АвторТема: DNA tribes - этно-популяционный анализ  (Прочитано 59103 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн Srkz

  • Сообщений: 6760
  • Страна: ru
  • Рейтинг +3525/-2
  • Y-ДНК: N-L1025 Y64023
  • мтДНК: U4a1e-pre T16093C T16311T
Re: DNA tribes - этно-популяционный анализ
« Ответ #195 : 05 Июнь 2014, 17:34:27 »
Так, у меня три "индийских" сегмента в 11.1, 7.3 (судя по фамилии, человек из джатов) и 5.4cM, все на 10 хромосоме.
Интересно. Может, и правда какое-то пересечение было.

Оффлайн FenriR

  • Сообщений: 2005
  • Страна: 00
  • Рейтинг +527/-2
  • Y-ДНК: N1c1-L1025
  • мтДНК: K1a
Re: DNA tribes - этно-популяционный анализ
« Ответ #196 : 05 Июнь 2014, 20:15:37 »
Интересно. Может, и правда какое-то пересечение было.

любопытно только через кого: для отголосков "курганников" сегменты слишком длинные, да и сконцентрированы на одной хромосоме. Другое дело, что калаши, пуштуны, представители индийских каст и, вероятно, джаты - так или иначе (географически, социально) изолированные популяции - одним из вариантов объяснения были бы европейские цыгане, со степенью изоляции, примерно, на уровне ашкенази, но, согласно DNA tribes, компонент Kalash-Balochi у них на уровне 1.5%, в сравнении с моими 6.5%, причем Gangetic North-Central India и Dravidian-South India, у меня остутствующие, 8.3 и 5.9% соответственно,
Это можно было бы свести на неточность отдельного инструмента, но этот компонент появляется и в myOrigins и в калькуляторах MDLP (компоненты Kalash/Indo-Iranian) на уровне 1-2%, что-то с ним не то, имхо)

Оффлайн Asmat headhunter

  • Биохимическая субстанция
  • Сообщений: 12379
  • Страна: id
  • Рейтинг +810/-34
  • И того казака те тунгусы пальмами тут искололи
Re: DNA tribes - этно-популяционный анализ
« Ответ #197 : 05 Июнь 2014, 20:18:41 »
Это можно было бы свести на неточность отдельного инструмента, но этот компонент появляется и в myOrigins и в калькуляторах MDLP (компоненты Kalash/Indo-Iranian) на уровне 1-2%, что-то с ним не то, имхо)

Может, это какая-то гетерогенная группа компонентов на деле - просто подробно ещё не копались в этом?

Оффлайн Srkz

  • Сообщений: 6760
  • Страна: ru
  • Рейтинг +3525/-2
  • Y-ДНК: N-L1025 Y64023
  • мтДНК: U4a1e-pre T16093C T16311T
Re: DNA tribes - этно-популяционный анализ
« Ответ #198 : 05 Июнь 2014, 20:26:57 »
сегменты слишком длинные, да и сконцентрированы на одной хромосоме.
А может, это один длинный сегмент от какого-то из предков XIX века? Просто на других участках не нашлось протестировавшихся индусов для пересечения.

Оффлайн Srkz

  • Сообщений: 6760
  • Страна: ru
  • Рейтинг +3525/-2
  • Y-ДНК: N-L1025 Y64023
  • мтДНК: U4a1e-pre T16093C T16311T
Re: DNA tribes - этно-популяционный анализ
« Ответ #199 : 05 Июнь 2014, 20:47:06 »
Может, это какая-то гетерогенная группа компонентов на деле - просто подробно ещё не копались в этом?
Одни и те же снипы могут входить в большое количество кластеров. Алгоритм ищет наиболее вероятное сочетание, которое даст имеющийся результат. Если кластеров много, то вероятность шума и случайных отклонений повышается. Что касается калашского кластера, он явно каким-то далеким боком пересекается с Европой. При этом калаши сильно отдрейфовали, именно поэтому у них и появился свой собственный кластер. Как они выглядели изначально, вот вопрос.

