имхо, скорее всего, это или близость этого компонента к европейским или степь или "если в компонентах происходит что-то странное, списывай все на влияние Урала"=)
Ну да, видимо, архаику туда пособирали. Допустим, Tatar-Chuvash явно недоложили по сравнению восточноевропейцами из таблицы  :D

Оффлайн FenriR

  • Сообщений: 2005
  • Страна: 00
  • Рейтинг +527/-2
  • Y-ДНК: N1c1-L1025
  • мтДНК: K1a
Re: DNA tribes - этно-популяционный анализ
« Ответ #194 : 05 Июнь 2014, 17:23:38 »
Ну да, видимо, архаику туда пособирали. Допустим, Tatar-Chuvash явно недоложили по сравнению восточноевропейцами из таблицы  :D
да, судя по таблице средних значений, должно быть минимум 2-3% вместо 0.8%
вспомнил, как на 23andme до меня допытывался один индус "из касты войнов" из Кералы, с общим со мной сегментом в 11.1cM, не мигрировали ли мои предки в Индию) Так, у меня три "индийских" сегмента в 11.1, 7.3 (судя по фамилии, человек из джатов) и 5.4cM, все на 10 хромосоме. Может, цыгане, как вариант?=)
« Последнее редактирование: 05 Июнь 2014, 17:30:14 от FenriR »

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.