АвторТема: MURKA. Мануал для дилетанта. ОБСУЖДЕНИЕ  (Прочитано 35544 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн Аббат БузониАвтор темы

  • ...
  • Сообщений: 19391
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1578/-58
  • Y-ДНК: I1a2a1a3a1a1a-YP1084+
  • мтДНК: H16
MURKA. Мануал для дилетанта. ОБСУЖДЕНИЕ
« : 06 Сентябрь 2011, 12:51:09 »
Фара, ты лучший!
« Последнее редактирование: 29 Сентябрь 2011, 22:10:09 от Аббат Бузони »

Онлайн Farroukh

  • Maternal Y-DNA: R1b-L584
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 12998
  • Страна: az
  • Рейтинг +2986/-15
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37518
  • мтДНК: F2f
MURKA. Мануал для дилетанта. ОБСУЖДЕНИЕ
« Ответ #1 : 06 Сентябрь 2011, 12:52:13 »
Спасибо! Попробуй по этому мануалу построить какое-нибудь деревце! Если возникнут вопросы - пиши сюда!

Оффлайн Аббат БузониАвтор темы

  • ...
  • Сообщений: 19391
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1578/-58
  • Y-ДНК: I1a2a1a3a1a1a-YP1084+
  • мтДНК: H16
MURKA. Мануал для дилетанта. ОБСУЖДЕНИЕ
« Ответ #2 : 06 Сентябрь 2011, 12:54:21 »
Когда дома буду посмотрю.

Оффлайн Шад

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6298
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1239/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
MURKA. Мануал для дилетанта. ОБСУЖДЕНИЕ
« Ответ #3 : 06 Сентябрь 2011, 13:03:35 »
Сбылась мечта дилетантов! Респект Фарруху!

Онлайн Farroukh

  • Maternal Y-DNA: R1b-L584
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 12998
  • Страна: az
  • Рейтинг +2986/-15
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37518
  • мтДНК: F2f
Re: MURKA. Мануал для дилетанта. ОБСУЖДЕНИЕ
« Ответ #4 : 06 Сентябрь 2011, 15:40:16 »
Только сейчас обратил внимание, что более новая версия Мурки отличается от той, с которой работал я: иные имена у файлов, папок и т. п.
Вывешиваю старую версию Мурки для которой данный мануал актуален.
« Последнее редактирование: 07 Сентябрь 2011, 08:10:08 от Farroukh »

Оффлайн mouglley

  • ...
  • Сообщений: 7779
  • Страна: hr
  • Рейтинг +434/-7
  • Я знаю, что познаю всё.
    • Записки Маугли
  • Y-ДНК: N1c1-L1025
  • мтДНК: J1c3
Re: MURKA. Мануал для дилетанта. ОБСУЖДЕНИЕ
« Ответ #5 : 06 Сентябрь 2011, 21:36:50 »
Имена bat файлов придумывал я под свои заточки.
Так что именуйте их по-своему, как удобно.

Но теми, которые Root*.bat нельзя пользоваться, пока не найдёте гаплотип предка ветви.
Для N1 он - синтетический (в природе несуществующий).

После этого его можно назначить предком. Для этого перед его названием в файле *.ych поставить d@
То есть, впесто Pupquin наприсать d@Pupquin.
В этом случае всё дерево будет укореняться на него в случае, если будет запущен один из Root*.bat

Оффлайн Alexander

  • Сообщений: 657
  • Рейтинг +73/-1
  • Y-ДНК: J2b
Re: MURKA. Мануал для дилетанта. ОБСУЖДЕНИЕ
« Ответ #6 : 06 Сентябрь 2011, 23:03:34 »
Мануал - Жесть + ! (Выражение сильного положительного впечатления от содержания поста или коммента);
Un…fuckin‘…believable - Очень невероятно! That’s incredible - Просто невероятно! Superb! - Великолепно! Fantastic! - Фантастика! Awesome! - Потрясающе! That was mind blowing! - это вынесло мне мозг!
Жаль со временем всё хуже и хуже, летом бы мануалу цены бы не было (хотя всё относительно и индивидуально).
Кстати, цитата "Во второй строке скорости для каждого маркёра соответственно – 10,6,7,9,6,.." - откуда дровишки? Скорости по Вертнеру? А если без весов, то ставить 1 (единицы или ничего)?

Оффлайн Аббат БузониАвтор темы

  • ...
  • Сообщений: 19391
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1578/-58
  • Y-ДНК: I1a2a1a3a1a1a-YP1084+
  • мтДНК: H16
Re: MURKA. Мануал для дилетанта. ОБСУЖДЕНИЕ
« Ответ #7 : 06 Сентябрь 2011, 23:08:34 »
Ссыль на старую версию Мурки битая

Оффлайн Lesla

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 9171
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2401/-9
  • FTDNA: 154400 (Big Y - 283049)
  • Y-ДНК: R1a-YP682 (VK06+)
Re: MURKA. Мануал для дилетанта. ОБСУЖДЕНИЕ
« Ответ #8 : 06 Сентябрь 2011, 23:16:37 »
Ссыль на старую версию Мурки битая
А днем еще можно было скачать. Сервер что ли захлебнулся от потока желающих?  :)