Оффлайн FenriR

  • Сообщений: 2005
  • Страна: 00
  • Рейтинг +527/-2
  • Y-ДНК: N1c1-L1025
  • мтДНК: K1a
Re: DNA tribes - этно-популяционный анализ
« Ответ #200 : 05 Июнь 2014, 21:47:34 »
Может, это какая-то гетерогенная группа компонентов на деле - просто подробно ещё не копались в этом?
этот компонент должен быть достаточно специфичным, как правильно заметил ув. Srkz, благодаря генетическому дрейфу, но, емнип, в то же время, их компонент каким-то образом родственен кавказскому, можно посмотреть например здесь (Стр.6), ну и в новом апдейте видно, что у калашей с пуштунами заментно повышены значения для Daghestan-North Caucasus, а у чеченцев и даргинцев, в свою очередь, несколько для Kalash-Balochi.
А может, это один длинный сегмент от какого-то из предков XIX века? Просто на других участках не нашлось протестировавшихся индусов для пересечения.
да, действительно интересная версия, но кем же он был, чтобы дать сегмент такой длины?=) Если судить по предковым компонентам, предок должен был быть из "контактной зоны" Афганистан-Пакистан-Северо-Запад Индии, или, по крайней мере, со связями к этой зоне, как в случае с Керала: другие компоненты не сохранились, значит условный Kalash преобладал (что-то вроде 30-50%), если так, то эти 1-2% действительно подходят под ~5 поколений, т.е. 100-150 лет. Где представители Восточной Европы могли контактировать с популяциями Южной Азии, т.н. "Большая Игра" в Афганистане?=))
« Последнее редактирование: 05 Июнь 2014, 21:55:45 от FenriR »

Оффлайн Fire

  • 100% child of stardust
  • Сообщений: 9531
  • Страна: gr
  • Рейтинг +883/-130
  • Y-dna G2a1a1a1a1a1b1 Z7947
Re: DNA tribes - этно-популяционный анализ
« Ответ #201 : 07 Июнь 2014, 20:41:49 »


Что это вообще такое может быть в России? Откуда у нас калаши и белуджи? :o
имхо, скорее всего, это или близость этого компонента к европейским или степь или "если в компонентах происходит что-то странное, списывай все на влияние Урала"=)
По мифам Хазариг легендарный предок Хазар, и его брат Булгар из горы Имеона(Гиндо-Куш Памир Тянь-Шань)

Оффлайн valera27

  • Сообщений: 726
  • Страна: ru
  • Рейтинг +157/-0
  • Y - R1a1a-YP682(xYP1260,YP612,YP1696); mt - H1a
Re: DNA tribes - этно-популяционный анализ
« Ответ #202 : 08 Июль 2014, 20:47:17 »
Тоже пропустил свою 23andme-шную raw data через DNA Tribes (SNP Upload) - вот чего получилось:

Continental Core:
Basque 66.2%
Dravidian South India 25.5%
Mesoamerican 6.5%
Aka-Mbuti-Hadza 1.8%
South China 0.0%

Regional Cluster:
Balto-Slavic 43.5%
NW Europe 19.8%
Central European 13.3%
Tatar-Chuvash 10.3%
Ashkenazi Jewish 5.3%
Finnish 4.9%
Bedouin-Gulf Arabs 1.3%
Dravidian-South India 0.6%
Khoisan 0.5%
Melanesian 0.3%
Mari-Chuvash 0.2%

Оффлайн Rompecabeza

  • Сообщений: 172
  • Страна: ru
  • Рейтинг +14/-0
  • Y-ДНК: NA
  • мтДНК: U5a1b1
Re: DNA tribes - этно-популяционный анализ
« Ответ #203 : 08 Июль 2014, 20:54:17 »
Валера, а как Вы загрузили?

Оффлайн Srkz

  • Сообщений: 6760
  • Страна: ru
  • Рейтинг +3525/-2
  • Y-ДНК: N-L1025 Y64023
  • мтДНК: U4a1e-pre T16093C T16311T
Re: DNA tribes - этно-популяционный анализ
« Ответ #204 : 08 Июль 2014, 21:09:29 »
Любопытно, обратил сейчас внимание, что они признали "calculator effect"
Цитировать
Note on "Calculator Effect" for Updates: If you have previously submitted a parent's or
grandparent's genotype for inclusion in a native population, their results will be corrected for the
"Calculator Effect." However, results for any children or grandchildren will not be corrected and can
receive higher admixture and total similarity scores for that region and population. For best results,
update your parent or grandparent (instead of descendants).

