MURKA. Мануал для дилетанта. ОБСУЖДЕНИЕ

[Аббат Бузони]

Фара, ты лучший!

[Farroukh]

Спасибо! Попробуй по этому мануалу построить какое-нибудь деревце! Если возникнут вопросы - пиши сюда!

[Аббат Бузони]

Когда дома буду посмотрю.

[Шад]

Сбылась мечта дилетантов! Респект Фарруху!

[Farroukh]

Только сейчас обратил внимание, что более новая версия Мурки отличается от той, с которой работал я: иные имена у файлов, папок и т. п.
Вывешиваю старую версию Мурки для которой данный мануал актуален.

[mouglley]

Имена bat файлов придумывал я под свои заточки.
Так что именуйте их по-своему, как удобно.

Но теми, которые Root*.bat нельзя пользоваться, пока не найдёте гаплотип предка ветви.
Для N1 он - синтетический (в природе несуществующий).

После этого его можно назначить предком. Для этого перед его названием в файле *.ych поставить d@
То есть, впесто Pupquin наприсать d@Pupquin.
В этом случае всё дерево будет укореняться на него в случае, если будет запущен один из Root*.bat

[Alexander]

Мануал - Жесть + ! (Выражение сильного положительного впечатления от содержания поста или коммента);
Un…fuckin‘…believable - Очень невероятно! That’s incredible - Просто невероятно! Superb! - Великолепно! Fantastic! - Фантастика! Awesome! - Потрясающе! That was mind blowing! - это вынесло мне мозг!
Жаль со временем всё хуже и хуже, летом бы мануалу цены бы не было (хотя всё относительно и индивидуально).
Кстати, цитата "Во второй строке скорости для каждого маркёра соответственно – 10,6,7,9,6,.." - откуда дровишки? Скорости по Вертнеру? А если без весов, то ставить 1 (единицы или ничего)?

[Аббат Бузони]

Ссыль на старую версию Мурки битая

[Lesla]

Ссыль на старую версию Мурки битая

А днем еще можно было скачать. Сервер что ли захлебнулся от потока желающих? 

[Farroukh]

Ссыль на старую версию Мурки битая

Странно. Тогда может уважаемые админы вывесят старую версию на нашем сервере?

скорости для каждого маркёра соответственно – 10,6,7,9,6,.." - откуда дровишки? Скорости по Вертнеру? А если без весов, то ставить 1 (единицы или ничего)?

Откуда эти скорости и как их при необходимости менять - на этот вопрос лучше ответит сам Валерий.
Единицы - это просто разделители гаплотипов, если не ошибаюсь

[Alexander]

Цитата: "Файл с обозначениями маркёров и их скоростями взять отседова:
* Haplotypes.zip (2.79 Кб - загружено 4 раз.)"
Пишет - файл повреждён...(?)
По ссылке "старая версия" - прога скачалась нормально.
И ещё вопрос - в процессе освоения, наверное не обязательно задувать 67-м, сколько мин? На пробный файл в 3 маркера будет работать?

[VVR]

Кстати, цитата "Во второй строке скорости для каждого маркёра соответственно – 10,6,7,9,6,.." - откуда дровишки? Скорости по Вертнеру? А если без весов, то ставить 1 (единицы или ничего)?

Наверное, под скоростями маркеров в данном случае понимаются всё-таки  их веса. Веса маркеров, если не ошибаюсь, те которые использует mougley.
Совсем без весов не бывает. Надо не забывать, что в таком случае программа считает, что веса всех маркеров равны.

[VVR]

Чем отличается ych-файл Мурки от нетворковского? По описанию Фарруха ничем. Тем не менее мой файл, работавший в Нетворке, Мурка не захотела обрабатывать. А вот ych-файл, который в виде образца был в дистрибутиве преобразовывался в рдф нормально и направлялся в заданную папку. Как ни пытался, ничего не вышло. На этом этапе несколько месяцев  назад и закончилась моя первая попытка освоения Мурки.

[mouglley]

А если без весов, то ставить 1 (единицы или ничего)?

Если без весов строка должна остаться девственно пустой.
То есть, вместо одной должно быть две пустых строки перед именем первого таксона.

[mouglley]

Чем отличается ych-файл Мурки от нетворковского? По описанию Фарруха ничем. Тем не менее мой файл, работавший в Нетворке, Мурка не захотела обрабатывать. А вот ych-файл, который в виде образца был в дистрибутиве преобразовывался в рдф нормально и направлялся в заданную папку. Как ни пытался, ничего не вышло. На этом этапе несколько месяцев  назад и закончилась моя первая попытка освоения Мурки.

Да, их грамматика не различается.

Нужно удалять все пробелы и специальные значки, которые есть в мануале Валерия.
Возможно, что те значки приемлему для Нетворка, но непригодны для Мурки.