АвторТема: MURKA. Мануал для дилетанта. ОБСУЖДЕНИЕ  (Прочитано 45677 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн Valery

  • Сообщений: 10107
  • Страна: 00
  • Рейтинг +1381/-7
  • Ultimate Matriarchy
Re: MURKA. Мануал для дилетанта. ОБСУЖДЕНИЕ
« Ответ #255 : 28 Ноябрь 2013, 18:11:55 »
а чем вас не устраивают скрипты для запуска которые есть в самом дистрибутиве? там есть образцы у которых имя кончается на *gv.bat это оно самое

Оффлайн Михаил Ночевной

  • Сообщений: 2117
  • Страна: ru
  • Рейтинг +173/-12
  • Y-ДНК: G2a2 (L1264+)
  • мтДНК: U5a1
Re: MURKA. Мануал для дилетанта. ОБСУЖДЕНИЕ
« Ответ #256 : 28 Ноябрь 2013, 18:22:58 »
а чем вас не устраивают скрипты для запуска которые есть в самом дистрибутиве? там есть образцы у которых имя кончается на *gv.bat это оно самое
я чайник, не понимаю этих терминов :(

Оффлайн Valery

  • Сообщений: 10107
  • Страна: 00
  • Рейтинг +1381/-7
  • Ultimate Matriarchy
Re: MURKA. Мануал для дилетанта. ОБСУЖДЕНИЕ
« Ответ #257 : 28 Ноябрь 2013, 18:28:43 »
там готовый скрипт .bat который можно запускать прямо из директории где он лежит, только поменять имя входного файла RDF на то которым вы назовете файл созданный из ych

Оффлайн Михаил Ночевной

  • Сообщений: 2117
  • Страна: ru
  • Рейтинг +173/-12
  • Y-ДНК: G2a2 (L1264+)
  • мтДНК: U5a1
Re: MURKA. Мануал для дилетанта. ОБСУЖДЕНИЕ
« Ответ #258 : 28 Ноябрь 2013, 18:42:11 »
там готовый скрипт .bat который можно запускать прямо из директории где он лежит, только поменять имя входного файла RDF на то которым вы назовете файл созданный из ych
в корневой папке мурки много файлов формата бат...

Оффлайн Valery

  • Сообщений: 10107
  • Страна: 00
  • Рейтинг +1381/-7
  • Ultimate Matriarchy
Re: MURKA. Мануал для дилетанта. ОБСУЖДЕНИЕ
« Ответ #259 : 28 Ноябрь 2013, 22:35:42 »
вам нужен файл runmjstrgv.bat

Что в нем надо поправить. Ищите строчку

-i "data\seq\r1a1w4.rdf" -r "data\metric\states_str0050ineq_2_4"

первый параметр - путь ко входному файлу с данными, который вы создали с помощью runych2rdf.bat, замените на то имя которое вы ему дали, а второй - к файлу метрики. Метрики уже есть в дистрибутиве, надо только убедиться что вы делали RDF с такими же настройками какие указываете в файле метрики. Если runych2rdf.bat запускался с аргументами

-d 2 -n 2 (ширина столбца 2 символа, длина десятичной записи числа 2 символа)

то подсунете метрику

"data\metric\states_str0050ineq_2_2"

а если

-d 2 -n 4 (ширина столбца 2 символа, длина десятичной записи числа 4 символа)

то

"data\metric\states_str0050ineq_2_4"

обе есть у вас в папке data\metric


И все )) Можно много чего еще настраивать по вкусу, но для запуска этого уже достаточно.




Оффлайн Михаил Ночевной

  • Сообщений: 2117
  • Страна: ru
  • Рейтинг +173/-12
  • Y-ДНК: G2a2 (L1264+)
  • мтДНК: U5a1
Re: MURKA. Мануал для дилетанта. ОБСУЖДЕНИЕ
« Ответ #260 : 29 Ноябрь 2013, 20:51:03 »
все сделал так, что теперь запускать? прога чтото посчитала и свернулась...

Оффлайн Шад

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6335
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1333/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Re: MURKA. Мануал для дилетанта. ОБСУЖДЕНИЕ
« Ответ #261 : 29 Ноябрь 2013, 22:09:03 »
все сделал так, что теперь запускать? прога чтото посчитала и свернулась...

в bat-файле нужно указать в конце команду pause
тогда будет выводится DOS-окно с отображением результатов работы bat-файла

Оффлайн Михаил Ночевной

  • Сообщений: 2117
  • Страна: ru
  • Рейтинг +173/-12
  • Y-ДНК: G2a2 (L1264+)
  • мтДНК: U5a1
Re: MURKA. Мануал для дилетанта. ОБСУЖДЕНИЕ
« Ответ #262 : 29 Ноябрь 2013, 22:14:14 »
все сделал так, что теперь запускать? прога чтото посчитала и свернулась...

в bat-файле нужно указать в конце команду pause
тогда будет выводится DOS-окно с отображением результатов работы bat-файла
так и есть а что делать с дос окном...