Онлайн Farroukh

  • Maternal Y-DNA: R1b-L584
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 12998
  • Страна: az
  • Рейтинг +2986/-15
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37518
  • мтДНК: F2f
Re: MURKA. Мануал для дилетанта. ОБСУЖДЕНИЕ
« Ответ #9 : 07 Сентябрь 2011, 08:18:29 »
Цитировать
Ссыль на старую версию Мурки битая
Странно. Тогда может уважаемые админы вывесят старую версию на нашем сервере?
Цитировать
скорости для каждого маркёра соответственно – 10,6,7,9,6,.." - откуда дровишки? Скорости по Вертнеру? А если без весов, то ставить 1 (единицы или ничего)?
Откуда эти скорости и как их при необходимости менять - на этот вопрос лучше ответит сам Валерий.
Единицы - это просто разделители гаплотипов, если не ошибаюсь

Оффлайн Alexander

  • Сообщений: 657
  • Рейтинг +73/-1
  • Y-ДНК: J2b
Re: MURKA. Мануал для дилетанта. ОБСУЖДЕНИЕ
« Ответ #10 : 07 Сентябрь 2011, 16:34:31 »
Цитата: "Файл с обозначениями маркёров и их скоростями взять отседова:
* Haplotypes.zip (2.79 Кб - загружено 4 раз.)"
Пишет - файл повреждён...(?)
По ссылке "старая версия" - прога скачалась нормально.
И ещё вопрос - в процессе освоения, наверное не обязательно задувать 67-м, сколько мин? На пробный файл в 3 маркера будет работать?
« Последнее редактирование: 07 Сентябрь 2011, 16:59:57 от Alexander »

Оффлайн VVR

  • ...
  • Сообщений: 2668
  • Страна: ua
  • Рейтинг +615/-0
  • Y-ДНК: o.R1a1a1b1a2a1a1a1e~-YP569,YP1260+;м.R1a1a1b1a1a1a2~-L260,YP1337+
  • мтДНК: K1c1h
Re: MURKA. Мануал для дилетанта. ОБСУЖДЕНИЕ
« Ответ #11 : 07 Сентябрь 2011, 19:04:25 »

Кстати, цитата "Во второй строке скорости для каждого маркёра соответственно – 10,6,7,9,6,.." - откуда дровишки? Скорости по Вертнеру? А если без весов, то ставить 1 (единицы или ничего)?
Наверное, под скоростями маркеров в данном случае понимаются всё-таки  их веса. Веса маркеров, если не ошибаюсь, те которые использует mougley.
Совсем без весов не бывает. Надо не забывать, что в таком случае программа считает, что веса всех маркеров равны.

Оффлайн VVR

  • ...
  • Сообщений: 2668
  • Страна: ua
  • Рейтинг +615/-0
  • Y-ДНК: o.R1a1a1b1a2a1a1a1e~-YP569,YP1260+;м.R1a1a1b1a1a1a2~-L260,YP1337+
  • мтДНК: K1c1h
Re: MURKA. Мануал для дилетанта. ОБСУЖДЕНИЕ
« Ответ #12 : 07 Сентябрь 2011, 19:15:01 »
Чем отличается ych-файл Мурки от нетворковского? По описанию Фарруха ничем. Тем не менее мой файл, работавший в Нетворке, Мурка не захотела обрабатывать. А вот ych-файл, который в виде образца был в дистрибутиве преобразовывался в рдф нормально и направлялся в заданную папку. Как ни пытался, ничего не вышло. На этом этапе несколько месяцев  назад и закончилась моя первая попытка освоения Мурки.

Оффлайн mouglley

  • ...
  • Сообщений: 7779
  • Страна: hr
  • Рейтинг +434/-7
  • Я знаю, что познаю всё.
    • Записки Маугли
  • Y-ДНК: N1c1-L1025
  • мтДНК: J1c3
Re: MURKA. Мануал для дилетанта. ОБСУЖДЕНИЕ
« Ответ #13 : 07 Сентябрь 2011, 21:08:03 »
А если без весов, то ставить 1 (единицы или ничего)?
Если без весов строка должна остаться девственно пустой.
То есть, вместо одной должно быть две пустых строки перед именем первого таксона.

Оффлайн mouglley

  • ...
  • Сообщений: 7779
  • Страна: hr
  • Рейтинг +434/-7
  • Я знаю, что познаю всё.
    • Записки Маугли
  • Y-ДНК: N1c1-L1025
  • мтДНК: J1c3
Re: MURKA. Мануал для дилетанта. ОБСУЖДЕНИЕ
« Ответ #14 : 07 Сентябрь 2011, 21:11:00 »
Чем отличается ych-файл Мурки от нетворковского? По описанию Фарруха ничем. Тем не менее мой файл, работавший в Нетворке, Мурка не захотела обрабатывать. А вот ych-файл, который в виде образца был в дистрибутиве преобразовывался в рдф нормально и направлялся в заданную папку. Как ни пытался, ничего не вышло. На этом этапе несколько месяцев  назад и закончилась моя первая попытка освоения Мурки.
Да, их грамматика не различается.

Нужно удалять все пробелы и специальные значки, которые есть в мануале Валерия.
Возможно, что те значки приемлему для Нетворка, но непригодны для Мурки.

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100