Gedmatch Ad-Mix Utility

[Anode]

Новая игрушка на gedmatch
http://ww2.gedmatch.com:8007/autosomal/ap_mix1.php

Нажимаю ссылку  - "невозможно отобразить стр". Как попасть туда?

http://ww2.gedmatch.com:8007/autosomal/ap_mix1w.php

Живая ссылка также есть с главной страницы ("Admixture Proportions by Chromosome")

[Людмила]

Anode
Большое спасибо. Получилось. Такая гремучая смесь! Только может быть действительно подходить к этому как к игрушке, раз при повторном обращении получаются разные результаты?

[Шад]

Теперь Gedmatch имеет все возможности Dodecad v3. Кроме admixture analysis теперь реализована визуализация по сегментам хромосом и возможность сравнения двух образцов.
Соответствующее сообщение разместил в своём блоге Диенек. 

[UA6ATG]

А никто не скажет, какова общая  методика занесения туда своих данных, скажем после теста в FTDNA?

[I2a1a]

А никто не скажет, какова общая  методика занесения туда своих данных, скажем после теста в FTDNA?

Загружаете свои данные от FTDNA на сайт Gedmatch.
Вот и вся методика.

[UA6ATG]

А никто не скажет, какова общая  методика занесения туда своих данных, скажем после теста в FTDNA?

Загружаете свои данные от FTDNA на сайт Gedmatch.
Вот и вся методика.

Я понимаю, но данные вручную заносить (то есть банально вводя данные повторов маркеров Y хромосомы) или есть какой более продвинутый способ?  Или речь идет о других тестах не на Y хромосоме?

[I2a1a]

А никто не скажет, какова общая  методика занесения туда своих данных, скажем после теста в FTDNA?

Загружаете свои данные от FTDNA на сайт Gedmatch.
Вот и вся методика.

Я понимаю, но данные вручную заносить (то есть банально вводя данные повторов маркеров Y хромосомы) или есть какой более продвинутый способ?  Или речь идет о других тестах не на Y хромосоме?

Речь идеет разумеется о аутосомных генотипах и генотипах X хромосомы.

[UA6ATG]

Речь идеет разумеется о аутосомных генотипах и генотипах X хромосомы.

А не могли бы Вы очень кратно рассказать, как именно переносить данные из FTDNA в этом случаи?

[I2a1a]

Речь идеет разумеется о аутосомных генотипах и генотипах X хромосомы.

А не могли бы Вы очень кратно рассказать, как именно переносить данные из FTDNA в этом случаи?

http://ww2.gedmatch.com:8007/autosomal/a-upload1.php
http://ww2.gedmatch.com:8007/x/x_upload1.php

[UA6ATG]

Речь идеет разумеется о аутосомных генотипах и генотипах X хромосомы.

А не могли бы Вы очень кратно рассказать, как именно переносить данные из FTDNA в этом случаи?

http://ww2.gedmatch.com:8007/autosomal/a-upload1.php
http://ww2.gedmatch.com:8007/x/x_upload1.php

Спасибо! В целом понятно.  Вот только:
On the screen that opens, RIGHT click on "Autosomal Results".
Так я понял этот Autosomal Results надо заказывать и оплачивать отдельно?
По Х хромосоме: это заказ стандартного теста на мито ДНК или я не так понимаю?

[Genesis]

Autosomal Results - GZIP, CSV
X Chromosome Results - GZIP, CSV

Это результаты у Вас есть, только если Вы заказывали  Family Finder:

2. In the column on the left, under Family Finder (either Affymetrix or Illumina section), click on "Download Raw Data"

[Шад]

Спасибо! В целом понятно.  Вот только:
On the screen that opens, RIGHT click on "Autosomal Results".
Так я понял этот Autosomal Results надо заказывать и оплачивать отдельно?
По Х хромосоме: это заказ стандартного теста на мито ДНК или я не так понимаю?

GEDMatch и рассчитан на анализ аутосомного теста. Для этого нужно заказать Family Finder на FTDNA (там будет и анализ Х-хромосомы в отдельном файле) или заказать стандартный тест на 23иЯ (там будет всё: гаплотипы по Y и мито, аутосомы, Х-хромосома). Но если у Вас уже есть набор на FTDNA, то лучше и дешевле остановиться на заказе Family Finder, тем более сейчас есть скидка.

[UA6ATG]

Вообще то дешевле будет заказать с большой рожденственной скидкой на 23andme если она конечно будет...
Ну да ладно.  А нет случайно перевода help к  Gedmatch на русский язык? Может кто переводил?

[Шад]

Вообще то дешевле будет заказать с большой рожденственной скидкой на 23andme если она конечно будет...
Ну да ладно.  А нет случайно перевода help к  Gedmatch на русский язык? Может кто переводил?

Help как таковой вряд ли переводили, но на форуме есть ветка, где вопросы по Гедматчу достаточно подробно обсуждаются.

Относительно рождественных скидок на 23иЯ (если они, действительно, будут). Посчитайте с учетом пересылки через Шапито - получиться не мало. А в ФТДНА Ваш кит уже находится - ничего отдельно пересылать не нужно. Там конечно панель мультиснипов беднее - но для генеалогических целей и выяснения этнофона вполне подойдет.

[Шад]

Хотелось бы развить эту тему:)
Сейчас в GEDmatch представлены все основные калькуляторы и "ораклы": Диенек, Еврогенес, Хараппа, и конечно MDLP от Вадима Веренича.
Т.е. инструментальная база для анализа более чем солидная.
Может как-то обобщить результаты по разным проектам для сравнения и обобщения. Хотя бы по участникам МолГена, что, в принципе, обеспечит достаточно репрезентативную многонациональную выборку.

Даже если отбросить проблему идентификации метисов, которые способны запутать и без того запутанный вопрос:), то остается достаточно интересным вопрос о близости по генетическим дистанциям различных этносов.

Касательно сходства русских, украинцев, белорусов и литовцев - это уже установленный факт.
А вот почему к среднему ашкеназу оказались близки тосканцы, сицилийцы и киприоты? Именно эти популяции. А не немцы, австрийцы и поляки в этническом окружении которых они казалось бы проживали?