Оффлайн Шад

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6335
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1333/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Re: MURKA. Мануал для дилетанта. ОБСУЖДЕНИЕ
« Ответ #263 : 29 Ноябрь 2013, 22:23:35 »
все сделал так, что теперь запускать? прога чтото посчитала и свернулась...

в bat-файле нужно указать в конце команду pause
тогда будет выводится DOS-окно с отображением результатов работы bat-файла
так и есть а что делать с дос окном...

Если там нет сообщения об ошибках, то закрывать и наслаждаться полученными результатами.
Если всё сделано правильно, то результаты можно смотреть в директории: ...:\murka\nw\viz\

Оффлайн Михаил Ночевной

  • Сообщений: 2117
  • Страна: ru
  • Рейтинг +173/-12
  • Y-ДНК: G2a2 (L1264+)
  • мтДНК: U5a1
Re: MURKA. Мануал для дилетанта. ОБСУЖДЕНИЕ
« Ответ #264 : 30 Ноябрь 2013, 10:18:49 »
все сделал так, что теперь запускать? прога чтото посчитала и свернулась...

в bat-файле нужно указать в конце команду pause
тогда будет выводится DOS-окно с отображением результатов работы bat-файла
так и есть а что делать с дос окном...

Если там нет сообщения об ошибках, то закрывать и наслаждаться полученными результатами.
Если всё сделано правильно, то результаты можно смотреть в директории: ...:\murka\nw\viz\
сообщений о ошибок нет, появился в указаном месте файл формата DOT но он не открывается...чем его открыть можно?

Оффлайн Mich Glitch

  • Genus regis
  • Сообщений: 36936
  • Страна: ca
  • Рейтинг +3773/-48
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5a
Re: MURKA. Мануал для дилетанта. ОБСУЖДЕНИЕ
« Ответ #265 : 30 Ноябрь 2013, 10:26:10 »
Михаил,

Смотрю я на Ваши потуги и расстраиваюсь.
Нельзя быть таким ленивым.
Всё, что должно быть сказано - уже сказано.
Всё, что нужно для построения Муркой, уже на форуме не единожды выложено. (В этом темах этого раздела.)
Бросьте изображать маленького капризного ребёнка, терзающего всех вопросами, а просто прочитайте хотя бы раз то, что уже написано.

Оффлайн Valery

  • Сообщений: 10107
  • Страна: 00
  • Рейтинг +1381/-7
  • Ultimate Matriarchy
Re: MURKA. Мануал для дилетанта. ОБСУЖДЕНИЕ
« Ответ #266 : 30 Ноябрь 2013, 13:30:09 »
все сделал так, что теперь запускать? прога чтото посчитала и свернулась...

в bat-файле нужно указать в конце команду pause
тогда будет выводится DOS-окно с отображением результатов работы bat-файла
так и есть а что делать с дос окном...

Если там нет сообщения об ошибках, то закрывать и наслаждаться полученными результатами.
Если всё сделано правильно, то результаты можно смотреть в директории: ...:\murka\nw\viz\
сообщений о ошибок нет, появился в указаном месте файл формата DOT но он не открывается...чем его открыть можно?

значит, у Вас graphviz установлен не в ту папку которая указана в скрипте запуска мурки. Для виндоуз по умолчанию я записываю в настройках C:\gv\bin\dot.exe, если у вас не так, то меняйте.

Оффлайн Valery

  • Сообщений: 10107
  • Страна: 00
  • Рейтинг +1381/-7
  • Ultimate Matriarchy
Re: MURKA. Мануал для дилетанта. ОБСУЖДЕНИЕ
« Ответ #267 : 30 Ноябрь 2013, 13:54:58 »
Собственно, в файле install.txt дистирибутива для windows написано про Графвиз:

We recommend to place it into c:/gv directory, otherwise you
have to change paths in Murka's ./sample directory.


несколько лаконично, но суть понятна. Еще можно прописать пути с гв в переменные окружения. Под линуксом бинарники gv обычно сидят в /usr/bin либо /usr/local/bin поэтому и проблемы с путями нет, bash их прекрасно знает. Правда, должен признать, для Линукса я поддерживают автоматическую установку автотулзами, ну а виндовый порт мурки так, ручками ((

Оффлайн Михаил Ночевной

  • Сообщений: 2117
  • Страна: ru
  • Рейтинг +173/-12
  • Y-ДНК: G2a2 (L1264+)
  • мтДНК: U5a1
Re: MURKA. Мануал для дилетанта. ОБСУЖДЕНИЕ
« Ответ #268 : 02 Декабрь 2013, 14:46:59 »
у меня операционка 8.
я поменял местонахождение графвиза (был совсем не там) - на указанный путь.
но ДОТ файл созданный чтото считает и исчезает.
открываю dot.exe - открывает пустую командную строку...

Оффлайн Valery

  • Сообщений: 10107
  • Страна: 00
  • Рейтинг +1381/-7
  • Ultimate Matriarchy
Re: MURKA. Мануал для дилетанта. ОБСУЖДЕНИЕ
« Ответ #269 : 02 Декабрь 2013, 14:53:30 »
выложите пожалуйста файл которым запускаете мурку, я укажу как исправить его, после чего он создаст лог murka.log, этот лог выложите здесь

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.