Оффлайн valera27

  • Сообщений: 726
  • Страна: ru
  • Рейтинг +157/-0
  • Y - R1a1a-YP682(xYP1260,YP612,YP1696); mt - H1a
Re: DNA tribes - этно-популяционный анализ
« Ответ #205 : 08 Июль 2014, 21:13:46 »
Валера, а как Вы загрузили?

Как-то у них не очень все продумано... было нелегко, но справился)))

1) На странице http://www.dnatribes.com/snp.html выбрал вариант SNP Data Upload (with Discount) за 39.99. На следующей странице нажал кнопку Checkout и попытался выбрать вариант с регистрацией.
2) Выяснил, что зарегистрироваться можно только имея почту на Гугле, Yahoo или Aol. Завел почту на гугле, повторил пункт 1 (попутно изменив в корзине количество заказов с 2 на 1))), на этот раз все прошло автоматом.
3) Заполнил (не без затруднений) сведения о себе и своей карточке, подтвердил, сняли деньги, и на мою новую почту пришло письмо.
4) Возник вопрос - чего делать дальше? И тут пришло новое письмо - мол я деньги заплатил, а ничего не загрузил. В этом письме был адрес, куда отправлять файл (отправил) и ссылка на страницу, где я должен указать сведения о месте рождения 4-х бабушек и дедушек (условие предоставления скидки) - сходил туда и заполнил, там есть поле для почты (указал тот же свежий gmail): видимо по нему все и связывается.
5) Пришло письмо, что все ок
6) Буквально через полдня пришло письмо с результатами в PDF

Оффлайн vnik

  • Сообщений: 242
  • Страна: de
  • Рейтинг +23/-0
  • мтДНК: H16
Re: DNA tribes - этно-популяционный анализ
« Ответ #206 : 09 Июль 2014, 21:10:50 »
У меня следующий расклад, но я делал обновление предыдущих результатов, срок которым 2 года:

Continental Core:
Basque 61.7%
Dravidian South India 27.3%
Mesoamerican 7.9%
Aka-Mbuti-Hadza 3.1%
South China 0.0%

Regional Cluster:
Balto-Slavic 39.4%
Central European 14.2%
NW Europe 8.1%
Spanish-Portuguese 6.8%
Tatar-Chuvash 6.7%
Yeniseian 6.5%
Finnish 5.8%
Pontic West Caucasus 2.9%
Mari-Chuvash 2.8%
Horn of Africa 2.8%
Kalash-Balochi 2.0%
Ashkenazi Jewish 1.0%
North Siberian 0.6%
Dravidian-South India 0.2%
Central Asian 0.1%

Оффлайн Jonik

  • Сообщений: 405
  • Страна: us
  • Рейтинг +25/-0
  • Y-ДНК: N1c1 (L591+)
  • мтДНК: I1a1a
Re: DNA tribes - этно-популяционный анализ
« Ответ #207 : 07 Февраль 2015, 22:22:10 »
Что-то изменилось у них 2 февраля 2015 года, пропала возможность опграде от 15 до 26, обновить старый репорт за $25, т.д., остался только 26 за $139. Наверно новый хозяин, емаили обновились тоже.
http://dnatribes.com/

Оффлайн vnik

  • Сообщений: 242
  • Страна: de
  • Рейтинг +23/-0
  • мтДНК: H16
Re: DNA tribes - этно-популяционный анализ
« Ответ #208 : 11 Февраль 2015, 23:46:40 »
Что-то изменилось у них
Вроде и так понятно. Лукаса уже нет и такого энтузиазма и оперативности в работе больше не будет.

Оффлайн Jonik

  • Сообщений: 405
  • Страна: us
  • Рейтинг +25/-0
  • Y-ДНК: N1c1 (L591+)
  • мтДНК: I1a1a
Re: DNA tribes - этно-популяционный анализ
« Ответ #209 : 13 Февраль 2015, 00:34:52 »
"Currently, the upgrade option is not available. However, due to popular demand we expect to make it available again in April of 2015 during the next expansion of our operations. Please check back with us then.
Sincerely,
DNA Tribes Staff "

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.